s********l
发帖数: 1195 | 1 我以前只用过细菌做蛋白的over expression和in vitro的检测
现在转到新的实验组用很多医学样品，比如血样、尿样等
以前没有接触这些样品的经验
请版上做过clinical research的牛人推荐一些入门的读物
我好熟悉一下从这些样品里提取纯化某种或者某几种蛋白的方法
多谢！ |
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F***w
发帖数: 58 | 2 欧洲博士毕业一年，还在原实验组里，老板不是大牛，但工作效率很高， 5分左右的文
章很多，与其他实验室合作偶尔有CNS, 但自己实验室的没有。他一直在欧洲，人脉不
算广。毕业以后一直在考虑将来能干什么，想到美国做博后，但现在的老板不愿意放，
强力支持我挂自己的名字申请funding。如果被拒，打算立刻申请去美国，可是如果拿
到funding的话，还需要在现在的实验室继续待几年，然后离开。不知道这样一来对自
己将来的发展到底利大于弊还是弊大于利? 想问问大家在美国，老板可能支持博后自己
申请funding吗? |
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h****g
发帖数: 439 | 3 比较两组（对照组和实验组，每组5个标本）的基因表达，realtime pcr，然后用ct来
计算相对表达量。 问题是，计算delta delta CT时，delta CT calibrator用哪个？是
用对照组中的一个标本的，还是用对照组delta CT的平均值呢？ |
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U********S
发帖数: 1896 | 4 不是。
你另外需要一个housekeeping基因比如GAPDH，actin, 18s等等，这样每个样本有两个Ct值，一个是测试基因比如A另一个是housekeeping基因B，delta ct是同个样本A和B基因之间差值。由多个样本的话需要计算delta ct的平均值作为这一组的结果，同样方法计算得到另外一组的delta ct。两组delta ct的差值叫delta delta ct，代表实验组和对照组之间的差异，用公式2^(-delta delta ct)可以得到差异的倍数。多个样本之间的delta ct误差计算以及如何传递两组的误差到最后的倍数误差请参考user bulletin#2。 |
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h*********9
发帖数: 1108 | 5 我有一组数据是这样的
菌株对amp抗性分析：
A组（对照组）: 抗性（%)=8.7%; 敏感性（%)=86.96%
B组（含aer）:抗性（%)=20.51; 敏感性（%)=76.29%
我现在相比较是否实验组的抗性比对照组显著增加。
可以直接在spss中用比较两组的百分比数据吗？如果可以，输入数据的时候是去掉百分
号比较呢，还是转换成小数去比较，非常感谢 |
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a***n
发帖数: 328 | 6 谢谢你的长文！
受益匪浅。
当然，如果文中夹枪带棒的话能少一些就更好了。
问两个问题：
1. 关于bt蛋白毒性研究的那一段
被认为对人体无害。但是有一些报道则有不同结论。
2007年绿色和平组织赞助的一个科研报告，暗示说bt作物可能会导致小鼠的肝损坏。但
是如果分析数据，发现并没有统计学上的差别。也就是说，统计意义上，用bt作物喂养
的小鼠肝损害程度，并不高于用非bt食物喂养的小鼠（The observed changes have
been found to be of no biological significance by the European Food Safety
Authority）。
这个biological significance指的是什么？
2. 关于Pusztai
Rowett Research Institute检验了Pusztai的数据，认为数据里有致命错误。比如说，
有些试验根本没有作，博士生混淆了对照组和实验组，在这个研究里 Pusztai错误的使
用了一种豆类凝集素（对哺乳类动物有毒）。最后Pusztai退休。
如果这些都是真的，Lancet上的文 |
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Z******5
发帖数: 435 | 7 比如说我要检测没有处理的细胞Con和处理后的细胞Tre之间基因G表达的变化，那么就
是要分别定量Con和Tre cDNA中基因G和内参GAPDH的量。 要看基因G的变化，就是看它
在实验组和对照组中相对于内参的变化。 这个应该算是同一个模板里不同基因的相对
定量吧。 |
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Z******5
发帖数: 435 | 8 同意你这个说法，哈哈。 我就是要检测对照组和实验组中10几个基因的差别，所以就
先加模板了。 |
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h****g
发帖数: 439 | 9 可能我没说太明白。 实验组老鼠和对照组老鼠。 每组10只，每组有10个百分数，而不
是一个。比如
A组；20%，30%，29%，31%，34%等等
B组，10%18%17%，19% 等等 |
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S**********e
发帖数: 1789 | 10 STS处理的细胞死过头了。这个公司的kit很奇怪，细胞死得稍微多一点，实验组的信号
就会低于对照组。很多人都遇到过类似问题。可以试试降低浓度，缩短时间。或者换个
公司的kit.
STS |
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m**********d
发帖数: 137 | 11 不加antibody，只加ProteinA agarose孵育1hr，作为Negative Ctrl。qPCR的结果Neg
Ctrl是实验组的1/7-1/10，请问这个强度的background能否接受？
现在做的是RNAPol2的ChIP，大家都说RNApol2的这个antibody做ChIP很不错，但我步步
按照Millipore ChIP Kit做下来，elution之后用nanodrop测了一下DNA浓度，发现特低
。请问版上ChIP大牛们，要想得到个decent qPCR结果，ChIP下来的DNA浓度有个限制么？
多谢各位指点啦 |
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s******n
发帖数: 63 | 12 这好像是第二次发咯，楼主求建议的时候最好把自己的问题简洁、严肃的描述出来，虽
说是bbs，不是什么学术场合，但是你自己都不严肃，别人又怎么会认真呢？
caspase 3的p17/p19不太好做，可能要多试几种抗体。
promega 的Apo-ONE® Homogeneous Caspase-3/7 Assay实验组和对照组没区别：
staurosporin的浓度、刺激时间预实验要摸索一下，
caspase-3转染的浓度要低一些，稍微一过量就自激活，细胞就都死了。
另外就是设阳性对照啊，引起caspase-3激活的刺激应该不止staurosporin吧，找个最
稳定的刺激作为阳性对照。 |
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s******n
发帖数: 63 | 13 这好像是第二次发咯，楼主求建议的时候最好把自己的问题简洁、严肃的描述出来，虽
说是bbs，不是什么学术场合，但是你自己都不严肃，别人又怎么会认真呢？
caspase 3的p17/p19不太好做，可能要多试几种抗体。
promega 的Apo-ONE® Homogeneous Caspase-3/7 Assay实验组和对照组没区别：
staurosporin的浓度、刺激时间预实验要摸索一下，
caspase-3转染的浓度要低一些，稍微一过量就自激活，细胞就都死了。
另外就是设阳性对照啊，引起caspase-3激活的刺激应该不止staurosporin吧，找个最
稳定的刺激作为阳性对照。 |
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L**********O
发帖数: 1761 | 14 我用promega的。
做triplicate，结果３值差异好大。Firefly一般background有30左右,而实验组也只有
30左右. Renillia一般比较正常,在１００ 左右。。
谢谢!~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ |
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c******r
发帖数: 3778 | 15 是啊，我是这样看的。
另外，做实验的samples还需要isotype controls。
实验组：
第三组
1. 用特异性抗体沉淀+需要研究的序列的primers
目的：回答你的biological question
2. 用IgG沉淀+需要研究的序列的primers（negative）
目的：抗体对这一段特定序列没有非特异性结合。
目的：确定抗体和所有实验步骤都没问题。
目的：确定特异性抗体对已知序列没有非特异性结合。即确定positive control是有效
的。
目的：确定抗体对已知序列没有非特异性结合。
目的：确定抗体对随机序列没有非特异性结合。 |
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G********e
发帖数: 528 | 16 老鼠实验的variation难道不是经常很大的吗？
是不是大致的phenotypes相似，实验组明显和对照组有区别就可以说明问题了？ |
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G********e
发帖数: 528 | 17 我干过几次，实验组是几次注射三四个月后陆续死掉了，对照组除了男的睾丸变大，别
的没发现异常。 |
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m******5
发帖数: 1383 | 18 阴性对照很干净
但实验组只有很弱的带，相对于100% input 来说大概才 0.5-1%吧 |
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O******e
发帖数: 4845 | 19 如果是生化或者细胞实验，一次实验如果只有对照组和实验组两组数据，是不会有p
value
的。动物实验如果每组个体数足够大，可以算p value. |
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F**********6
发帖数: 90 | 20 做了几次CHIP，每次对照IgG都能扩增出很弱的条带（实验组的条带很强！）。请问如
何解决对照IgG有弱条带的问题？
看了些别人发表的CHIP实验数据，绝大部份对照IgG基本上没有条带。但偶然能看到一
两篇文章里的CHIP实验数据里的对照里有弱的条带。
多谢指教 |
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i****g
发帖数: 426 | 21 学术界的一句名言是“发表或死亡”（publish or perish），意指科学家必须发表论
文，否则就要出局。那些在知名期刊发表大量有影响论文的科学家能获得很高的地位以
及大量基金资助。这种利益驱使已经将学术圈搅得不再纯洁，少数人为了获得竞争优势
不择手段，“学术不端”的案例能经常听到，最常见的就是剽窃他人成果。一些极端情
况下，有科学家甚至会蓄意破坏同事的研究工作。近日，《科学美国人》杂志总结了这
些极端案例。
资助被停，报复同事
不久前，美国西奈山医学中心（位于纽约曼哈顿，是美国最大的医学院附属医院之一）
博士后莫森·霍森卡尼遭到警方逮捕，被控犯有盗窃罪。霍森卡尼今年40岁，伊朗裔，
毕业于哈佛大学医学院，主要研究方向是心脏再生的分子机制。据其他同事介绍，去年
6月霍森卡尼的研究项目不幸被医院方面停掉，理由是研究进展太慢。另外，医院方面
还发现，他提供给院方的关于自身背景的信息“不可靠”。失去基金资助的霍森卡尼非
常恼怒，想到了疯狂报复他的同事，用恶劣手段破坏其实验工作。
受理此案的曼哈顿刑事法庭在法庭文件中说，去年7月1日，霍森卡尼展开了首次报复。
他偷偷溜进实验室，故意将对照... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 22 ZZ
纪念物理科学家吴健雄女士诞辰100周年
今年是吴健雄女士诞辰100周年之际，回首她非同寻常的百年人生，令人可敬可佩。
父慈教严 终身不忘
百年以前的1912年5月31日，吴健雄出生于中国上海，祖籍江苏省太仓市浏河镇。祖父
吴挹峰是清末秀才。父亲吴仲裔是一个思想活跃、开朗，乐于进取的人。他对子女一律
平等看待，按“健”字辈及“英雄豪杰”的顺序，依次为儿女们起名——吴健英、吴健
雄、吴健豪。哥哥吴健英，弟弟吴健豪，吴健雄是他唯一的女儿。叔叔吴琢之。
吴健雄的小学教育是在浏河“明德女子职业补习学校”完成的。这所由他父亲创办并自
任校长的女子学校，在当时
民国初期封闭的浏河，无疑开了女子受教育的历史先河。在学校初创的日子，父亲领着
年幼的女儿健雄挨家挨户动员说服，介绍女子上学的好处，不论贫富，一视同仁，不但
书费杂费全免，还教缝纫、刺绣、园艺等实用技术。父亲的大爱、大义给予了健雄早期
的人格启蒙教育。
1923年，健雄才11岁，父亲便送她到离家100多里的苏州第二女子师范念书，意在培养
她独立自主的生存能力，同时也希望她接受更多更严格的正规教育。健雄牢记父亲教诲
“不怕困难，埋首努力，... 阅读全帖 |
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h****s
发帖数: 401 | 23 http://news.creaders.net/headline/newsViewer.php?nid=518918&id=
给你吃什么，给你吃屁！这是南京人常常用来骂人的一句话。不过，这句话以后可能就
会常常对高血压患者说。随着生活水平的提高，高血压患者越来越多，江苏有1/3的成
人患高血压，所以，关于高血压的一切研究都会受到极大的关注。昨天，一则关于高血
压的研究被很多网友转载，外国科学家实验证明，人屁中含有一种“硫化氢”成分，可
以降低血压。不过，南京的专家却认为，这个从理论上是可以的，但“硫化氢”是一把
双刃剑，可以降血压，却会对胰岛造成损伤。
研究：
老鼠“吃屁”，血压平稳
有新研究表明，屁中含有的一种臭鸡蛋味气体能够控制实验鼠的血压。我们对这种
名为“硫化氢”的气体的恶心气味相当熟悉，因为它来自人体结肠中的细菌，并被最终
排出体外。
国外科学家做个老鼠实验，给一组实验老鼠打一种营养液，其中去除“硫化氢”的
化学分子，另一组对照老鼠则注入正常的营养液。一段时间后，实验者发现，实验组的
老鼠血压很高，而对照组的老鼠血压平稳。这说明“硫化氢”对血压控制有一定的作用
。新的研究发... 阅读全帖 |
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i****e
发帖数: 1527 | 24 老板基本就在办公室，忙的连去试验看大家做实验的时间都没有，哪有时间亲自做实验
啊？
做为一个实验组，老板对自己的Trainee的信任是开展科学工作的基础，当然如何去训
练自己的学生成为一个严谨的科学工作者也是老板的重要职责。
老板如果对自己的学生实验结果有疑问，可以讨论，可以让组内其他人重复，但是老板
亲自去重复我还真不觉得有什么值得推崇的。
还有为何大家自然而然觉得老板做的实验水平一定就比下边的学生的水平高呢？
当然如果实验室没有其他人手了，那另当别论了。 |
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b******s
发帖数: 5365 | 25 从来没有做过B cell,现在要在B cell line里看一个细胞内蛋白,用一样的抗体,flow
cytometry没问题但做cofocal isotype control 的背景很强.目前为止blocking 效果
最好的就是老鼠血清(用的抗体是monoclonal mouse antibody directly conjugated
with Alexa Fluor),但问题是背景没了,信号也弱了好多.这个实验组和isocontrol 比
起来亮不了多少.现在打算用1抗加2抗做,一般是用和二抗同种的血清来做blocking,但
听之前染过这个蛋白的人说,二抗血清对B cell Fc没什么作用.我的问题如下:
1. 不知道这种情况下能不能先做Fc blocking再用二抗血清block?
2.Caltac Laboratories (now belong to Invitrogen)原来有个抗CD32,但不连接荧光
素的已经不卖了,而且那个也是从老鼠养出来的.请问有什么非老鼠的抗体或血清适合做
human B cell FcR blocking?
3. 做co-staining 的... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 26 通俗点讲
Brain Tumor Cytoskeleton Dynamic Microtubules likes Tublin Myosin Action etc
. projects
要借助数学 和工程计算学 生化学
药学 医学 至少 5 个实验组的co-Fundings.
比如以下 生化数学计算方面的 论文
Margolin G. at al. (2012)
The mechanisms of microtubule catastrophe and rescue: implications from
analysis of a dimer-scale computational model
Mol Biol Cell. 23: 642-56.
link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22190741
引用它的论文 是应用药学方面的
Bouazza N et al. (2011)
Population pharmacokinetics and pharmacodynamics of cysteamine in
nephropathic cy... 阅读全帖 |
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W*********n
发帖数: 775 | 27 谢谢回复！
有对照组和实验组，所以花费得2K. 其实样品不是难制备，就是处理起来比较繁琐。再
者，我前面作了两个生物重复了，这是第三次，然后分析，如果这次结果不好，就是鸡
肋，扔不扔的都很头痛。所以我就想知道这个蛋白样品，如果仅仅是上面的2个问题，
是不是对实验结果不产生影响。如果有影响，就重新制备，没有影响，就继续。 |
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f****6
发帖数: 365 | 28 目前的课题，我们用一个表面分子标记了一群特征性的T细胞亚群，这是一个新发现，
以前从没有人报
道过，而且我有microarray的结果，上面罗列了几乎2000基因在这群细胞上的高表达或
者低表达，这
几乎是个寻宝图。我认为这是个新领域，在这群细胞上有很多可做的。
假如我离开目前的组，我能在其他组或者回国继续做这个吗？虽然用老板发现的分子标
记可以界定这群
细胞，但我在实验的过程中又陆续发现了其他两个标记，假如老板不让我用他发现的标
记，我是否可以
用我发现的那两个标记去研究他们？
实在是对老板失望了。组里一个4个人：老板（黑人），一个白女孩（ 博后),另一个白
女孩 （技术
员），加上我（博后）。上周老板对我说技术员只想管少量老鼠，所以老板要我分管60
多笼老鼠。我问
为什么我要管那没多老鼠，那个博后也应该管一些老鼠？老板立即脱口而出：No, she
is postdoctor.
我说：难道我不是博后？他一下楞了，然后说：那些老鼠都是你的。 然后我去查了那
些老鼠，发现大
多数都不是我的用的，有些品系是储备品种，有些是共用的。
其他事情我都不想说了，总之，老板对那两白女特别偏袒，她们的... 阅读全帖 |
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w*******r
发帖数: 23 | 29 我试验目的是找到药物的靶标。control是beads，实验组是用biotinylated drug pull
down 细胞裂解液中的靶蛋白。在60KD左右发现了一条只出现在pull down sample里的
条带。于是，我把60KD的带切下来送去做质谱。可分析结果中丰度最大的却是一个70多
KD的蛋白，这是怎么回事？如果是个小于60KD的蛋白，那么还可能是翻译后修饰导致的
。但为什么我明明在60KD切下的胶，会有70多KD的蛋白呢？这个蛋白有两个isoform，
都是70多KD，查了文献，也没有什么剪切处理的产物。百思不得其解，求高手解惑。万
分感谢！ |
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s*******e
发帖数: 1544 | 30 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: softknife (软刀), 信区: Military
标 题: 好消息：湖南转基因大米事件3人被撤职
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Dec 6 08:47:51 2012, 美东)
http://news.qq.com/a/20121206/002001.htm?qq=0&ADUIN=57335376&AD
---------------------------------------
人民网北京12月6日电 （记者 李叶）中国疾病预防控制中心今日在其网站对“黄金大
米”一事进行情况通报。通报称，湖南省衡南县江口镇中心小学25名儿童于2008年6月2
日随午餐每人食用了60克“黄金大米”米饭。“黄金大米”米饭系由美国塔夫茨大学汤
光文在美国进行烹调后，未按规定向国内相关机构申报，于2008年5月29日携带入境。
中国疾控中心对此次事件造成的不良影响深表歉意。三名当事人被处分。
2008年5月20日至6月23日，含“黄金大米”实验组的试验在湖南省衡南县江口镇中心小
学实施。试验对象为80名儿童，随机分为3组，其... 阅读全帖 |
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f**********r
发帖数: 18251 | 31 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: softknife (软刀), 信区: Military
标 题: 好消息：湖南转基因大米事件3人被撤职
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Dec 6 08:47:51 2012, 美东)
http://news.qq.com/a/20121206/002001.htm?qq=0&ADUIN=57335376&AD
---------------------------------------
人民网北京12月6日电 （记者 李叶）中国疾病预防控制中心今日在其网站对“黄金大
米”一事进行情况通报。通报称，湖南省衡南县江口镇中心小学25名儿童于2008年6月2
日随午餐每人食用了60克“黄金大米”米饭。“黄金大米”米饭系由美国塔夫茨大学汤
光文在美国进行烹调后，未按规定向国内相关机构申报，于2008年5月29日携带入境。
中国疾控中心对此次事件造成的不良影响深表歉意。三名当事人被处分。
2008年5月20日至6月23日，含“黄金大米”实验组的试验在湖南省衡南县江口镇中心小
学实施。试验对象为80名儿童，随机分为3组，其... 阅读全帖 |
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r******g
发帖数: 600 | 32 很决定于实验组的！有的老板很严谨，有的老板则是唯利是图啊 |
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A*******e
发帖数: 13 | 33 ：转一个，听说还有些比较激进的言论没有收在文字稿里。
中科院神经科学研究所2012 年年会蒲慕明所长的讲话
谈灰色地带的科研诚信
2012 年12 月28 日
（根据录音整理）
一、前言
我今天想讲的主题是过去主题的延续。几年前我曾经谈过诚信的问题。科学
研究的诚信问题现在越来越重要。媒体上常有关于科学不端行为的报导，但事实
上明目张胆的科学不端行为（scientific misconducts），所谓伪造、篡改和剽窃
（Fabrication，Falsification，Plagiarism，简称FFP），是极少见的。现在最严重
的问题不是明显的FFP，而是灰色地带的诚信问题，就是那些不容易被发现、标
准不容易确定的问题。我们每一个从事科学研究的人都会遇到这些问题，都应该
认真考虑，当遇到这些问题时，怎么做才符合诚信的要求。
二、数据分析和表述时的灰色地带行为
今天我首先想讲的就是数据分析和表述时的不当行为。首先，较严重的就是
选择数据。只选择自己喜欢的结果，不喜欢的就不要。忽略不计对自己的结论有
威胁性的数据。第二，在发表文章或口头表述结果时不当地夸大表述。前者比较
容易判断是非，... 阅读全帖 |
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s*********y
发帖数: 579 | 34 对照组发病率是0，实验组d1/2是0， 三天后是50％，6天是100％。
是用Group还是Survival？怎么出来的都不是我想要的？Y axis怎么设定？
谢谢！ |
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m******5
发帖数: 1383 | 35 Con 和实验组都用mytomycin c 处理一下后单独score migration and invasion |
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H**1
发帖数: 34 | 36 老王，老刘和老张
老王，老张和老刘都是美国中西部一个州立大学的博后，
之所以叫做老王，老张，老刘，并不是因为昵称或者爱称，
而是因为他们的确都很老。
30多岁还在学校里晃悠，既不是学生，也不是老师，
而且看起来很像老师，甚至比一些新来的老师都老，
所以索性取了一个老字，叫做老王，老张还有老刘。
老王，老张还有老刘是很好的朋友，算不上基友，他们不太懂
什么是基友，10年的qq还不是太阳，有个人人账号，访问量，
也没过500。三个人算不上志同道合，几乎没有什么
共同点，唯一的共同点，就是他们都是博后，哦，对了
另一个共同点就是他们都养小白鼠和细胞。
老张常常羡慕老王和老刘，因为老王和老刘是美派博士，本科毕业就出国了，
而老张，在国内读完了博士才来的美国，他说老王和老刘活的比他明白，
至少来美国五六年出去旅游过两三次，去过纽约和芝加哥。他来了
美国两年，只去过一次底特律，还是来的时候转机。
老张常说，他其实本科毕业就能来美国，因为当时女朋友反对，
就没出来，后来在国内读博时，被女朋友甩了，嫌他快30了，
还屌毛没有，耽误了她的青春。没说到这儿，老张就撇撇嘴，说，
操她大爷的，
老子的有的是屌... 阅读全帖 |
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n*m
发帖数: 27 | 37 你们有没有遇到全或无的数据，就是对照是0，实验组有数据。做什么量化的图啊，
比如做柱状图的话，对照是0，也没有error bar啊，图看起来不是很怪？对于这种所有
对照背景为0的数据，做什么样的量化图表示出来啊？
多谢达人指教！ |
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l******a
发帖数: 3339 | 38 对我是外行，你是内行。
我没有从他的data里看出来吃了GMO的老鼠得癌多。实验组60个老鼠，有些组得癌的比
control要少，有些组多一点儿，control 10个，我不觉得能说明任何问题。我觉得我
抛70个银币，10个control，另外60个分成不同的组，能得出跟他差不多的结论。也许
把control也搞成60个，能说明一些问题。period。 |
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X*******8
发帖数: 3895 | 39 先说一哈，本人从未来过生物版，这是第一次。平时都是在车板修车，菌斑关心国家大
事。来这里也属偶然，主要是被一个讨论BT的贴子吸引近来的。我曾经给一个反转基因
的网友写过一个科普，有些关于BT的内容。既然这里也在讨论，就转过来。算是抛砖引
玉吧。好像在菌斑听说过，在生物版反对转基因，会被狗血喷头的。哈哈，大家嘴下留
情啊。我觉得谩骂，不解决问题，理性讨论则有助于双方的提高。
先说一个我自己的困惑。记得方世民曾经说反转基因是生物界的共识。如果说反转基因
就是反对在中国主粮匆忙推广转基因的话，我是孤陋寡闻，没听说过这个共识。本人好
歹也在一个所谓的主流机构工作，据本人不完全调查，周围十有八九的同事都不支持在
主粮匆忙推广。都还是希望对BT有一个长期的毒理试验。因此，我怎么觉得，方说的其
实主流对支持转基因研究的态度。如果是这样，倒没错。我们谁会去反对转基因研究？
那毕竟是我们的饭碗啊。方应该把话说明白点。免得误导大家。
下面的观点纯属我本人的一知半解，欢迎有远见的，真知灼见的讨论，谢绝谩骂。奇葩
论就不要说了。
摘要：BT其实是会被生物体吸收的。BT的确能改变生物体的某些生理指标的。短期摄入... 阅读全帖 |
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X*******8
发帖数: 3895 | 40 先说一哈，本人从未来过生物版，这是第一次。平时都是在车板修车，菌斑关心国家大
事。来这里也属偶然，主要是被一个讨论BT的贴子吸引近来的。我曾经给一个反转基因
的网友写过一个科普，有些关于BT的内容。既然这里也在讨论，就转过来。算是抛砖引
玉吧。好像在菌斑听说过，在生物版反对转基因，会被狗血喷头的。哈哈，大家嘴下留
情啊。我觉得谩骂，不解决问题，理性讨论则有助于双方的提高。
先说一个我自己的困惑。记得方世民曾经说支持基因是生物界的共识。如果说支持转基
因就是支持在中国主粮匆忙推广转基因的话，我是孤陋寡闻，没听说过这个共识。本人
好歹也在一个所谓的主流机构工作，据本人不完全调查，周围十有八九的同事都不支持
在主粮匆忙推广。都还是希望对BT有一个长期的毒理试验。因此，我怎么觉得，方说的
其实主流对支持转基因研究的态度。如果是这样，倒没错。我们谁会去反对转基因研究
？方应该把话说明白点。免得误导大家。
下面的观点纯属我本人的一知半解，欢迎有远见的，有理有据的，真知灼见的讨论，谢
绝谩骂。
摘要：BT其实是会被生物体吸收的。BT的确能改变生物体的某些生理指标的。短期摄入
含BT食物可能不影响健康... 阅读全帖 |
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c******r
发帖数: 3778 | 41 我的意思是：
“不过一个叫Irina Ermakova （Ermakova, IV NAT
BIOTECH, 2007: 25(12):1351-1354; Marshall, A. NAT BIOTECH, 2007; 25(9):981-
987)的研究还是值得大家看看的(当然，这个研究主要是关于Roundup-Ready (RR) soya
，而不是关于BT的。但本质是探讨转基因对生物体机能的影响)。我倒不是要你们去看
她的研究结果，主要是让你们去看看他们的辩论。关于这篇文章，我多说两句。
Ermakovade 的实验算是很系统的研究了转基因对小鼠健康的影响。很有意思的是，人
们指责 Ermakova的实验设计有问题，借此否定她的结果。但我看了 Marshall的评论，
着实可笑，首先 Marshall先入为主，说谁谁已经证明转基因没有害处，所以 Ermakova
的结果不可信。这种逻辑很荒谬。其次，指责人家实验设计有问题，但压根没去看人家
的全文，仅凭他问的几个问题，居然想当然认为Ermakova的实验中，实验组和对照组的
老鼠养在不同条件下，由此得出，出现的差异是由于饲养环境... 阅读全帖 |
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t**l
发帖数: 109 | 42 我想做个实验，实验组的结果是XIST down regulation，能用QPCR做XIST吗。还是需要
做RNA IN SITU？想找一个比较routine的方法测量XIST
male cell 会有XIST吗？还是说只有femail才有xist |
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n**********u
发帖数: 77 | 43 美国大地现在都还是沉沉入睡的时刻，悠闲的中国周日下午也很少人有机会翻墙看看有
关学术争议的回复。 没想到我在香港尽然能够第一个回复。 不清楚这个方面的研究，
上下文也不清楚，但是楼主对待科学的态度还是很认真的，至少从国内申请奖项的态度
上楼主的实验室还是保守的。这种前沿问题还没有完全明晰之前，还是保守低调一些为
好，数据和实践是最好的评审，楼主一直用这样一个态度去做会成功的。 我只有做过
qpcr， 针对gDNA的，raw CT data和背景值这些放上去有用吗，单纯的数据摆上去我想
也很少有人关心吧，我也可能没有这方面的经验而看不懂（对照的就是背景值吗？
under detection 不就行了）。检测的可信范围这个我想实验组的量比内参的高的话，
应该就可行了吧。 |
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g*****n
发帖数: 250 | 44 "假阳性"是什么意思？发表的结果不是来自一次实验。对照组里没有，实验组里有，那
就可能是“真阳性”。重复了n次，都是这样，而且统计出显著差异，那怎么可能是假
阳性？科研基本的原则。 |
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x**********o
发帖数: 142 | 45 看来学医的不懂生物，学生物的不懂医，还是我来回答一下吧
法国的论文与孟山都的三个月论文实验组与对照组数量是一样的，之所以要这样分组就
是因为想以长期实验来反驳孟山都的三个月实验，这点在生物版上已经有人贴过了
关于SD大鼠易患癌，按照法国科学家的解释，最应该关注的是肿瘤爆发的速度。在三组
实验鼠中，肿瘤或者肝肾反应从第4个月开始有迹象，第11或者第12个月爆发。换算成
人类是在35到40岁。在对照组中肿瘤突发于生命终结期，大约第23或24个月，这在鼠类
中属于正常
为什么会这么说，因为很多哺乳动物到老了都会得癌，比如人类就是这样，男性人类中
80岁以上尸体解剖得前列腺癌的可能性是90%以上，但是40岁左右得前列腺癌的人却很低
所以，法国的科学家证明的是食用转基因，可以使不容易得癌的年青SD大鼠得癌，也就
是如果人吃转基因的话，可以使本不容易得癌的中青年的人得癌率增加 |
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l***s
发帖数: 841 | 46 Technical replicates算SE没有什么意义。 一般来说 同一实验组内Ct variation不超
过0.2，SE几乎为0. 正确的做法是做三次独立的实验，这才是真正意义上的replicates。 |
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r******g
发帖数: 600 | 47 没有问题啊
Null Hypothesis 是 1：19啊
（通俗的解释啊）
你的结果是11：89，P value＝0.05的意思是，在null hypothesis基础上只有5%的概率
得到比11：89的情况更extreme的结果啊！所以，你的实验结果是阳性啊啊，换句话说
，你的实验结果跟1：19不一样！
所以，在1：19的背景下，想得到11：89的结果已经是难上加难了，如果想得到30：70
就更难了，只有1%可能得到比30：70更extreme的结果！所以，非常非常不可能，也就
是说，原来1：19的null hypothesis被你的数据推翻了，于是，你的结果是阳性的！
比如，你做一个 RTPCR，control RQ value是 1，1.2, 1.3
实验组 结果是 89, 90, 100.
做这个rtpcr之前，你是不知道结果的，所以你的null hypothesis是，control=
experimtal
显然，你这个结果情况下P value会很低了，因为，基于你的null hypothesis 出现89.
90，100的概率太低了，所以，你的Pvalue很低... 阅读全帖 |
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r******g
发帖数: 600 | 48 没有问题啊
Null Hypothesis 是 1：19啊
（通俗的解释啊）
你的结果是11：89，P value＝0.05的意思是，在null hypothesis基础上只有5%的概率
得到比11：89的情况更extreme的结果啊！所以，你的实验结果是阳性啊啊，换句话说
，你的实验结果跟1：19不一样！
所以，在1：19的背景下，想得到11：89的结果已经是难上加难了，如果想得到30：70
就更难了，只有1%可能得到比30：70更extreme的结果！所以，非常非常不可能，也就
是说，原来1：19的null hypothesis被你的数据推翻了，于是，你的结果是阳性的！
比如，你做一个 RTPCR，control RQ value是 1，1.2, 1.3
实验组 结果是 89, 90, 100.
做这个rtpcr之前，你是不知道结果的，所以你的null hypothesis是，control=
experimtal
显然，你这个结果情况下P value会很低了，因为，基于你的null hypothesis 出现89.
90，100的概率太低了，所以，你的Pvalue很低... 阅读全帖 |
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a******a
发帖数: 283 | 49 我试了两次。一次结果和预计的差不多，10^4细胞有大约那么多的细胞基因数量测出来
；另外一次就差些，有可能丢细胞比较明显。
我的步骤就是：离心，加水20ul，p20枪头反复吸放20次，然后取3ul作pcr。
但是我的100个细胞的实验组只测到个位数的genomes数量 ：（
有没有建议？
另外如果从活体病理组织细胞取样提取DNA，能否使用同样protocol？有人做过吗？有
什么好的protocol吗？
这个好酷！
我准备尝试一下。我的是就是PCR最后读荧光数据，应该可以吧。
不用跑胶的。
我准备照你这个条件提取DNA，加REs消化下，然后就用来做PCR，看看能不能出来数据
。做ddPCR的。貌似应该可以把。
率。 |
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n**e
发帖数: 2026 | 50 【 以下文字转载自 Midlife 讨论区 】
发信人: nile (nile), 信区: Midlife
标 题: 素食给我健康之——素食与能量
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Mar 22 10:31:19 2014, 美东)
人体能量储蓄有两种方式，脂肪和糖原。用脂肪存储过剩能量的结果就是肥胖。糖原储
存在肝脏和肌肉细胞里，称肝糖原和肌糖原。糖原是健康的能量储存方式。肝糖原可以
随时分解成单糖维持血糖满足脑细胞的能量供应，肌糖原可以在原位为肌肉供能。糖原
储备不足的人不能耐受饥饿。血糖下降，无法用肝糖原迅速补充，饥饿状态下很容易出
现低血糖反应。这个时候靠动员脂肪通过糖异生来补充糖是来不及的。糖原就相当于高
能蓄电池。人们当然希望能够多以糖原而少用脂肪来存储能量。
脂肪和糖原的合成原料都是来自碳水化合物的葡萄糖。脂肪合成和糖原合成最关键的环
节就是脂肪酸合成酶，和糖原合成酶。前者通过脂肪酸合成酶变成脂肪，后者通过糖原
合成酶变成糖原。酶的数量和活性很大程度上是先天决定的。这也就是人们体型胖瘦不
同基础。
糖原合成酶主要受到胰岛素的正调控。进食血糖上升，使胰岛素分泌增加，... 阅读全帖 |
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