q*******8
发帖数: 768 | 1 删了 打了好多字还是删了，感觉是作业啊？作弊是不对的 |
|
|
l**********1
发帖数: 5204 | 3 please refer Cell 2011 one paper:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22078888
full text link:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/Pub40.pdf
from one Super Niu Lab at Stanford:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/ |
|
y*******a
发帖数: 303 | 4 我晕，不是作业，我自己的实验。。。 自己刚刚学生物，对蛋白质方面一点都不懂。
。。 |
|
|
|
y*******a
发帖数: 303 | 7 你好,你是不是觉得这个问题很简单啊? 没别的意思,只是想知道自己弱到什么程度了.
我们实验室不太做蛋白的实验~ |
|
q*******8
发帖数: 768 | 8 我不觉得很简单啊。。。感觉像我们老师给研究生留的作业。。。
个人以为要先做PULLDOWN，找到有关联的蛋白，然后用YEAST2HYBRID之类印证direct
interation。这样得到的蛋白再用P32-ATP做phosphorilation. |
|
y*******a
发帖数: 303 | 9 谢谢你的回复，听你这么一说还是很简单的，不知道实际操作起来会不会比较顺利。我
这两天看了看文献，和你说的过程差不多，只是人家做的都是已经知道substrate蛋白
了，我自己没想到可以先做Y2H来找substrate。
另外，我要改改自己说话的方式了，我自己读起来也像一道作业题，呵呵～ |
|
q*******8
发帖数: 768 | 10 当然也要做做RESEARCH，看看可能的CANDIDATE，这样缩小一下范围
这几个做起来都不简单啊~~~~耗上个一年半载的起码。。。 |
|
q*******8
发帖数: 768 | 11 那就转几个RNAi/amiRNA, 看看PHENOTYPE。大致猜一下会涉及到什么途径。 |
|
|
l**********1
发帖数: 5204 | 13 one mentor in your future career (possible)
HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
//www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
//facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
//www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
plus this one:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289 |
|
y*******a
发帖数: 303 | 14 谢谢你的帮助。文章很有用，我会认真看的。另外，我已经有At的mutant seeds了，已
经开始做实验了。 不知道为什么大家总是能找到一些很好的paper，是平时的积累呢，
还是搜索能力高啊？ |
|
|
l**********1
发帖数: 5204 | 16 每天一早起来 洗漱 化妆后 第一件事 就是 上买买提 bbs Biology
看别人的求的paper 的题目 以及 摘要 和自己的有关联没有
如有 必须取得那个paper 的全文 当然有的时侯就在null floor 楼下的 sendspace
link
里就能立马拿到full text pdf file/s.
还有每晚卸妆后 临睡前也必须来这里check 一次
你坚持这样做三年 1001晨+1001晚 以上 你
成不了能及时获得很好的paper 的你
那就来提诉我吧 ... 赔给你100个包子
原因: 三个臭皮匠 有时侯可能抵一个诸葛亮的一个想法
这里三年 偶遇30个wsn wsnv 千老的急求papers relative to your projects.
抵一个JD Watson的一个想法还是有可能的吧
//en.wikipedia.org/wiki/James_D._Watson |
|
c********b
发帖数: 363 | 17 I got your point a little bit:
You think non-coding RNA is involved in resistance, so Xuemei's study has a
link there.
That is pretty... NAIVE.
Again, she focus on smRNA metabolism, not function. So the link is like
everything is linked in a celll, directly or indirectly. |
|
c********b
发帖数: 363 | 18 "not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
non coding RNAs"
This comments is universally right: all proteins encoding needs non-coding
RNA like tRNAs and rRNAs. So, not being specific leads to nowhere. |
|
q*******8
发帖数: 768 | 19 删了 打了好多字还是删了，感觉是作业啊？作弊是不对的 |
|
|
l**********1
发帖数: 5204 | 21 please refer Cell 2011 one paper:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22078888
full text link:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/Pub40.pdf
from one Super Niu Lab at Stanford:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/ |
|
y*******a
发帖数: 303 | 22 我晕，不是作业，我自己的实验。。。 自己刚刚学生物，对蛋白质方面一点都不懂。
。。 |
|
|
|
y*******a
发帖数: 303 | 25 你好,你是不是觉得这个问题很简单啊? 没别的意思,只是想知道自己弱到什么程度了.
我们实验室不太做蛋白的实验~ |
|
q*******8
发帖数: 768 | 26 我不觉得很简单啊。。。感觉像我们老师给研究生留的作业。。。
个人以为要先做PULLDOWN，找到有关联的蛋白，然后用YEAST2HYBRID之类印证direct
interation。这样得到的蛋白再用P32-ATP做phosphorilation. |
|
y*******a
发帖数: 303 | 27 谢谢你的回复，听你这么一说还是很简单的，不知道实际操作起来会不会比较顺利。我
这两天看了看文献，和你说的过程差不多，只是人家做的都是已经知道substrate蛋白
了，我自己没想到可以先做Y2H来找substrate。
另外，我要改改自己说话的方式了，我自己读起来也像一道作业题，呵呵～ |
|
q*******8
发帖数: 768 | 28 当然也要做做RESEARCH，看看可能的CANDIDATE，这样缩小一下范围
这几个做起来都不简单啊~~~~耗上个一年半载的起码。。。 |
|
q*******8
发帖数: 768 | 29 那就转几个RNAi/amiRNA, 看看PHENOTYPE。大致猜一下会涉及到什么途径。 |
|
|
l**********1
发帖数: 5204 | 31 one mentor in your future career (possible)
HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
//www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
//facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
//www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
plus this one:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289 |
|
y*******a
发帖数: 303 | 32 谢谢你的帮助。文章很有用，我会认真看的。另外，我已经有At的mutant seeds了，已
经开始做实验了。 不知道为什么大家总是能找到一些很好的paper，是平时的积累呢，
还是搜索能力高啊？ |
|
|
l**********1
发帖数: 5204 | 34 每天一早起来 洗漱 化妆后 第一件事 就是 上买买提 bbs Biology
看别人的求的paper 的题目 以及 摘要 和自己的有关联没有
如有 必须取得那个paper 的全文 当然有的时侯就在null floor 楼下的 sendspace
link
里就能立马拿到full text pdf file/s.
还有每晚卸妆后 临睡前也必须来这里check 一次
你坚持这样做三年 1001晨+1001晚 以上 你
成不了能及时获得很好的paper 的你
那就来提诉我吧 ... 赔给你100个包子
原因: 三个臭皮匠 有时侯可能抵一个诸葛亮的一个想法
这里三年 偶遇30个wsn wsnv 千老的急求papers relative to your projects.
抵一个JD Watson的一个想法还是有可能的吧
//en.wikipedia.org/wiki/James_D._Watson |
|
c********b
发帖数: 363 | 35 I got your point a little bit:
You think non-coding RNA is involved in resistance, so Xuemei's study has a
link there.
That is pretty... NAIVE.
Again, she focus on smRNA metabolism, not function. So the link is like
everything is linked in a celll, directly or indirectly. |
|
c********b
发帖数: 363 | 36 "not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
non coding RNAs"
This comments is universally right: all proteins encoding needs non-coding
RNA like tRNAs and rRNAs. So, not being specific leads to nowhere. |
|
f******h
发帖数: 40 | 37 正在写一篇综述，总觉得标题读起来很别扭，所以到这里来征求大家的意见。如果您的
意见触动了我的灵感，我便包子答谢。 |
|
a*****x
发帖数: 901 | 38 如果没有mouse model的条件，至少要有human cancer cell line, 或者ex vivo tumor
model的phenotype，或者找合作者做mouse model。而且phenotype光用siRNA knock-
down是不可信的,要有resuce。
Mechanism指的是要完整的story。磷酸化位点是什么，突变以后就没有level变化了?磷
酸化以后为什么B的level会变低，影响了E3的结合？蛋白A是不是B直接的kinase，等等
。就是可以做出一个model的figure，而且主要的地方不需要加问号。更多的是Cell的
要求，如果Mechanism有big surprise的话可以try Nature/Science。
如果你老板很大，或者大家一直在找B的调控蛋白但是找不到的话，目前的数据试CNS也
未尝不可。不过一般情况下没有太大希望 -- it doesn't hurt to try. Science第一
轮不过的话一个星期就会通知你。 |
|
g*****n
发帖数: 241 | 39 谢谢Windplayer的意见，抱歉“A没有活性”是我没有表述清楚，我说的没有活性是指
在E. coli里面表达出的A没有kinase的活性。
我们实验室是做遗传的，很多时候靠遗传数据来支持我们的结论，生化不是我们的强项
。所以我们这篇文章的侧重点也是遗传多于生化。虽然我也希望能有co-ip来证明两个
蛋白结合，但我们的model是A导致B的降解，很可能他们是mutually exclusive，所以
可能不太好用co-ip做出结合。 |
|
|
n**8
发帖数: 221 | 41 没做过这个，但如果我是你，我会试试这两个条件，
1.) ATP analog
2.）实在不行，就crosslink，这个要设计好control。 |
|
a*****x
发帖数: 901 | 42 一般做in vitro phosphorylation |
|
i**********a
发帖数: 1402 | 43 能一起co-ip不一定是底物，所以这个方法还要用后续方法验证。 |
|
|
p*****u
发帖数: 191 | 45 vitro phosphorylation必须顶这个 |
|
g***y
发帖数: 201 | 46 CaM Kinase II alpha subunit (AB-1)，mouse monoclonal, from calbiochem, cat#
NB12
works on 4%PFA fixed paraffin section, need citrate buffer antigen retrieval
though, dilution 1:200-1:500
also works on crysection.
爱卿免跪平身，千万别忘了给我几个包子！ |
|
H*****e
发帖数: 120 | 47 Hi experts,
I need to sequence PI3K and PTEN in tumors for determine whether there is
mutation. But I do not know much about sequencing mutations since I only
work kinase for years. So I have a few basic questions, wish to get answers
here:
1.RNA or DNA, The tumor sample will be provided by a colleague in Hospital.
I can get both DNA and RNA purified. Should I sequence DNA or RNA after I
PCR them out?
2.If only 1 copy has mutation and the other copy is wt, can routine sequence
in core lab det... 阅读全帖 |
|
l**********1
发帖数: 5204 | 48 try
Human Phospho-MAPK Array kit
(R&D Systems, Minneapolis, MN).
link:
//www.biocompare.com/ProductDetails/3015549/Proteome-Profiler-Human-Phospho-
MAPK-Array-Kit-NEW.html
cited from 2011 paper:
Activation of p38 mitogen-activated protein kinase by norepinephrine in T-
lineage cells.
Immunology. 2011 Feb;132(2):197-
link:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21039464
>Phospho-MAPK protein array
>Following exposure to NE (150 lM, 15 min), total cellular
>protein was obtained using the reagents and proto... 阅读全帖 |
|
i*****g
发帖数: 11893 | 49 光是细胞死亡这个function, phenotype是不够的
细胞有一千种死法
精细做结构和功能，domain 定位，好的论文可以发到nature cell biology之类的，但
楼主的是植物
另外，标题可以想想sexy一点
比如说：plant to animal transition mediated through signaling complex
assembled by domainX of protein Y
nerve regeneration regluated by protein Y from plants
blackhole formation required domain X of 楼主proteinX during PCD process
indispensable role of 楼主protein Y regulated with domain X associated
transcriptional kinase complex in hypersonic space shuttle construction
你看，我随便就想出一些乱七八糟的文章... 阅读全帖 |
|
r**a
发帖数: 121 | 50 我们学校里居然下不了这个文献，哪位同修可以帮我下一下，发送到我有邮箱：
l***********[email protected]
谢谢先了，感激不尽啊！！
Regulation of Cdk7 activity through a phosphatidylinositol (3)-kinase/PKC-ι
-mediated signaling cascade in glioblastoma.
Desai SR, Pillai PP, Patel RS, McCray AN, Win-Piazza HY, Acevedo-Duncan ME.
Carcinogenesis. 2012 Jan;33(1):10-9. Epub 2011 Oct 21. |
|
