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全部话题 - 话题: 碱基
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x*****8
发帖数: 10683
1
来自主题: Military版 - 为什么会有与正递缸视频
小崔在中情局lab里面紧张地分析DNA。她还从数据库中调出了以往获得的正日和英姬的
DNA序列。
根据网上视频,她假定:烟蒂上应该只有正恩的DNA,而烟灰缸外侧应该只有与正的DNA
。测序和比对结果证实了这一点。
然后,她开始进行表观遗传分析。这是一个比较新的研究领域,生活方式和疾病对DNA
碱基的修饰比如甲基化究竟有哪些影响还是悬而未决的问题。不过,已有的研究表明,
吸烟和喝酒对表观遗传影响较大,并且可能由父母遗传给孩子。小崔发现无论是正恩还
是与正,其表观遗传都符合烟鬼和酒鬼的特征,小崔提出以下猜想:正日和英姬都是烟
鬼加酒鬼,所以正恩和与正也不能幸免。
小崔自己不吸烟,也很少喝酒,也和她父母一致。
忙了一天,小崔回到韩国城吃晚餐。还没有到餐馆,她就预感到那个不太正常的自称夏
先生的老男人这次可能又会准时出现。
说实在的,她对夏的最初印象很不佳:夏似乎有50来岁了,头发稀疏斑白,背部佝偻,
而且体味很难闻,英语口音比较浓。但交谈过几次,她觉得夏真是绝顶聪明,谈起基因
蛋白代谢还有计算机口若悬河。

condition
skin
t******e
发帖数: 2504
2
古DNA不好测,DNA链都降解了,测的过程,就是个无数碎片拼图过程, 我估计肯定有
拼错的地方。
德国马普所测尼人全序DNA,好像耗了有十年。 我的理解,尼人全序DNA出来之后,与
非洲人和非洲以外的智人全序DNA作比较,应该是能辨别出尼人的贡献部分的。
另外,基因组与基因似乎是2个概念, 我的外行理解,基因组大概相当于句子,基因相
当于词汇,碱基就相当于字母。

发帖数: 1
3
不是开玩笑。
实验室用HCN合成了氨基酸/碱基/核糖/脂类这些生命最基本砖块。
千老一天到晚杀小白鼠,敲打基因,怎么会想45亿年前的原始时代?
s***o
发帖数: 1234
4
来自主题: Military版 - Re: 问MRI (核磁共振成像) (转载)
这个耗子有经验。一定要拿最原始的数据,11101100那种。
自己恢复成图像就没人能骗你了。
耗子现在就在一堆碱基里找遗传代谢病的证据。
s*l
发帖数: 9421
5
来自主题: Military版 - 世道变了,数学的都出来骗炮了
尼玛张汤姆的introduction of linear algebra 在三十秒内便被注完,数学系的娃都
没有抢注上,这说明呆子也可以成为celebrity。其实和谁做不重要,重要的是看你怎
么想。数学索男留在你体内的是一串美妙的数学公式,马工留下的是一组程序代码,千
老留下的是一股碱基,作家留下的是一段故事,诗人留下的是一首诗行,歌声留下的是
一首金曲。
n********g
发帖数: 6504
6
来自主题: Military版 - No money? No Nobel Prize.
人际关系、基金和命运对学者的无情嘲弄
From: Bhattacharjee 科研圈 2017-11-07
图片来源:Bryan Bacon/The Huntsville Times

撰文 Yudhijit Bhattacharjee
翻译 李杨
审校 张梦茜
编辑 魏潇
得知他曾经的同事赢得了科学界最伟大的荣誉时,这位荧光蛋白基因的发现者正驾驶着
一辆小客车。他在阿拉巴马州亨茨维尔市的一家本田汽车销售店铺做客户的免费接送服
务,以此为生。
诺贝尔颁奖典礼上的旁观者
2008 年 12 月,道格拉斯·普拉舍(Douglas Prasher)跟汽车店请了一周的假,去参
加在斯德哥尔摩举办的诺贝尔颁奖典礼。这是他和妻子吉娜多年来第一次度假。颁奖礼
当天,他穿上了一套租来的、所有男性参会者都要穿的燕尾服,还有一双从亨茨维尔商
店借的皮鞋。
在诺贝尔晚宴上,普拉舍坐在悬挂于七层楼高的天花板上那闪闪发光的枝形吊灯下,尝
到了第一口他 30 年来梦寐以求的餐后甜酒。当服务员把酒倒进杯子里时,他问是否可
以把瓶子放在桌上,却被服务员拒绝了。她告诉他这剩下的酒是工作人员打算晚点偷偷
喝掉的... 阅读全帖

发帖数: 1
7
pcr要是primer里有连续两三个碱基不一样,可能就扩增不了了
如果现在病人感染的毒株和报道毒株的序列不一样的地方正好在那个primer上
那就检测不到 导致假阴性了
解决办法 可以按虾蟹的做microarray
或者加一对罐装病毒保守区的引物


: 多不多变应该是看结构重不重要吧

: 弄到跟人体细胞结合的部分

: 应该就可以稳定检测了

: 根据黄总的研究

: 这些区域在哪里还是相对容易判断的


发帖数: 1
8
睡前再回一下 你说的原理是对的 新型肺炎各个毒株那个区域是应该差别小
但是小到什么程度呢
我刚说了 pcr的probe如果连续两三个碱基不一致就可能检测不到


: 和其他区别大,但自己应该变化比较小吧

: 否则就没法感染了

: 区别大,所以其他罐装病毒不感染人

: 正好突变了一个往人这里传的


发帖数: 1
9
来自主题: Military版 - 能教授能不能用电镜暴笑祖国呢
RNA病毒解结构用途不大,人家随便突变一个碱基结构就变了,你就白干了
这版上外行真多,还老是攻击千老
x*****8
发帖数: 10683
10
来自主题: Military版 - 我们都是星际生命分子的后代
美国生化学家米勒实验把水,甲烷,氨,氢气,一氧化碳等物质放一个烧瓶里面,通电
模拟雷电几天,就把生命基本组成分子比如碱基,氨基酸,糖等等全产生了。
这就是生命的化学起源理论。
恒星一般都是聚变反应,把1号元素氢转变为稍微重一些的元素比如2号氦,6号元素碳
,7号元素氮,8号元素氧,15号元素磷等等。只要有1,6,7,8,可能还有15号元素,
再用宇宙射线或者紫外线一轰击,生命分子就产生了,在星际到处飘荡。
病毒不管是基于RNA,DNA,还是蛋白质的,都和咱们地位平等。
对于热一些的行星,可能用6号元素碳,15号元素磷等效果不好,就把碳换成硅或者锗
,磷换成砷或者锑,生命也可以活得很好。
T****i
发帖数: 15191
11
病毒和高等生物的物种分类没有类比性。SARS和武肺病毒基本上就是一个病毒突变(或
者编辑)来的。病毒基因组太小了,随便变几个碱基,按比例就有很大差异了。
w*******s
发帖数: 285
12
2月2日,印度研究人员于1月31日发表在bioRxiv上的有关新型冠状病毒来源于实验室的
论文撤稿。
相关:印度研究人员新冠病毒论文被质疑“扭曲事实” 已撤稿
此前,网上不断有各种版本的流言,或多或少都把此次疫情的发生与国内科研机构的实
验室病毒标本泄露关联在一起。
对此,2月2日下午,中国科学院武汉病毒所研究员石正丽在朋友圈说:“2019新型冠状
病毒是大自然给人类不文明生活习惯的惩罚,我石正丽用我的生命担保,和实验室没有
关系。”
《中国科学报》记者向她本人求证此条朋友圈消息属实,并获准通过本报发布。
石正丽朋友圈截图(经本人授权发布)
同时,1月31日,《科学》也发布最新调查报道称,生物信息学家正努力用科学击败“
阴谋论”。
作为石正丽的长期合作伙伴,美国非盈利组织环保生态健康联盟疾病生态学家Peter
Daszak在接受《科学》采访时表示,每当新疾病、新病毒出现时,都会产生诸如实验室
泄漏或者生物工程制造一类的“阴谋论”。“这令人羞耻!”
中山大学医学院院长郭德银也对《中国科学报》表示:“阴谋论从来不需要提供证据,
但科学需要。”目前,基于基因组序列对病毒在进化上的分析结果,为... 阅读全帖
D****8
发帖数: 408
13
这两天太忙 漏了不少信息了
这个测了25k,还缺4000个碱基实在不合常理
25k的测肯定用了测序仪了,匹配组装还缺那4000个?
等进一步确认吧

发帖数: 1
14
你别告诉,就纠结4000个碱基,
那个穿山甲肺里sars,各种冠状病毒一应俱全,你还有什么好说的
n********g
发帖数: 6504
15
来自主题: Military版 - 泄露的病毒确实有不同种类
广东采样的和武汉/上海测定的差4个碱基
n********g
发帖数: 6504
16
广东报告其病毒株和标准型之间差了4个碱基。总共好像是2万多还是3万多。感觉区别
挺大变异很快了。
n********g
发帖数: 6504
17
我没有微博账号。
不过致病病毒之前有不那么有毒的前体是常识。
不然亿万年它们怎么幸存下来的。
突然出现30000个碱基致命病毒排列组合的概率和0没啥区别。
x********e
发帖数: 35261
18
外行又来献丑求打脸。nCoV基因组3万碱基。108个样品之间按一定的算法相互比对,按
序列的相似度在y轴上确定位置。然后根据采样时间或者局部相似度1确定x轴坐标,做
出一个phylogenetic tree。在这个二维图的基础上再按地理位置区分局部采样的区别
,看哪些地区的采样有偏差。
才15个数据?真是笑掉大牙。
x********e
发帖数: 35261
19
来自主题: Military版 - 新冠起源我的最新研究成果
不能光看氨基酸。比对核酸可能有不少同义突变。我说H1和H3高度相似,是因为他们除
了重组区域,只有2个碱基突变,占基因组的0.007%
x********e
发帖数: 35261
20
来自主题: Military版 - 新冠起源我的最新研究成果
我去中国的新冠病毒毒库搜了一下,2019年12月只有一个基因组:Wuhan-Hu-1/2019 。
这个基因组和我提出的H0非常接近。它跟WH04只差2个碱基突变。
x********e
发帖数: 35261
21
来自主题: Military版 - 新冠起源我的最新研究成果
再从H0,H1和H3的关系评一评序列比对的算法问题。
两序列比对主要有三个参数:coverage,gap,mismatch。覆盖率越高说明两序列越相
似,算加分。两序列中会有短片段(大概20bp以内)缺失,在coverage的基础上减分。
mismatch代表突变,也是减分。
H0与H1比对算出来得分大于H0与H3比对。说明对于H3的三个点突变扣分很多。但实际上
虽然H1的碱基与H0完全对上,但其实缺了45个核酸。H3与H0比缺了31个核酸,另外有3
个不影响功能的突变,在生物学意义上更接近H0。
这种时候就应该微调算法。说明生物信息学到底还是门工具科学,脱离生物学意义,会
出错。

Wuhan
H3
S*******l
发帖数: 4637
22
来自主题: Military版 - 码工们请听题
再提供一个考虑,可以减少点复杂性。好比同一个弹坑两次着弹的几率可以忽略不记。
同一个碱基多次变异的几率也可以不用考虑。
n********g
发帖数: 6504
23
来自主题: Military版 - 天热不利病毒这条不可信
不已经很清楚了吗?连碱基有几条毛都数出来了。还需要什么科普。
S*******l
发帖数: 4637
24
来自主题: Military版 - tg新冠疫苗用到人身上了。
变异没那么快。新冠平均一个月两个碱基变异,分散在30000 bp长的序列上,能引起显
著差异的突变几率并不大。
一个疫苗至少可以有效一个season。
下一季回来变异太大的,就测序做新疫苗呗。
w***u
发帖数: 17713
25
来自主题: Military版 - tg新冠疫苗用到人身上了。
现在进化压力还不大,这玩意天生善变。以后估计和流感差不多,弱化但季季不同,在
flu shot那一锅算命汤里加这么一株就可以了。


: 变异没那么快。新冠平均一个月两个碱基变异,分散在30000 bp长的序列上,能
引起显

: 著差异的突变几率并不大。

: 一个疫苗至少可以有效一个season。

: 下一季回来变异太大的,就测序做新疫苗呗。

n********g
发帖数: 6504
26
来自主题: Military版 - 西雅图可能成为下一个武汉
检测的试剂盒需要重新设计。两种病毒只有一个碱基区别。但一种喝水就能出院。另一
种的治病致死率要乘以3。
病人可以前后分别或同时染上两种病毒。在有新试剂盒之前,确诊病人需隔离负压单间。
n********g
发帖数: 6504
27
来自主题: Military版 - 西雅图可能成为下一个武汉
只差一个碱基。这么精准的测序千老做不出来。需要廉价准确的快速测序。
贺建奎入狱是人类的损失。

间。
n********g
发帖数: 6504
28
来自主题: Military版 - 贺建奎入狱是人类的巨大损失
两种新冠病毒只差一个碱基。这么精准的试剂盒千老做不出来。需要廉价准确的快速测
序。
快速测序权威被送进了监狱。导致无数的无谓治疗,无数心灵痛苦,无数无谓的隔离,
真是对人类最基本伦理的讽刺。
十万亿计的经济损失就不提了。
I***8
发帖数: 1949
29
来自主题: Military版 - 贺建奎入狱是人类的巨大损失
你这种屁都不懂的民科SB为什么天天自我感觉良好出来现呢??引入一个碱基的点突变
有什么难的?还特么的快速准确测序?贺XX 做什么的你知道么?
n********g
发帖数: 6504
30
来自主题: Military版 - 贺建奎入狱是人类的巨大损失
你咋那么多废话。你直说核酸检测能不能分辨只差一个碱基的两种亚型不就完了。
不行就得廉价准确快速的测序。

发帖数: 1
31
人体内不缺碱基吧?
g****t
发帖数: 31659
32
你没听懂他的逻辑,他的意思是洗蒸汽浴。体表可能有的病毒就全没了。(包括鼻子里
的)
进门先洗澡不会错的。


: 人体内不缺碱基吧?

L****n
发帖数: 12932
33
体外环境没有碱基。 病毒的传播通过口鼻喷沫,热蒸汽能够灭活口鼻腔体外的病毒的
话,基本可以阻断传播的途径。

发帖数: 1
34
来自主题: Military版 - CDC竟然是手工设计primer的,LOL。
手工设计说明是高人,20来个碱基眼睛一撸就能看得出二级结构退火温度
还要啥primer5啊
不过那帮白痴简单加减法都要用计算器,尼玛要能心算退火温度和看出二级结构,得让
他们死好几次lol
m******n
发帖数: 6327
35
2001年9月11日,恐怖袭击造成美国本土近三千人身亡。一周后,布什总统发表电视讲话,宣布本拉登为首的基地组织是911原凶,要伸张正义,就要抓到本拉登,“不论死活”。
九一一之后不久,中央情报局(CIA)从阿富汗战争塔利班战俘和其他抓获的基地组织成员口中得知本拉登有个信使,名叫阿科威特。本拉登从不用电话或者网络联系,所以信使是接近本拉登的唯一途径。中央情报局研究几个被抓获的基地组织高级成员的审讯记录时发现他们一听到阿科威特这个名字就守口如瓶,甚至编造假名有意误导美国人;于是更加确信,这个阿科威特是一个重要的线索。又过了几年,中央情报局才知道阿科威特的真名叫阿布·穆罕默德,是出生在科威特的巴基斯坦人;除了送信,阿布还负责为基地组织成员安排家庭和后路。此时,中央情报局只知道阿布这个名字,不知道阿布身在何处。
2010年中期,美国早已总统换届多时,欧巴马接替了布什,但是抓捕本拉登的工作没有停。这时,阿布·穆罕默德犯下了一个致命错误。他接了一个自己信任的人电话,而此人恰恰在中央情报局监视之下。阿布接这个电话时远在天边,然而这个电话已经足够中央情报局找到他了。8月,不知自己已经被跟踪的阿布,来到... 阅读全帖
w****n
发帖数: 25644
36
【 以下文字转载自 Joke 讨论区 】
发信人: delta2013 (首席砖家), 信区: Joke
标 题: 什么样的女人是美女 一目了然的生育竞争优势 ZT
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 25 21:28:01 2015, 美东)
关于女性美貌,大致公认的有以下几点:
1.瓜子脸
2.大眼睛
3.白皮肤
4.红嘴唇
5.大乳房
6.细腰
7.圆臀
8.细长的脖子
9.如银铃一般的声音
细说起来,这几点都是哺乳动物千万年生存、生育竞争的结果:
1. 生育竞争
a. 两性竞争侧重点
i. 公猴子。在自然状态下,哺乳动物雄性需要占领一大片生存资源才有交配权,例如
一个公猴子占领了一个山头,就可以拥有与几十个母猴子的交配权,进而生出上百个小
猴子,其基因也在种群基因库中就发扬光大。对于争不到山头的公猴子,其结果就是断
子绝孙,其基因就被从基因库中剔除。所以, 公猴子主要竞争侧重点是是能够占领生
存资源(猴子是占山为王,狮子是守住一片水草地等着牛羊来)。所以女人挑男人是挑
男人的地位。
ii. 母猴子。而母猴子需要占领的生存资源则少得多,因为一个母猴子一辈子也就生... 阅读全帖
w****n
发帖数: 25644
37
【 以下文字转载自 Joke 讨论区 】
发信人: delta2013 (首席砖家), 信区: Joke
标 题: 什么样的女人是美女 一目了然的生育竞争优势 ZT
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Oct 25 21:28:01 2015, 美东)
关于女性美貌,大致公认的有以下几点:
1.瓜子脸
2.大眼睛
3.白皮肤
4.红嘴唇
5.大乳房
6.细腰
7.圆臀
8.细长的脖子
9.如银铃一般的声音
细说起来,这几点都是哺乳动物千万年生存、生育竞争的结果:
1. 生育竞争
a. 两性竞争侧重点
i. 公猴子。在自然状态下,哺乳动物雄性需要占领一大片生存资源才有交配权,例如
一个公猴子占领了一个山头,就可以拥有与几十个母猴子的交配权,进而生出上百个小
猴子,其基因也在种群基因库中就发扬光大。对于争不到山头的公猴子,其结果就是断
子绝孙,其基因就被从基因库中剔除。所以, 公猴子主要竞争侧重点是是能够占领生
存资源(猴子是占山为王,狮子是守住一片水草地等着牛羊来)。所以女人挑男人是挑
男人的地位。
ii. 母猴子。而母猴子需要占领的生存资源则少得多,因为一个母猴子一辈子也就生... 阅读全帖
E*V
发帖数: 17544
38
是么?我怎么觉得催泪弹不会这样?
这次事件是中国在穆斯林世界中的地位,动作都受影响阿
美国的碱基
a******7
发帖数: 7936
39
举个例子你就暴跳了?真不淡定,真ungeilivable
法律经常考虑特殊情况?那要法律有啥用?每个违法的人都可以用它为自己辩解了,因
为每个人都是特殊的,都是独一无二的,都是特殊情况?转录和翻译的修补机制是用来
维护正常的生理机能的,错配的碱基是要被消除的,LZ你打算被这个社会消除?自我了
断?你太可爱了,求求你了快了断了吧。不知道谁在这里现。
诶呀,我太失望了,警察没给你记点,你也可以申述,那你还上这来问这问那,这不是
现,是什么?
诶呀wsn都不敢用自己的id,还要用朋友的账号。现哦,真现。
封你一个三现神童玩儿去吧

发帖数: 1
40
来自主题: Faculty版 - 韩春雨为什么牛?
转贴,非原创。
简言之,麻省理工的张峰三年前研制出世上第一把剪刀,河北科大的韩春雨刚刚造出第
二把,都是用来精准剪裁DNA的。分子生物学界苦苦寻觅之近半个世纪并公认希望万分
渺茫,所以被称作生物学界划时代的革命性壮举。无意外的话,不出五年应冠以生物医
学诺奖。
为什么小小剪刀如此轰动?
那得先说说人是啥。人不过是30几兆细胞堆积而成的生命体。而决定我们的呼吸心跳相
貌行为甚或思维乃至手里的教鞭质量,正是细胞。准确地说,是细胞核里的基因组。始
于来自五湖四海却能奇缘般地汇聚于此海角天涯有幸群侃神聊,大概也离不开我们基因
组里一些共性的。
那么,基因组又是什么呢?
基因组是一根由两条超长的脱氧核糖核酸即DNA交缠而成的双股长绳。其组成极其简单
,仅由4个不同的碱基即ATCG串联而成。准确地说,一股上的A或C与另一股上的T或G双
手紧拉配对从而形成双股DNA间的绝对互补缠绵,以确保遗传密码之精确无误,人人完
美,好人一生平安。
其实ATCG没有那么安分专情。先把它们比作♦A♥A♦2♥
2,看看他们是怎样开小差的。比如♦A偶尔会很无情... 阅读全帖
w***r
发帖数: 709
41
来自主题: Faculty版 - 如何做重要有意义的工作
这个太扯了。dna结构揭示了遗传复制本质,碱基互补。
这可以说现代分子生物学的殿基。
g******t
发帖数: 11249
42
鲁 白
(2002年9月25日在复旦大学上海医学院的讲课录音记录)
我是上医的校友,80年代中期在上医,然后出国多年,很惭愧到上医的机会很少,跟大
家没有太多的交流。
今天我讲的题目不太容易讲,第一是本人工作做得也不是非常好,第二是大家对我的期
望也过分高了一点,好像来参加我的讲演,就可以在很好的杂志上发表文章,如果有这
种期望,我很抱歉,做不到。在讲课前我先问大家一个问题,在座的有多少人已经在英
文杂志上发表过文章(课堂上回答发表过的人很少)? 看来相当少,这也难怪,很多
学生刚刚进入课题,也许是来凑凑热闹, 看看鲁白是个什么样的怪物,没有关系,反正
我是来献丑了 (笑) 。
要写好的文章,最重要问题的不是英文,也不是写作的技巧,而是要有好的科学。研究
工作做得好这是最重要的。有一个错误的印象,认为只要我写得好,就可以发表在好的
杂志上,这是不对的。要发表好的文章,是非常非常困难的一件事情,最主要的因素是
一定要有一流的工作。所以今天我借这机会,主要讲的不是怎样写,而要怎样才能够做
好的研究工作。首先,什么样的研究工作是一个好的工作,大家要有一个共识。抱歉,
今天我讲的许多内容都是... 阅读全帖
g****d
发帖数: 3461
43
来自主题: Food版 - 给拼图美女道个歉

碱基配对,广告贴
S*******C
发帖数: 822
44
来自主题: JobHunting版 - L家第一轮店面 被烙印黑了
4种碱基组成的DNA序列相当于是base 为4的数
长度为10的sequence就是长度为10的数,一共有4^10个这样的不同的数
创建长度为4^10的array就可以记录所有可能的10-char sequence是否出现过
最后从小到大遍历一遍这样的array就可以从小到大打印出所有重复出现的10-char
sequence,这样花费4^10的内存空间不需要排序输出结果
S*******C
发帖数: 822
45
来自主题: JobHunting版 - L家第一轮店面 被烙印黑了
4种碱基组成的DNA序列相当于是base 为4的数
长度为10的sequence就是长度为10的数,一共有4^10个这样的不同的数
创建长度为4^10的array就可以记录所有可能的10-char sequence是否出现过
最后从小到大遍历一遍这样的array就可以从小到大打印出所有重复出现的10-char
sequence,这样花费4^10的内存空间不需要排序输出结果
l******n
发帖数: 30
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来自主题: JobHunting版 - L家悲剧,发面筋,顺求分析原因
1. recruiter
2. host manager 老墨? 讲项目,behavior,问了一道 brain storm 所有翻转数组的
方法
3. technical communication 两白男,讲项目
4. lunch 国人小哥,直接中文聊天
5. coding 一中一印,(1) product without the element itself, 我先讲了不用除法的
方法, 然后是用除法的方法,需要考虑没有0,一个0和多于一个0的情况 (2) 判断一个
graph 是不是 bipartite, 我用了 BFS 的方法,起始结点标左边,然后相邻标右边,
再相邻标左边,如顺利标完则是 bipartite,发现冲突则不是
6. system design: tiny URL. 先写了 URL 表示,数据模型。然后聊了后端存储,
NoSQL,怎么 partition,怎么判重。然后聊了 cache 和前端的 LB。
7. coding 同样一中一印, (1) 找出DNA序列中出现多以一次的长度为10的碱基序列,
和面试官讨论最后用bitmap实现。(2) 两个排序数组找 i... 阅读全帖
l******n
发帖数: 30
47
来自主题: JobHunting版 - L家悲剧,发面筋,顺求分析原因
5.1 先说了时间O(n)空间O(n),面试官要求时间O(n)空间O(1), 只想到了做除法。一开
始写得时候没考虑 0,后来面试官提示有没有 edge case 才加上的。估计减分了。
5.2 用一个哈希表 visited 保存访问过的节点,另一个哈希表保存节点分在那一侧
7.1 由于长度为10的碱基序列总状态为4^10,可以用长度为4^10的 bitmap 保存是不是
遇见过。请问 rolling hash 怎么做?
7.2 比如有排序数组 xs1 = [1, 2, 4], xs2 = [2, 2, 5], 先对每个元素加标记表明
来自哪个数组 xs1 = [(1, 1), (2, 1), (4, 1)] xs2 = [(2, 2), (2, 2), (5, 2)]
然后对排序数组进行 merge。比较当前和前一个是不是相等且来自不同数组,如果是,
再检查是不是和 result 中最后一个相等,如果不是则 append 到 result.
c*******t
发帖数: 123
48
来自主题: JobHunting版 - L家悲剧,发面筋,顺求分析原因
大哥,4^10是多大的数啊?2的20次方,2的9次方就1GB了啊。
每个碱基可以用00,01,10,11中得三个表示,一共只需要2*10=20bit的空间。
l******n
发帖数: 30
49
来自主题: JobHunting版 - L家悲剧,发面筋,顺求分析原因
是用bitmap放遇见的所有碱基序列,不是一个。
4^10=1048576 bits= 131072 Bytes = 131KB
m****s
发帖数: 18160
50
来自主题: JobMarket版 - 征人回国创业
【 以下文字转载自 Returnee 讨论区 】
发信人: jiankuihe (zz), 信区: Returnee
标 题: 征人回国创业
关键字: 基因测序
发信站: BBS 未名空间站 (Sun Mar 29 02:33:23 2015, 美东)
我们在深圳开了一家小公司( www.pacgeno.com),刚刚起步,已经拿到了风投。现在主
要的目标是开发基因测序仪。目前公司的数个职位还是空缺,国内找不到合适的人。如
果各位网友中有二代基因测序仪器开发经验,或者做过基因芯片,或者对单分子荧光检
测有经验的优秀PHD,欢迎加入。公司刚开始,都会有股份期权。基因测序是国内外最
热最有前途的领域,因此欢迎回来和我们共同创业
职位一:CTO
要求:在生物医疗企业从事过多年研发工作。
职位二:首席化学家
要求:多年从事合成化学(合成碱基等小分子)或者表面化学(玻璃表面修饰,寡核苷
酸杂交)研究。
职位三:首席测序科学家
要求:能够开发测序前样品处理方法,测序建库方法。优化测序流程,优化测序试剂,
优化测序循环。开发针对肿瘤,产前诊断,和遗传病的基因检测方法。
职位四:CFO
要求:在证劵... 阅读全帖
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