s******9
发帖数: 283 | 1 NCBI protein database一般都有标注吧。
FEATURES Location/Qualifiers
source 1..503
/organism="Homo sapiens"
/db_xref="taxon:9606"
gene 1..503
/gene="TGFBR1"
/gene_synonym="ALK5"
/gene_synonym="SKR4"
Protein 1..503
/gene="TGFBR1"
/gene_synonym="ALK5"
/gene_synonym="SKR4"
... 阅读全帖 |
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c**i
发帖数: 6973 | 2 Peter Landers, New Breast Cancer Drug Found Deep in the Sea. Wall Street
Journal, Jan. 4, 2010.
http://online.wsj.com/article/SB1000142405274870411150457605977
("A study found it [Halaven] extended the life of patients with advanced
breast cancer by about two-and-1/2 months, to 13 months")
My comment:
(a) Eisai Co., Ltd. エーザイ株式会社
(a public company; headquarters Tokyo; established in 1941 by Toyoji NAITO
内藤 豊次 as Nohon Eisai Co., Ltd. 日本衛材（衛生材料の略。具体的には絆創膏
や包帯の事))
ja.wikipedia.org
(b) eribulin
htt... 阅读全帖 |
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c**i
发帖数: 6973 | 3 Peter Landers, New Breast Cancer Drug Found Deep in the Sea. Wall Street
Journal, Jan. 4, 2010.
http://online.wsj.com/article/SB1000142405274870411150457605977
("A study found it [Halaven] extended the life of patients with advanced
breast cancer by about two-and-1/2 months, to 13 months")
My comment:
(a) Eisai Co., Ltd. エーザイ株式会社
(a public company; headquarters Tokyo; established in 1941 by Toyoji NAITO
内藤 豊次 as Nohon Eisai Co., Ltd. 日本衛材（衛生材料の略。具体的には絆創膏
や包帯の事))
ja.wikipedia.org
(b) eribulin
htt... 阅读全帖 |
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c**i
发帖数: 6973 | 4 Peter Landers, New Breast Cancer Drug Found Deep in the Sea. Wall Street
Journal, Jan. 4, 2010.
http://online.wsj.com/article/SB1000142405274870411150457605977
("A study found it [Halaven] extended the life of patients with advanced
breast cancer by about two-and-1/2 months, to 13 months")
My comment:
(a) Eisai Co., Ltd. エーザイ株式会社
(a public company; headquarters Tokyo; established in 1941 by Toyoji NAITO
内藤 豊次 as Nohon Eisai Co., Ltd. 日本衛材（衛生材料の略。具体的には絆創膏
や包帯の事))
ja.wikipedia.org
(b) eribulin
htt... 阅读全帖 |
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E*********n
发帖数: 144 | 5 Proline is non essential amino acid. Threonine is essential amino acid.You
can get threonine from foods such as lentils, peanuts, eggs, milk, pork,
beef, chicken, soybeans, chickpeas, hummus, snap beans and asparagus. You
can get proline from almost all the above foods too. Supplementing proline-
rich proteins doesn't necessarily boost collagen production. You also need
Vitamin C. Topical use of Vitamin C and Retinol A (tretinoin) are more
efficient than oral proline rich supplement for younger ... 阅读全帖 |
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T*******r
发帖数: 333 | 6 对你的“数学推导”我无话可说了，我没那么多时间教你，这是你中学老师的责任，我
认输。
给你一个实际的例子。
http://baike.baidu.com/view/4830066.htm
尼龙菌
这种奇异的生物只是一种细菌。 Flavobacterium, Sp. K172 ， aka “尼龙菌”。
1975年在一个废水池中由日本科学家发现。（勤劳的日本科研员， 你说他们怎么会去
废水池捞东西的？ 难道是找忍者神龟？） 它所分泌的酶可以帮助它消化尼龙。而尼龙
， 是一种在1935年才出现的人造材料。这种细菌，虽然其使用的酶效率比较低（只有
一般酶的２％）， 但是它可以靠这种方式吃尼龙过活， 更有意思的是， 它们无法
享用普通细菌食用的碳水化合物； 而且， 这种细菌的出现并非只有一次。
也就是说， 这是一种在1935年后才出现的生物！
感谢分子生物学， 我们已经弄清了尼龙菌出现的机理； 抑或说， 尼龙菌【演化】的机理： 移码突变（frameshift mutation）
所谓移码突变， 指的是DNA序列中的一个单位（AGCT）出现丢失或插值， 导致整个序列整体移位的情况。
仅仅是这一个意... 阅读全帖 |
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L******e
发帖数: 679 | 7 My boss want me to find out exactly how many protein kinases (among them,
how many tyrosine kinases and serine/threonine kinases) and lipid kinases in
human beings.
I chekced several references and a website " www.kinase.com'
I got the follows:
1, 518 kinases. 90 are Tyrosine kinases.
I cannot find the number of serine/threonine kinases and lipid kinases, even
though i searched many published papers.
Roughly, the protein kinase was mainly classified as TK and STK, but there
is still some other |
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r****i
发帖数: 323 | 8 J Recept Signal Transduct Res. 2010 Dec;30(6):372-5. Epub 2010 Aug 23.
On the roles of Mg in the activation of G proteins.
Birnbaumer L, Zurita AR.
Laboratory of Neurobiology, National Institute of Environmental Health
Sciences, NIH, DHHS, Research Triangle Park, NC27709, USA. birnbau1@niehs.
nih.gov
Abstract
In this review, we highlight the evolution of our knowledge about the way Mg
(2+) participates in the activation of heterotrimeric G proteins, beginning
with its requirement in hormonal sti... 阅读全帖 |
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A*G
发帖数: 256 | 9 ACG codes for threonine. AMP activated kinase, which will be activated by
the phosphorylation on 172 threonine, was a major target in our group when I
was a PhD student. |
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s********o
发帖数: 3319 | 10 D. 100% sure. the key word here is "cytoplasmic enzyme". some protein
kinases require phosphorylation at serine/threonine for activation.
A is for membrane-bound protein.
B &C for extracellular (secretory) protein.
E for example mannose-6 P but not in Serine or Threonine . |
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l*****7
发帖数: 8463 | 11 Cancer researcher retracts 19 studies at once
with 23 comments
jcheng
Jin Cheng
A former cancer biologist at the Moffitt Cancer Center in Tampa, Florida has
retracted 19 papers from a single journal.
Jin Cheng, who studies how ovarian cancer develops, withdrew 19 papers from
the Journal of Biological Chemistry originally published over the last 15
years, and corrected another. All of the retractions are for image
manipulation.
For example, here’s the notice for “Activation of phosphatidylinosito... 阅读全帖 |
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d******8
发帖数: 3017 | 12 Almonds
Nutritional value per 100 g (3.5 oz)
Energy 2,408 kJ (576 kcal)
Carbohydrates 21.69 g
- Starch 0.74 g
- Sugars 3.89 g
- Lactose 0.00 g
- Dietary fiber 12.2 g
Fat 49.42 g
- saturated 3.731 g
- monounsaturated 30.889 g
- polyunsaturated 12.070 g
Protein 21.22 g
- Tryptophan 0.214 g
- Threonine 0.598 g
- Isoleucine 0.702 g
- Leucine 1.488 g
- Lysine 0.580 g
- Methionine 0.151 g
- Cystine 0.189 g
- Phenylalanine 1.120 g
- Tyrosine 0.452 g
- Valine 0.817 g
- Arginine 2.446 g
- Histidine 0.... 阅读全帖 |
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r****n
发帖数: 1088 | 13 随便发表一下我的研究成果：
phosphorus, magnesium, zinc, potassium
glycine, creatine, monohydrate, taurine, threonine,
glutamine, leucine, valine, isoleucine, maltodextrin, cocoa, alkali,
lecithin,
cellulose gum, acesulfame, potassium,sucralose,
磷，镁，锌，钾
甘氨酸，肌氨酸，一水合物，牛磺酸，苏氨酸，
谷氨酰胺，亮氨酸，缬氨酸，异亮氨酸，麦芽糖糊精，可可碱，卵磷脂，
纤维素胶，双氧恶噻嗪钾，三氯蔗糖， |
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G***a
发帖数: 27294 | 14 (2)既然说到了氨基酸，那就再仔细看看氨基酸。
人体有８种氨基酸是不能自己合成的，必须通过外界摄取，所以叫essential amino
acid
其中这三种，目前食谱是肯定缺乏：Leucine,Threonine,Phenylalanine
分别有关：肌肉合成；免疫抗体合成；肾上腺素前体合成
还有有一种可能缺乏：Valine－－保证愈伤，和氮代谢
而这几种重要的氨基酸，都可以从一种食物中获取：花生。
这其实就是问题核心所在。很多靠吃素减肥的人，很害怕加坚果。觉得“油”是很增肥
的东西。
所以猛控油，猛控油。你也ｅｘｐｌｉｃｉｔｌｙ的说了，你要“低油少盐”
炒菜油是应该低。但是天然食物中的油，不能一点没有。否则氨基酸和不饱和脂肪酸都
没有来源
给血液指标带来很大的危险。这个问题也和第一个问题ｃｏｒｒｅｌａｔｅ。
三大能量物：脂肪，蛋白质，和糖，必须得至少吃一个。所以我个人不同意把前两个都
给压到最低
一旦这样做，糖必然超标，只要你吃７００卡以上就超 （目前食谱约１１００－１２
００）
C |
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S***I
发帖数: 2737 | 15 學習了，謝謝。
Phenylalanine是甜味的那個AA，diet coke里也有是吧？
Leucine,Threonine， 不吃肉會成問題，
那堅果 （花生，或腰果那樣大小的）， 一天吃10顆夠補這兩個AA嗎？ |
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l******8
发帖数: 9475 | 16 奶牛没白养， 懂得孝敬你。
【化学成份】
多疣壁虚含铝、铁、钙、镁、钡、铍、镉、钴、铬、铜、锰、镍、铅、磷、锶、锌、锆
等17种元素。
此外，壁虎含脂肪油10.5%，甘氨酸（glycine），谷氨酸（glutamic acid），脯氨酸
（proline），丙氨酸（alanine），天冬氨酸（alpartic acid），精氨酸（arginine
），丝氨酸（serine），缬氨酸（valine），苏氨酸（threonine），异亮氨酸（
isoleucine），组氨酸（histidine0等14种氨基酸，无机元素以钠为主，其次是钾、磷
、钙、镁、铁、硅、铝、钛、铬、锰、铅、钡、铜、锆、银、锶、锡等18种元素。
【药理作用】壁虎组织液：壁虎制成浸出液注射剂治疗某些慢性病，对于神经衰弱，肠
胃疾患、消化不良、食欲不振等。
【炮制】净制：除去灰土，勿使尾部脱落。切制：竹片插在嘴巴下方提起，用文火烤干
即可。
【性味】味咸；性寒；小毒
【归经】肝经
【功能主治】祛风定惊；解毒散结。主历节风痛；四肢不遂；惊痫；破伤风，痈疬；疠
风；风癣；噎膈
【用法用量】内服：煎汤，2-5g；研末，每次1-2... 阅读全帖 |
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r****o
发帖数: 105 | 17 My lab happens to study one important type of O-glycosylation.
O-glycosylations are carbohydrates linked through hydroxyl groups of
serine or threonine of the protein. There are different types of
O-glycosylations. They have different functions.
(1)O-GalNAc(mucin type)
Originally, O-glycosylation only refers to this type. This type
of glycosylation has usually extended chains(but less branched than
N-glycans). The first carbohydrate moiety linking to the protein is
N-acetylgalactosa |
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v***a
发帖数: 1242 | 18 tyrosine kinase除了可以phosphorylate tyrosine residues，还能phosphorylate其
它的residues吗？比如Threonine和Serine？谢谢！ |
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J***2
发帖数: 444 | 19 1.Histone H3 Thr-3 Phosphorylation by Haspin Positions Aurora B at
Centromeres in Mitosis
Fangwei Wang, Jun Dai, John R. Daum, Ewa Niedzialkowska, Budhaditya
Banerjee, P. Todd Stukenberg, Gary J. Gorbsky, and Jonathan M. G. Higgins
Published online August 12 2010; 10.1126/science.1189435 (Science
Express Reports)
2.Survivin Reads Phosphorylated Histone H3 Threonine 3 to Activate the
Mitotic Kinase Aurora B
Alexander E. Kelly, Cristina Ghenoiu, John Z. Xue, Christian Zierhut,
Hiroshi |
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J********n
发帖数: 534 | 20 如果你表达的是kinase，很容易自己修饰自己。
如果你表达的非kinase, 有少许可能被修饰，可能在Serine, Threonine, Tyrosine,
Histidine, Aspartate被修饰。
一旦被修饰而你又很介意的话，可以co express一些phosphatase, 或者invitro
dephosphorylation. |
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v******l
发帖数: 235 | 21 请帮忙发到我的信箱 j********[email protected].
http://www.annualreviews.org/doi/pdf/10.1146/annurev.physiol.70.113006.100651
Annu Rev Physiol. 2008;70:329-55.
Molecular physiology of the WNK kinases.
Kahle KT, Ring AM, Lifton RP.
Howard Hughes Medical Institute, Department of Genetics, Yale University
School of Medicine, New Haven, CT 06510, USA.
Abstract
Mutations in the serine-threonine kinases WNK1 and WNK4 cause a Mendelian
disease featuring hypertension and hyperkalemia. In vitro and in vivo
studies have |
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r******y
发帖数: 21907 | 22 我也在做plasma membrane protein的phosphorylation，不过我是植物蛋白，加triton
x-
100或者sds让membrane protein soluble，然后centrifugation 取上清，sonication
是打
碎细胞膜吧，对膜蛋白不好吧。ELISA你用的什么抗体？我估计要用phosphotyrisine
threonine的
antibodies·做Western |
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s********8
发帖数: 619 | 23 做表达用的,这个serine是个conserved residue. |
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i*********0
发帖数: 915 | 24 一般都没事，我做的一个gene就是t变成了s，不过很保守，都是sq／tq domain。 |
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h**********8
发帖数: 650 | 25 不好说， 我做的一个蛋白， 某位点也是这样突变。
问题是， 这个位点报道可以磷酸化， 不知道如此突变会影响磷酸化效率么。 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 27 Agree
otherwise next setp likes
Site-directed mutagenesis etc
who believe? |
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M*****n
发帖数: 16729 | 28 看看是不是SNP.
表以为别的species是S， 你这儿就没有SNP。
S变成T的SNP是常见的。
现在Genome测得多了，所谓的wildtype是相对的，没有绝对的wildtype.
所谓的reference 其实是most common variant，不是绝对的wild type. |
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s******s
发帖数: 13035 | 29 重新克隆呗，能费啥事？也说不定ref是错的，经常的事情 |
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s********8
发帖数: 619 | 30 又测序了一个克隆,目前为止没有突变.看来还是polymerase的问题.
问题是这个基因有2.5kb,还得接着测,但愿没突变了. |
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h******y
发帖数: 55 | 31 把突变那个和没突变的做个比较就知道要不要紧了啊。
没突变那个是不能省的，要不就说不清。
多设计几个引物，多挑几个克隆，一次全测了，不要挤牙膏啊。 |
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s********8
发帖数: 619 | 32 一次全测?我比较小农,我一般一次只测一个克隆, 序列没问题再接着往下测,帮老板省
钱啊... |
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l**********1
发帖数: 5204 | 33 fi you Boss need to save money (for avoiding at least five positive clones plus two control clones for
one time outside sequencing)
is equal wasting your time or lowering your work accuracy/integrality's amplitude,
then You should Move on to next PI ASAP. That is better for you
even you are 凤凰N,
but this field was and is and future is also 烧钱的领域 只适合贵族干 不适合凤凰PI his/her Lab. |
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s******s
发帖数: 13035 | 34 一个测序也就三四刀，你一天工资要100刀了吧？一天浪费的试剂更多了吧？
浪费时间在等测序上，其实不是给老板省钱 |
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s********8
发帖数: 619 | 35 大家对我一次测一个克隆这么有意见啊,呵呵,我等测序的时候还干别的有很多事啊,不
适只做这一个实验呀.不过已经拿到了测序结果了,克隆没问题可以接着往下做了:)
其实同时还做了一个5k的,主要是测这个耽误了两天. |
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o********r
发帖数: 775 | 36
同学，现在实验时间往往比钱更重要，如果你做的是热门课题，至少有3个顶级实验室
同时在做这个，你只要晚一点就被scoop。
我们做实验验证的时候，同一个PCR基本用3种酶同时扩增，有一次（第一次测序失败）
同时用了3种酶，两侧各3个引物，27个PCR，54个测序一起做。 |
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y*******a
发帖数: 303 | 38 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase? |
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y*******a
发帖数: 303 | 39 如题，已知一个基因的信息，prediction是Serine/threonine-protein kinase，但不
知道substrate，怎样从实验的角度证明是protein kinase? |
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l**********1
发帖数: 5204 | 40 Phosphorylation of 蘇氨酸（Threonine） Thr 对cancer
metabolism重要不?
pls refer
Cell (2013) 152: 290-303.
cited
>AMPK inhibits the Vps34 complex by phosphorylating
>T163/S165 in Vps34 and therefore suppresses
>overall PI(3)P production
web link:
HTTP : //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23332761
metabolism
or |
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l**********1
发帖数: 5204 | 41 Phosphorylation of 蘇氨酸（Threonine） Thr 对cancer
metabolism重要不?
pls refer
Cell (2013) 152: 290-303.
cited
>AMPK inhibits the Vps34 complex by phosphorylating
>T163/S165 in Vps34 and therefore suppresses
>overall PI(3)P production
web link:
HTTP : //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23332761
metabolism
or |
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k******0
发帖数: 1073 | 42 CNS灌水大牛11g的文章应用率低得好像有些可怜，2009年的文章还被引用不到50，即使
2011，12的较新文章，引用率也很低。离国际大牛还远着。
1. [PDF] Serine/threonine phosphatases: mechanism through structure
Y Shi - Cell, 2009 - bio.ijs.si
Cited by 236
2. Structure and mechanism of an amino acid antiporter
…, L Zhou, S Dang, L Sun, X Li, J Wang, Y Shi - Science …, 2009 -
Cited by 84
3. Structural basis for sequence-specific recognition of DNA by TAL
effectors
Cited by 51
4. Structure of a presenilin family intramembrane aspartate protease
X Li, S Dang, C Yan,... 阅读全帖 |
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k******0
发帖数: 1073 | 43 根据google scholar， CNS灌水大牛11g的文章应用率低得好像有些可怜，2009年的文
章还被引用不到50，即使2011，12的较新文章，引用率也很低。离国际大牛还远着。
1. [PDF] Serine/threonine phosphatases: mechanism through structure
Y Shi - Cell, 2009 - bio.ijs.si
Cited by 236
2. Structure and mechanism of an amino acid antiporter
…, L Zhou, S Dang, L Sun, X Li, J Wang, Y Shi - Science …, 2009 -
Cited by 84
3. Structural basis for sequence-specific recognition of DNA by TAL
effectors
Cited by 51
4. Structure of a presenilin family intramembrane aspartate protease
X ... 阅读全帖 |
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i****g
发帖数: 3896 | 44 施一公近五年引用次数最高的文章就是这篇“Serine/Threonine Phosphatases:
Mechanism through Structure ”，Web of Science查询是186次，但这是一篇Review
，并非研究论文，讨论引用次数没有意义。
施一公近五年研究论文引用次数最高的是2009年的Science文章“Structure and
Mechanism of an Amino Acid Antiporter ”，仅68次。
谢晓亮2009年后引用次数最高的研究论文为2010年的Science文章“Quantifying E-
coli Proteome and Transcriptome with Single-Molecule Sensitivity in Single
Cells ”，为255次。
庄小威2009年后引用最高的研究论文是2010年的“Breaking the Diffraction Barrier
王晓东2009年后引用最高的研究论文是2009年的Cell“Receptor Interacting Protein
Kinase-3 De... 阅读全帖 |
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s*****1
发帖数: 273 | 45 This is my collection over the last two years. Hope it will be of some help
to other test-takers.
gastrogastrostomy 胃胃吻合术;
genioglossus 颏舌肌;
glyceryl guaiacolate 愈创木酚甘油醚;
glycyl glycine N-甘氨酰甘氨酸
Threonine 苏氨酸［氨基酸类药］
Propionyl-CoA carboxylase 丙酰基-CoA羧化酶;丙酰辅酶A羧化酶
ophthalmoplegia n.眼肌麻痹,眼肌瘫痪;以眼的运动神经麻痹为特征的疾病;此病往往
发生于重症肌无力、肉毒中毒、维生素B1缺乏和颅内神经疾病.
Ketoglutarate 酮戊二酸
Wernicke center 韦尼克中枢(言语中枢〕
gluconeogenesis 糖原异生[作用];糖异生
Pyruvate 丙酮酸盐;丙酮酸
carboxylase 羧化酶
Acetyl 乙酰
avidin 阿维丁;抗生物素蛋白;卵白素;亲和素〔分〕
Alopecia |
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c*******9
发帖数: 122 | 46 A is not right for sure.
I am thinking E: cause golgi adds 0-oligosaccharides to serine and threonine
.
Not sure |
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d*****x
发帖数: 96 | 47 Phosphorylation usually occurs on serine, threonine, and tyrosine residues
in eukaryotic proteins |
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