a****o
发帖数: 1786 | 1 Journal Club 1: Paused RNA polymerase and bidirectional transcription
谢绝转载
我来抛砖引玉了，其实不是砖，是坯
In the last issue of 2008, Science published 4 related papers about paused
RNA polymerase and bidirectional transcription. I would like to briefly
summarize the history of these studies and how they would influence our
understanding of transcription.
Paused polymerase
The first well known example of paused (stalling) RNA polymerase was
described about 20 years ago by John Lis and colleagues at Cornell
Uni |
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a****o
发帖数: 1786 | 2 考古呀
Although RNA polymerase only use one strand as template during transcription
, both strands get into RNA polymerase and separate around Mg ++, so
collision is inevitable for head-to-head transcbing RNA polymerases.It is
not like DNA polymerase, which only take one strand of DNA into its active
center.
and
strand |
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b******n
发帖数: 4225 | 3 按照stratagene的说法，综合了fusion的快速和pfuUltra的准确
we couple the fusion polymerase technology with our engineered PfuUltra DNA
polymerase,** hotstart antibody, and proprietary ArchaeMaxx PCR enhancing
factor to achieve extreme accuracy, high specificity, and long
target-length capability while dramatically reducing overall PCR extension
times.
这玩意靠谱不？ |
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j****x
发帖数: 1704 | 4 单从参数上看，这个PfuUltra DNA Polymerase相比Phusion High-Fidelity DNA
Polymerase，还是差了一个档次
没用过PfuUltra，但是Phusion很靠谱
DNA |
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b******n
发帖数: 4225 | 5 PfuUltra II Fusion HS DNA Polymerase
这个是stratagene用来做site-direct mutagenesis kit里面的
号称可以扩增20kb
我们一直用这个做高保真扩展，效果很不错
你有钱就多买几个DNA polymerase来试试 |
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f*******e
发帖数: 354 | 6 买了个signosis的single cell real time PCR kit, 但是你面的东东实在太少了，做一
次预实验就消耗了不少，不知道大家有没有用另外的DNA polymerase, 不至于有CDNA但
是没有聚合酶做PCR啊
看了takara的 LA taq， EX taq，都是用来扩增长片段的，没有提到可以用于扩增非常
少的cDNA。
谁做过的推荐下，非常感谢！ |
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f*******e
发帖数: 354 | 7 我不是要扩增长片段 我只是要做single cell或极少量RNA RT来的PCR，就是常规的RTp
cr 但是模板量极少。kit里都有带的DNA polymerase 但是都非常少 很快就用完了 但是
还剩下很多的cDNA和RNA 用自己的普通taq酶好像不怎么灵 所以请教大家有没有用过什
么NB的酶 很多公司的牛酶都是宣称长片段 高保真 但是没有说高效率（灵敏）的 |
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z*******o
发帖数: 1794 | 8 Just so so, the best polymerase I used before is KOD plus.
DNA |
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b********9
发帖数: 1061 | 9 Want to know how the company produces high fidelity DNA polymerase. The
procedure.
Anyone can help with this?
Thanks |
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d***s
发帖数: 1062 | 10 RNA polymerase II下调是不是transcription就下调了，细胞内mRNA和microRNA的生成
就减少了？谢谢 |
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M*****n
发帖数: 16729 | 11 use T4 DNA polymerase without dNTP,
it will trim the overhang,
double-check manufacturter's manual, because I may have remembered it wrong. |
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w*****g
发帖数: 95 | 12 我实验室用PfuUltra high-fidelity DNA polymerase做mutagensis, 也是长片段pcr的
一个选择。phusion的确是快，原来两天活可以并一天了！ |
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q**********0
发帖数: 335 | 13 Thanks for the above sharing. Not sure how high the incorporate error rate
of phusion or PfuUltra high-fidelity DNA polymerase. Do both of them have
high-fidelity amplification? Thanks. |
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g*******e
发帖数: 156 | 15 版上有经常做overlap extension PCR的朋友吗？
你们都用啥polymerase? 高保真的
我们用Phusion，感觉不是很好
请推荐一款比较好用的吧。谢谢！ |
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c********b
发帖数: 363 | 16 如果两端需要加A，我用Fidelitaq （USB），一般就用Advantage HD DNA polymerase
（clontech）。
基本没问题。 |
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K********g
发帖数: 58 | 17 I already have a couple of proof reading polymerase,
so just wonder which one you use in Surveyor assay,
thanks |
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a***e
发帖数: 1010 | 18 This is a very nice summarization of the recent biggest advancement of the
transcription field.
Although protein coding genes only occupy a small part of the genome, people
have accepted the idea that most of the genome sequences are actually
transcribed. In the last issue of 2008, Science published Lis and colleague
’s work about RNA polymerase II –mediated bi-directional transcription
which excited the people wondering how much we really understand
transcription.
In these papers, researchers |
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D*********t
发帖数: 370 | 19 "About RNA polymerase II colliding, according to their data, the reverse
transcription not only happened in the promoter, but also coding region and
3’-UTR. If these bidirectional transcriptions happened in one cell, this
collide is unavoidable, I guess."
Pol II moves only in one direction on one strand. It can transcribe from
different strands – if the sense transcript is produced from the top strand
,
the antisense will be from the bottom strand. So there won't be any
collision.
in
S
question |
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S*******m
发帖数: 34 | 20 I found the following paragraph on this webpage. I agree with him.
http://www.molecularstation.com/forum/microbiology-forum/20624-pfu-
polymerase-mixed-taq-polymerase.html
Pfu polymerase mixed with Taq polymerase
That won't work. Pfu is a polymerase. It's not capable of
proofreading without polymerizing. So, it won't follow Taq around and
act as a high fidelity proofreader. If you mix the two enzymes, you'll
have some strands of DNA that are high fidelity (which were synthesized
by Pfu), and oth... 阅读全帖 |
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r****o
发帖数: 105 | 21 本文献给YL
（六）兴风作浪的乳糖(lactose)
晚上每天都有人做报告，我觉得让我收获最大的是Bill Studier的报告。本来这个报告是后来才听到的，
但是由于Burgess的模块是唯一的涉及大肠杆菌钟表达蛋白的，我把这一段提前来说说。Studier这老哥是
Brookhaven National Laboratory的，一生研究T7 噬菌体，也是T7 RNA polymerase induction
system(pET 系列质粒)的发明者。
T7 系统在大肠杆菌表达蛋白的应用实在太广泛了，但凡表达蛋白的兄弟姐妹们的不可能不知道这个
系统。长话短说，pET系列的质粒都用T7 promoter来控制基因的表达。T7 promoter只能被T7 RNA
polymerase 识别，而这个咚咚大肠杆菌是没有的。但是有一些溶原菌株,染色体里面已经整合入了由
LacUV promoter和lac operon控制的T7 RNA polymerase 基因片断。如果在细菌培养基里面加入
IPTG, 来诱导T7 RNA polymerase 的表达，就可以启动目的蛋白的表 |
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q*****d
发帖数: 445 | 22 最近要做library, 使用这个实验室的方法进行易错PCR
（http://www.msg.ucsf.edu/agard/Protocols/PCR_Random_Mutagenesis.htm），酶
是NEB的Taq,但是效果一直不是很好，35 cycle PCR的浓度还是很低，30cycle特别的少
，请问
大家有什么方法提高产量吗？还是我的方法不够好，谢谢大家。
PCR Random Mutagenesis
Materials
1. Parental plasmid
2. Oligos surrounding region to be mutagenized
3. Error-prone PCR buffer (10x is 100mM Tris-HCl, pH8.3; 500mM KCl,
70mM MgCl2, 0.1% (w/v) gelatin.)
4. 10mM MnCl2 (stock) (make sure there is no brown coloring to
stock soln; if there is it means... 阅读全帖 |
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w*p
发帖数: 16484 | 23 蛋白结构得诺奖：
2003: Peter Agre and Roderick MacKinnon (Chemistry), Agre "for the
discovery of water channels" and MacKinnon "for structural and mechanistic
studies of ion channels". Structures by MacKinnon and his group began in
1998 with the transmembrane potassium channel 1bl8, and continued with many
others. After this prize, Agre was involved in the structures reported in
2005, 2f2b and 2evu.
2006: Roger Kornberg (Chemistry) "for his studies of the molecular basis
of eukaryotic transcript... 阅读全帖 |
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b**********9
发帖数: 87 | 24 http://www.bio.whu.edu.cn/News_reads.asp?cid=174&id=3053
周 宇
职称职务：研究员
学科专业：生物信息与功能基因组学
研究方向：生物信息学、功能基因组学、RNA组学
实验室位置：生命科学学院6109、6101室
联系电话：027-68756749
Email: [email protected]
/* */
学习经历
1999-09－2003-06 武汉大学 本科 生物学基地班
2003-09－2004-09 武汉大学 硕士 生化与分子生物学
2004-10－2005-07 法国巴黎十一大学 硕士 生物信息与生物统计学
2005-09－2008-12 武汉大学 博士 生化与分子生物学
2005-09－2008-12 法国巴黎十一大学 博士 计算机 (与武汉大学联合培养）
主要工作经历及任职情况
2009-07－2015-05 美国加州大学圣地亚哥分校 博士后
2015-05－至今 武汉大学 研究员
2015-08－至今 武汉大学高等研究院 兼职研究员
主要研究领域及兴趣
近年来发展起来... 阅读全帖 |
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x*********a
发帖数: 906 | 25 Thanks, yes, I see.
lamda prophage encodes T7 RNA polymerase.
The question is in E. coli K12 whether the lamda prophage is the only one
encoding T7 RNA polymerase?
E. coli have many prophages on genome.
Do lamda- E. coli strains still have T7 RNA polymerase? |
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x*********a
发帖数: 906 | 26 Is this true?
In T7 RNA polymerase negative E. coli strain, T7 promoter-driven gene could
be expressed at a low level by other (prophage) RNA polymerases.
Anyone observed/heard the expression of T7 promoter-driven gene on high-copy
plasmid in T7 RNA polymerase negative E. coli strains?
Thanks. |
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C*******e
发帖数: 4348 | 27 1.可能没有全长cDNA
2.可能有全长cDNA，但是用的DNA polymerase没办法从你的模板里p 9kb
解决方法可以有
1.如果对cDNA质量有怀疑，重新制备
2.换DNA polymerase，我用过TAKARA的LA DNA polymerase，不过模板不是cDNA，是细
菌gDNA，
扩了13kb。模板是细菌gDNA还是人/老鼠 gDNA还是cDNA还有区别的，可以参考他们网站
3.既然小段的可以P出来，就重新设计引物，分两段或者分三段甚至四段扩，（互相
overlap)分别扩
好了以后再做mega PCR |
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c********b
发帖数: 363 | 28 normally people use rRNA (like 18S or 28S) as a control, so run on is
general for RNA polymerase but not only for Pol II.
Run-on reflects how many active polymerases were binding to the gene-of-
interest at the moment the cells were freezed. So it can reflect the
transcription activity (I did not stay that it can tell the stability). And
of course, you know nothing is 100% in biology, right?
nuclear run-on, just google it, easy to find. It is not good for short genes
, because less space for pol... 阅读全帖 |
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K**4
发帖数: 1015 | 29 Well, I can not give you an answer to your question like 哪种DNA聚合酶的突变
率最低?
But from my friend's work, I can tell you that for DNA replication, many polymerases are involved, but only one is the primary enzyme. In the case of archaea and eukaryotes, this is Pol II (or better known as Family B DNA polymerase) and in bacteria, this is Pol III. Also note that Pol II and Pol III belong to distinct folds.
In nature, organisms dont need to maintain very reliable polymerases since allowing mutation duri... 阅读全帖 |
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s******9
发帖数: 283 | 30 http://www.genomeweb.com/sequencing/industry-experts-question-c
The group questioning the paper has issues with components of the physics,
enzymology, and chemistry behind the study.
One issue, said Lindsay, is that the study describes using superconducting
materials at the interface of the protein transistor and probes to reduce
signal decay. However, he said, "none of us know of a superconducting
material that works at the same temperature as a polymerase."
Superconducting materials operate at... 阅读全帖 |
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s****l
发帖数: 10462 | 31 有人愿意讨论这里面提及的测序技术吗？优缺点，可行性，第一手经验等等
这里面谁现在是赢家很清楚，但是可见的将来和更远的将来谁会赢？
http://cen.acs.org/articles/92/i33/Next-Gen-Sequencing-Numbers-
全文拷贝如下
试试看图能不能贴上
/1407973177171.jpg
/1408028636124.jpg
OVER STORY
Next-Gen Sequencing Is A Numbers Game
As technical and cost barriers fall, instrument firms move their systems
into research and clinical markets
By Ann M. Thayer
Department: Business
Keywords: instrumentation, gene sequencing, diagnostics, genomics, cancer
[+]Enlarge
09233-cover-Openercxd_17647969-690
A... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 32 Terminators in eukaryotes[edit]
In eukaryotic transcription of mRNAs, terminator signals are recognized by
protein factors that are associated with the RNA polymerase II and which
trigger the termination process. Once the poly-A signals are transcribed
into the mRNA, the proteins cleavage and polyadenylation specificity factor
(CPSF) and cleavage stimulation factor (CstF) transfer from the carboxyl
terminal domain of RNA polymerase II to the poly-A signal. These two factors
then recruit other pr... 阅读全帖 |
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a***k
发帖数: 27 | 33 I am not sure about the effect of removal from water.
But for the temperature, I THINK the DNA will still be "active". The meaning of a
DNA being active is "it still can serve as template for replication and transcription".
Its being active is always associated with the enzyme RNA polymerase and DNA
polymerase. Low temperature does not denature enzymes (usually in the lab,
enzymes are kept under low temperatures. The temperature of the refridgerator
of my department is -70C. The polymerase e |
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o******e
发帖数: 575 | 34 《也谈方舟子“最聪明”“非常适合作科研”》
方舟子的今天的一番自我煽情，真是说可以笑死人。全文付在下面，这里
先引一段：
》我的导师认为我是他见过的最聪明的学生，非常适
》合做科学研究工作，在我申请博士后、研究基金时，
》都给予最强烈的推荐。
英文俗话说，ＹＯＵ ＣＡＮ ＴＡＬＫ ＴＨＥ ＴＡＬＫ，ＣＡＮ
ＹＯＵ ＷＡＬＫ ＴＨＥ ＷＡＬＫ？再简单明了点，就是ＳＨＯＷ
ＭＥ ＴＨＥ ＭＯＮＥＹ。方的导师居然如此高评方舟子，那么我们
不妨先来看看方舟子在读博士期间发表了什么文章：
RNA Polymerase II-associated Protein (RAP) 74 Binds
Tran????ion Factor (TF) IIB and Blocks TFIIB-RAP30 Binding.
S.M. Fang and Z.F. Burton
The Journal of Biological Chemistry, 270, 11703-11709 (1996).
A cDNA encoding RAP74, a General Initiation Factor for
Tra... 阅读全帖 |
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g***j
发帖数: 40861 | 35 【 以下文字转载自 WaterWorld 讨论区 】
发信人: deer2005 (老鹿), 信区: WaterWorld
标 题: 依博拉病（Ebola virus disease）：真相和热点
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Oct 4 13:08:03 2014, 美东)
依博拉病（Ebola virus disease）：真相和热点
博客文章：
http://www.mitbbs.com/pc/pccon.php?id=14439&nid=338895
几天来，由于在德州Dalas发现美国国内首例病例，Ebola成了人们谈论的热点话题，
Ebola相关生化药股也在爆涨中。
Ebola可怕么？它如何传播？如何预防和治疗Ebola？
这里讨论了一些关于Ebola的热点问题：
（一）Ebola的真相
世界卫生组织（WHO）列举的关于Ebola的关键事实：
1. Ebola virus disease (EVD), formerly known as Ebola haemorrhagic
fever, is a severe, often fatal illness in ... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 36 【Filariasis
From Wikipedia, the free encyclopedia
Filariasis
Life cycle of Wuchereria bancrofti, a parasite that causes filariasis
Classification and external resources
Specialty Infectious disease
ICD-10 B74
ICD-9-CM 125.0-125.9
Patient UK Filariasis
MeSH D005368
[edit on Wikidata]
Filariasis is a parasitic disease caused by an infection with roundworms of
the Filarioidea type.[1] These are spread by blood-feeding black flies and
mosquitoes. This disease belongs to the group of d... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 37 12月27日 为什么我要替中国辩护
我要替中国辩护，并不是因为我是一个中国人，而是因为我知道中国就和这世界上绝大
数的国家一样，虽然有很多丑陋的现象，但是他们是受害者。就
象这个犯罪集团里很多的人一样，他们来自各种种族，他们可能充当了工具，但他们不
是制造这一切，谋划这一切的人。虽然经常会暴露中国产品出现问题。但要知道中国是
世界工厂，他们只是打工者，他们只是按照各种雇主提供的配方来生产，他们并不知道
他们会产生怎样的后果。或者这些工人知道后果，但他们只是奴隶，他们又如何去改变
这一切？ 所以，当我的调查不断往前推进的时候，不可避免地会涉及各国的企业，但
这并不表明是针对这个国家或这个国家的人民，而是针对一种社会现实和丑陋现象。就
拿菲律宾来说，菲律宾是一个犯罪猖獗的国家，有很多犯罪分子，但是菲律宾人民却是
这个集团的受害者，他们／她们被绑架，沦为了牺牲品，人体实验对象。一个日本人，
强奸上千名菲律宾女孩，却没有受到惩罚。以前我也提到过，有20个国家的名单，这20
个国家的人民其实都是受害者。现在他们把矛头对准中国，或许仅仅是因为我揭示了他
们图害世界人民的内幕，而我是一个中国人的缘... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 38 12月27日 为什么我要替中国辩护
我要替中国辩护，并不是因为我是一个中国人，而是因为我知道中国就和这世界上绝大
数的国家一样，虽然有很多丑陋的现象，但是他们是受害者。就
象这个犯罪集团里很多的人一样，他们来自各种种族，他们可能充当了工具，但他们不
是制造这一切，谋划这一切的人。虽然经常会暴露中国产品出现问题。但要知道中国是
世界工厂，他们只是打工者，他们只是按照各种雇主提供的配方来生产，他们并不知道
他们会产生怎样的后果。或者这些工人知道后果，但他们只是奴隶，他们又如何去改变
这一切？ 所以，当我的调查不断往前推进的时候，不可避免地会涉及各国的企业，但
这并不表明是针对这个国家或这个国家的人民，而是针对一种社会现实和丑陋现象。就
拿菲律宾来说，菲律宾是一个犯罪猖獗的国家，有很多犯罪分子，但是菲律宾人民却是
这个集团的受害者，他们／她们被绑架，沦为了牺牲品，人体实验对象。一个日本人，
强奸上千名菲律宾女孩，却没有受到惩罚。以前我也提到过，有20个国家的名单，这20
个国家的人民其实都是受害者。现在他们把矛头对准中国，或许仅仅是因为我揭示了他
们图害世界人民的内幕，而我是一个中国人的缘... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 39 12月28日 仔细阅读以下文章
或许这些文章可以告诉你们孩子被伤害病毒的答案。
Astellas Pharma 应该和这些人体实验有莫大的关系！
Founded 2005; 11 years ago
Headquarters 2-5-1, Nihonbashi-Honcho, Chūō-ku, Tokyo 103-8411, Japan
Key people Yoshihiko Katakana
(President and CEO)
Filariasis
From Wikipedia, the free encyclopedia
Filariasis
Life cycle of Wuchereria bancrofti, a parasite that causes filariasis
Classification and external resources
Specialty Infectious disease
ICD-10 B74
ICD-9-CM 125.0-125.9
Patient UK Filariasis
MeSH ... 阅读全帖 |
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k****z
发帖数: 1863 | 40 关于唐和老板已经知道的一些事实
老板实验室有几个博士生
两个华人，一个唐，另外一个貌似台湾人（待确定）姓ku
两个人的论文发表情况（从老板主页看来）：
唐一篇一作plos computational biology, 一篇二作biophysical journal
Asymmetric packaging of polymerases within vesicular stomatitis virus.
Hodges J, Tang X, Landesman MB, Ruedas JB, Ghimire A, Gudheti MV, Perrault J
, Jorgensen EM, Gerton JM, Saffarian S.
Vesicular Stomatitis Virus Polymerase's Strong Affinity to Its Template
Suggests Exotic Transcription Models
Tang X, Bendjennat M, Saffarian S.
ku已经毕业，去哈佛博士后，两篇一作，一篇 biophysical j... 阅读全帖 |
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k****z
发帖数: 1863 | 41 老板实验室有几个博士生
两个华人，一个唐，另外一个貌似台湾人（待确定）姓ku
两个人的论文发表情况（从老板主页看来）：
唐一篇一作plos computational biology, 一篇二作biophysical journal
Asymmetric packaging of polymerases within vesicular stomatitis virus.
Hodges J, Tang X, Landesman MB, Ruedas JB, Ghimire A, Gudheti MV, Perrault J
, Jorgensen EM, Gerton JM, Saffarian S.
Vesicular Stomatitis Virus Polymerase's Strong Affinity to Its Template
Suggests Exotic Transcription Models
Tang X, Bendjennat M, Saffarian S.
ku已经毕业，去哈佛博士后，两篇一作，一篇 biophysical journal， 一篇plos o... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 42 不理解怎么就用完了 买一罐1毫升的polymerase一个反应用10微升，这个可以做100个
反应
疑似病例才多少？
各个大学冰箱里polymerase多了去了
primer一罐200微升，一个反应2微升，也够100个反应了
不成就就把核酸提了寄到美国来做吧
我这儿一天就能给它做一千个没问题
: 不是上面说有人看病试剂盒用完了吗
: 说明后勤工作很不到位
: 现在这里投入资源应该是边际收益最大的地方
:
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x****6
发帖数: 4339 | 43 她有贴具体的分析数据吗？
非编码区域的进化速度不会比编码区域慢，在有的情况下甚至更快，比如人的基因组了
（如果我没记错的话）
并且非编码区的调控序列控制突变 这一说法是错误/误导。
病毒的突变率是由 聚合酶决定的，在新冠这里是 RNA-dependent RNA polymerase。它
也是remdesivir的成药靶点。这种酶是出了名的制造高突变率，因为和它的亲戚 DNA
polymerase比起来，它的蛋白少了一整个结构域。而这个结构域是用来校对聚合过程中
的出错的。 |
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发帖数: 1 | 44 12月27日 为什么我要替中国辩护
我要替中国辩护，并不是因为我是一个中国人，而是因为我知道中国就和这世界上绝大
数的国家一样，虽然有很多丑陋的现象，但是他们是受害者。就
象这个犯罪集团里很多的人一样，他们来自各种种族，他们可能充当了工具，但他们不
是制造这一切，谋划这一切的人。虽然经常会暴露中国产品出现问题。但要知道中国是
世界工厂，他们只是打工者，他们只是按照各种雇主提供的配方来生产，他们并不知道
他们会产生怎样的后果。或者这些工人知道后果，但他们只是奴隶，他们又如何去改变
这一切？ 所以，当我的调查不断往前推进的时候，不可避免地会涉及各国的企业，但
这并不表明是针对这个国家或这个国家的人民，而是针对一种社会现实和丑陋现象。就
拿菲律宾来说，菲律宾是一个犯罪猖獗的国家，有很多犯罪分子，但是菲律宾人民却是
这个集团的受害者，他们／她们被绑架，沦为了牺牲品，人体实验对象。一个日本人，
强奸上千名菲律宾女孩，却没有受到惩罚。以前我也提到过，有20个国家的名单，这20
个国家的人民其实都是受害者。现在他们把矛头对准中国，或许仅仅是因为我揭示了他
们图害世界人民的内幕，而我是一个中国人的缘... 阅读全帖 |
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d******5
发帖数: 4273 | 45 【 以下文字转载自 WaterWorld 讨论区 】
发信人: deer2005 (老鹿), 信区: WaterWorld
标 题: 依博拉病（Ebola virus disease）：真相和热点
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Oct 4 13:08:03 2014, 美东)
依博拉病（Ebola virus disease）：真相和热点
博客文章：
http://www.mitbbs.com/pc/pccon.php?id=14439&nid=338895
几天来，由于在德州Dalas发现美国国内首例病例，Ebola成了人们谈论的热点话题，
Ebola相关生化药股也在爆涨中。
Ebola可怕么？它如何传播？如何预防和治疗Ebola？
这里讨论了一些关于Ebola的热点问题：
（一）Ebola的真相
世界卫生组织（WHO）列举的关于Ebola的关键事实：
1. Ebola virus disease (EVD), formerly known as Ebola haemorrhagic
fever, is a severe, often fatal illness in ... 阅读全帖 |
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n********e
发帖数: 1630 | 47 多谢。一般每个contribution要多少个例子证明呢？ 那么在背景里面提到的，（for
example, xxx virus polymerase has other function, as shown in xxx work. In
this study, we explore additional functions of the polymerase protein) 这个
可以说my research guided other scientists, or my research expanded our
understanding of the field吗
另外背景里的就是，
xxx method is widely used in characterize macromolecules, such as viruses (1
,2), replication complex, ribosome, etc.
我的工作就是1，2。 这能写吗？ 可以说my research provides valuable insights
to .... 吗？ 这样是不是显得很wea... 阅读全帖 |
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d******5
发帖数: 4273 | 48 依博拉病（Ebola virus disease）：真相和热点
博客文章：
http://www.mitbbs.com/pc/pccon.php?id=14439&nid=338895
几天来，由于在德州Dalas发现美国国内首例病例，Ebola成了人们谈论的热点话题，
Ebola相关生化药股也在爆涨中。
Ebola可怕么？它如何传播？如何预防和治疗Ebola？
这里讨论了一些关于Ebola的热点问题：
（一）Ebola的真相
世界卫生组织（WHO）列举的关于Ebola的关键事实：
1. Ebola virus disease (EVD), formerly known as Ebola haemorrhagic
fever, is a severe, often fatal illness in humans.
2. The virus is transmitted to people from wild animals and
spreads in the human population through human-to-human
transmission.
3. The av... 阅读全帖 |
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n**t
发帖数: 45 | 49 【 以下文字转载自 Biology 讨论区,原文如下 】
发信人: royluo ( 罗马情结), 信区: Biology
标 题: 从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记（三）
发信站: Unknown Space - 未名空间 (Thu Apr 28 17:44:52 2005) WWW-POST
本文献给YL
（三） 不溶的sigma32
四月六号早上，我们开始了第一模块的实验，Burgess教授负责。这老兄研究了一辈子E.Coli的RNA polymerase。E.Coli RNA polymerase 核心酶是一个蛋白质复合体，只有合成RNA的活性，却没有
识别DNA的能力。Sigma系列因子能够识别启动子, 并且与核心酶结合，从而实现转录。我们这个实验
的核心主角就是其中一个因子，叫sigma32。Sigma32可以识别heat shock genes的启动子。Sigma 32
过表达在大肠杆菌里面的时候，绝大部分形成了不溶的包涵体(inclusion body),我们的任务就是要用变性
剂溶解变性不溶的蛋白，然后做重折叠。
所有的buffer几乎都已经配好了 |
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r****o
发帖数: 105 | 50 本文献给YL
（三） 不溶的sigma32
四月六号早上，我们开始了第一模块的实验，Burgess教授负责。这老兄研究了一辈子E.Coli的RNA polymerase。E.Coli RNA polymerase 核心酶是一个蛋白质复合体，只有合成RNA的活性，却没有
识别DNA的能力。Sigma系列因子能够识别启动子, 并且与核心酶结合，从而实现转录。我们这个实验
的核心主角就是其中一个因子，叫sigma32。Sigma32可以识别heat shock genes的启动子。Sigma 32
过表达在大肠杆菌里面的时候，绝大部分形成了不溶的包涵体(inclusion body),我们的任务就是要用变性
剂溶解变性不溶的蛋白，然后做重折叠。
所有的buffer几乎都已经配好了，所以直接做就行了。我们先用1% Triton 来溶解细菌本身的一些蛋白，
inclusion body 相当稳定，不溶于triton,所以这一步，绝大部分垃圾就被去掉了。
下一步就是用变性剂来溶解inclusion body。用什么好呢？Burgess教授提到了sarkosyl。sarkosyl(N-十 |
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