y*******a
发帖数: 303 | 1 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase? |
q*******8
发帖数: 768 | 2 删了 打了好多字还是删了，感觉是作业啊？作弊是不对的 |
g*********5
发帖数: 2533 | |
l**********1
发帖数: 5204 | 4 please refer Cell 2011 one paper:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22078888
full text link:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/Pub40.pdf
from one Super Niu Lab at Stanford:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/
【在 y*******a 的大作中提到】
: 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
: 知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase?
|
y*******a
发帖数: 303 | 5 我晕，不是作业，我自己的实验。。。 自己刚刚学生物，对蛋白质方面一点都不懂。
。。
【在 q*******8 的大作中提到】
: 删了 打了好多字还是删了，感觉是作业啊？作弊是不对的
|
y*******a
发帖数: 303 | 6 我刚入行生物一年多，生化知识薄弱，自己的project 是protein kinase～
【在 g*********5 的大作中提到】
: …… 您是学生物的？
|
y*******a
发帖数: 303 | 7 非常感谢，我先看看的！
【在 l**********1 的大作中提到】
: please refer Cell 2011 one paper:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22078888
: full text link:
: //www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/Pub40.pdf
: from one Super Niu Lab at Stanford:
: //www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/
|
l**********1
发帖数: 5204 | 8 De rien.
【在 y*******a 的大作中提到】
: 非常感谢，我先看看的！
|
y*******a
发帖数: 303 | 9 你好,你是不是觉得这个问题很简单啊? 没别的意思,只是想知道自己弱到什么程度了.
我们实验室不太做蛋白的实验~
【在 g*********5 的大作中提到】
: …… 您是学生物的？
|
q*******8
发帖数: 768 | 10 我不觉得很简单啊。。。感觉像我们老师给研究生留的作业。。。
个人以为要先做PULLDOWN，找到有关联的蛋白，然后用YEAST2HYBRID之类印证direct
interation。这样得到的蛋白再用P32-ATP做phosphorilation. |
|
|
y*******a
发帖数: 303 | 11 谢谢你的回复，听你这么一说还是很简单的，不知道实际操作起来会不会比较顺利。我
这两天看了看文献，和你说的过程差不多，只是人家做的都是已经知道substrate蛋白
了，我自己没想到可以先做Y2H来找substrate。
另外，我要改改自己说话的方式了，我自己读起来也像一道作业题，呵呵～
【在 q*******8 的大作中提到】
: 我不觉得很简单啊。。。感觉像我们老师给研究生留的作业。。。
: 个人以为要先做PULLDOWN，找到有关联的蛋白，然后用YEAST2HYBRID之类印证direct
: interation。这样得到的蛋白再用P32-ATP做phosphorilation.
|
q*******8
发帖数: 768 | 12 当然也要做做RESEARCH，看看可能的CANDIDATE，这样缩小一下范围
这几个做起来都不简单啊~~~~耗上个一年半载的起码。。。 |
y*******a
发帖数: 303 | 13 可是我的这个protein kinase gene 是新的，目前data base上已经可以得到cDNA, 但
是protein还没得到，是不是就没有办法缩小范围了呢？
【在 q*******8 的大作中提到】
: 当然也要做做RESEARCH，看看可能的CANDIDATE，这样缩小一下范围
: 这几个做起来都不简单啊~~~~耗上个一年半载的起码。。。
|
q*******8
发帖数: 768 | 14 那就转几个RNAi/amiRNA, 看看PHENOTYPE。大致猜一下会涉及到什么途径。 |
y*******a
发帖数: 303 | 15 好的，非常感谢！
【在 q*******8 的大作中提到】
: 那就转几个RNAi/amiRNA, 看看PHENOTYPE。大致猜一下会涉及到什么途径。
|
b******y
发帖数: 627 | 16 Some kinases auto-phosphorylate. If you eventually get protein, either
through recombination or IP, try to incubate it at high concentration in the
presence of p32-ATP and Mg2+ and auto-radiography to see whether your
protein auto-phosphorylate itself.
However, bioinformatics are pretty powerful. If it says that it is S/T
kinase with high confidence, it is. However, substrates of kinase are non-
trivial to find for three reasons: 1) interactions between kinases and their
substrate are mostly transient; 2) specificity of kinases are miserable and
3) there are a fair amount redundancy amount kinases.
Good luck! |
y*******a
发帖数: 303 | 17 谢谢你的回复，对我很有帮助啊。我project的主要目的是分析这个新的kinase gene可
不可以提高植物的抗性，主要做的是transgenic plants 的physiology analysis， 只
是老板提出来了。。。
the
their
and
【在 b******y 的大作中提到】
: Some kinases auto-phosphorylate. If you eventually get protein, either
: through recombination or IP, try to incubate it at high concentration in the
: presence of p32-ATP and Mg2+ and auto-radiography to see whether your
: protein auto-phosphorylate itself.
: However, bioinformatics are pretty powerful. If it says that it is S/T
: kinase with high confidence, it is. However, substrates of kinase are non-
: trivial to find for three reasons: 1) interactions between kinases and their
: substrate are mostly transient; 2) specificity of kinases are miserable and
: 3) there are a fair amount redundancy amount kinases.
: Good luck!
|
l**********1
发帖数: 5204 | 18 one mentor in your future career (possible)
HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
//www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
//facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
//www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
plus this one:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289
【在 y*******a 的大作中提到】
: 谢谢你的回复，对我很有帮助啊。我project的主要目的是分析这个新的kinase gene可
: 不可以提高植物的抗性，主要做的是transgenic plants 的physiology analysis， 只
: 是老板提出来了。。。
:
: the
: their
: and
|
c********b
发帖数: 363 | 19 你可以试试in gel phosphorylation, 这样既可以知道你的是不是kinase,又不用费力
去找substrate.
http://stke.sciencemag.org/cgi/content/abstract/sigtrans;2002/1
如果这个蛋白不是对植物病毒的抵抗有帮助的话，先上VIGS来knockdown看表型。载体
可以在ABRC买到，10刀一个，control也有卖。
【在 y*******a 的大作中提到】
: 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
: 知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase?
|
c********b
发帖数: 363 | 20 Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
project:
【在 l**********1 的大作中提到】
: one mentor in your future career (possible)
: HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
: //www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
: //facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
: and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
: //www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
: plus this one:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289
|
|
|
y*******a
发帖数: 303 | 21 谢谢你的帮助。文章很有用，我会认真看的。另外，我已经有At的mutant seeds了，已
经开始做实验了。 不知道为什么大家总是能找到一些很好的paper，是平时的积累呢，
还是搜索能力高啊？
【在 c********b 的大作中提到】
: 你可以试试in gel phosphorylation, 这样既可以知道你的是不是kinase,又不用费力
: 去找substrate.
: http://stke.sciencemag.org/cgi/content/abstract/sigtrans;2002/1
: 如果这个蛋白不是对植物病毒的抵抗有帮助的话，先上VIGS来knockdown看表型。载体
: 可以在ABRC买到，10刀一个，control也有卖。
|
y*******a
发帖数: 303 | 22 miRNA也是我的一个project，嘿嘿～
【在 c********b 的大作中提到】
: Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
:
: project:
|
l**********1
发帖数: 5204 | 23 Continue to 18th floor
not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
non coding RNAs:
References:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
more
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
citedin&uid=15565159
original hint from:
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
NB: if HIV treatment is not relative to 抗性和kinase
Are you sure? centuribob (Planta)
回复]
[ 20 ]
发信人: centuribob (Planta), 信区: Biology
标 题: Re: 怎样设计小实验来确定一个基因编码的蛋白质是protein kina
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 9 2012, 美东)
Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
【在 l**********1 的大作中提到】
: one mentor in your future career (possible)
: HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
: //www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
: //facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
: and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
: //www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
: plus this one:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289
|
l**********1
发帖数: 5204 | 24 每天一早起来 洗漱 化妆后 第一件事 就是 上买买提 bbs Biology
看别人的求的paper 的题目 以及 摘要 和自己的有关联没有
如有 必须取得那个paper 的全文 当然有的时侯就在null floor 楼下的 sendspace
link
里就能立马拿到full text pdf file/s.
还有每晚卸妆后 临睡前也必须来这里check 一次
你坚持这样做三年 1001晨+1001晚 以上 你
成不了能及时获得很好的paper 的你
那就来提诉我吧 ... 赔给你100个包子
原因: 三个臭皮匠 有时侯可能抵一个诸葛亮的一个想法
这里三年 偶遇30个wsn wsnv 千老的急求papers relative to your projects.
抵一个JD Watson的一个想法还是有可能的吧
//en.wikipedia.org/wiki/James_D._Watson
【在 y*******a 的大作中提到】
: 谢谢你的帮助。文章很有用，我会认真看的。另外，我已经有At的mutant seeds了，已
: 经开始做实验了。 不知道为什么大家总是能找到一些很好的paper，是平时的积累呢，
: 还是搜索能力高啊？
|
c********b
发帖数: 363 | 25 I did not see your logic.
I was saying Xuemei did not work on Kinase and resistance. Did her group
publish original research report on HIV?? I bet she has no permission to
work on HIV yet. I will meet her this May, and I can ask her if you want me
to.
As for myself, I am a pure RNA biologist. I work on miRNA, non coding
pathogen RNA, circular RNA, etc. I guess I am pretty familiar with
literatures in plant RNA biology.
【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
|
c********b
发帖数: 363 | 26 I got your point a little bit:
You think non-coding RNA is involved in resistance, so Xuemei's study has a
link there.
That is pretty... NAIVE.
Again, she focus on smRNA metabolism, not function. So the link is like
everything is linked in a celll, directly or indirectly.
【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
|
c********b
发帖数: 363 | 27 "not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
non coding RNAs"
This comments is universally right: all proteins encoding needs non-coding
RNA like tRNAs and rRNAs. So, not being specific leads to nowhere.
【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
|
l**********1
发帖数: 5204 | 28 请注意你的用词
>Xuemei又不做抗性和kinase
是"和"而不是"或"
then
what is this?
a)
her Vita:
19. Wenming Wang and Xuemei Chen. HUA ENHANCER3 reveals a role for a
cyclin-dependent protein kinase in the specification of floral organ
identity in Arabidopsis. (2004) Development 131, 3147-
from
//www.plantbiology.ucr.edu/faculty/chen.html
and her review article:
b)
//www.springerlink.com/content/p22k662q1162kp07/
and this:
c)
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20675573
Plant Cell. 2010 Jul;22(7):2156-
Orchestration of the floral transition and floral development in Arabidopsis
by the bifunctional transcription factor APETALA2.
Yant L, Mathieu J, Dinh TT, Ott F, Lanz C, Wollmann H, Chen X, Schmid M.
Source
Max Planck Institute for Developmental Biology, D-72076 Tübingen, Germany.
and UC Riverside
full text link:
//www.plantcell.org/content/22/7/2156.full.pdf
难不成合作项目= 2nd last author did nothing about Kinase?
你是她老公或相好的话 那偶就闪人了 centuribob (Planta) 老大 You are always correct
for her topics.
【在 c********b 的大作中提到】
: Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
:
: project:
|
l**********1
发帖数: 5204 | 29 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20023165
full text link:
//www.weigelworld.org/research/publications/2010/pdfs/Rodriguez%
20Development%202010.pdf
even Xue-mei Chen before 2010 never did Arabidopsis cyclin-dependent
kinases and microRNA
after 2011 she should noted that paper.
And You centuribob (Planta) from 2012 now still ignored it?
【在 c********b 的大作中提到】
: "not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs"
: This comments is universally right: all proteins encoding needs non-coding
: RNA like tRNAs and rRNAs. So, not being specific leads to nowhere.
|
y*******a
发帖数: 303 | 30 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase? |
|
|
q*******8
发帖数: 768 | 31 删了 打了好多字还是删了，感觉是作业啊？作弊是不对的 |
g*********5
发帖数: 2533 | |
l**********1
发帖数: 5204 | 33 please refer Cell 2011 one paper:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22078888
full text link:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/Pub40.pdf
from one Super Niu Lab at Stanford:
//www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/
【在 y*******a 的大作中提到】
: 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
: 知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase?
|
y*******a
发帖数: 303 | 34 我晕，不是作业，我自己的实验。。。 自己刚刚学生物，对蛋白质方面一点都不懂。
。。
【在 q*******8 的大作中提到】
: 删了 打了好多字还是删了，感觉是作业啊？作弊是不对的
|
y*******a
发帖数: 303 | 35 我刚入行生物一年多，生化知识薄弱，自己的project 是protein kinase～
【在 g*********5 的大作中提到】
: …… 您是学生物的？
|
y*******a
发帖数: 303 | 36 非常感谢，我先看看的！
【在 l**********1 的大作中提到】
: please refer Cell 2011 one paper:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22078888
: full text link:
: //www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/Pub40.pdf
: from one Super Niu Lab at Stanford:
: //www.stanford.edu/group/ferrelllab/publications/
|
l**********1
发帖数: 5204 | 37 De rien.
【在 y*******a 的大作中提到】
: 非常感谢，我先看看的！
|
y*******a
发帖数: 303 | 38 你好,你是不是觉得这个问题很简单啊? 没别的意思,只是想知道自己弱到什么程度了.
我们实验室不太做蛋白的实验~
【在 g*********5 的大作中提到】
: …… 您是学生物的？
|
q*******8
发帖数: 768 | 39 我不觉得很简单啊。。。感觉像我们老师给研究生留的作业。。。
个人以为要先做PULLDOWN，找到有关联的蛋白，然后用YEAST2HYBRID之类印证direct
interation。这样得到的蛋白再用P32-ATP做phosphorilation. |
y*******a
发帖数: 303 | 40 谢谢你的回复，听你这么一说还是很简单的，不知道实际操作起来会不会比较顺利。我
这两天看了看文献，和你说的过程差不多，只是人家做的都是已经知道substrate蛋白
了，我自己没想到可以先做Y2H来找substrate。
另外，我要改改自己说话的方式了，我自己读起来也像一道作业题，呵呵～
【在 q*******8 的大作中提到】
: 我不觉得很简单啊。。。感觉像我们老师给研究生留的作业。。。
: 个人以为要先做PULLDOWN，找到有关联的蛋白，然后用YEAST2HYBRID之类印证direct
: interation。这样得到的蛋白再用P32-ATP做phosphorilation.
|
|
|
q*******8
发帖数: 768 | 41 当然也要做做RESEARCH，看看可能的CANDIDATE，这样缩小一下范围
这几个做起来都不简单啊~~~~耗上个一年半载的起码。。。 |
y*******a
发帖数: 303 | 42 可是我的这个protein kinase gene 是新的，目前data base上已经可以得到cDNA, 但
是protein还没得到，是不是就没有办法缩小范围了呢？
【在 q*******8 的大作中提到】
: 当然也要做做RESEARCH，看看可能的CANDIDATE，这样缩小一下范围
: 这几个做起来都不简单啊~~~~耗上个一年半载的起码。。。
|
q*******8
发帖数: 768 | 43 那就转几个RNAi/amiRNA, 看看PHENOTYPE。大致猜一下会涉及到什么途径。 |
y*******a
发帖数: 303 | 44 好的，非常感谢！
【在 q*******8 的大作中提到】
: 那就转几个RNAi/amiRNA, 看看PHENOTYPE。大致猜一下会涉及到什么途径。
|
b******y
发帖数: 627 | 45 Some kinases auto-phosphorylate. If you eventually get protein, either
through recombination or IP, try to incubate it at high concentration in the
presence of p32-ATP and Mg2+ and auto-radiography to see whether your
protein auto-phosphorylate itself.
However, bioinformatics are pretty powerful. If it says that it is S/T
kinase with high confidence, it is. However, substrates of kinase are non-
trivial to find for three reasons: 1) interactions between kinases and their
substrate are mostly transient; 2) specificity of kinases are miserable and
3) there are a fair amount redundancy amount kinases.
Good luck! |
y*******a
发帖数: 303 | 46 谢谢你的回复，对我很有帮助啊。我project的主要目的是分析这个新的kinase gene可
不可以提高植物的抗性，主要做的是transgenic plants 的physiology analysis， 只
是老板提出来了。。。
the
their
and
【在 b******y 的大作中提到】
: Some kinases auto-phosphorylate. If you eventually get protein, either
: through recombination or IP, try to incubate it at high concentration in the
: presence of p32-ATP and Mg2+ and auto-radiography to see whether your
: protein auto-phosphorylate itself.
: However, bioinformatics are pretty powerful. If it says that it is S/T
: kinase with high confidence, it is. However, substrates of kinase are non-
: trivial to find for three reasons: 1) interactions between kinases and their
: substrate are mostly transient; 2) specificity of kinases are miserable and
: 3) there are a fair amount redundancy amount kinases.
: Good luck!
|
l**********1
发帖数: 5204 | 47 one mentor in your future career (possible)
HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
//www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
//facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
//www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
plus this one:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289
【在 y*******a 的大作中提到】
: 谢谢你的回复，对我很有帮助啊。我project的主要目的是分析这个新的kinase gene可
: 不可以提高植物的抗性，主要做的是transgenic plants 的physiology analysis， 只
: 是老板提出来了。。。
:
: the
: their
: and
|
c********b
发帖数: 363 | 48 你可以试试in gel phosphorylation, 这样既可以知道你的是不是kinase,又不用费力
去找substrate.
http://stke.sciencemag.org/cgi/content/abstract/sigtrans;2002/1
如果这个蛋白不是对植物病毒的抵抗有帮助的话，先上VIGS来knockdown看表型。载体
可以在ABRC买到，10刀一个，control也有卖。
【在 y*******a 的大作中提到】
: 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
: 知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase?
|
c********b
发帖数: 363 | 49 Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
project:
【在 l**********1 的大作中提到】
: one mentor in your future career (possible)
: HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
: //www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
: //facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
: and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
: //www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
: plus this one:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289
|
y*******a
发帖数: 303 | 50 谢谢你的帮助。文章很有用，我会认真看的。另外，我已经有At的mutant seeds了，已
经开始做实验了。 不知道为什么大家总是能找到一些很好的paper，是平时的积累呢，
还是搜索能力高啊？
【在 c********b 的大作中提到】
: 你可以试试in gel phosphorylation, 这样既可以知道你的是不是kinase,又不用费力
: 去找substrate.
: http://stke.sciencemag.org/cgi/content/abstract/sigtrans;2002/1
: 如果这个蛋白不是对植物病毒的抵抗有帮助的话，先上VIGS来knockdown看表型。载体
: 可以在ABRC买到，10刀一个，control也有卖。
|
|
|
y*******a
发帖数: 303 | 51 miRNA也是我的一个project，嘿嘿～
【在 c********b 的大作中提到】
: Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
:
: project:
|
l**********1
发帖数: 5204 | 52 Continue to 18th floor
not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
non coding RNAs:
References:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
more
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
citedin&uid=15565159
original hint from:
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
NB: if HIV treatment is not relative to 抗性和kinase
Are you sure? centuribob (Planta)
回复]
[ 20 ]
发信人: centuribob (Planta), 信区: Biology
标 题: Re: 怎样设计小实验来确定一个基因编码的蛋白质是protein kina
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 9 2012, 美东)
Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
【在 l**********1 的大作中提到】
: one mentor in your future career (possible)
: HHMI PI Xue-mei Chen PhD:
: //www.hhmi.org/news/chenx_bg.html
: //facultydirectory.ucr.edu/cgi-bin/pub/public_individual.pl?faculty=2491
: and she reviewed paper (2011 or 2012) might relative to your ongoing project:
: //www.bashanfoundation.org/wenbo/wenbobattle.pdf
: plus this one:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21150289
|
l**********1
发帖数: 5204 | 53 每天一早起来 洗漱 化妆后 第一件事 就是 上买买提 bbs Biology
看别人的求的paper 的题目 以及 摘要 和自己的有关联没有
如有 必须取得那个paper 的全文 当然有的时侯就在null floor 楼下的 sendspace
link
里就能立马拿到full text pdf file/s.
还有每晚卸妆后 临睡前也必须来这里check 一次
你坚持这样做三年 1001晨+1001晚 以上 你
成不了能及时获得很好的paper 的你
那就来提诉我吧 ... 赔给你100个包子
原因: 三个臭皮匠 有时侯可能抵一个诸葛亮的一个想法
这里三年 偶遇30个wsn wsnv 千老的急求papers relative to your projects.
抵一个JD Watson的一个想法还是有可能的吧
//en.wikipedia.org/wiki/James_D._Watson
【在 y*******a 的大作中提到】
: 谢谢你的帮助。文章很有用，我会认真看的。另外，我已经有At的mutant seeds了，已
: 经开始做实验了。 不知道为什么大家总是能找到一些很好的paper，是平时的积累呢，
: 还是搜索能力高啊？
|
c********b
发帖数: 363 | 54 I did not see your logic.
I was saying Xuemei did not work on Kinase and resistance. Did her group
publish original research report on HIV?? I bet she has no permission to
work on HIV yet. I will meet her this May, and I can ask her if you want me
to.
As for myself, I am a pure RNA biologist. I work on miRNA, non coding
pathogen RNA, circular RNA, etc. I guess I am pretty familiar with
literatures in plant RNA biology.
【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
|
c********b
发帖数: 363 | 55 I got your point a little bit:
You think non-coding RNA is involved in resistance, so Xuemei's study has a
link there.
That is pretty... NAIVE.
Again, she focus on smRNA metabolism, not function. So the link is like
everything is linked in a celll, directly or indirectly.
【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
|
c********b
发帖数: 363 | 56 "not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
non coding RNAs"
This comments is universally right: all proteins encoding needs non-coding
RNA like tRNAs and rRNAs. So, not being specific leads to nowhere.
【在 l**********1 的大作中提到】
: Continue to 18th floor
: not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs:
: References:
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22312265
: more
: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?db=pubmed&cmd=link&linkname=pubmed_pubmed_
: citedin&uid=15565159
: original hint from:
: http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31644341.html
|
l**********1
发帖数: 5204 | 57 请注意你的用词
>Xuemei又不做抗性和kinase
是"和"而不是"或"
then
what is this?
a)
her Vita:
19. Wenming Wang and Xuemei Chen. HUA ENHANCER3 reveals a role for a
cyclin-dependent protein kinase in the specification of floral organ
identity in Arabidopsis. (2004) Development 131, 3147-
from
//www.plantbiology.ucr.edu/faculty/chen.html
and her review article:
b)
//www.springerlink.com/content/p22k662q1162kp07/
and this:
c)
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20675573
Plant Cell. 2010 Jul;22(7):2156-
Orchestration of the floral transition and floral development in Arabidopsis
by the bifunctional transcription factor APETALA2.
Yant L, Mathieu J, Dinh TT, Ott F, Lanz C, Wollmann H, Chen X, Schmid M.
Source
Max Planck Institute for Developmental Biology, D-72076 Tübingen, Germany.
and UC Riverside
full text link:
//www.plantcell.org/content/22/7/2156.full.pdf
难不成合作项目= 2nd last author did nothing about Kinase?
你是她老公或相好的话 那偶就闪人了 centuribob (Planta) 老大 You are always correct
for her topics.
【在 c********b 的大作中提到】
: Xuemei又不做抗性和kinase，人家做小RNA的代谢
:
: project:
|
l**********1
发帖数: 5204 | 58 //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20023165
full text link:
//www.weigelworld.org/research/publications/2010/pdfs/Rodriguez%
20Development%202010.pdf
even Xue-mei Chen before 2010 never did Arabidopsis cyclin-dependent
kinases and microRNA
after 2011 she should noted that paper.
And You centuribob (Planta) from 2012 now still ignored it?
【在 c********b 的大作中提到】
: "not only Plant but also human HIV treatment should take more care about
: non coding RNAs"
: This comments is universally right: all proteins encoding needs non-coding
: RNA like tRNAs and rRNAs. So, not being specific leads to nowhere.
|
c********b
发帖数: 363 | 59 她postdoc老板是做花的顶尖人物，这两篇提到了kinase，但是focus是花啊.
我没有说我对她特别了解，但是我觉得focus在kinase或抗性是要关注机理，而你提到
的例子都是在关注别的机理时提到了kinase,所以不能算她的focus.
至于你怎么想的，我没兴趣。
【在 l**********1 的大作中提到】
: 请注意你的用词
: >Xuemei又不做抗性和kinase
: 是"和"而不是"或"
: then
: what is this?
: a)
: her Vita:
: 19. Wenming Wang and Xuemei Chen. HUA ENHANCER3 reveals a role for a
: cyclin-dependent protein kinase in the specification of floral organ
: identity in Arabidopsis. (2004) Development 131, 3147-
|
l**********1
发帖数: 5204 | 60 你就差多玛三个字
的关联=XYZ below shown
Xuemei又不做抗性和kinase（XYZ) ，人家做小RNA的代谢
害得我还以为你是她的原同事呢
BTW
既然centuribob (Planta) 的大 是专搞RNA world的
是Yonath Ada 的lab出来的薄厚 /PI 你认识吗? i mean met him/her before whom was PD
from her:
//www.nobelprize.org/nobel_prizes/chemistry/laureates/2009/
//www.weizmann.ac.il/sb/faculty_pages/Yonath/
Weizmann Institute of Science, Rehovot, IL,
The amazing ribosome
link:
//www.euchems-prague2012.cz/files/euchems-adv-210x279-05.pdf
【在 c********b 的大作中提到】
: 她postdoc老板是做花的顶尖人物，这两篇提到了kinase，但是focus是花啊.
: 我没有说我对她特别了解，但是我觉得focus在kinase或抗性是要关注机理，而你提到
: 的例子都是在关注别的机理时提到了kinase,所以不能算她的focus.
: 至于你怎么想的，我没兴趣。
|
