D*a
发帖数: 6830 | 1 你以为你真的懂进化论？（五）
Evolution myths: Natural selection leads to ever greater complexity－In fact
, natural selection often leads to ever greater simplicity. And, in many
cases, complexity may initially arise when selection is weak or absent.
上篇博客中的那两个人，无论生多少孩子，都比不上任何一个细菌的孩子多。如果把后
代的数量当作成功的标准，那么他俩都是Loser。
可是，人们倾向于把人类看作进化的最高端，细菌则被认为是最原始的生命形态。换个
说法，人们倾向于认为进化的目的就是把生命越弄越复杂，这个说法是错误的。
进化有时候会把生命越弄越简单。比如，海星和海胆都没有脑子，但它们的祖先反而是
有脑子的，是进化把它们的脑子弄没了。
当然，如今地球上那么多形态复杂的生物也都是进化的产物。那么，进化的方向到底是
倾向于越来越简单，还是越来越复杂？
最新的理论认为，在... 阅读全帖 |
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l**********1
发帖数: 5204 | 2 oligo dT 没错 如target gene 只有一段很短的碱基序列(<120bp) 已知
而没有任何其上游5' 或下游3'的序列信息
只能用oligo dT qRTPCR 从poly A tail 揪出那条mRNA to single strand cDNA
then to double strand cDNA the 附加带酶切位点的各种adapter
再用那些人工加入的带确定碱基序列的 adapter 5' to 3' 对应的 反链 3' to 5' 的引物
PCR cycling
具体步骤请看图:
snap copied and pasted from
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC50225/ |
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l**********1
发帖数: 5204 | 3 RE LZ
Did you read that Oxford nanopare NGS any relative paper? then replied with
below sentence?
1)
Nanopore 在
测长的DNA 上面有优势，号称没有 read length 的上限
2)
nanopore不用nuclease切DNA啊，你在哪里看到的。文章里明确说了，测完后还能
recover DNA的。它这个理论上就是靠DNA不同的碱基和那个pore蛋白的物理互作测序，
可能是氢键吧
3)
but now still has assembly problem
[ 47 ]
发信人: yuem0428 (ym), 信区: Biology
标 题: Re: 测序技术的重磅炸弹--Oxford Nanopore
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Feb 22 17:43:13 2012, 美东)
I would say there are two problems.
1. IT support. All previous sequencing data are from ... 阅读全帖 |
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L*****t
发帖数: 56 | 4 长引物的主要问题是5'容易丢碱基，我一般建议设计的时候多加几个保护碱基而不是纯化。PAGE纯化很贵，何况本来长引物产率就不高，纯化后就更少了。 |
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b****r
发帖数: 17995 | 5 未必一定是垃圾序列，但是目前证据基本没有几个支持不是垃圾序列的。还有那个目前
最流行的，说junk序列的主要目的是减少其他重要序列突变几率，我是从来都觉得不太
靠谱，不管你有三十亿还是三亿碱基对，错误率主要是由polymerase本身决定的，一个
碱基的突变率基本就是那么高，和总共有多少碱基在我看来基本上是独立事件。而且这
个更无法解释为什么这么多人，大家都序列都如此类似，甚至各种great apes之间都如
此类似。而这个问题用我刚才提到的瓶颈和遗传漂变就很容易解释。
月经的话，其他动物，特别是灵长类有类似的现象，这个我确实了解不够。但是仍然和
DNA junk 序列一样，本帖的关键话题方面，我没觉得出血的这种浪费有多威胁生存，
或者能带来多少生殖优势，毕竟有月经的动物仍然是极少数，哪怕是就是在哺乳类里
总之我觉得很多trait就是个碰巧产生的事情，在selection压力不高的时候就保持在这
个后代里了。再打个比方，脊椎动物一个有名的“设计缺陷”就是眼球里的感光细胞是
在感光片的背面，光线要经过血管层，神经层才能到达感光细胞，这样设计的后果造成
光线损失不少，而且如果血管层或者神经... 阅读全帖 |
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b****r
发帖数: 17995 | 6 当初人们对内含子认识有错 ！= 对其他DNA序列认识有错。 你要说junk DNA有用，得
拿出证据，这个很类似法庭上的无罪判定。
灵长类共同有的东西多了，随便选一个碱基，8，90%以上的可能所有灵长类都一样，你
能说这个碱基不应该是一个随机事件？ |
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h*****G
发帖数: 113 | 7 大家好，小弟最近构件质粒，插入GFP到一个基因的intron，利用endogenous的
promoter来表达GFP。基本的思路是Slice acceptor sequence-2A peptide-GFP, 因为
intron之前的exon没有刚好in frame, 所以需要在SA和2A之间加入几个碱基。现在的问
题不知道具体的SA 序列，在Addgene上看了几个plasmid，都没有把具体的序列位置给
标出来，所以也搞不清楚。比如这段序列是addgene一个plasmid的，表明是SA－2A序列
，也知道［］中的是2A序列。但是前面的话具体那段是SA呢，如果我需要在SA和2A之间
插入连个碱基，应该在哪里插入呢？
gcaagcttctgacctcttctcttcctcccacagggcctcgagagatctggcagcg［
gagagggcagaggaagtcttctaac
atgcggtgacgtggaggagaatcccggccct ］
或者各位大侠有没有常用的SA序列呢？非常感谢帮助指导。 |
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C********4
发帖数: 308 | 8 我有一个酶，切一段双链DNA出来，最后得到的是5端缩进去三个碱基。希望把这个缩进
去的补回来，最好还能伸出去一些碱基。
能否清楚的说一下，到底怎么做？
非常感谢！ |
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b*********8
发帖数: 44 | 9 最近想过表达一个21-22nt的miRNA,
1. 请问对于一般这个miRNA 与目标序列有多上个碱基完全匹配才能完全有效？4个碱基
错配会不会有效？
2. 一般要表达多长miRNA？只表达stem loop区段够不够？
谢谢！ |
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C*******e
发帖数: 4348 | 10 rt
有没有人用QuikChange Mutagenesis PCR protocol做过8 kb plasmid？
以前小质粒，4、5 kb的都没什么问题，换碱基、插入、去除什么都行
这次一个8kb的，一共只要替换6个碱基，怎么做都出不来条带
试过优化条件，不同模板浓度，不同PCR条件，加reagent去除2级结构什么的
是不是8kb太长了？ |
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c********n
发帖数: 225 | 11 谈谈和蛋白打交道的日子 （一）
序
笔者已经做了多年和蛋白相关的科研与服务，产品研发生产以及产业化。在这里分享一
下与蛋白打交道这些年带来的一些感想。其实所有的科学研究都是用来解决人类已经和
即将遇到的各种各样的问题的，只有解决了问题才会有更大的存在价值。
第一篇 DNA测序， Sanger Style - 纪念Frederick Sanger
2013年11月20号，Frederick Sanger 去世了， 享年95岁。Sanger是DNA测序之父，获
得过两次诺贝尔奖， 一个是1958年蛋白测序， 另一个是1980年DNA测序。虽然DNA结构
发现的比蛋白晚， 但毕竟是genetic code，master script。ATCG四个碱基的组合比蛋
白的20个氨基酸的天文数字组合可更容易研究找规律了。人天生就是个好奇的动物，
最喜欢找规律, 尤其喜欢从简单的地方入手，所以围绕DNA的研究在Watson-Crick的碱
基配对这个简单地规律被发现以后，起来的就比蛋白快了很多。其实DNA和蛋白， 就像
是帅才和将才， 他们的用处是不同的，需要出色的帅才（DNA）订好了方向，能干的将... 阅读全帖 |
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c********n
发帖数: 225 | 12 谈谈和蛋白打交道的日子 （一）
序
笔者已经做了多年和蛋白相关的科研与服务，产品研发生产以及产业化。在这里分享一
下与蛋白打交道这些年带来的一些感想。其实所有的科学研究都是用来解决人类已经和
即将遇到的各种各样的问题的，只有解决了问题才会有更大的存在价值。
第一篇 DNA测序， Sanger Style - 纪念Frederick Sanger
2013年11月20号，Frederick Sanger 去世了， 享年95岁。Sanger是DNA测序之父，获
得过两次诺贝尔奖， 一个是1958年蛋白测序， 另一个是1980年DNA测序。虽然DNA结构
发现的比蛋白晚， 但毕竟是genetic code，master script。ATCG四个碱基的组合比蛋
白的20个氨基酸的天文数字组合可更容易研究找规律了。人天生就是个好奇的动物，
最喜欢找规律, 尤其喜欢从简单的地方入手，所以围绕DNA的研究在Watson-Crick的碱
基配对这个简单地规律被发现以后，起来的就比蛋白快了很多。其实DNA和蛋白， 就像
是帅才和将才， 他们的用处是不同的，需要出色的帅才（DNA）订好了方向，能干的将... 阅读全帖 |
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H****N
发帖数: 997 | 13 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: mingxiaot (laoghost), 信区: Military
标 题: 崔永元又在转基因上显宝，特发介绍转基因。原创啊
关键字: 转基因,崔永元
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Jun 19 15:41:29 2014, 美东)
算科普，但都是十年前的知识，这十多年转基因的技术发展很快，我说的一些问题应该
可以有改进了。
要获得转基因植物需要两个技术：一是植物组织培养，二是外源基因导入技术。
首先，你没法扛着注射器给老榆树疙瘩扎针吧？所以要转基因得先用激素让植物组织生
长得比较松散。对这种松散的植物组织，你可以大致理解为皮薄，外源基因容易进入。
但这种松散的组织有个大问题，就是它们还能不能重新生成完整的植物。你做半天转基
因，不能拿一堆开不了花结不了果的糟面团子去喂猪吧。所以植物组织培养中最考人的
就是所谓的植物再生。这不奇怪，世间任何事物都是破坏容易建设难，造谣容易辟谣难。
有网友说：美国只做玉米转基因不做小麦转基因，因为小麦是美国佬的主食，他们怕祸
害自己所以不做小麦转基因。但在我看来，更主要的原因恐怕还... 阅读全帖 |
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x********e
发帖数: 35261 | 14 1.碱基配对：DNA中(A+T):(C+G)永远是1：1
2.噬菌体碱基同位素标记 |
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p*******i
发帖数: 449 | 15 “这种可能性非常小吧， 因为剪切后，连接前，总会有些碱基被削掉"
谢谢楼上的热心解答，您的意思，精确剪切和连接几率很小，大部分还是在切点附近有
碱基增减？ |
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O**********a
发帖数: 317 | 17 http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyNDA2NTI4Mg==&mid=208906889&
王晓东谈诺奖：我们来了，我们还会经常再来
2015-10-14 王晓东 知识分子
文｜王晓东（北京生命科学研究所所长）
作者简介：
王晓东，1949年以后出生于中国大陆的华人科学家中，首位当选美国科学院院士者。
1996年，他发现线粒体释放细胞色素C介导细胞凋亡现象，由此发现了细胞凋亡的分子
机理，揭示出线粒体在提供能量之外的第二个功能。除此，他还是第一位在世界权威教
科书《分子细胞生物学》中独立撰写一章的华人科学家。2004年起，王晓东参与创办北
京生命科学研究所，2010年全时回国。他领导的研究所目前已成为世界一流研究所。
人活着，最困惑的无外乎“我从哪里来”、“要到哪里去”两大问题。有宗教情结的朋
友这时会指出，答案在他们那里、而不在科学中。因为科学有局限。
而我则会说：“其实，我们科学界也有实实在在的答案。我们不光能对这两个问题给出
解释，还知道你来这儿干什么。”答案就在我们现代生物学的两项伟大发现里：一个是
DNA双螺旋结构；另一个是遗传密码的解析。... 阅读全帖 |
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j*******1
发帖数: 266 | 19 直到上世纪60 年代，主流进化生物学家认为“几乎全部”生物进化都是有达尔文所说
的“自然选择”产生的，日本群体遗传学家木村资生（Motoo Kimura），对这一观点发
起了强烈挑战。木村认为：在分子水平上，大多数进化改变和物种内的大多数变异，不
是由自然选择引起的，而是通过那些选择上中性或近乎中性的突变等位基因的随机漂变
引起的。他说，能够在一个种群中保持或达到较高出现频率的所有遗传突变，几乎都是
选择中性的，这些突变从适应的角度来说是中性的，谈不到什么有利或有害。在环境中
，基本上无法察觉，它能在一个种群中以不显现的方式传递，这一过程又被称为随机遗
传漂变（genetic drift） (Kimura 1968)。
中性进化学说是一种非达尔文理论的进化模式。木村刚提出中性突变理论时，占主流的
达尔文对这个理论十分反对，两派打的不可开交。到了20世纪80年代，大多数进化遗传
学家，包括达尔文派的理论家都接受了中性进化学说。
木村资生能提出中性进化学说，是和当时分子生物学的进展有直接关系。 1953年JD沃
森（James Watson）和FHC克里克 (Fredrick Click)... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 20 本文首发于2017年4月6日《南方周末》
近日，国内外主流媒体纷纷以“大多数癌症发生因运气不好”为题或类似题目，报道一
项2017年3月24日发表在美国《科学》杂志的研究成果，该研究指出癌症相关的基因突
变有三分之二是随机的，这不仅在学术界引起科学家广泛争论，也给普通民众带来极大
的困惑。
新论文，旧争论
癌症是所有恶性肿瘤的总称，都是由于一些细胞关键基因发生突变，导致细胞分裂和增
殖无法控制而造成的病变，而引发基因突变的原因多种多样，归纳起来则包括环境因素
、遗传因素，以及近年来发现的基因随机突变。一直以来，各国卫生部门、防癌公益组
织和医生都告诉大家，只要采取健康生活方式、避免接触致癌物等积极措施，大多数癌
症可以预防，很多科学研究也支持这一观点。
但是，来自美国约翰·霍普金斯大学的克里斯蒂安·托马赛蒂（Cristian Tomasetti）
、李路（Lu Li）和伯特·沃格斯坦（Bert Vogelstein）合作，2017年3月24日在美国
《科学》杂志在线发表了他们的最近研究成果，再次挑战了这一观点。
该研究小组基于423个国际癌症数据库，通过复杂的数学模型，分析了全球69个... 阅读全帖 |
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c******n
发帖数: 16403 | 21 http://tech.sina.com.cn/d/2009-05-15/09163095276.shtml
英国化学家找到地球生命源头
http://www.sina.com.cn 2009年05月15日 09:16 新浪科技
新浪科技讯 北京时间5月15日消息，据国外媒体报道，英国科学家13日表示，化学
反应导致地球生命在沸腾的简单化学物“汤”里出现，目前他们已经确定了这个过程的
重要步骤。
活生物体里的遗传信息现在都被保存在脱氧核糖核酸(DNA)里，这种核酸是非常有名
的糖、磷酸盐和一种碱基的“双螺旋”分子。但是DNA非常复杂，根本不会突然出现，科
学家认为它的单链亲属——核糖核酸(RNA)是最先出现的。
RNA在病毒合成蛋白质的过程中扮演着重要角色，病毒主要用它储存遗传密码。它在
化学方面与DNA非常类似，但是它的结构更简单，更结实。因此它看起来是地球上第一批
信息密码核酸的合适之选。但是“RNA先出现”的理论遇到了实际问题。
据传统看法认为，它的三个成分——碱基、核糖和磷酸糖类必须分别形成后，再合
成这种分子。然而评论家表示，比DNA稍微简单一些的RNA仍是一种复杂分子， |
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s*k
发帖数: 144 | 22 排骨, 以下是对您以上的关于DNA拓扑异构酶文章背景知识的一点补充.
对于DNA,当其处于正常生理溶液环境时,每隔10对碱基即大约3.4nm
DNA分子旋转一周(这是1953 Watson and Crick最重要的发现,即DNA的双螺旋).
多于此(每少于10对碱基即互旋360度)的在生理溶液环境下的DNA称之为超螺旋
(supercoil), 少于此的叫欠螺旋,两者在生理溶液中均具有张力(物理里是不是称
其为具有较高自由能?), 对于此,DNA拓扑异构酶使其回复到张力较低的状态是不
需要外能的, 即不消耗ATP, 而DNA拓扑异构酶使DNA达到高张力的状态是需要
外能的(消耗ATP).
在一般生物体中的DNA是处于超螺旋状态,它使DNA两条链缠得更紧, 而在DNA复制或
转录的时候,DNA拓扑异构酶使其解螺旋到常态或欠螺旋状态.
一般从生物里提取的genome DNA是处于常态,但病毒或质粒的DNA常是超螺旋态.
以上讨论均指B型DNA,另外还有A型和Z型DNA,三链DNA,这些是DNA分子在不同
溶液环境下的自然状态,螺旋数与B型不一样.
有两本书值得推荐:
Cantor, C. |
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A********a
发帖数: 1168 | 23 研究人员认为，章鱼、鱿鱼和墨鱼等头足类动物能通过编辑自己的基因来学习新的技能
，但这么做的代价就是无法演化速度的减慢。
科学家发现，鱿鱼大脑中超过60%的RNA转录物是通过编辑记录下来的，而人类身上这一
比例只有1%。
新浪科技讯 北京时间5月2日消息，据国外媒体报道，从打开水族缸的开关，到瞬
时的伪装变色，章鱼、鱿鱼和墨鱼等头足类动物以完成复杂行为的能力著称。近日的一
项新研究揭示了它们这些复杂行为背后的奇特演化路径。
研究人员认为，章鱼和鱿鱼等动物能通过编辑自己的基因来学习新的技能，但这么
做的代价就是演化速度的减慢。在此前的研究中，科学家发现鱿鱼的RNA（核糖核酸，
负责蛋白质合成的分子）编码区域表现出非常高的编辑率。在这些结果的基础上，来自
美国芝加哥大学海洋生物实验室的科学家发现，乌贼大脑中超过60%的RNA转录物是通过
重编码记录下来的，而人类身上这一比例只有1%。
在后续研究中，科学家在其他3个头足类物种中发现了同样活跃的RNA编辑水平。这
3个物种包括两种章鱼和一种墨鱼，它们都属于蛸亚纲（Coleoidea）。研究人员还鉴别
出了数千个演化过程中保存下来的RNA重编码位... 阅读全帖 |
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c********g
发帖数: 15629 | 24 http://zgrx.freeforums.org/topic-t35.html
方舟子与陈章良
对绝大多数海外学人来说，陈章良是一个耳熟能详的名字。这不仅仅是因为他是中国留
学生中回国时间较早（1987年）、回国之后地位上升得最快（1989年任北大正教授、
1992年起任北大生物系主任、生命科学院院长、1995年任北大副校长）、名气大得惊人
的一位人物，更是因为关于这个人的传闻一直不绝于耳。这是一些什么样的传闻呢？方
舟子曾在2000年12月16日专门就此撰写了一篇文章，题为《为什么不把陈章良立此存照
？》，其中说：
“目前网上对陈章良的指责主要有四点（估计都来源于《华夏文摘》几年前登过的一篇
攻击谈家祯、陈章良的文章，那篇文章充满不实之词，极不负责任）：
一、陈章良抄袭。
二、陈章良伪造恐龙蛋基因研究。
三、陈章良生活作风有问题。
四、陈章良学术成果太少。
对后面两点，不在我们打假范围。对前面两点，解释如下。”
http://www.xys.org/xys/ebooks/others/sc ... gliang.txt
方舟子说，“陈章良学术成果太少……不在我们打假范围”，显然是... 阅读全帖 |
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g*********r
发帖数: 9366 | 25 ☆─────────────────────────────────────☆
coarsening (草枯鹰眼疾，雪尽马蹄轻) 于 (Sun Jan 1 00:19:46 2012, 美东) 提到:
http://zgrx.freeforums.org/topic-t35.html
方舟子与陈章良
对绝大多数海外学人来说，陈章良是一个耳熟能详的名字。这不仅仅是因为他是中国留
学生中回国时间较早（1987年）、回国之后地位上升得最快（1989年任北大正教授、
1992年起任北大生物系主任、生命科学院院长、1995年任北大副校长）、名气大得惊人
的一位人物，更是因为关于这个人的传闻一直不绝于耳。这是一些什么样的传闻呢？方
舟子曾在2000年12月16日专门就此撰写了一篇文章，题为《为什么不把陈章良立此存照
？》，其中说：
“目前网上对陈章良的指责主要有四点（估计都来源于《华夏文摘》几年前登过的一篇
攻击谈家祯、陈章良的文章，那篇文章充满不实之词，极不负责任）：
一、陈章良抄袭。
二、陈章良伪造恐龙蛋基因研究。
三、陈章良生活作风有问题。
四、陈章良学术成果太少。
对后面两点，... 阅读全帖 |
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B*V
发帖数: 3365 | 26 【 以下文字转载自 MiscNews 讨论区 】
发信人: Cnews (chinanews), 信区: MiscNews
标 题: [ZGPT]变形金刚并非虚幻 美军开展“可编程物质”研究
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Jan 27 19:50:55 2013, 美东)
编者按：当你欣赏好莱坞大片《变形金刚》时，也许难以想象，这些能随意变化的“大
家伙”，有朝一日会走进现实生活。据有关报道称，美国宇航局就曾打造了一款名为“
超级机器人”的现实版变形金刚。它由20个不同的独立“模块”组成，能根据担负的任
务自行决定在何时何地变身以适应所处的环境。与“可重构机器人”的哲学原理相似，
美国国防部高级研究计划局正在进行的一项名为“可编程物质”的研究项目也于近日取
得了阶段性进展。
近年来，随着半导体纳米技术和自复制技术的发展，“可编程物质”开始从理论模拟迈
向真正的物理实现。一旦研制成功并应用于军事领域，就能为士兵提供革命性的新功能
。未来战场上的士兵，再也不用为背负沉重的背囊等牢骚满腹，他们只需携带一定量的
“可编程物质”，通过下达指令，将其变成所需要的武器或工具，包括军械、智能... 阅读全帖 |
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w********n
发帖数: 1119 | 27 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: wanglanlan (南刀北猫 东奇西虎), 信区: Military
标 题: 家宝很活跃：出书忆SARS时期：夜不能寐 泪流满面
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 1 05:01:42 2013, 美东)
家宝这明显是不希望大家这么快就把家宝忘记啊？ 我估计宝宝还会长期活跃在大家视
线内
温家宝新书谈SARS：夜不能寐时常常泪流满面
2013年11月01日13:46
来源：新华网
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新华网北京11月1日电 《温家宝谈教育》一书10月31日由人民出版社、人民教育出
版社联合出版发行，内容涵盖了温家宝自1995年9月至2013年3月的代表性教育论述。全
书分为五大部分，即“强国必强教，强国先强教(代序)”、“关于教育工作的讲话”、
“关于教育工作的通信”、“与大学师生的座谈”以及“附录：重视教育工作纪事”，
内容包括讲话、报告、信函、谈话等66篇，新闻媒体报道文章17组，教育活动图片50余
幅，总计50余万字。
10月31日，《温家宝谈教育》新书首发式在北京西单图书... 阅读全帖 |
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x*******8
发帖数: 1254 | 28 邓亚军，中国最早的一代DNA鉴定师之一，8年以前，当她从一个法医偶然转行到亲子鉴
定。8年间，2万余例DNA亲子鉴定，他们当中有20多岁的年轻人，也有六七十岁的老人
，无论孩子是1岁、两岁还是三四十岁，他们都想知道这个孩子是不是自己的。
70多岁老汉怀疑30岁儿子非亲生
鉴定室会遇到形形色色的人，有一个很极端的案例，是一个70多岁的老头，他纠结
了30多年，儿子都30多岁了，我有什么办法可以把我儿子的样本拿到，还不让儿子觉察
?他一遍一遍地打电话，鉴定师就告诉他，那就买包好烟，把他叫你家里去，让他抽一
下，把这个烟头留给我们就行。
8岁“小冬”仍未找到生父
一位亲子鉴定专家告诉记者，曾有一个怀孕的女子挺着大肚子过来做亲子鉴定，接
连测试了三个男子的样本，才最终确定。“今年一年就有3例类似的情况。”8岁的“小
冬”，则是一个“悲剧”的孩子，出生不久便被爸爸怀疑为非亲生子。去年，他被带到
广州某大学法医鉴定中心进行亲子鉴定，结果出来，他不是爸爸的亲骨肉，父母随之离
婚。之后，妈妈为了寻找“小冬”的生父，先后三次带着三个男子的样本过来鉴定，但
都不是孩子生父。
TIPS：DNA亲子鉴定测试准... 阅读全帖 |
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w********n
发帖数: 1119 | 29 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: wanglanlan (南刀北猫 东奇西虎), 信区: Military
标 题: 家宝很活跃：出书忆SARS时期：夜不能寐 泪流满面
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Nov 1 05:01:42 2013, 美东)
家宝这明显是不希望大家这么快就把家宝忘记啊？ 我估计宝宝还会长期活跃在大家视
线内
温家宝新书谈SARS：夜不能寐时常常泪流满面
2013年11月01日13:46
来源：新华网
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新华网北京11月1日电 《温家宝谈教育》一书10月31日由人民出版社、人民教育出
版社联合出版发行，内容涵盖了温家宝自1995年9月至2013年3月的代表性教育论述。全
书分为五大部分，即“强国必强教，强国先强教(代序)”、“关于教育工作的讲话”、
“关于教育工作的通信”、“与大学师生的座谈”以及“附录：重视教育工作纪事”，
内容包括讲话、报告、信函、谈话等66篇，新闻媒体报道文章17组，教育活动图片50余
幅，总计50余万字。
10月31日，《温家宝谈教育》新书首发式在北京西单图书... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 30 长期以来，直立行走被认为是人类出现的标志之一。虽然如此，但是也有灵长类的动物在这方面并不“服输”。据英国《每日邮报》1月26日报道，一头名叫安巴姆的英国大猩猩直立行走的视频受到网友追捧。虽然安巴姆这段直立行走的视频只有18秒，但在短短几天内，就有近15万人观看。大家都在为这头猩猩的“进化行为”议论纷纷。
可走很长一段距离
在英国肯特郡利姆港口野生动物园拍摄到的视频显示，这只银背大猩猩昂首阔步地直立行走，它也因此立刻成为互联网明星。这段视频是动物研究员约翰娜华生在对有关大猩猩运动情况的项目进行研究时拍摄的。
大部分大猩猩喜欢四肢着地行走，即使有的猩猩经过训练走路，那双腿也总是弯曲的，是一副如履薄冰又很“缺钙”的模样。但是安巴姆却不同，它喜欢直立行走，而且能够很好掌握平衡，走上很长一段距离。
体重近220公斤
大猩猩饲养员菲尔·里奇称：“安巴姆一岁时由于患了重病而不得不接受人类的抚养。作为最后一种手段，人们不得不把它与它的母亲舒巴分开。它在七八岁左右来到利姆港口野生动物园。它是我们动物园最大的大猩猩，它的体重近220公斤。安巴姆的父亲比塔姆在手上有太多食物的情况下也会展现出直立行走的行为。... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 31 据美国有线电视新闻网(CNN)报道，美国只用了几个小时便证实1日在巴基斯坦首都附近一座建筑内击毙的男子就是恐怖大亨奥萨马·本·拉登(专题)。他们如何得知这具头部中弹的尸体就是世界头号通缉犯呢？高级官员在接受美国有线电视新闻网(CNN)采访时给出的答案是：DNA检测比对以及其他手段。
据一名高级官员透露，官员们将在阿伯塔巴德地区击毙的男子的DNA与本·拉登家人的DNA进行比对，最终确认这名男子就是“9·11”恐怖袭击的策划者本·拉登(专题)。现在仍不清楚官员们拥有多少本·拉登家人的DNA样本，或者这些样本来自于哪些人。在2日下午召开的一场新闻简报会上，奥巴马总统的国土安全和反恐顾问约翰·布伦南表示，他们在此次突击行动前就已经获得“初步DNA情报”。官员们指出，在这座建筑击毙的5人中，有一人是本·拉登的儿子。
除了使用DNA鉴定尸体外，官员们还借助可视信息进行身份确认。官员们说，他们进行了照片比对并采用其他面部识别手段。此外，他们还对尸体的面部和身体特征进行了彻底的生物统计分析。美军DNA鉴定计划开拓者、法医病理学家维克托·维德恩表示，美国军方掌握了一些类似本·拉登这样的恐怖组织头目的 D... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 32 @华西都市报:今年5月，川大化工学院的理工男生创立了川大自己的微博“表白墙”，在很短的时间内粉丝就达到近万人，不少川大学子都通过这种方式向意中人表白。然而，因为通过“表白墙”表达爱意的牵手成功率太低，现在热度不复。专家称网络爱情存活率很低，看热闹的人居多。
明天就是“光棍节”了，你是要继续勇敢过节还是要努力地“脱单”？你敢不敢到网上的“表白墙”向暗恋的人表达爱意？昨天，华西都市报推出一项调查，56%的网友赞成“表白墙”这种表白方式，并认为有用，而44%的人认为不可行。今年5月，知名社交网站人人网推出“表白墙”公共主页后，“在网上表白”迅速成为各大高校的潮流。其中，四川大学“表白墙”也因其超高的人气迅速走红，“墙”上的那些表白宣言更是五花八门，风格各异。
川大有了“表白墙”
学生老师都成表白对象
遇到了意中人，但表白的话却怎么也说不出口，谁的青春没有遇到过这种囧事？
5月初，就读于川大化工学院的理工男李强（化名）在上网时，无意中看到了中南大学的网络“表白墙”，身边的好友也纷纷对其进行了关注。作为川大学子，李强下意识地在网上搜索川大表白墙，却没有结果。和同学合计了一番，他决定开设属于川大学... 阅读全帖 |
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a***n
发帖数: 3633 | 33 那不是运气好，而是挂了就挂了。灭绝掉的，或者变异了莫名其妙就死掉有多少？
那种概率题我也读过，他们理论的假设一是碱基可以随意组合，二是不同种生物
彼此之间没有关系，三是生物存在不是由低级到高级进化的，而是要一次性符合
一个很长的基因序列，这样才能创造出一个天文数字。
不过他们假设没有一个是对的。现代科技可以让你生产一段序列，但是随机产生的
序列根本没有活性。生物也不需要一次产生几十亿个序列正确的片段，而是从
短片段起，用数亿年发展过来。 |
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h*******n
发帖数: 980 | 34 除了线粒体DNA和Y染色体，还有一个办法是近几年兴起的，利用散布在染色体非编码区
的microsatellite区域进行分析。所谓非编码区，指这些区域不参与编码RNA，发生突
变一般也不会影响生物的表型和生存能力，因而基本不面对进化过程中的选择压力，可
以一直保存下来。microsatellite repeat是非编码区的短小重复序列，一般1-6个碱基
，可重复几十到几百次。通过分析microsatellite repeat的分布，重复次数和突变，
同样可以达到分析血缘和进化的目的。这个涉及的原理比较复杂，我也只知皮毛，就不
罗嗦了
号1
DNA |
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c*****u
发帖数: 174 | 35 端粒通常是由富含鸟嘌呤核苷酸(G)的短的串联重复序列组成，伸展到染色体的3，端。
一个基
因组内的所有端粒，即一个细胞里不同染色体的端粒都由相同的重复序列组成，但不同
物种的
染色体端粒的重复序列是各异的。哺乳动物和其他脊椎动物染色体端粒的重复序列中有
一个
TTAGGG保守序列，串联重复序列的长度在2 kb到20 kb之间。
端粒的重复序列不是在染色体DNA复制时连续合成的，而是由端粒酶(telomerase)
合成后
添加到染色体的末端。端粒酶最早是在四膜虫(Tetrahymena)中发现的。1985年，
Blackbaurn
和Greider发现人工合成四膜虫端粒的DNA片段(TTGGGG)4，可被四膜虫细胞抽提物中的
一种活
性物质加长，这种活性物质对热、蛋白酶K和RNA酶都敏感。端粒区内的DNA重复序列的
结构是
很特殊的，是一种单链断开的结构，可以不受DNA连接酶的作用。此外，最末端的一些
碱基可
能是“发夹”结构，这样就不会被核酸酶识别而免遭降解。
端粒酶将自身RNA模板合成的DNA重复序列加在后随链亲链的3’端，然后再以延长
了的亲
链为模板，由DNA聚 |
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n*******4
发帖数: 2285 | 36 那个说的就是染色体端粒（Telemere）。每回细胞分裂就缩短几个（固定序列的）碱基
对。被认为是细胞的一种内在时钟（或计数器），端粒缩短到一定程度，染色体不稳定
了，细胞就自动死亡，由此决定细胞能分裂多少次。体细胞都有一个Hayflick Limit，
一般分裂几十到一百次左右就不再分裂。干细胞（Stem Cells）却可以无止境分裂下去
，原因是有Telemerase不断补长Telemere。癌细胞也能无限分裂，就是因为Telemerase
也被激活。体细胞的Telemerase只在早期胚胎发育阶段被激活。一般认为Hayflick
Limit的存在就是为了防止体细胞变成癌细胞（人类细胞分裂一次平均要错几百个到几
千个碱基对），但Hayflick Limit也成了造成生物衰老的原因之一。Telemere附近的
DNA在细胞develop阶段很活跃，常有基因被拷到那里，所以本人认为这里有可能是个
DNA上的一个Cache、Heap区。几十个染色体各有各的Cache。 |
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S*******C
发帖数: 7325 | 37 ☆─────────────────────────────────────☆
monkeylady (MonkeyQueen) 于 (Fri Feb 12 10:22:39 2010, 美东) 提到:
很多证据，当然我看不懂那些证据了。包括我们东亚人。
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phenix0 (super傻蛋) 于 (Fri Feb 12 10:32:44 2010, 美东) 提到:
线粒体DNA
进化树
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monkeylady (MonkeyQueen) 于 (Fri Feb 12 10:39:23 2010, 美东) 提到:
你还懂这个，说说。科普语言，拒绝图标和公式。
☆─────────────────────────────────────☆
phenix0 (super傻蛋) 于 (Fri Feb 12 10:47:11 2010, 美东) 提到:
很久很久以前，非洲有个老太太生了很多小孩。当时的非... 阅读全帖 |
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f*******2
发帖数: 410 | 38 辽代契丹人群分子遗传学研究 （有删节）
作 者：许 月
答辩日期 2006.06.06
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指导教师：周 慧 教授
吉林大学古dna实验室
我师姐做的，欢迎提问啊。
契丹是我国北方的古代游牧民族，它起源于辽河上游的草原地区，于公元907年正式建
立国家政权，国号“契丹”，947年其国号改为“大辽”，1125年为女真人所灭。在其
即将灭亡之际，一部分契丹人西迁至中亚地区建立了“西辽”王朝，公元1218年西辽为
蒙古所灭，至元末明初之时，契丹族便已完全从史籍中消失了。
本文以采集自萧和家族墓地、商都辽墓、尖山辽墓、耶律羽之家族墓地、吐尔基辽墓和
山嘴子辽墓的人骨遗骸为研究对象，对其线粒体DNA高可变一区进行提取、扩增、测序
和序列分析。
个体序列分析的结果表明：在变异位点、突变率、单倍型归属和共享序列分布上，契丹
人群均与亚洲人群非常接近；群体内部关系分析结果表明：萧和家族墓地样本与商都辽
墓样本遗传关系较近，耶律羽之家族墓地样本与吐尔基辽墓样本遗传关系较近，山嘴子
辽墓样本与尖山辽墓样本遗传关系较近，将群体内各墓地分别按照贵族组与平民组、早
期组与中... 阅读全帖 |
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f*******2
发帖数: 410 | 39 辽代契丹人群分子遗传学研究 （有删节）
作 者：许 月
答辩日期 2006.06.06
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指导教师：周 慧 教授
吉林大学古dna实验室
我师姐做的，欢迎提问啊。
契丹是我国北方的古代游牧民族，它起源于辽河上游的草原地区，于公元907年正式建
立国家政权，国号“契丹”，947年其国号改为“大辽”，1125年为女真人所灭。在其
即将灭亡之际，一部分契丹人西迁至中亚地区建立了“西辽”王朝，公元1218年西辽为
蒙古所灭，至元末明初之时，契丹族便已完全从史籍中消失了。
本文以采集自萧和家族墓地、商都辽墓、尖山辽墓、耶律羽之家族墓地、吐尔基辽墓和
山嘴子辽墓的人骨遗骸为研究对象，对其线粒体DNA高可变一区进行提取、扩增、测序
和序列分析。
个体序列分析的结果表明：在变异位点、突变率、单倍型归属和共享序列分布上，契丹
人群均与亚洲人群非常接近；群体内部关系分析结果表明：萧和家族墓地样本与商都辽
墓样本遗传关系较近，耶律羽之家族墓地样本与吐尔基辽墓样本遗传关系较近，山嘴子
辽墓样本与尖山辽墓样本遗传关系较近，将群体内各墓地分别按照贵族组与平民组、早
期组与中... 阅读全帖 |
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D********i
发帖数: 514 | 40 有5种碱基和20多种氨基酸，但地球上核酸包含的信息总量三倍于蛋白质，要靠信息简
并来达到平衡，想想其中的道理。
靠更多的词，还是靠少数词加更多的组合或者顺序变化来表述意义，是两种策略。要表
达相等的信息量，前一个策略显然低效，后一个更容易出错。前一个策略对记忆性要求
高，后一个对逻辑分析性要求高。随着人类脑功能的进步和信息传递工具的改进，后一
种策略越来越有优势，也就成为语言的演变方向。
汉语的分析程度是非常高的。但藏缅语族的语言分析程度很低，例如有非常复杂的格变
化。 |
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T******y
发帖数: 14506 | 41 把碱基粘在玻璃片上的公司。没什么科技含量。民工企业。 |
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T******y
发帖数: 14506 | 42 差不多，就是看病人和正常人的碱基差异。离确诊十万八千里。 |
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y****e
发帖数: 23939 | 43 没关系，反正基因组都测出来了。
灭亡之前，把碱基序列复制10万份，向太空发射出去。以后不管什么文明捡到了就可以
复制人类出来。 |
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e*u
发帖数: 10016 | 44 山西吉林局地多种动物异常 疑祸起转基因玉米
[导读]大老鼠消失、母猪爱生死胎、狗肚子里都是水，此外，羊也出现异常情况。全国
闻名的生猪集散地，很多村子的养猪业已经变得萧条。而这些出现异常的动物，几乎都
吃过同一种玉米——先玉335。
这是一组我们无法给出一个明确新闻由头的报道，因为诸如大老鼠消失、母猪爱生死胎
、狗肚子里都是水等等动物异常现象，已经存在了一段时间。当地的农民会忧虑，还可
能放弃养殖业，甚至将其当成笑谈。他们逐渐习惯了这种异常，我们却无法视若无睹。
在中国乃至世界，反对转基因和支持转基因的两方都打得不可开交，科学、利益、健康
、破坏……转基因的争议围绕着这些关键词愈演愈烈。我们无意卷入其中，但当种种动
物异常现象摆在眼前，转基因却突然又成了绕不开的话题。也许，争议、发现异常并非
坏事，它可以警醒人类，那些未知的不确定的风险，其实近在身边。
老鼠不见了
——山西、吉林动物异常现象调查
美国的专利记录显示，中国大量种植的玉米种子“先玉335”的父本PH4CV的类别编号指
示为转基因农作物，“如果是这样的话，山西、吉林等地的各种动物异常反应就有了比
较合理的解释”
一直深受鼠患... 阅读全帖 |
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p****d
发帖数: 420 | 45
你说的这个是太大张旗鼓了，像这种成品，不知道怎么做买了样品也不一定
能逆向出来。有些技术，比如生物育种，什么种子哪个序列哪个碱基，不知
道你就是大海捞针，知道了比较容易就重复出来。再比如高性能模拟电路设
计，在美国能做得好的中国人有不少，在这边把电路设计好，数据打包回去
生产就行了，根本用不着冒险买样片。而中美之间的数据流量就太多了，就
算想查也查不过来，再说这对一个公司也是正常的数据交流。 |
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t*******y
发帖数: 21396 | 46 自艾滋病病毒1981年被发现以来，终于有医生宣布病人被彻底治愈，但这被认为只是一
起特殊的个案。
在2010年12月的杂志上，德国三所大学医学部的研究人员共同发表论文称，其研究结果
有力地证明一位43岁男性艾滋病患者被治愈。这应该是一个激动人心的结果----自艾滋
病病毒1981年被发现以来，世界上还从未有任何一位病人被治愈。
不过，被“治愈”的并非普通艾滋病人。当前定居柏林的美籍男子蒂莫西•布朗(
Timothy Brown)，十几年前患上艾滋病，几年前又被确诊为白血病。2007年，他在德国
柏林大学夏里特医学院接受了造血干细胞移植，用以治疗白血病。
不同的是，医生为他寻找了一位携带特殊基因的干细胞捐献者，而携带这种特殊基因的
人能够天然抵抗艾滋病病毒的侵扰。
“这是一个十分不寻常的病例，它表明了在特定条件下，通过基因疗法可能会清除人体
内的艾滋病病毒。”美国加州大学洛杉矶分校艾滋病研究所副所长、临床艾滋病研究与
教育中心主任唐纳德•光泰(Ronald Mitsuyasu)表示，“但它本质上并不是基因
疗法。迄今为止，还不能被复制。”
多位专注于艾滋病治疗的国... 阅读全帖 |
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x*****7
发帖数: 7326 | 47 也没有自由基的世界，也会发生DNA碱基错配甚至断裂的小概率事件。
当初我学量子生物学的时候，因为数学基础不够，对偏微分方程的解法没有掌握，但对
老师的这一论断
记得很清楚。据她说是这是将量子力学应用到DNA上的研究成果。
所以关键不是预防电离辐射电磁辐射预防吸烟喝酒嗑药熬夜带来的自由基，而是增强
DNA自我修复的能
力。 |
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h******y
发帖数: 1374 | 48 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: StephenKing (88), 信区: Biology
标 题: 弱弱地请教酶切问题！！！
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Apr 29 22:03:59 2011, 美东)
我最近酶切质粒（PMD-18T)总是切的相当不好，能切开，但是切开的目的带特别弱，质
粒很亮，我guarantee质粒浓度没问题，会不会是目的带弱质粒本身的碱基数太多了？
我用的酶是ASCI和NCOI，请高手指点，不胜感激！
PS：我在考虑可不可以加大上样量，或者在酶切体系中少加点水？
PPS：我以前博士做的是bioinfo，现在博后为了跟一个NAS的大佬，被强迫做bench
work，这一年来非常痛苦。进展很慢。只有一篇文章，刚写好，压在老板手里，还没改。
我是不是应该转回bioinfo？ |
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y****e
发帖数: 23939 | 49 这个是比较marker，不需要三十亿个碱基一一对照。而且早自动化了。而且是很好的可
以并行化的例子。 |
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s******s
发帖数: 13035 | 50 以前国内学校有一生物教授突然领悟了八八六十四卦和生物碱基编码的原理，
见人就拉进办公室侃半天，后来大家都躲着走 |
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