c********n
发帖数: 225 | 1 谈谈和蛋白打交道的日子 （一）
序
笔者已经做了多年和蛋白相关的科研与服务，产品研发生产以及产业化。在这里分享一
下与蛋白打交道这些年带来的一些感想。其实所有的科学研究都是用来解决人类已经和
即将遇到的各种各样的问题的，只有解决了问题才会有更大的存在价值。
第一篇 DNA测序， Sanger Style - 纪念Frederick Sanger
2013年11月20号，Frederick Sanger 去世了， 享年95岁。Sanger是DNA测序之父，获
得过两次诺贝尔奖， 一个是1958年蛋白测序， 另一个是1980年DNA测序。虽然DNA结构
发现的比蛋白晚， 但毕竟是genetic code，master script。ATCG四个碱基的组合比蛋
白的20个氨基酸的天文数字组合可更容易研究找规律了。人天生就是个好奇的动物，
最喜欢找规律, 尤其喜欢从简单的地方入手，所以围绕DNA的研究在Watson-Crick的碱
基配对这个简单地规律被发现以后，起来的就比蛋白快了很多。其实DNA和蛋白， 就像
是帅才和将才， 他们的用处是不同的，需要出色的帅才（DNA）订好了方向，能干的将... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 2 谈谈和蛋白打交道的日子 （一）
序
笔者已经做了多年和蛋白相关的科研与服务，产品研发生产以及产业化。在这里分享一
下与蛋白打交道这些年带来的一些感想。其实所有的科学研究都是用来解决人类已经和
即将遇到的各种各样的问题的，只有解决了问题才会有更大的存在价值。
第一篇 DNA测序， Sanger Style - 纪念Frederick Sanger
2013年11月20号，Frederick Sanger 去世了， 享年95岁。Sanger是DNA测序之父，获
得过两次诺贝尔奖， 一个是1958年蛋白测序， 另一个是1980年DNA测序。虽然DNA结构
发现的比蛋白晚， 但毕竟是genetic code，master script。ATCG四个碱基的组合比蛋
白的20个氨基酸的天文数字组合可更容易研究找规律了。人天生就是个好奇的动物，
最喜欢找规律, 尤其喜欢从简单的地方入手，所以围绕DNA的研究在Watson-Crick的碱
基配对这个简单地规律被发现以后，起来的就比蛋白快了很多。其实DNA和蛋白， 就像
是帅才和将才， 他们的用处是不同的，需要出色的帅才（DNA）订好了方向，能干的将... 阅读全帖 |
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t*******w
发帖数: 107 | 3 以前sanger过plasmids，对于sanger PCR产物没有经验，问个弱智问题
用F和R primer amplify一个gene以后，需要 sanger PCR 产物
这种情况下，能直接使用PCR的primer来 sanger吗？不知道没有5' extra nt会不会影
响sanger reading
如果 不可行的话，sanger primer的design要离5' end 至少多远呢？ |
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o*****s
发帖数: 1445 | 4 写的真好，就像温家宝说的，出事了就“请大家把我忘记”。不要来个sanger2，3事，
记忆中sanger，etc. etc.
另外，谢谢sanger的重要信息，原来华师妹子喜欢女上位。sanger我来教你一套穷人攒
机的办法。是这样的，你们north NJ，有钱人很多。你可以在craigslist上看一眼，租
房子的话搞套旧的bose 321，买房子就上bose lifestyle。那些机器新的都是2，3000
，甚至4000块都有。但是哪，因为穷人不懂啊。事实上是这样的，bose 321和
lifestyle，我都有。他们背后都有1个叫optical audio inlet的接口。然后哪，你要
买的是一个电视机，一个蓝光player。蓝光craigslist上带wifi的就20多，30块。这货
的质量和做工差的难以想象。跟个山寨货差不多。丝毫没有高档电器的范。然后哪，你
要买一个高级的旧蓝光，背后有optical audio output的。这样，通过蓝光连电视机，
给1080的视频信号。通过optical audio连bose 321。这样一启动，哇，震撼的效果就
来了。外加省老钱... 阅读全帖 |
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g**********y
发帖数: 423 | 5 Below are two SNPs I obtained for two samples from Exom DNAseq and Sanger.
From Sanger's results, it seems both SNPs are heterozygous, while GATK(v3.2)
call one sample as homozygous.
Does this mean we still need to do filtering based on sequencing depth,
which is hard filtering, then why do we need the machine learning-based soft
filtering?
If we need to do filtering based on sequencing depth, what threshold would
you recommend?
Sample1:GATK Sample2:GATK Sanger for both samples Sample1:IGV Sampl... 阅读全帖 |
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s****r
发帖数: 736 | 6 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: sanger 封 Eppi 在 Virginia
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Tue Sep 30 13:17:32 2008)
【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
由于 Eppi 在 Virginia 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 3 天。
版主:sanger
Tue Sep 30 13:17:22 2008 |
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s****r
发帖数: 736 | 7 【 以下文字转载自 Notice 讨论区 】
发信人: deliver (自动发信系统), 信区:
标 题: sanger 封 anila 在 Virginia
发信站: BBS 未名空间站自动发信系统 (Tue Sep 30 13:19:29 2008)
【此篇文章是由自动发信系统所张贴】
由于 anila 在 Virginia 版的 人身攻击 行为，
被暂时取消在本版的发文权力 3 天。
版主:sanger
Tue Sep 30 13:19:23 2008 |
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s****r
发帖数: 736 | 8 哥啊，我好久没来，发现只有你关心我 lol
在纽约郊区住得有一段了。认识了杂七杂八的人，见识了乱七八糟的事。版聚性质的
hiking，bbq也参加了几次。结果...结果是不会再去了。女神，偶尔来一次，都是豪车
接送，wsn能搭句讪就谢天谢地了；剩女次次都来，可她们，见过一次也就够了（不好
意思，我话重了）。
看板上，哥说华师女的事。我虽然心有不愿，但在这也算有了些见闻亲历。不论华师女
还是复旦女，与其他理工女最大的不同是眼界和谈吐。她们在学校的时候，闲，所以游
历四方博览群书。在NYC，也没闲着。博物馆音乐厅，歌剧话剧都有涉猎。仅就我而言
，与她们坐下交谈时，我每每都有新的收获，感觉自己在这个或那个方面有提高有上升
。这种愉悦感，不是你我能从普通理工女博士那里获取的。
话题尺度再大一点。当一群人在维信群里或者在聚会中肆无忌惮谈性爱肢势时，'女上'
永远是这群人的最爱。然而，对诸多理工男女来说，这仿若就是一种奢求。
不论怎么说，我是矮矬穷屌丝。blue ray player, 音响，发电机这类，高端的上不去
，底端的整不来。最后想想还是别折腾了。见过聊过走过，知足了。如果真有一天我或
者... 阅读全帖 |
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w***e
发帖数: 1331 | 9 老欧你没注意看，sanger这是在show off, 简单讲就是他date过华师和复旦的女生，女
上，最近打算另觅新欢，怕人家爆尿，先来打个招呼。。。 看来Pfizer最近形式不错
哈。。。。
你那些包啊，音响啊。。啥的。。。too late ...sanger已经把事办了。。。 哈 |
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T**********t
发帖数: 1604 | 10 只能答一下第二个问题：
sanger测序用的引物是质粒测序的标准引物还是自己设计的？你说的往后隔了好远是多
远？Sanger测序的前30-50个base基本都是乱的，没有太大参考意义。所以一般设计测
序引物都会在插入位点的前后至少隔开50bp以上的距离，否则你就要损失一段序列读不
出来了。 |
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t*******w
发帖数: 107 | 11 也就是说，这种情况下，sanger primer和PCR product, anneal后，template的5‘ 完
全没有任何extra bases,
这种情况下不会影响sanger reading对吧？
这样，就方便了 |
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r**********e
发帖数: 587 | 12 其实是个很基本的问题。
我们一般都用pcr－sanger sequencing来测比如有没有突变，只是看有或者没有
我现在需要知道这个位点的突变的相对精确的allele frequency，比如20% vs 50%的区别
那么我直接sanger sequencing，ab1文件的两种颜色的peak height的差别是否能真实
反映allele frequency的差别呢？ |
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h********0
发帖数: 12056 | 13 其实，曼德拉对世界的危害不小， 贡献是零，Sanger 对世界都是正能量。
两次获诺贝尔奖。曼德拉的和平奖是最没营养的诺奖，比文学奖还差。 |
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s******y
发帖数: 17729 | 14 不得不说，sanger两次诺奖对生物锁男都伤害很大
要是没有他的工作，也许很多锁男就不会掉进生物这个烂坑不是
测个啥鸟序列啊，爱啥啥，让丫呆着不是挺好的，折腾烧进去一堆钱不说，反正也不是
锁男的钱，尼玛坑进去一堆锁男，那个可是肉身啊，跌进坑里就很难满血满魔了不是 |
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t*******r
发帖数: 364 | 15 ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/resources/theses/
值得作为毕业论文的模板 |
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f**********r
发帖数: 18251 | 16 【 以下文字转载自 ECUST 讨论区 】
发信人: oestrus (Frostmourne hungers.), 信区: ECUST
标 题: Re: sanger shopping的季节又快到了
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Dec 25 11:53:55 2012, 美东)
您老这是典型的瞎指路。这种女生丢地上都没人要。华理要是有男生需要绿卡，愿意接
盘的话，直接跑法拉盛的理发店，找老板娘要信息。或者去华人诊所都ok。前提是要有
份工作，哪怕是postdoc。
这种一般有2类：1爸爸来美国。但是有一技之长，就是按摩，做饭。身份黑了以后，再
上法院做难民。不外是64，法轮功，计划生育。这样身份就没问题。接下来就是靠一技
之长，最后办绿卡，就是eb3什么的。前后长达10多年。最后能赶在小孩考大学前把小
孩接出来读大学就算成功。但是，这种小孩都是读的极烂无比的大学。整个人生screw
up。然后，生活极其混乱。平时在chinatown出门说是夫妻，全是假的。就是一对男女
，把被子搬一起了。就跟很多外地女生跑美国，跟bf睡然后说这是我哥。你他妈跟你哥
劈腿吗？
2是女的来美... 阅读全帖 |
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f**********r
发帖数: 18251 | 17 【 以下文字转载自 ECUST 讨论区 】
发信人: oestrus (Frostmourne hungers.), 信区: ECUST
标 题: Re: sanger shopping的季节又快到了
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Dec 25 11:53:55 2012, 美东)
您老这是典型的瞎指路。这种女生丢地上都没人要。华理要是有男生需要绿卡，愿意接
盘的话，直接跑法拉盛的理发店，找老板娘要信息。或者去华人诊所都ok。前提是要有
份工作，哪怕是postdoc。
这种一般有2类：1爸爸来美国。但是有一技之长，就是按摩，做饭。身份黑了以后，再
上法院做难民。不外是64，法轮功，计划生育。这样身份就没问题。接下来就是靠一技
之长，最后办绿卡，就是eb3什么的。前后长达10多年。最后能赶在小孩考大学前把小
孩接出来读大学就算成功。但是，这种小孩都是读的极烂无比的大学。整个人生screw
up。然后，生活极其混乱。平时在chinatown出门说是夫妻，全是假的。就是一对男女
，把被子搬一起了。就跟很多外地女生跑美国，跟bf睡然后说这是我哥。你他妈跟你哥
劈腿吗？
2是女的来美... 阅读全帖 |
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f**********r
发帖数: 18251 | 18 【 以下文字转载自 ECUST 讨论区 】
发信人: oestrus (Frostmourne hungers.), 信区: ECUST
标 题: Re: sanger shopping的季节又快到了
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Dec 25 11:53:55 2012, 美东)
您老这是典型的瞎指路。这种女生丢地上都没人要。华理要是有男生需要绿卡，愿意接
盘的话，直接跑法拉盛的理发店，找老板娘要信息。或者去华人诊所都ok。前提是要有
份工作，哪怕是postdoc。
这种一般有2类：1爸爸来美国。但是有一技之长，就是按摩，做饭。身份黑了以后，再
上法院做难民。不外是64，法轮功，计划生育。这样身份就没问题。接下来就是靠一技
之长，最后办绿卡，就是eb3什么的。前后长达10多年。最后能赶在小孩考大学前把小
孩接出来读大学就算成功。但是，这种小孩都是读的极烂无比的大学。整个人生screw
up。然后，生活极其混乱。平时在chinatown出门说是夫妻，全是假的。就是一对男女
，把被子搬一起了。就跟很多外地女生跑美国，跟bf睡然后说这是我哥。你他妈跟你哥
劈腿吗？
2是女的来美... 阅读全帖 |
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o*****s
发帖数: 1445 | 19 我擦，90后还用的着这么费力吗？90后学生就是鸡，鸡就是学生。开个is250，带到
short hill mall买衣服，买包，买化妆品就上了。这还是指在nyc的90后。要是类似
SIT,rutgers univ.，那就开个lexus，吃个饭，看场电影，show一下你的生活品位就上
床了。操90后很cheap的一件事情，跟去chinatown找个韩国鸡发泄一样丢人。
我们说的都是泡大纽约地区81-85年的高盛，高学历，高收入，高品位，高傲，高贵的
高级剩女。
你不懂女人的心里。女生一般25-27岁，MBA or cs/economics/math/stat major phd，
进nyc前都是非处了。然后就dating了。那个时候都是要求很高的。然后混到快30岁，
其实心里要什么样的男人都很清楚了。都是符合底线就deal了。有点像option快过期了
，跳水甩卖一样。
这时候根本不要你什么帅啊，唱歌好听啊，会跳国标啊。都是干净就行了；爱听歌就行
了；带的出去就行了。就是说不要找个科研男，凤凰男，经典华理男就行了。
sanger啊，人生就这么一次啊。抓紧机遇，赶紧努力，把nyc的高级剩女... 阅读全帖 |
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o*****s
发帖数: 1445 | 20 sanger，就等着看你的youtube video了。跟那个开range rover sports的lin一样。到
时候就看见你和一个nyc的华师女生在apartment里被包围，果断拿出semiauto的
shotgun
突围。最后和小马哥那样弹尽人亡，身上穿的一件hugo boss白色大衣，都是枪眼和鲜
血。跟小马哥那么
帅。然后腿上中枪，浑身是血的拍着audi q5叫女友走人，自己殿后。我们就等着您这
样的黑堡英
雄给华理男生在nyc版面正名了。 |
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o*****s
发帖数: 1445 | 21 sanger，就等着看你的youtube video了。跟那个开range rover sports的lin一样。到
时候就看见你和一个nyc的华师女生在apartment里被包围，果断拿出semiauto的
shotgun
突围。最后和小马哥那样弹尽人亡，身上穿的一件hugo boss白色大衣，都是枪眼和鲜
血。跟小马哥那么
帅。然后腿上中枪，浑身是血的拍着audi q5叫女友走人，自己殿后。我们就等着您这
样的黑堡英
雄给华理男生在nyc版面正名了。 |
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o******n
发帖数: 511 | 22 没找到,都是收费的.如果自己把反向引物测出来的序列弄个reverse complement然后比
对感觉不可靠. 有什么免费软件可以生成contig?
sanger测序问题:
用模板加引物,理论上测出来的序列是从引物后面第一个碱基开始显示,但实际又往后隔
了好远,这样正常吗?
谢谢~~~ |
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a*********n
发帖数: 2526 | 23 老人家吃了半辈子同位素，居然能活95
听cohen说，sanger一般只有一个实验员，大部分实验都自己上。。。 |
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a********k
发帖数: 2273 | 24 我觉得比CNS，Sanger老兄差远了。
我还觉得，一公影响的下一代比三老先生多。君不见状元们毅然投奔一公大师。 |
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h*****9
发帖数: 4028 | 25 学生物的不被Sanger发明的技术影响的实验室，恐怕不多。真心巨牛超牛。 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 26 Dozen Ys ago,
auto sequencer ABI Prism 3100 or 3700
15 Ys ago ABI 310 or 373 already didn't use Sanger isotope labelling..
Pls refer,
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10220426
Ps:
matrix used almost above types then.. |
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l**********1
发帖数: 5204 | 27 Dozen Ys ago,
auto sequencer ABI Prism 3100 or 3700
15 Ys ago ABI 310 or 373 already didn't use Sanger isotope labelling..
Pls refer,
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10220426
Ps:
matrix used almost above types then.. |
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s*****g
发帖数: 7857 | 28 “又做了几遍不记得了，最后很成功，
一个气泡也没有！功夫不负有心人。这时看看表已经是早上5点多了。Bus没有了，就走
路回家。 直到今天都还可以感受到那个夏天清晨清凉的空气的的味道。中间要路过一
个学校养鸡场， 是做IgY抗体用的。那天黎明的鸡鸣声就好像是在给自己打气。回家睡
了不到三个小时又回到实验室，那天的Sanger DNA测序是成功的。”
天道酬勤！
你的师兄们和前辈们给你这个勤奋，有悟性，会变通的人很好的training! |
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l********e
发帖数: 415 | 29 NGS has a much higher error rate. This is just a sequencing error, I think.
Trust the sanger result. |
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s******r
发帖数: 1245 | 30 看一下vcf里每个位点的depth和quality score多少，可能太低默认扔掉了
sanger是怎么做的？光看peak overlap不能知道percentage，要准的话得做subcloning
然后测几十个克隆
2)
soft |
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r**********e
发帖数: 587 | 31 很感谢。虽然笨但很好
我就是想问下，如果从最简单最快的pcr sanger sequencing看到差别，那么有多少把
握／信心接下来的精确定量会有显著差别呢？ |
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l**********1
发帖数: 5204 | 32 linker-based PCR
plus
iMapper soft:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18974167
//geocachingsoftware.com/imapper.html
more details
please to to E-Book
Chapter 2:
its link:
FTP://ftp.sanger.ac.uk/pub4/theses/kong/chapter2.pdf
citation:
>Based on these expectations, a web-based server called iMapper (Insertional
Mutagenesis Mapping and Analysis Tool) was developed for the efficient
analysis of insertion site sequence reads against vertebrate and
invertebrate Ensembl genomes. Taking linker-based PCR se... 阅读全帖 |
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s****l
发帖数: 10462 | 33 有人愿意讨论这里面提及的测序技术吗？优缺点，可行性，第一手经验等等
这里面谁现在是赢家很清楚，但是可见的将来和更远的将来谁会赢？
http://cen.acs.org/articles/92/i33/Next-Gen-Sequencing-Numbers-
全文拷贝如下
试试看图能不能贴上
/1407973177171.jpg
/1408028636124.jpg
OVER STORY
Next-Gen Sequencing Is A Numbers Game
As technical and cost barriers fall, instrument firms move their systems
into research and clinical markets
By Ann M. Thayer
Department: Business
Keywords: instrumentation, gene sequencing, diagnostics, genomics, cancer
[+]Enlarge
09233-cover-Openercxd_17647969-690
A... 阅读全帖 |
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s****r
发帖数: 736 | 34 ☆─────────────────────────────────────☆
sanger (不是songer，是sanger！) 于 (Sun Sep 28 23:32:13 2008) 提到:
maillist已经够烦的了
不用到mmt也来斗气的
再说
说那些也没意思啊
☆─────────────────────────────────────☆
Eppi (艾苤) 于 (Mon Sep 29 09:13:20 2008) 提到:
请问，具体来讲，是哪一句？
☆─────────────────────────────────────☆
sanger (不是songer，是sanger！) 于 (Mon Sep 29 19:34:40 2008) 提到:
TO eppi
"你他妈的才XX！..."
posted on Thu Sep 25 09:58:55 2008
☆─────────────────────────────────────☆
sanger (不是songer，是sanger！) 于 (Mon Sep 29 19:39: |
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l****z
发帖数: 29846 | 35 by Jammie
Gee, you don’t suppose they leaked this information to make Obama look good
, do you? Ironically, Obama’s stooge Eric Holder supposedly is
investigating the source of the leak.
Internal State Department emails reportedly show the White House
cooperated with a journalist whose revelations about an anti-Iran
cyberattack are now the subject of a high-profile leak probe.
The Washington Times reported Monday on emails, from late 2011 to early
2012, obtained by the nonprofit Freedom ... 阅读全帖 |
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c***1
发帖数: 652 | 36 【 以下文字转载自 ECUST 讨论区 】
发信人: sanger (不是songer，是sanger！), 信区: ECUST
标 题: Re: sanger啊，blu ray player买了吗？
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Oct 4 01:03:03 2013, 美东)
哥啊，我好久没来，发现只有你关心我 lol
在纽约郊区住得有一段了。认识了杂七杂八的人，见识了乱七八糟的事。版聚性质的
hiking，bbq也参加了几次。结果...结果是不会再去了。女神，偶尔来一次，都是豪车
接送，wsn能搭句讪就谢天谢地了；剩女次次都来，可她们，见过一次也就够了（不好
意思，我话重了）。
看板上，哥说华师女的事。我虽然心有不愿，但在这也算有了些见闻亲历。不论华师女
还是复旦女，与其他理工女最大的不同是眼界和谈吐。她们在学校的时候，闲，所以游
历四方博览群书。在NYC，也没闲着。博物馆音乐厅，歌剧话剧都有涉猎。仅就我而言
，与她们坐下交谈时，我每每都有新的收获，感觉自己在这个或那个方面有提高有上升
。这种愉悦感，不是你我能从普通理工女博士那里获取的。
话题尺度再大一点。当一群人... 阅读全帖 |
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c***1
发帖数: 652 | 37 【 以下文字转载自 ECUST 讨论区 】
发信人: sanger (不是songer，是sanger！), 信区: ECUST
标 题: Re: sanger啊，blu ray player买了吗？
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Oct 4 01:03:03 2013, 美东)
哥啊，我好久没来，发现只有你关心我 lol
在纽约郊区住得有一段了。认识了杂七杂八的人，见识了乱七八糟的事。版聚性质的
hiking，bbq也参加了几次。结果...结果是不会再去了。女神，偶尔来一次，都是豪车
接送，wsn能搭句讪就谢天谢地了；剩女次次都来，可她们，见过一次也就够了（不好
意思，我话重了）。
看板上，哥说华师女的事。我虽然心有不愿，但在这也算有了些见闻亲历。不论华师女
还是复旦女，与其他理工女最大的不同是眼界和谈吐。她们在学校的时候，闲，所以游
历四方博览群书。在NYC，也没闲着。博物馆音乐厅，歌剧话剧都有涉猎。仅就我而言
，与她们坐下交谈时，我每每都有新的收获，感觉自己在这个或那个方面有提高有上升
。这种愉悦感，不是你我能从普通理工女博士那里获取的。
话题尺度再大一点。当一群人... 阅读全帖 |
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s****r
发帖数: 736 | 39 ☆─────────────────────────────────────☆
jollyl (砖石老五) 于 (Wed Oct 17 22:41:30 2007) 提到:
人气要比这高了:)
☆─────────────────────────────────────☆
sanger (不是songer，是sanger！) 于 (Wed Oct 17 23:10:49 2007) 提到:
"顶顶，没抢到SF……orz
我在灌纯水……orz, 大家千万不要学我……XD……Orz……
请LX，LS各位和LZ轻松一点 …… 囧rz"
我要来拜一下这个兄弟!
☆─────────────────────────────────────☆
sanger (不是songer，是sanger！) 于 (Wed Oct 17 23:11:59 2007) 提到:
Hehe,可惜首发在这里太容易抢了
惭愧啊
谁去maillist帮我贴个广告，我给发包子
☆─────────────────────────────────────☆
Iloveyoyo (小猫猫很 |
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s****r
发帖数: 736 | 40 ☆─────────────────────────────────────☆
sanger (不是songer，是sanger！) 于 (Thu May 31 22:31:08 2007) 提到:
欢迎来到处女地
愿每一个来维州的在维州的都能圆自己梦!
新同学
三言两语，简单的介绍介绍自己吧
有什么问题
你们可以写信给acss,也可以发贴到这里
我们会尽我们所能给你们解答
另外，作为一个小小的礼物
签到的我代表版务给你们发包子！
☆─────────────────────────────────────☆
cityfish (千万不要相信流血七天仍然不会死的怪物) 于 (Thu May 31 22:34:51 2007) 提到:
签到
☆─────────────────────────────────────☆
sanger (不是songer，是sanger！) 于 (Thu May 31 22:37:56 2007) 提到:
你是老江湖了
还在这里骗包子？
怎么着也上个嫩点的mj
介绍自己的时候，编得像一点
呵呵
搞不好，我的包子就被你骗去了 |
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o*****s
发帖数: 1445 | 41 【 以下文字转载自 ChemEng 讨论区 】
发信人: sanger (不是songer，是sanger！), 信区: ChemEng
标 题: 求教萃取剂的选择 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jun 3 05:03:05 2012, 美东)
发信人: sanger (不是songer，是sanger！), 信区: Chemistry
标 题: 求教萃取剂的选择
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jun 3 05:02:20 2012, 美东)
由于试验需要，在水相反应中必须添加一定量表面活性剂。在反应结束后，又必须去除
该表面活性剂。现在基本的想法用有机物萃取分离表面活性剂。但是该表面活性剂亲水
性很高（HLB ~10）， 一般的有机物，如hexane，diethyl ether，都无法将其萃取出
来。所以在此求教各位xdjm，有什么好的萃取剂推荐么？ |
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o*****s
发帖数: 1445 | 42 【 以下文字转载自 ChemEng 讨论区 】
发信人: sanger (不是songer，是sanger！), 信区: ChemEng
标 题: 求教萃取剂的选择 (转载)
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jun 3 05:03:05 2012, 美东)
发信人: sanger (不是songer，是sanger！), 信区: Chemistry
标 题: 求教萃取剂的选择
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jun 3 05:02:20 2012, 美东)
由于试验需要，在水相反应中必须添加一定量表面活性剂。在反应结束后，又必须去除
该表面活性剂。现在基本的想法用有机物萃取分离表面活性剂。但是该表面活性剂亲水
性很高（HLB ~10）， 一般的有机物，如hexane，diethyl ether，都无法将其萃取出
来。所以在此求教各位xdjm，有什么好的萃取剂推荐么？ |
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t****t
发帖数: 86 | 43 "In a career of a little over 40 years, Sanger published ～70 papers of
original research, from “The nitrogen of the potato” in 1942 (Neuberger
and Sanger 1942) to “Nucleotide sequence of bacteriophage lambda DNA” in
1982 (Sanger et al. 1982). In addition, he was responsible for ～20 reviews,
award lectures, and meeting abstracts, as well as a number of papers from
members of his laboratory that he did not put his name on."
Ref: Would Fred Sanger Get Funded Today? Stanley Fields, GENETICS June 1,
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s***e
发帖数: 793 | 44 I agree.
First: PCR's principle is very beautiful.
Life, by nature, is the process of DNA replication. PCR employs it so
beautifully.
Second: PCR is also very practical.
Despite the theoretical beauty, it is also amazing PCR is actually working
and damn reliable and stable(comparing with other bio experiments).
Third: PCR opens the door of possibilities.
A feasible and efficient way to manipulate DNA hence RNA hence protein.
It is very hard to find a biological publication without PCR.
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l**********1
发帖数: 5204 | 45 454 GS FLX+
● Up to 1000bp
● 99.997% accuracy
● 1M reads, 700bp
0.7 Gbase/day
● Homopolymer issue
● Cost ~$14K for run
● $500K instrument
$20K/Gbase
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or soon later you can try:
Ion Torrent PGM
● Long Reads and Fast
● No optics, CMOS chip sensor
● Uses standard nucleotides
● Up to 300bp reads (going to 400bp)
● >99.5% raw
● >99.999% consensus
● 318 (11M wells) >1Gbase in 3 hours
● 8 Gbase/day possible
● Micron sized well, 22mmx22mm chip
moving to 1 Billion wells per chip
● $700 per run (1 Gbas... 阅读全帖 |
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s*****3
发帖数: 20 | 46 Here are my 2 cents.
1) If you only look at one or a few SNP(s) for that gene, Taqman SNP
analysis (in 384-well or even in 96-well format) can be your choice. This is
much
cheaper and faster than Sanger or NGS.
2) If you look at 10-100 SNPs, Openarray SNP analysis (using OpenArray or
Quantstudio) can be your choice.
3) If you look at a large number of SNPs, e.g >100 SNPS (though I doubt it
since you only look at one gene), you could consider NGS target resequencing
such as Ion Torrent custom Am... 阅读全帖 |
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b**********n
发帖数: 2812 | 48 With Quest to Cool Fuel Rods Stumbling, U.S. Sees ‘Weeks’ of Struggle
By NORIMITSU ONISHI, DAVID E. SANGER and MATTHEW L. WALD
TOKYO — Amid widening alarm in the United States and elsewhere about Japan
’s nuclear crisis, military fire trucks began spraying cooling water on
spent fuel rods at the country’s stricken nuclear power station late
Thursday after earlier efforts to cool the rods failed, Japanese officials
said.
The United States’ top nuclear official followed up his bleak appraisal of
t... 阅读全帖 |
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R****a
发帖数: 6858 | 49 ZT:浅析我国未来两级入轨空天飞机方案
来源: 大鱼翅 于 2013-09-11 08:45:05 [档案] [博客] [旧帖] [给我悄悄话] 本文已
被阅读：2次 字体：调大/调小/重置 | 加入书签 | 打印 | 所有跟帖 | 加跟贴 | 查
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浅析我国未来两级入轨空天飞机方案
2013-08-31 13:34:21
[导语]：1986年3月，《中国高技术研究发展计划纲要》获得批示，这项计划就是促进
中国高新科技发展的“863计划”，在未来的15年内取得7个领域重要突破，其中航天技
术排在第二位，也就是“863-2”，其下确定了两个方向：第一，大型运载火箭与天地
往返运输系统，即204项目；第二，载人空间站及其应用，即205项目。1989年，863－
204专家组在《大型运载火箭及天地往返运输系统可行性及概念研究综合报告》中提出
了未来中国航天发展的“两步走”战略：要在2015年左右研制出两级水平起降的空天飞
机，以适应未来空间站大系统发展的需要。
图1两级入轨平台是未来空天飞机发展的方向之一
1.空天飞机的概念与特点
空天飞机属于跨大气层飞行器，从字面上不难看... 阅读全帖 |
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d*******3
发帖数: 8598 | 50 通过科学研究的刊物读原始论文和综述等文献，首先是学习的一步，是学术成长的必需
；其后成为研究人员的日常工作的一部分，所谓活到老学到老对自然科学研究者来说不
是例外而是常规，停止读文献之日基本是退出科学前沿之时。
读文献时，可以经常想其他人的文章与自己目前的研究能否有关系，也可以想文献对自
己以后的方向的影响。经常这么要求自己可能从文献得到帮助，不过多数时候阅读文献
并不一定马上有用，可能更多如儿童时代看故事书一般好玩，久而久之实际成为研究人
员的生活习惯。
实验科学的研究人员，如果自己动手，时间最多的是花在做实验。对生命科学的人来说
，研究生和博士后阶段都是自己做实验，而任助理教授以后，自己做多少实验因人而异
，现实是做实验比较好的人最后一般也不做实验了，有些人误认为做了“老板” 不宜
做实验，荒废了自己实验室最佳研究人员。英国传统提倡教授做实验，发育生物学的诺
贝尔奖得主John Gurdon、分子生物学的诺贝尔奖得主Fred Sanger 等皆一直自己动手
做实验。Sanger 的美国学生Gerald Rubin在休斯医学研究所HHMI的内部机构Janelia
Farm也提倡教授做... 阅读全帖 |
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