m******1
发帖数: 19713 | 1 呵呵，你这一贴，才让我注意到RIBO今天成了我们俱乐部的正式成员了。欢迎欢迎！！
RIBO，你在美国新闻版举证的那些关于HOMO的生物学基础，麻烦你有时间的话给整理个
纲要吧，否则，我们一被问到这类问题，总是哑口无言。谢谢！！！ |
|
d*****r
发帖数: 39446 | 2 【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
Ribo 已经退出本俱乐部, 特此通知. |
|
d*****r
发帖数: 39446 | 3 【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
Ribo 已经退出本俱乐部, 特此通知. |
|
t**********y
发帖数: 374 | 4 练习使用Getopt, 写了下面一小段. 运行的command: perl temp.pl -ribo Y,
结果输出是:
temp.pl -ribo at temp.pl line 16.
错在那儿呢?:( 多谢
--------------------------------------------
use strict;
use warnings;
use IO::File;
use Getopt::Long;
my $usage= "temp.pl -ribo ";
my %options=(
ribo => undef
);
&GetOptions(
'ribo=s' => \$options{ribo}
);
die $usage unless (-s $options{ribo});
if ($options{ribo} eq "Y"){print "good-try\n";}
exit; |
|
d****n
发帖数: 1637 | 5 He should use "defined",
die $usage unless (defined $options{ribo} );
cause %options already has key ribo.
so exists $options{ribo} is always True. |
|
m******1
发帖数: 19713 | 6 所以啊，还是需要有强大的理论基础，所以我才跑来问学生物的。这个wql是个反同的
高手，他的帖子很不好回。他当年和彩虹版的ribo有过很深的讨论，那个ribo是学生物
的，他列出来很多关于同性恋的生物学基础的文献，但是好象仍然没有能够直接证明同
性恋是天生的的文献。。 |
|
t**********y
发帖数: 374 | 7 多谢, 多谢:). 两种修改都对
die $usage unless (exists $options{ribo});
die $usage unless (defined $options{ribo});
能推荐一些好的Getopt::Long 用法的例子吗?
我用-s是看了别人的例子, 不是很懂为什么...... |
|
s******y
发帖数: 28562 | 8 如果是这个原因的话，那么就直接加一般的ATP 好了。
ribo不 ribo什么的，其实是指ribonucleotide 与deoxy-ribonucleotide
来作区别，是怕一些小本什么的犯傻把dATP加进去了。 |
|
k*****e
发帖数: 22013 | 9 【 以下文字转载自 LGBT_News 俱乐部 】
发信人: kaleege (隆冬盖), 信区: LGBT_News
标 题: [合集] 【资料】性取向生物学研究
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Jan 25 10:59:32 2010, 美东)
☆─────────────────────────────────────☆
Ribo (路的尽头是天涯) 于 (Sat Jan 16 15:05:48 2010, 美东) 提到:
前几个月majia111版主大人就叫我整理以前在美新版的发言，可惜搜了下发现全部被那里的版
主删干净了，加上本人太懒。。。借有人提起再总结一次吧。。。homosexuality的研究的
主流观点大概是基因和后天环境共同作用的结果（这里的后天环境并不指代后天教育）：
（from wikipedia)
(1) The American Psychological Association, American Psychiatric Association
, and National Association of Social Workers s |
|
n*******t
发帖数: 7254 | 10 【 以下文字转载自 Rainbow 讨论区 】
发信人: Ribo (路的尽头是天涯), 信区: Rainbow
标 题: Lady Gaga yelled for gay rights...
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Feb 3 22:09:53 2010, 美东)
Geeeez, I love her so much more after I watched this video clip. |
|
L*******e
发帖数: 2202 | 11 我们来个个击破这个Q&A吧，首先是这个常见问题。
我简短的写为：
主流的科学界认识是：同性恋的产生既有先天的因素，也有后天的因素。其中后天的因
素集中在幼儿
期。不管哪种因素，在成年期改变性取向被证明是非常困难，成功率极低，且非人道的
过程。
欢迎大家补充，特别希望生物学医学的大牛来补充一下文献，我记得以前有，（Ribo写
过？）但是好像
找不到了。 |
|
g********d
发帖数: 4174 | 12 我们缺乏象RIBO那样了解生物的对心理学社会学很了解的同志。最重要的焦点问题是同
性平权对小孩的影响。对旁观者来说，科学的事实是有说服力的。其实有很多事实，但
没有人整理出来。而且，我认为社会学的事实比生物的更好理解，而且好象更CONCLUSIVE一些。 |
|
a***n
发帖数: 2632 | 13 记得Ribo回答说，2005年的统计结果表明，同性恋和异性的离婚率没有区别。
如果真是88年就有结果，那说明98年同意同性结婚后，同性的生活更稳定了。当然，那
个88年的结果很值得怀疑，那时候没有同性婚姻，哪来的离婚率。 |
|
g********d
发帖数: 4174 | 14 记得RIBO给过你很多同性恋的生物学证据，你都视而不见。几年过去了，这样的证据越
来越多，比如饶毅的文章
Nature. 2011 Apr 7;472(7341):95-9. Epub 2011 Mar 23.
可是你还是转不过弯来。
既然你不承认同性恋是天生的，但是又支持同性恋的平等权利，可见你也不认为天生不
天生是关键，你为什么还要纠缠这个问题？更何况你的“BORN
GAY本来就是你们编造出来的。”的指责毫无道理。
BORN |
|
m******1
发帖数: 19713 | 15 我怎么觉得就你撒泼得厉害？前边都给你讲得很清楚了，born this way不只是说一定
是基因遗传，born this way的意思是有biological basis，这个ribo以前给过你很多
文献，你就是不看，就只顾闭起眼睛喊“骗人骗人”，那我们有什么办法？ |
|
R**o
发帖数: 311 | 16 如下是我之前的回帖：
从“另外”开始的后面4/5的篇幅你看都没看，就在前面的帖子里说我相信全球变暖是
事实。
我再一次请问我哪里的句子说了我相信全球变暖100％确实了？ 请你直接正面回答，你
是否强
奸了我的观点？
发信人: Ribo (路的尽头是天涯), 信区: USANews
标 题: Re: 谁是骗子？
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Feb 2 00:31:55 2010, 美东)
哈哈。我说的那些话不是我说的，而是我重复Steven Chu说的。你去看看他在youtube
上的很
多演
讲都是这个观点。
另外你在和god，和gay作类比的时候，首先有god为什么是毁灭性的？另外，你类比了
前提，
却逻辑
错误的类比了结果：我在说全球变暖的行动性，而不是说确信度。换句话说，我并没有
说即使
全球变
暖不能100% rule out，我们就要去相信全球变暖这一命题(this is NOT what i have
said，please DO NOT put your words in my mouth.),而你却类比的说，god存在没有
被100% rule out, |
|
y****t
发帖数: 10233 | 17 where did i say
you, ribo, believe global warming?
you get your facts straight first, OK?
mean.
no |
|
G******i
发帖数: 5226 | 18 ☆─────────────────────────────────────☆
jzzhang (爆米花) 于 (Wed Jun 29 10:06:07 2011, 美东) 提到:
VSC
4.29 received
6.16 initial review
☆─────────────────────────────────────☆
jzzhang (爆米花) 于 (Wed Jun 29 10:07:53 2011, 美东) 提到:
VSC 加急了2次都遭拒了 我怕公司真的等不了了 有木有4.29号收到的童鞋
☆─────────────────────────────────────☆
qqfly (qq fly) 于 (Wed Jun 29 10:49:32 2011, 美东) 提到:
VSC
4.29 received
6.29 initial review
中间加急一次被拒
☆─────────────────────────────────────☆
jetchen (飞机) 于 (Wed Jun 29 10:50:21 2011, 美... 阅读全帖 |
|
发帖数: 1 | 19 沾喜气！ big cong！
[在 Ribo (路的尽头是天涯) 的大作中提到：]
：EB1A PP
：
：........... |
|
s****y
发帖数: 18685 | 20 就是那个阿三
是不是算UU第二个炸药奖？
1995-99 Professor, Biochemistry Department, University of Utah and Faculty
Member, Graduate Programs in Biological Chemistry and Molecular Biology.
http://www.mrc-lmb.cam.ac.uk/ribo/homepage/ramak/education.html
Wimberly, B.T., Brodersen, D.E., Clemons, W.M., Jr., Morgan-Warren, R.J.,
Carter, A.P., Vonrhein, C., Hartsch, T., and Ramakrishnan, V. (2000).
Structure of the 30S ribosomal subunit. Nature 407, 327-339.
http://www.nature.com/nature/journal/v407/n6802/abs/407327a0.h |
|
d*g
发帖数: 16592 | 21 包子到此帖为止
发信人: Ribo (路的尽头是天涯), 信区: Tennis
标 题: Re: 现在看球的球迷们
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Jan 29 05:46:43 2011, 美东)
Re |
|
J********i
发帖数: 50662 | 22 我要求拿10黄
包子到此帖为止
发信人: Ribo (路的尽头是天涯), 信区: Tennis
标 题: Re: 现在看球的球迷们
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Jan 29 05:46:43 2011, 美东)
Re |
|
z**n
发帖数: 22303 | 23 和Ribo交流比和你有意义多了，你这样的红卫兵小将般言行只会给自己想要代表的团体抹黑，让大众
越来越不见待，歧视和敌意越来越深。 |
|
t******n
发帖数: 2939 | 24 ☆─────────────────────────────────────☆
rabbit8 (兔子) 于 (Wed Jul 3 16:57:44 2013, 美东) 提到:
明确定义一下，铊党：就是整天发与铊有关的贴子的那一群人。
铊党很烦人，整天发铊贴。
建议开一个铊版，把发铊贴的铊党，请到铊版去。
让水版清静一点。
☆─────────────────────────────────────☆
hanjia (还有暑假) 于 (Wed Jul 3 17:29:12 2013, 美东) 提到:
挺好的，没觉得烦人。
倒是你这种唧唧歪歪赶别人走的很烦人。
既然不爱看，你为啥不自己滚蛋呢？
☆─────────────────────────────────────☆
CleverBeaver (我不是Otter) 于 (Wed Jul 3 17:34:55 2013, 美东) 提到:
Spt lz roll egg asap
☆─────────────────────────────────────☆
xmfdrspeech (1234... 阅读全帖 |
|
m******1
发帖数: 19713 | 25 【 以下文字转载自 USANews 讨论区 】
发信人: Ribo (路的尽头是天涯), 信区: USANews
标 题: Re: 美脱口秀名嘴艾伦甜蜜迎娶小她15岁女友
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Sep 1 03:47:39 2009, 美东)
贴一个今年她在Tulane University的毕业典礼的speech,太喜欢她了！里面提到了她的come out story.
还有一个她在访谈里和McCain对gay marriage的犀利访问： |
|
m******1
发帖数: 19713 | 26 感谢所有支持者，虽然现在没有被批准，但是我不会放弃的。
advil
alixiaoyu
asian
atxt
Beckett
Bigfish7
bigland
bluemood
churchance
Cloudfornia
dannyxz
dephazz
Enimsl
evilolive
fance
fennelyam
fiorio
FlowerLand
foggy
fullbloom
globalized
gloomywu
goooo1111
Heath
hudie
ici
jaff1973
jet2009
jilli
kaleege
killtime
Lake2008
liebling
littlecookie
lmature
LuckyBlue
LXJSmonk
lyy48
majia111
miami128
Milstein
newtenant
nippon
nr205
old0442
pans
peger
ppdd2
QPQT
Qtopia
quovadis
RandomG
Ribo
RightRat
Robinson
rucgeoffrey
shermanxia
shuye |
|
c****e
发帖数: 1842 | 27 ☆─────────────────────────────────────☆
howdy2011 (好呀) 于 (Thu Jun 30 21:00:16 2011, 美东) 提到:
宋丹丹：
听说一个人体内所有细胞核中的DNA都头尾相连总长度大概300亿千米,能在地球和太阳
之间来回100次,连光要走完这段距离都要一天多时间.我们到底了解自己多少?干嘛总想
与自己的DNA抗争干嘛一定要跟别人一样?顺应自己的本能是你的权利只要不违法.爱是上
天赐予的最好礼物无论同性异性只要真心相爱都该得到祝福
姚晨：
宁财神发来短信：真不好意思，把你们都卷进来，我有点毛。不过这次的全民
大讨论也有好处，能够引发对同志人群的关心与思考，这是好事。我回复：没事，
我也支持同性恋。只觉得杜先生应就事论事，骂人就不好了。但拜托您下回写东西，
观点再清楚明确点。要是再找骂，我就懒得帮你了。
路东：
我奶奶，三十岁开始守寡﹑大字不识一个的农妇，一辈子没当上文化人，也不清楚
艺术家是个啥，但她老人家说了“吃饭，喜欢吃甜的你就吃你的甜的，喜欢吃咸的
就吃你的咸的，各吃各的，吃到肚子里自个儿舒坦就行，甭管别人... 阅读全帖 |
|
j*****a
发帖数: 436 | 28 Change line 16 to:
die $usage unless (exists $options{ribo}); |
|
c*********r
发帖数: 1312 | 29 我做了四个RNA-seq样品，前两个是mRNA-seq，后两个是自己用invitrogen的Ribo-
Minus除去rRNA，期望能得到long ncRNA。样品是学校的Genomic core facility制备的
，一个大概$400多，测序和分析是在collaborator那里做的，目前没要钱，所以还不知
道他家的价钱。
但学校Genomic core facility的报价是：2x75 GA v5 kits：$2060/lane.
去年七月份在new mexico的一个institute做了一个咨询，价格大概是这样的：
Given:
- 2 libraries (you have already used the illumina SIPE kit to make paired
end library)
- Request for mRNA sequencing (PE)
- Sea urchin. genome size is ~850Mbases http://www.scienceonline.org/cgi/content/full/314/5801/941 so... 阅读全帖 |
|
v***a
发帖数: 1242 | 30 加到终浓度多少比较合适？
买来的ATP是10mM的。
谢谢~
另，看到NEB上说ATP要ribo的，怎么知道是不是呢？product sheet上也没有说。 |
|
n********k
发帖数: 2818 | 31 IRES stands for Internal Ribo Entry Site if I don't remember wrong...well,
if it is completely in frame, I think you worry shouldn't be whether it
represses the IRES but a different protein being made... |
|
i*****i
发帖数: 154 | 32 最近老板要做RNA-Seq看lncRNA的表达。
Illumina的Kit要做PolyA的selection。
但是有人说有些lncRNA是没有polyA尾巴的，所以我问问版上的大侠，大概有多少
lncRNA是没有polyA尾巴的。
是不是用Ribo-zero 处理sample做library更合适一些？
谢谢 |
|
j*p
发帖数: 411 | 33 大部分(>90%)lncRNA有polyA. Ribo-zero 数据远不如polyA selected数据来得平滑.
just a trade off, up 2 you |
|
j*p
发帖数: 411 | 34 1. 180M估计是HiSeq2000 pair-end。pair-end 会产生两个文件，每一个文件大概有
100M reads，每一对read都互相对应。有时候能产生更多的数据，我反正是没见过有
380M这么多的。
2. 如果只想知道普通gene表达，30M reads应该是足够多了。那些做HiSeq的多数是想
要知道例如LncRNA，eRNA之类低表达的基因（需要ChIPseq），或者是想看看有没有不
同alternative splicing， circular RNA等。一般讲数据多，read长，分析后得出的
结果越靠谱。
3. 不同的library construction也会有影响，总的来说，polyA selection会比Ribo 0
，数据看上去要平滑，缺点就是不能够detect没有polyA的gene（废话）。
4. 具体问题具体对待吧。 |
|
i*****i
发帖数: 154 | 35 谢谢JCP的帮忙。
因为我们的RNA质量不是很高，担心ployA筛选丢掉的东西比较多，目前倾向于用ribo-
zero。 |
|
j*p
发帖数: 411 | 36 1. 如果只想测量已知lncRNA的表达量差异，80M 101bp 应该够了，如果是human 样品。
2. 如果想发现新的lncRNA，200M 101bp比较合适（这也得看你做的体系是否比较特别
，如果是，那应该会有novel lncRNA）。
3. biological replicates比一个样品测得深来得重要。理由(a)transcriptome
assembly已经不是什么新闻，没有novelty；(b)有replicate才有statistics，forget
about cufflinks p-value with only one replicate；(3)如果细胞是in vivo 或者从
组织来，replicates' variation 会比你想象的大。
4. 如果是用ribo 0，reads打75折。
5. 如果是做strand specific library，不要用那种号称4小时就能做完的kit，我看过
不少于5个不同实验样品，很明显可以看到90%reads在正确的strand上，10%在错误的
strand 上（很难判断是在反链上还是由于反链没有除干净）... 阅读全帖 |
|
c*********r
发帖数: 1312 | 37 理论上够了，关键看你用什么试剂盒来做library。和有经验的sequencing facility交
流交流。
测低浓度RNA不要用nanodrop，用Qubit HS(High Sensitivity)或者bioanalyzer。
我去年暑假做的，500 ng可以作常规的RNA-seq，而且当时担心Ribo-Zero那一步会不会
有很多损失。实际上现在需要的RNA量可以比这个低很多。
单细胞的测序也开始流行，就是成本高。。。
buffer |
|
m******1
发帖数: 19713 | 38 此版支持者名单：
advil
alixiaoyu
asian
atxt
Beckett
Bigfish7
bigland
bluemood
churchance
Cloudfornia
dannyxz
dephazz
Enimsl
evilolive
fance
fennelyam
fiorio
FlowerLand
foggy
fullbloom
globalized
gloomywu
goooo1111
Heath
hudie
ici
jaff1973
jet2009
jilli
kaleege
killtime
Lake2008
liebling
littlecookie
lmature
LuckyBlue
LXJSmonk
lyy48
majia111
miami128
Milstein
newtenant
nippon
nr205
old0442
pans
peger
ppdd2
QPQT
Qtopia
quovadis
RandomG
Ribo
RightRat
Robinson
rucgeoffrey
shermanxia
shuye
syd612
tearsp |
|
m****s
发帖数: 18160 | 39 ☆─────────────────────────────────────☆
hudie (hudie) 于 (Tue Jan 19 20:18:11 2010, 美东) 提到:
关于queernews，我来做个FAQ，请站务再次认真考虑开版，谢谢！！！
提要：
为什么需要queernews版？
开queernews版，有很多人支持吗？
有很多与同性恋有关的新闻吗？
开个俱乐部就好了，或者去别的新闻版面讨论，为什么一定要公共版面？
已经有了两个同志版，再开新版是重复吗？
买买提拒绝queernews的申请，最终也不利于买买提的发展。
支持者名单
************************************************
************************************************
【为什么需要queernews版？】
引用马甲同学http://www.mitbbs.com/article/board/31286325_0.html
1。mitbbs做为最大的海外华人论坛，拥有大量的同志、双性恋及易性人。他们需要一
个... 阅读全帖 |
|
m****s
发帖数: 18160 | 40 ☆─────────────────────────────────────☆
chinayale (chinayale) 于 (Mon Jan 11 20:50:49 2010, 北京) 提到:
1 投诉人(ID)
chinayale
2 投诉对象及职务(限版主）
kicolly
royalex2009
willhung
3 投诉标题
投诉美新版长期包庇污言秽语人士和肆意删贴！
4 投诉目标(更改处理决定/更改板规/弹劾板主...)
要求版主对于滥用职权的行为进行道歉，并对个别流氓ID诸如lczlcz，yourtt，piyaoke，Commissar等进行处理！
5 投诉理由及证据
刚发现本人最近刊登的美国新闻都被无故删掉，请版主解释！我刊登的这些新闻都是发
生在美国的新闻，为什么会被删掉？难道发生在美国的和同性婚姻有关的新闻都不算美
国新闻吗？请问版主这是什么标准？！
在删除我转发的这些新闻的同时，版主们对于像lczlcz这种满口污言秽语肆意攻击同性
恋黑人印第安人以及其它弱势群体的帖子却眼开眼闭，强烈要求美新版版主给出解释！
我刊登的美国众多的通过同性婚姻的... 阅读全帖 |
|
m*********k
发帖数: 10521 | 41 [WBCenter] biok Jan 29. ● tennis 版申请代发包子
10*488=4880
成功奖励 10 伪币的用户: XS2009, Lukas, alay, simon1000, lxinzheng, Jackguy, foxboro, odome, biok, fairchild, haiduc, bee, Carrpool, gosummerod, dpg, chilema, berylyytt, churchance, praetor, Subboy, diehard, tobenoir, chp, gogle, smthiid, fifaxyj, asus, KevinGarnet, tottizl, streetl, captainli, vernon, taolele, QuK, zaoqi, siriusliu, round2, clive, code11, djmj, novastar, bahou, windmill, fortys, elmtang, ZOI, wanjeep, peachgcm, wilsontour,... 阅读全帖 |
|
m*********k
发帖数: 10521 | 42 "[WaterWorld]
thirdman Jul 3. ● 独立日的包子!!!"
成功奖励 10 伪币的用户: Sadaharu, cangyuan, lvus, Acartia, catla,
bluerain0909, shaya, GeauxTigers, graceWA, southnorth, xiaodaigua, guaibaoma
, manwu, shoufinder, jiezhou71, jkzh, zaaw, wy2012, Rewards, bairen, plus,
soul613, UUESAU, holdzhu, jjyymit, onion2010, loso, getababy, cm1988,
jinfang, RSH, shida, Dovee, lyqaijerry, BayArea999, shxhqh, shuishui567,
biyehe, smartfan, joay, baoziyang, bookface, wbwb, bbdou, rainjq, gigiwaiwai
, KeepLoving, honeydew10... 阅读全帖 |
|
m******1
发帖数: 19713 | 43 SUPPORT！
这个主意我想过很久了，曾经都想过编一本小册子，印发出去，但是，一直都觉得工程
太大。我们先来个网络版吧，先收集一下都有哪些问题，有几大类，然后再慢慢想答案。
我想弄这个，是因为有些领域的东西不是每个人都懂，比如象HOMO的生物学基础这类的
问题，我觉得有些专门搞生物的比如Ribo，就是专家，如果不是读了大量相关的PAPER
，说不出那些话。如果生物、法律、社会学等各个领域的专家们都把他们知道的东西概
括总结给大家，那会是很造福同志群体的事。
如果网络版搞的很好的话，我们可以再考虑弄印刷版。 |
|
g********d
发帖数: 4174 | 44 对你在USANEWS上的帖子印象深刻，能不能请你在有空的时候把那些很有价值的信息整
理出来？ |
|
m******1
发帖数: 19713 | 45 感谢所有支持者，虽然现在没有被批准，但是我不会放弃的。
advil
alixiaoyu
asian
atxt
Beckett
Bigfish7
bigland
bluemood
churchance
Cloudfornia
dannyxz
dephazz
Enimsl
evilolive
fance
fennelyam
fiorio
FlowerLand
foggy
fullbloom
globalized
gloomywu
goooo1111
Heath
hudie
ici
jaff1973
jet2009
jilli
kaleege
killtime
Lake2008
liebling
littlecookie
lmature
LuckyBlue
LXJSmonk
lyy48
majia111
miami128
Milstein
newtenant
nippon
nr205
old0442
pans
peger
ppdd2
QPQT
Qtopia
quovadis
RandomG
Ribo
RightRat
Robinson
rucgeoffrey
shermanxia
shuye |
|
g********d
发帖数: 4174 | 46 赞好文。不知道Ribo或是别人有没有熟悉心理学和社会学方面的文献的，要是能给出一
些原始文献来支持（1）-（3）的结论就好了。
那里的版
研究的
）：
Association
factors that
including
sexual
majority of |
|
