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全部话题 - 话题: 位点
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d*********o
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1
http://science.caixin.com/2020-03-10/101526576.html?originReferrer=weibo_caixinwang
bioRxiv论文的通讯作者之一、中国科学院西双版纳热带植物园副研究员Alice
Catherine Hughes对财新记者表示,“人工干预没有任何证据,这种病毒显然(
clearly)是从野生动物起源和进化而来的。”
研究认为,来自蝙蝠的冠状病毒可能提供了新冠病毒的基因骨架,与蝙蝠或其他野生动
物的进一步重组事件,则使它获得了S蛋白、RBD和多碱基剪切位点
【财新网】(实习记者 黄晏浩 记者 徐路易)新冠病毒又一项“特殊性”在自然界中
找到了类似物。3月6日,一篇发表在bioRxiv预印本网站的论文称,S蛋白两个亚基S1和
S2间的蛋白酶切位点有多个氨基酸插入,并非新冠病毒独有,一种新的蝙蝠冠状病毒
RmYN02的S蛋白同样存在类似插入。研究团队认为,这一结果有力证明了类似插入可以
自然发生,新冠病毒起源于蝙蝠和其他野生动物中存在病毒之间的多重自然重组。论文
尚未经过同行评议。
该论文题目为《一种新的蝙蝠冠状病毒揭示了... 阅读全帖
R******d
发帖数: 1436
2
来自主题: Statistics版 - 疾病位点不同OR值combine的问题
这里的疾病位点指染色体上的单个碱基位点,通常一个位点有两个allele,如果一个是
正常的,一个是risk allele,那么带risk allele的位点就是疾病位点。
是的,可以用logistic regression找出单个risk allele(如果OR大于某个阈值),以
及该位点对应的基因。但是如果疾病有两个或者更多位点都能致病,那么不仅仅是要看
单个位点的致病风险,还想看一下几个位点的risk allele同时出现的时候的得病的风
险。由于组合数很多,不可能在logistic regression模型里都包括进去,只能挑几个
你想看的。
y****g
发帖数: 36950
3
位点:rs7816345 基因名:
CC
你有大胸的可能性比较高
TT
你的胸部可能和飞机场一样平
CT
你的胸比一般尺寸小点
乳腺癌的位点很多,
基因位点: rs80358515,rs80358981,rs80357468,rs80357305,rs80358557,rs80357885,
rs397509035,rs397508983,rs80359480,rs80359675,rs397509301,rs80358474,
rs80356932
基因检测结果
未发现致病位点

:大奶的基因位点是在哪里?
:乳腺癌的基因位点是在哪里?
d*****u
发帖数: 17243
4
SNP位点rs13010010位于一个显著影响智商的基因座位中,该处有一个非编码RNA基因
LINC01104,该基因在大脑皮层中高表达;对这个SNP位点多态性本身的分析也显示其对
智商的高影响;同时该位点的多态性还与受教育程度显著相关。东亚人中的频率大约为
55.16%(T)。
该位点在不同人群中的频率(ss1298459805项目):
东亚 C 0.44840002 T 0.55160004
欧洲 C 0.61429995 T 0.38569999
非洲 C 0.98029995 T 0.01970000
美原 C 0.81560004 T 0.18440001
南亚 C 0.78829998 T 0.21170001
W*****B
发帖数: 4796
5
有没有高颜值的基因频率数据,

:SNP位点rs13010010位于一个显著影响智商的基因座位中,该处有一个非编码RNA基因
:LINC01104,该基因在大脑皮层中高表达;对这个SNP位点多态性本身的分析也显示其
对智商的高影响;同时该位点的多态性还与受教育程度显著相关。东亚人中的频率大约
为55.16%(T)。
:该位点在不同人群中的频率(ss1298459805项目):
:东亚 C 0.44840002 T 0.55160004
:欧洲 C 0.61429995 T 0.38569999
:非洲 C 0.98029995 T 0.01970000
:美原 C 0.81560004 T 0.18440001
:南亚 C 0.78829998 T 0.21170001
W*********n
发帖数: 775
6
真核生物的基因 (转录出来的是mRNA),打算看一下调控它的转录因子(
transcription factors),请问是否它的转录因子结合位点一定在转录起始位点上游?
以我的知识我认为:基因转录出来是mRNA, 所以转录酶是RNA聚合酶II,而 RNA聚合酶
II 的转录因子应该是在上游的(不知道这么说是否正确?)。
因为我的目标基因的翻译起始位点在第二个预测的Exon的中部,第一个Exon(500bp)
和第一个Intron(4500bp)比较长, 所以我想知道分析这个基因的转录因子,应该从
第一个Exon之前分析呢,还是应该从翻译起始位点之前分析?
谢谢!
y****g
发帖数: 36950
7
肝癌高风险基因是位点RS12503843为AA的人
我的这个位点基因是GG,属于低风险。所以我的后代最多也就是AG,中等风险。
当然我希望我的配偶这个位点最好也是GG
h******d
发帖数: 92
8
请问一些基础的问题:
独立转录的一个基因,它的转录起始位点有没有可能在它上游基因的终止密码子之前?
它的转录终止位点是否有可能在它下游基因的起始密码子之后?(能不能提供一个或者
几个具体的例子,给个文献什么的)
一般细菌的启动子和终止子有多长?
几个同向的基因,一般它们的基因间距离小于多少bp,我们可以推测它们属于一个转录
本?
一般有什么实验方法证明几个同向的基因属于不属于一个转录本?
非常感谢
h***e
发帖数: 146
9
独立转录的一个基因,它的转录起始位点有没有可能在它上游基因的终止密码子之前?
它的转录终止位点是否有可能在它下游基因的起始密码子之后?(能不能提供一个或者
几个具体的例子,给个文献什么的)
这两个的答案都是肯定的 都可能的
我见过这样的基因 这说明这两个基因是在一个operon上吧
j****x
发帖数: 1704
10
估计你做的这个gene甚至物种是没有已知的基因组序列信息的吧,否则你也就不会费劲
做RACE了。
把你的编码产物比对一下近缘物种的基因组序列(如果有全长cDNA序列当然最好),蛋
白质的N端往往是比较保守的,根据近缘物种的ortholog可以很大程度上帮助你确定5'
端起始位点。
如果你确定你拿到了完整的5'端序列(包含UTR),那么根据Kozak规则,ORF里第一个
符合Kozak规则的ATG就很大可能是起始ATG。真核mRNA不同于原核mRNA,基本不存在什
么RBS序列的概念,5' mG cap就是核糖体识别和结合的位点,然后往下游移动遇到合适
的ATG就开始翻译了(至少我当年上医学分子生物学的时候老师是什么说的,呵呵)
如果你不确定你是否获得了完整的mRNA 5'序列,那么继续吧,至少先通过NB等方法确
定一下可能有几个转录本,最长的转录本有多大。因为alternative splicing等等因素
的存在,一个基因存在多个翻译起始位点确实很常见,这也是基因表达调控的一种重要
方式了,遇到这种情况,你可能需要在5' RACE的引物设计上下点心思,用来区别不同
的mRNA产物。
j****x
发帖数: 1704
11
LZ现在的困惑不是转录起始位点,转录起始位点就是mRNA 5'UTR开始的位置,这个5'
RACE如果做的好的话直接就出来了,毕竟他genomic/cDNA序列基本是明确的,从前RACE
都是根据部分已知的序列来获取剩下的未知序列的,难度差多了。
LZ现在困惑的是翻译起始位点,这个和mRNA 5'端是否有60bp的差别关系不大,通过
northern也无法确定核糖体究竟从哪个ATG开始翻译。如果有ortholog就序列比对一下
看看其他物种中有没有已经鉴定过的同源蛋白,因为相对而言N端是保守的(不讨论
isoforms)。
就像你说的,基本上第一个ATG就是起始ATG,即使不是最佳的Kozak序列,至少也能低
水平的起始翻译,后面的ATG除非有IRES,否则很难有很强的表达,这甚至还有可能是
表达调控的一种方式。
W******e
发帖数: 529
12
大奶的基因位点是在哪里?
乳腺癌的基因位点是在哪里?
y****g
发帖数: 36950
13
rs1311117307和rs8067378和 rs4282438描述
感染过hpv,一些细胞基因组被插入了E6和E7基因。这2个基因会持续表达。
这和浸润性宫颈癌和四例宫颈癌易感位点之间的关联(rs13117307在这两年之中,在
17q12,rs8067378在6p21.32和rs4282438和rs9277952)在中国汉族人群在日本人口调查
位点:rs8067378    基因名:
AA1811 人甲基化率最低,GG280 人高癌变,儿童哮喘的易感性高AG1434 人HPV容易诱发
l*******k
发帖数: 361
14
不同的kinase有不同的Motif,查一下就知道了,我想在网上应该有相应的软件
发信人: timememory (光阴的故事), 信区: Biology
标 题: 已知磷酸化位点,能不能推断是什么酶的底物?
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Apr 25 11:58:16 2010, 美东)
我在http://www.phosphosite.org网站上查到蛋白磷酸化的位点(多数是核磁测出来的),比如"MANRGPayGLSREVQ"中的y,能不能从这片段就推断出它是什么酶的底物?这方面完全不懂,不知道靠谱么?
c*******y
发帖数: 1657
15
来自主题: Biology版 - 怎样知道抗体的结合位点epitope
有好几个抗体想知道它们的结合位点
查了santa cruz,给出了大致的结合位点(是c还是n端)
还有些抗体santa cruz没有
要怎样才能知道呢?
难道要查很多文献吗?
C*******e
发帖数: 4348
16
来自主题: Biology版 - 高手帮忙看一下有没有dcm位点
最近用FseI切一个质粒
有两个位点
可是只有一个能切
所以很清楚不是反应里有inhibitor的问题
但是不能切的那个地方序列里也没有找到dam,dcm位点
对甲基化不是很了解
请高人帮忙看看下面这个序列是不是会被block
(FseI site在括号里)
另外准备转到BL21里再纯化(是dcm mutant吧?)
会不会有帮助呢?
ATTCGCCCTTTTA(GG^CCGGCC)GCCAGTGTGCTGGAATT
e****s
发帖数: 1125
17
来自主题: Biology版 - 新手求教两个蛋白的作用位点
你这里说的和我理解的allosteric effect有点点不一样,我对这些确实不大了解,可
能理解有偏
差。 我理解的是第3者的远程的结合引起一个蛋白构象的改变,从而影响和另一个蛋白
或者底物的结
合。另外一点,LZ可以看一下你的蛋白是单聚体还是多聚体。通常认为oligomers 相对有
allosteric effect的机率更大。
你说的这个现象肯定存在,但更像是misfolding带来的?所以不管怎么突变,一定要检
测该蛋白的主
要活性有否明显的变化,酶起码测酶活,蛋白起码检测主要功能,CD之类的也行。标记
前后也得比较活
性。
话也说回来,有一天心血来潮想了个Idea,想做两个蛋白间的结合,结果发现以前发表
的结合位点完全
错误。于是就来兴趣想确定这两个蛋白的相互结合位点,结果1年半了,还没有Promising的
结果。估计那
个大牛组里的也是逼急了,编了个故事出来。当然走了不少弯路,组里也没人做这个的。
o****u
发帖数: 214
18
一般的商业性特异蛋白酶识别序列都是在酶切位点前方的。
比如Factor Xa是: xxxLEGR/xxxx
有没有人知道有什么酶具有酶切位点后方特异性的?
比如xxxx/LEU(某个序列)xxx
o****u
发帖数: 214
19
是,常见的都是识别位点前序列的。
我就是想知道有没有识别位点后序列的。
也就是说S1,S2,S3,S4 pocket非特异,而S1',S2',S3'pocket特异的
b******n
发帖数: 4225
20
来自主题: Biology版 - 多位点突变
这个方法看起来很有意思,只是如果有的mutation primer没有annealing到template
strand上,那不就没突变成功么?
10个位点啊,我不相信能有100%的正确性
多少会有一些少于10个位点突变成功的

800
.
K**4
发帖数: 1015
21
你用A 的转录结合位点在整个基因组上搜索
会找到非常多的hits,其中很多是false positive。
对于你这个情况,如果单单是基于出现的这两个位点而提出假设,往往很危险。
S******e
发帖数: 393
22
假如一个蛋白可以被泛素化,包括mono, multi-mono, or ub-chain,
那么泛素化的位点(lysine)在这个蛋白上是固定不变的吗?
还是说有可能在不同的条件下可以变换被ubiquitination的位点(从一个lysine换到另
一个lysine)。
Thank you.
S******e
发帖数: 393
23
假如一个蛋白可以被泛素化,包括mono, multi-mono, or ub-chain,
那么泛素化的位点(lysine)在这个蛋白上是固定不变的吗?
还是说有可能在不同的条件下可以变换被ubiquitination的位点(从一个lysine换到另
一个lysine)。
Thank you.
W*********n
发帖数: 775
24
谢谢!
您说的“ 一般情况下,看看TSS(transcription start site)前后20-50kb就差不多了
。转录起始位点后面的20-50k处,可能包括基因的所有intron 和Exon了,如果在这些
序列中发现转录因子结合位点,也可以认为它们参与了该基因的转录?
我最转录这块了解不多,现在对一个基因的转录调控比较感兴趣,所以想查查看看那些
转录因子调控它。希望专业人士给与指导。
W*********n
发帖数: 775
25
来自主题: Biology版 - 求好的磷酸化位点预测软件
现在用kinasephos2 软件预测蛋白上的磷酸化位点,但是一个研究的很清楚的蛋白上的
已经确定的两个磷酸化位点(T)都不能够预测出来,所以觉得这个软件可能不是很好
,哪位能推荐几个好用的? 谢谢!
e********r
发帖数: 147
26
大家都知道,现在的genomic annotation对细胞内蛋白的翻译起始位点是“猜”的。对
于细菌基因组来说,ATG, GTG, CTG和TTG都有可能是起始位点。一般的分析倒也没必要
把这个事搞得很清楚。
但现在我们的项目需要先确定一个具体蛋白究竟是从哪儿开始翻译的。目前我们利用的
方法是用抗体去拽这个蛋白,希望富集到足够的量以后,通过N-terminal测序来确定。
然而这个蛋白的表达量很低,搞了多次还是拿不到足够的蛋白用于测序。那么现在问题
来了:大家还有更好的策略不?谢谢!
m******u
发帖数: 12400
27
搞清楚之后的目的是什么?
有些蛋白有多个其实翻译位点。
几乎所有的蛋白都会切除翻译起始位点(或)及其后的若干氨基酸,若不说分泌蛋白要
切除整个引导序列的话。
R******d
发帖数: 1436
28
来自主题: Statistics版 - 疾病位点不同OR值combine的问题
你的意思是无法从多个单等位基因位点的OR值得到多个位点联合的OR值?
唯一的办法是不是用原始数据从新算一遍?

OR
m****g
发帖数: 530
29
来自主题: _Harvard_Medical_School版 - 大肠癌遗传易感新位点被“锁定”利于早期检出
大肠癌遗传易感的新位点在哪里?多基因在大肠癌发病中的空间立体作用到底怎样?
由黑龙江省医院消化内科医学博士王
燕颖完成的一项人事部归国留学人员科技项目——“髓过氧化物酶(MPO)基因多态性与
大肠癌诊断研究”,首次对上述问题进
行了成功探索,并确认MPO基因463位点G/A多态性为大肠癌发病的一个重要遗传易感因
素。这项科研成果为高危大肠癌
人群筛查、早期肠癌检出,以及相关基因调控和化学干预奠定了理论基础及临床实践。

大肠癌是严重影响人类健康的十大肿瘤之一,其发病率始终位居消化道肿瘤“榜首
”,死亡率排在恶性肿瘤的第二位。绝
大多数的肠癌都属于腺癌,由肠内息肉(腺瘤)和溃疡性结肠炎发展而来。大量证据表明
,现代不良饮食习惯是国人大肠癌发
病率急剧上升的重要原因,肠道化学致癌物如亚硝基化合物、杂环芳香胺、多环芳烃等
的含量明显增加,这些物质具有遗
传毒性,对大肠癌的发生起到了“推波助澜”的作用。
在目前的研究中,人们在肺癌、乳腺癌、膀胱癌、卵巢癌、恶性淋巴瘤、肝毒细胞
瘤中均已发现MPO的“魅影”。MPO
既是化学致癌物的重要代谢酶,同时也是一个氧化应激相关酶,它是否参与了肠道
y****g
发帖数: 36950
30
还有位点:rs1042522    基因名:TP53
CC
癌变修复很强劲,癌变比中500W都难
GG 癌变概率高上天
所以我的配偶这个基因应该也要求CC
LOL
y****g
发帖数: 36950
31
肾上腺皮质癌、基底细胞癌、乳腺癌、脉络丛乳头状瘤、结直肠癌、胶质瘤易感、肝细
胞癌、鼻咽癌、胰腺癌高发
基因详情参考文献
位点:rs11540652    基因名:TP53
CC 不容易癌变
W******e
发帖数: 529
32
以后交友要慎重,
在查清女友的基因前,一切免谈
另外,有没有出轨基因?同行恋基因?位点在哪里?
y****g
发帖数: 36950
33
rs9332964 is a nonsynonymous change known as R227Q in the SRD5A2 gene. The
SRD5A2 gene encodes steroid 5-alpha-reductase, an enzyme which catalyzes the
conversion of testosterone in the body. Polymorphisms in SRD5A2 have been
implicated in several disorders of male sexual development such as
micropenis. The homozygous rs9332964(A;A) genotype has been observed in
several Japenese males with micropenis.
基因详情
参考文献
位点:rs9332964 基因名:SRD5A2
CC
Average
TT
Micropenis
CT
carrier for mutations linked t... 阅读全帖
p*******n
发帖数: 129
34
看了一下这两个月的大盘,貌似就没有突破2030的阻力位点? 在考虑要不要周末前留
点白粉uvxy。
p*****n
发帖数: 981
35
来自主题: Biology版 - [合集] 请教磷酸化位点的问题
☆─────────────────────────────────────☆
raison () 于 (Fri Jan 26 00:39:22 2007) 提到:
已知一个kinase phosphorylates 一个phosphatase,有什莫简单办法找到磷酸化位点呢
?多些各位
☆─────────────────────────────────────☆
nontypical (金属) 于 (Fri Jan 26 00:49:00 2007) 提到:
MS or point mutation

☆─────────────────────────────────────☆
raison () 于 (Fri Jan 26 00:50:28 2007) 提到:
MS? how?
☆─────────────────────────────────────☆
IVYtony (村委书记) 于 (Fri Jan 26 00:51:34 2007) 提到:
Mass Spec就是有这个应用,你还是去读一下MS手册
☆──────────────
p******h
发帖数: 68
36
相同上样量的wt蛋白和突变一个活性位点的该蛋白,做western blot,显色会有差异么?
有遇到过这样问题的么?
t********y
发帖数: 6
37
我在http://www.phosphosite.org网站上查到蛋白磷酸化的位点(多数是核磁测出来的),比如"MANRGPayGLSREVQ"中的y,能不能从这片段就推断出它是什么酶的底物?这方面完全不懂,不知道靠谱么?
a****o
发帖数: 1786
38
可以有个大致方向,通常激酶的特异性不是太高,很可能好几个酶都可以识别这个位点
,具体哪个酶作用,可能还需要实验验证
d****i
发帖数: 2346
39
谢谢各位!
我是发现那几行每个CG位点有没有变,因此有疑问。
c***y
发帖数: 615
40
来自主题: Biology版 - 转录因子结合位点
需要补充的是,在类外的物种中,这个consensus sequence 主要位于5' 位点 (ChiP
数据);换了我的,都跑到intron 或 3' 端了 ( in vitro genomic selection).
test这个3'端的,是觉得构建luciferase construct的思路清晰些
p****p
发帖数: 3360
41
来自主题: Biology版 - 转录因子结合位点
由于TF的结合位点consensus都很短,in vitro selection很容易出假阳性。可以考虑
用chip-seq来做in vivo的。
e*****t
发帖数: 642
42
知道一个mRNA snp和它在genome上的位置。如何知道编码的蛋白突变位点?genome
browser,ensembl或者ncbi应该都行,但是看了半天没看出来。高手帮帮忙
b******n
发帖数: 4225
43
来自主题: Biology版 - 请推荐寻找突变位点的软件
现在有一个基因的标准序列,可编码功能性蛋白
然后发现多条突变序列,发生了插入,缺失,替换等等突变
导致该基因不能编码蛋白
自己blast之后用眼睛去找这些突变太费力了,而且容易发生错误
请问有什么软件能迅速的帮助寻找这些突变的位点,类型,以及突变的结果
结果最好能给出一个列表的形式
谢谢
k****a
发帖数: 83
44
来自主题: Biology版 - 新手求教两个蛋白的作用位点
大家好。我是新手,老板让我一个人完成一个小课题,就是看A蛋白和B蛋白的作用位点
。已经证实了A蛋白和B蛋白能够Bind,但是接下来就是让我证明B蛋白是bind在A蛋白的
哪个部分。
现在老板让我纯化蛋白,然后再让我做这个证明。因为我以前没有做过这方面的东西,
所以有点晕。我查看了文献,发现用Immunoprecipitation是可以证明A蛋白和B蛋白是
否bind的。
现在,我想如果在A蛋白上做过mutation,是其某一部分失活,而另一部分正常,我想
应该也可以证明B蛋白结合到A蛋白哪个部分的问题吧。或者是用放射性物质标记B蛋白
,然后两者结合后再看放射性物质是在A蛋白的哪个部分。
我的问题是,我发现文献上的immunoprecipitation都是细胞里面做的。但是现在我老
板让我纯化蛋白,我想问一下,纯化后的蛋白怎么做这个protein protein
interaction.
问题很幼稚。先谢谢大家。
m***o
发帖数: 272
45
在做5-race,目的是得到一个蛋白的short form。已经得到了一个从exon6开始转录的
短的RNA,而且也得到一些UTR序列在5intorn。 用的是ambion First choice RLM RACE
KIT. 得到的片段测序,mRNA起始的位点总是不一样。起始点最长有60bp的差别。而且
在UTR序列里面有3个ATG都在读码框架里,请问怎么知道哪个ATG是真正的翻译起始点?
除了RACE,还有什么实验可以确定mRNA的起始点呢?
另外一个问题,在做另一个蛋白的RACE时候,得到过两次先表达Exon5,然后是exon2的
序列,有这样的exon rearrangement 吗?就是先转录下游的exon然后再回过头转录上
游的exon? 第一次得到这个结果的时候觉得可能是artificial,但是用不同的primer又
得到了一次这样的结果。而且还是complete的exon序列。请各位发表点意见建议吧,我
google也没有找到类似的事情。
C*******e
发帖数: 4348
46
除了5' RACE还可以做primer extension啊
不过就是要用P32
如果同时又好几个mRNA TSS的话
结果上也会看到几个不同大小的片段
然后根据信号的强弱可以知道哪个是主要的TSS
对于翻译起始位点
不能光看ATG吧
还要结合RBS看
Z******5
发帖数: 435
47
其实要找翻译起始位点为什么不从蛋白质入手呢?打个质谱就搞定了。
退一步,如果你有部分蛋白序列,也可以大概推测一下,看看读码框,说不定就能找到
起始的ATG。
如果要从纯序列入手,貌似记得以前分子生物学上讲过,一般ATG前面的序列会形成茎
环的二级结构,便于ATG的识别(我觉得这个不太靠谱)。当然也注意一下读码框,看
看哪个ATG翻译出来的序列比较合理。(比如可以看终止密码子的位置,就知道蛋白大
小是否合理, 检查翻译出的蛋白质的序列特征,比如预测一下可溶性等)
===========================
关于TSS的问题,现在一般认为很多基因都是有多个TSS的。比如我做的一个基因,就发
现在不同的细胞中使用不同的TSSs,大概查几十bp。 建议你挑20个以上克隆测序,然
后看TSS的分布情况。 当然为了省事,你测十来个,直接说最长的那个就是也可以(现
在很多文章也是这么发的),或者不做克隆,直接将最后一轮的PCR产物测序。
j****x
发帖数: 1704
48
一般而言真核生物翻译起始的规则是,符合Kozak规则的一个ATG就是起始ATG。查一下
你这3个离得很近的ATG哪些是符合“AXXATGG”条件的,简言之只要-3位点是A或者+4位
点是G,那么就足够起始翻译了。如果你的第一个ATG就符合,那应该就没什么疑虑了。
后面的2个ATG如果也符合,那么理论上也有可能起始翻译,但是效率会比第一个ATG低
很多很多倍。你可以设想,在正常蛋白序列中,N端有多个相距不远的M是很正常的事情
,要是随机从这些M开始起始翻译,还不乱套了。
你也说有了cDNA序列和gene序列了,那么理论上的最长翻译产物自然是清楚的了,用这
个氨基酸序列比对模式物种,如果N端能匹配,自然是很强的佐证了。

里。
p******i
发帖数: 1092
49
转录的起始位点:
如果有TATA BOX, 很可能是single transcription start site,
但是大多数真核gene都没有TATA BOX,所以都是有好几个TSS clusters,每个TSS
cluster里面的TSS们大概在200bp这么大的范围之内
如果有几个相聚较远的TSS cluster,那么这个gene有可能有不同的mRNA species,但
是还是要做实验去验证
是不是应该针对每一个mRNA species,再单独考虑start codon 的问题?
however... 貌似很多gene都有不同的mRNA species,但是不一定这些mRNA species都
有功能,更不一定都会translate成蛋白
你说你的目的是得到一个蛋白的short form,
你expect short form和wild type的区别是什么?
after all, if there is nothing new about this short form, you cannot publish
, right?
是不是可以把可能的short form的ORF... 阅读全帖
s****r
发帖数: 736
50
来自主题: Biology版 - 多位点突变
求教一个技术问题:
目的是在plasmid上一次引入三个site-directed mutation. 三个位点,间隔150bp, 800
bp, 和2K bp. 准备尝试用QuickChange Multiple Site-Directed Mutagenesis,但是
害怕间隔相差太大PCR会出错。也看了其他的一些方法,比如Andreas Seyfang &
Huaqian Jing的Multiple site-directed mutagenesis of more than 10 sites
simultaneously and in a single round (the schematic diagram was attached).
不过不确定accuracy和efficiency到底怎样。
不知道大家有什么好的建议?谢谢了先!
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