p********e
发帖数: 61 | 1 兄弟是想做什么样的抗体? 多抗？单抗? 多抗多为兔多抗，也可以做羊，马，牛之类的。
单抗也分为小鼠，大鼠和兔子。
如果谷歌一下“Custom Antibody”， 广告铺天盖地，Organic结果更是浩如烟海。选
哪家确实让人头痛。我以前做为客户从其他公司定制过抗体(Genscript, Sigma等)，给
公司打工时也给客户做过不少抗体，现在我所在的公司也在做定制抗体，所以我对现状
还是了解一些的。下面给大家一些我的个人观点。
像马牛羊驴甚至骆驼这类大动物的多抗多用于二抗或给病人紧急用（蛇素狂犬之类的）
，这东西贵得去了，大家用不着。最常用的还是四类：兔多抗，小鼠单抗，大鼠单抗和
兔单抗。兔杂交瘤的专利好象还没过期，所以只能由Epitomics或与之相关的公司做，
其他大家都可以做。技术上，无论单抗还是多抗，实在是没有什么难度，任何一个生物
WSN租间房子养几只动物（不需要无菌，敞开养就行）就可以搞起来。成功的关键主要
有两点：1. 抗原； 2. 多做几只。
抗原好，做抗体很容易，抗原不好，神仙也没用。做免疫的可能都用过Ova，就是鸡蛋
里的白蛋白。这玩意儿往无论是老鼠还是兔子体内一... 阅读全帖 |
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z******5
发帖数: 30 | 2 多谢.目前是想做兔多抗。目的蛋白是人Exoc5。试了几个commercial的(抗原有多肽有
全蛋白)，都不好用。
polymerase兄现在在哪家公司呢？
的。 |
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p********e
发帖数: 61 | 3 兄弟是想做什么样的抗体? 多抗？单抗? 多抗多为兔多抗，也可以做羊，马，牛之类的。
单抗也分为小鼠，大鼠和兔子。
如果谷歌一下“Custom Antibody”， 广告铺天盖地，Organic结果更是浩如烟海。选
哪家确实让人头痛。我以前做为客户从其他公司定制过抗体(Genscript, Sigma等)，给
公司打工时也给客户做过不少抗体，现在我所在的公司也在做定制抗体，所以我对现状
还是了解一些的。下面给大家一些我的个人观点。
像马牛羊驴甚至骆驼这类大动物的多抗多用于二抗或给病人紧急用（蛇素狂犬之类的）
，这东西贵得去了，大家用不着。最常用的还是四类：兔多抗，小鼠单抗，大鼠单抗和
兔单抗。兔杂交瘤的专利好象还没过期，所以只能由Epitomics或与之相关的公司做，
其他大家都可以做。技术上，无论单抗还是多抗，实在是没有什么难度，任何一个生物
WSN租间房子养几只动物（不需要无菌，敞开养就行）就可以搞起来。成功的关键主要
有两点：1. 抗原； 2. 多做几只。
抗原好，做抗体很容易，抗原不好，神仙也没用。做免疫的可能都用过Ova，就是鸡蛋
里的白蛋白。这玩意儿往无论是老鼠还是兔子体内一... 阅读全帖 |
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z******5
发帖数: 30 | 4 多谢.目前是想做兔多抗。目的蛋白是人Exoc5。试了几个commercial的(抗原有多肽有
全蛋白)，都不好用。
polymerase兄现在在哪家公司呢？
的。 |
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e*******0
发帖数: 1487 | 5 我是搞生物学研究的，不是特别同意楼主的意见。第一，生物学，尤其是生物医学的研
究取得的成果，是有目共睹的，只不过楼主的水太浅，两眼一抹黑，看不到而已，流感
疫苗、维甲酸治疗白血病，黑色素瘤的治疗，乳腺癌早期诊断，各种癌症的特效药物的
研发，都是在生物研究飞速发展所带来的成果。各类大分子药物的筛选、多肽和抗体片
段的药用研究、纳米技术在疾病诊断、治疗等领域的发展都是非常迅速的。在疾病基因
及其突变的筛选研究方面，新技术的应用更是日新月异，纳米技术的运用，使筛选手段
极其多样化和方便迅速。第二，生物科学grant的发放并没有根本性的失误。以美国为
例，审定grant的第一要点就是project的可行性，这一根本性原则决定了申请grant的
人即便可能造假，却不至于假的离谱。因为grant被要求必须是在现有的被证实的结论
基础上设想，申请人本身所做的工作并非一定是决定因素。第三，生物paper的确有不
少人的工作并不可信，但是，要分不同的PI。有些PI在某个领域里耕耘多年，有固定的
圈子，所做的工作是要被圈子里其他PI用作分析研究基础的，这样的PI很少在根本性的
问题上出错，否则，在圈子里就... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 6 澳大利亚的
The University of Queensland and the ARC Centre in Bioinformatic 官网里有个
小鼠和人的
蛋白组分布数据库:
for example
Mouse:
//locate.imb.uq.edu.au/searchpages/MouseGO:0005737.shtml
//locate.imb.uq.edu.au/searchpages/MouseGO:0005783.shtml
for Human just go to
//locate.imb.uq.edu.au/
then click relative icons.
至于如何移动的
参看论文
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20299325
如是膜蛋白 有多肽序列信息的话
用这个工具模拟一下:
//mu2py.biocomp.unibo.it/mempype/default/faq |
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x**2
发帖数: 255 | 7 是用合成的多肽做的么？
这样的话只有实验才能验证吧 |
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R*****o
发帖数: 12 | 8 表达蛋白和peptide没啥大的区别，文献中报道利用蛋白做抗原最后产生的也是1-2个优
势表位且以线性表位为主。不过peptide最大的问题应该是预测的线性表位是否准确的
问题，所以要是做一条肽的话成功率会很难保证，很可能Elisa识别peptide很好但是不
能识别内源。不过如果预测好一点或者多选择几条的话，应该还是不错的。
另外有的公司也提供可溶表达的服务，比如上面说的Abmart，可以利用可溶表达蛋白和
多肽两种方法同时做。 |
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o****u
发帖数: 214 | 9 我倒是很好奇。你这个３k的多肽是过表达的还是原生的。如果是过表达，还真是满厉
害的。
另外，我以前也认为工业化的东西很神秘。后来和公司做得多了，才发现其实好多
protocol也是学术圈的人帮忙设计的。从纯科研实验室到公司实验室有些思维要稍微转
化一下，至少很多kit是不能用的。如果是正规公司，有些非标准的pcr都不能用，因为
涉及到专利问题。但至少到中试为止，工业圈比学术圈好点的也就是多一些know-how的
东西，核心层面的谁也不比厉害多少。当然真正到了full scale生产的时候，涉及管理
层面的东西，搞学术的一般就不行了。
我倒是做过相关的项目。但是从你目前提供的信息来看，很难具体的帮你分析，比如用
的是什么strain,粗提方法是什么等等。但是如果你是工业项目，估计你也很难把所有
的东西都写上来。如果你还想从这里得到帮助，自己把握尺度，再多提供点信息吧。 |
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o****u
发帖数: 214 | 10 我说你还先不要笑话其他人。
我不久前才给公司设计了一个在大型反应器里面测蛋白含量的方案。当然不是直接测多
肽的。最后用的是一个很老但是很简单的方法。
对于这种工业用protocol的设计，我的经验是双方要坐下来好好谈具体细节，比如说你
的粗提物的大致蛋白杂质含量,需要测定有多高的精度,然后才能设计成功的。像你这样
很模糊的提问题，是很难得到准确的解决方法的。
另外，如果可能的话，能大致讲一下3k的多肽是怎么过表达的吗？
I
concentration
detect |
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l**********1
发帖数: 5204 | 11 利用人工智能免疫系 likes CD44 plus Hyaluronan (hyaluronic acid, HA) is a
linear naturally occurring polysaccharide 钓3kDa左右的多肽的鱼
可以不通过分离而直接挑出peptide or protein来特异反应--just matrix two cents.
References:
1)
Erickson M, Stern R.
Chain gangs: new aspects of hyaluronan metabolism.
Biochem Res Int.2012:893947.
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22216413
and
2)
Chaim OM et al.(2011)
Brown Spider (Loxosceles genus) Venom Toxins: Tools for Biological Purposes.
Toxins (Basel). 3: 309-344
Abstract
Venomous animals use ... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 13 这么复杂啊？听得我都要发抖了。。。 不认识能做这个的人。。。
但是正好我要合成的多肽没有lysine, 也没有cycteine
for
e. |
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s******y
发帖数: 28562 | 14 非常谢谢！ 我们准备订购的合成的多肽末端是有N-acetylation 的（所以不敢在
太小的公司那里订）， 而那个GST fusion万一真的需要做的话也准备在293T cell里面
制备
你知道得很多啊，谢谢。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 15 另外，我说的是合成表达用的基因，不是指合成多肽
不知道他们有没有另外的专门从库里克隆基因的服务。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 16 【 以下文字转载自 Faculty 讨论区 】
发信人: sunnyday (胖头鱼。按斤卖就赚了), 信区: Faculty
标 题: 大家知道苏州的这个会议组织bitlifesciences么？
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Aug 21 12:12:43 2012, 美东)
最近收到一个会议邀请，让我去做报告，是在苏州的，
http://www.bitlifesciences.com/pepcon2013/default.asp
第6届蛋白和多肽会议。
会议是要收费的，即使对于speaker, 也要1300美元的样子。但是因为包括三天的
食宿，所以貌似还不算特别离谱。
因为以前听人家说过国内有些会议就是为了收钱，组织得乱七八糟，去参加的
人都弄得一肚子气什么的。但是也知道有些很正经的会议（比方说冷泉港组织的）
也是在苏州办的。所以我想确认一下这个是不是一个正经会议？
有同仁们对此有参加的经验么？ 麻烦指点一下。 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 17 sunny 以下没一位来自藤校的发考题哦
2012 第五届蛋白质和多肽大会
Lifetime Members
Advisory Board Members:
//www.bitlifesciences.com/pepcon2012/programcommittee.asp
是个Top5 药企大中华区的CROs 和大连的啥鸟公司结合吹风忽悠tg 医药markert 的会吧
link:
//www.bitlifesciences.com/pepcon2012/cn/meetingintro.asp |
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d******u
发帖数: 99 | 18 这次直接说他们的CLV合成多肽有FLS2 contamination，所以看到CLV与FLS2受体的结合
protoplast
binding |
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s*******e
发帖数: 1010 | 19 难度大而且市场未开发，大公司不干小公司又干不起，能直接从catlog上找到可能很有
难度。可能比较简单的方法是联系和国内有渠道的公司（做多肽或抗体的小公司），看
看能不能从国内找到提供定制服务的。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 20 PSD-95 is a member of the membrane-associated guanylate kinase (MAGUK)
family. With PSD-93 it is recruited into the same NMDA receptor and
potassium channel clusters. These two MAGUK proteins may interact at
postsynaptic sites to form a multimeric scaffold for the clustering of
receptors, ion channels, and associated signaling proteins.[1]
针对于PSD-95设计的抑制多肽药品NA-1(Tat-NR289c)日前在加拿大和美国并行进行的双
盲测试中取得良好成果.
研究人员对脑部手术的病人术后出现的轻微中风使用该药品。在没有采用该药物的对照
组中，有３２％的病人会出现不同程度的脑部损伤，采用了该药物的病人则有非常明显
的保护作用。 |
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b*****g
发帖数: 91 | 21 想申请绿卡eb1a，恳请版上大侠给审稿机会或希望得到你们的推荐！我已发表15篇文章
，研究方向是计算生物物理和化学，特别是膜蛋白的结构与功能关系以及多肽与膜的结
合过程和机制。非常感谢。
请站内联系或直接email我:z*******[email protected] |
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c**********r
发帖数: 109 | 22 已知某种植物对某种疾病有特效，现在想确定这种有效成分，应该如何着手？
是不是先根据分子量粗分以下，看大分子还是小分子有效；大分子的话，可能是蛋白质
或者多肽，小分子的话可能是杂环有机物
大分子可以用HPLC分离，然后测序什么的，小分子也是下分离然后质谱、光谱分析等。
这个思路对吗？谢谢 |
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K******S
发帖数: 10109 | 23 就是氧化(+16),在MS2里,带氧化的M的多肽有很独特的-64的片断,可以用来确认 |
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d**********i
发帖数: 2036 | 25 天哪，就这种水平居然还来讨论做药物什么的，难怪几十亿投下去，几十年也没搞出个啥 |
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e***o
发帖数: 344 | 26 正是因为外行所以才来求教。所以不怕被笑话，只怕牛人不肯赐教。
只是这个几十亿搞不出东西，就不应该怪我了。那些大药厂的CTO和顾问scientist也应
该有至少和你一样牛的人吧（我前老板为例，捣鼓了20年也有一个FDA和欧盟批准的新
药，也是大药厂的顾问）。
你就别卖关子了，给咱们科普一下吧。看上去不止我一个人感兴趣。
个啥 |
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d****u
发帖数: 1553 | 27 他说的deliver指的是药物达到实际病灶部位并且发挥作用的效率吧 |
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s******y
发帖数: 28562 | 29 刚才有人已经说了，我这里说的deliver是指药品到达病灶的问题。
尤其是大部分肽类分子不容易过膜，所以大部分应用都集中在对细胞外的受体的作用上
。对于细胞内部的东西，尤其是线粒体（一个非常重要的靶点），几乎无能为力。而很
多小分子过膜相对容易得多。
另外就是在血清里的外来肽，一是容易被酶切（这个通过对肽的修饰有时候可以改善）
，二是有可能触发免疫反应（这个需要做很好的测试来筛选），反正难处很多。
当然，肽类药物也有很多好处，一个就是容易设计，二就是容易做成库。所以还是有人
在做的。 |
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A******y
发帖数: 2041 | 30 Na, nucleotides synthesized in solution phase could be very cheap, too. The
cost of the drug is never an issue. There are recombinant protein
therapies that cost more than 300k a year and medicare/medicaid pays for
them.
The delivery just too difficult. Nature over billions of years evolution
only given virus as only effective way to deliver nucleotides. I think we
are still not at the point of out-smart nature. Also, the idea of magic
bullet is fading, you need a magic shotgun that can hit... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 32 是有这个方面的研究，但是从普遍来说，还是不太好使，尤其如果要穿透多重膜
的时候。
而且修改了之后，也常常会影响肽的构型和功能 |
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A******y
发帖数: 2041 | 33 Sorry, my technical Chinese is not as good. You mean polypeptide?
Polypeptide is cheap once you industrialize the synthesis. even for 20-50 a
.a. you can just use Schultz technique and get grams of them (I know a lab
do that all the time). I'm suppose to be a classically trained peptide
chemist, but I am doing small molecule right now, Btw, for less than 20
residues, solution phase polypeptide could be even cheaper if you know how
to do it. My academic grandfather have a 3 million dollar N... 阅读全帖 |
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s******9
发帖数: 283 | 34 为什么不能象蛋白一样加affinity tag，然后再切掉？ |
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s******9
发帖数: 283 | 35 化学合成很难解决某些post-translational modifications，而天然活性肽有大量的修
饰（比如某些disulfide bonds和cyclizations）。所以合成他们最有效的途径还通过
engineering biosynthetic pathways。这是一个很好的synthetic biology的方向。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 36 现在就是这么做的。
但是，即使如此，再加上各种size exclusion and ion exchange column,
也很难保证提纯到什么程度。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 37 肯定也会用reverse phase，不然根本就不能得到足够纯的产品。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 38 不是一个好主意。
病毒本身就是一个很麻烦的事情，
而且，如果用病毒的话，就很难控制给药和停药的时间。
虽然理论上可以用可诱导promoter来控制什么时候开始给药，但是实践操作
起来很麻烦。
比方说用小分子什么的可以试药，比方说先开一两个星期，看到疗效不好
就换一种，但是用病毒的话，一旦放进去了就永远的在体内了。你要换一种
药的话很麻烦。一是没有那么多的不同的可诱导promoter来给你用，二是
大部分可诱导promoter都是对代谢物产生反应的，所以放在人体里几乎不能
避免会出现一个程度的表达。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 39 一般来说，最短也必须有8个氨基酸，才足够组成一个构型。
在我的有限印象中，大部分能够有足够specificity 的肽，大多在20~30个
氨基酸左右。 |
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i***i
发帖数: 46 | 41 看到一个hiv test的东西，
里面有：
1 Test Stick, containing a nitrocellulose membrane with adsorbed HIV-1 and
HIV-2 synthetic peptides and goat anti-human IgG, and a pad containing a
blocking agent and protein-A colloidal gold
1 Test Tube, containing 1 mL of a phosphate buffered saline solution with
polymers and an antimicrobial agent
帮朋友问下专业人士，这个stick要和口腔的gum接触，stick的东西对人体有没有危害
的可能？那个合成的多肽，会不会有传染性？还有那个tube里面的东西，要是不小心接
触人体会怎样？
谢谢大家。 |
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j****x
发帖数: 1704 | 42 OraQuick In-Home HIV Test，你说的是这个吧？
都已经通过FDA认可了，安全性应该是有保证的，合成的多肽更不可能有传染性，又不
是疯牛病。Tube里面就是磷酸缓冲液和一些杀菌剂成分，不小心接触了洗掉就是了。
FDA网站以及公司产品说明里都应该有详细的安全性说明，不放心就自己仔细看看呗
不过这玩意是不是要变成高档会所夜店的标配了啊，市场潜力很大啊 |
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k******n
发帖数: 54 | 43 打算做一个蛋白的兔多抗抗体，请问北美哪家公司的抗体定做比较好啊？用合成多肽做
抗原和表达蛋白做抗原哪一种的效果好呢？
请大家不吝赐教，谢谢！ |
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D*a
发帖数: 6830 | 44 新乡医学院药学院院长涉嫌多件学术造假
http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2013/4/276959.shtm
上图为陈宙峰在《自然》杂志上发表的论文，下图为疑似被杨俊添加了自己名字的论文。
■本报记者 冯丽妃 唐凤
已发表的论文竟然被“偷”了！近期，美国圣路易斯华盛顿大学麻醉系教授陈宙峰居然
碰到这么一件不可思议的事儿。
一开始收到匿名检举人发来的邮件，陈宙峰还觉得是天方夜谭。然而，事实却让他不得
不信。
匿名检举邮件称，河南新乡医学院药学院现任院长杨俊把陈宙峰曾经发表在《自然》杂
志上的一篇文章“PS”上自己的名字后，附在其简历中，牟取利益。且有确切材料为证。
真有如此剽窃之人？震惊之余，出于好奇，陈宙峰在接下来的一个多月中，利用自己的
空暇时间对杨俊的信息作了些搜集。
在此过程中，他发现，这位“杨博士”所涉嫌的学术不端行为并非仅此一件……
“真是想人之不敢想，
做前人未做之大事！”
“美国圣路易斯华盛顿大学教授陈宙峰有个有趣的发现。”3月4日，北京大学生命科学
院院长饶毅在发给《中国科学报》记者的一封邮件中称。
这封邮件同时记录了此前饶毅和陈宙峰... 阅读全帖 |
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n******2
发帖数: 971 | 47 大牛，请给详细指点一下。例如，我用proteinase K 处理reverse crosslink后的DNA
：蛋白溶液，这个过程前后的peak会移位吗，高度会下降吗？ |
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s******y
发帖数: 28562 | 48 会
蛋白的紫外吸收是由氨基酸残基产生的，而氨基酸残基的吸收系数和所在的环境的
hydrophobicity 程度有关。同一个氨基酸，处于hydrophilic 的环境中的吸收度一般
会大大小于出于hydrophobic 环境的吸收度。 用蛋白酶处理后的蛋白会水解成小片段
，氨基酸都被泡在水中了，吸收度一般都是大大下降。
DNA |
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l**********1
发帖数: 5204 | 49 Zan super bull/cow's well said. |
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y******n
发帖数: 8667 | 50
在280nm吸收是快速测蛋白浓度的方法之一。这一般只考虑的是aa的组成。难道是不准
的？ |
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