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全部话题 - 话题: 结构域
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y***y
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1
目前手头有一个感兴趣的核定位表达的蛋白,想看看它是否有DNA结合结构域,锌指结
构等功能结构域,用过SMART, Pfam,PredictProtein等测过,但结果不一致,想问问
大家都用啥网站,找个相对比较靠谱的。
f***y
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2
一个颜宁能顶十个千人
http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2017/6/378809.shtm
2017年6月8日,清华大学生命学院、结构生物学高精尖创新中心颜宁研究组在《细胞》
(Cell)杂志在线发表了题为《人源脂类外向转运蛋白ABCA1的结构》(Structure of
the Human Lipid Exporter ABCA1)的研究论文,首次报道了胆固醇逆向运输过程中的
关键蛋白ABCA1近原子分辨率的冷冻电镜结构,为理解其作用机制及相关疾病致病机理
奠定了重要基础。
胆固醇广泛地存在于高等动物的各类组织细胞当中,它不仅是细胞膜、血浆脂蛋白的重
要组成部分,也是包括胆酸、维生素D、类固醇激素在内的许多特殊生物活性分子的前
体化合物。但是,人体内过量的胆固醇积累会促进血管动脉粥样硬化的发生和发展,并
有可能导致严重的心脑血管疾病(如冠心病及中风等)。正因为胆固醇对于人体健康具
有两面性,所以细胞内的胆固醇平衡(cholesterol homeostasis)对于维持人体的健康
是必须的。细胞内的胆固醇平衡涉及一系列受严格调控的过程(图1),例... 阅读全帖

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3
新型冠状病毒2019-nCov的爆发引起了人们对于此突发性公共卫生事件的高度关注。冠
状病毒的刺突糖蛋白(Spike glycoprotein, S glycoprotein)是疫苗、治疗性抗体的
研发以及临床诊断的关键靶点。
为了协助对该流行性疾病进行医学防护措施研发,2020年2月15日,美国卫生总署(NIH)
与德克萨斯大学奥斯汀分校Jason S. McLellan研究组(McLellan组在病毒结构方面做
了很多重要的工作,包括MERS等,有着丰富的经验)进行合作在预印版平台bioRxiv发
表文章Cryo-EM Structure of the 2019-nCoV Spike in the Prefusion Conformation
,利用冷冻电镜技术分析了新型冠状病毒表面S蛋白的近原子结构。另外作者们通过生
物物理以及结构方面的证据发现,SARS-CoV-2的S蛋白结合人体ACE2(宿主细胞受体血
管紧张素转化酶2)【1,2】的亲和力要远高于SARS-CoV的S蛋白,解释了新型冠状病毒
传染性之强的主要原因。
新型冠状病毒是会引发发热、严重呼吸道疾病及肺炎的人传人的病原... 阅读全帖

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4
来自主题: Military版 - 喜讯:结构立功了!
新型β冠状病毒(2019-nCov)的爆发代表了一种流行病威胁,已宣布为国际关注的突
发公共卫生事件。 CoV峰值(S)糖蛋白是迫切需要的疫苗,治疗性抗体和诊断方法的
关键目标。为促进医学对策(MCM)的开发,我们确定了预融合构象中的2019-nCoV S三
聚体的3.5Å分辨率冷冻EM结构。三聚体的主要状态具有以受体可接近的构型向上
旋转的三个受体结合结构域(RBD)之一。我们还显示了生物物理和结构证据,即2019-
nCoV S以比SARS-CoV S更高的亲和力结合ACE2。此外,我们测试了几种已发布的SARS-
CoV RBD特异性单克隆抗体,发现它们与nCoV-2019没有明显的结合。 表明抗体在两种
病毒RBD之间交叉反应可能有限。
l***q
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5
获奖情况:1998年度教育部科技进步一等奖
主要完成人员:朱德煦、刘建宁、华子春、孙自勇、陈于
红、马忠
主要完成单位:南京大学
内容简介:(1)用分子模建方法预测了尿激酶原(pro-UK)
的三维结构,在此基础上采用定点突变和动力学分析方法阐明
了尿激酶原存在内源性催化活性的结构基础,深化了对尿激酶
原酶学性质的认识,为尿激酶原的临床合理应用提供了科学依
据。
(2)在分子水平上解释了尿激酶对纤维蛋白低亲和性的原
因,并阐明了纤溶酶原激活剂分子中心环柄结构域和纤维蛋白
亲和性的关系,为设计新一代纤溶酶原激活剂奠定了科学依据。
(3)以尿激酶原为模型,证明了维系丝氨酸蛋白水解酶活
性构象的主要作用力是:Asp355和酶原转变成酶新生的N_末端
Ile之间形成的盐键,而不是靠疏水相互作用维系。
(4)系统地探索了重组尿激酶原在大肠杆菌中的高效表达
和表达产物的最佳复性条件,为重组尿激酶原及其变体的生产
化奠定了基础。
(5)设计并构建了性能较天然pro-UK/UK更优良的pro-
UK/UK变体,为开发第二代纤溶酶原激活剂跨出了坚实的一步。
(6)pro-UK非催化性能的探索。发现u-P
f***y
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6
https://tech.sina.com.cn/d/f/2018-09-07/doc-ihitesuz6317283.shtml
今日,顶尖学术期刊《科学》杂志在其官网上在线发表了最新一批论文。其中,我们很
高兴地看到一篇来自颜宁课题组的研究。值得一提的是,这是在过去的这个暑假里,颜
宁课题组发表的第三篇《科学》长文(Research Article)。在今天的这篇文章里,我
们也将为各位读者介绍和回顾这些进展。
图片来源:普林斯顿大学
9月6日在线发表:Structure of the human voltage-gated sodium channel Nav1
.4 in complex with β1
9月6日,颜宁课题组的这项最新论文正式在线发表,这是关于电压门控钠离子通道
(Nav)的研究。尽管Nav可能对许多人类疾病有着潜在影响,但几十年来的大量探索,
依旧没有解析出任何来自人类的Nav通道结构,这也在很大程度上影响了我们对其作用
机理的理解,限制了相应的新疗法开发。
人类Nav1.4-β1复合体的结构(图片来源:《科学》)
在这项研究里,研究人员们使用冷冻电镜技术,报... 阅读全帖

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7
来自主题: Biology版 - CRISPR英雄谱
#注明译者,请随便转载:)
CRISPR英雄谱
埃里克・兰德(Eric Lander)
小鹿/译
三年之前,科学家们宣布,CRISPR技术能够对真核活细胞进行精准与有效的基因组编辑
。自此,这项技术手段已然震撼了科学界,数以千计的实验室正在将其运用于从生物医
药到农业的各个领域。然而,从一种奇特的细菌重复序列现象的发现开始,到确认这种
现象为适应性免疫系统,进而对它的生物功能特性的了解,直至开发为一项基因工程的
技术,这此前二十载相关的研究历程却不为人所知。本文正是着眼于填补这段科学历史
的空白,它讲述的是观念的演化历史和先锋人物的传奇故事,并且从中获得关于支撑科
学发现的优秀科研环境的启迪。
前言
很难想起曾经有哪一次科学革命像CRISPR这般如此迅速地改变生物学界。仅仅三年之前
,科学家宣布,CRISPR系统,即细菌通过纪录和精准攻击入侵病毒的DNA序列而进行自
身防御的适应性免疫系统,可以利用转化为一项简单而有效的技术在哺乳动物和其它生
物体的活体细胞内进行基因组编辑。CRISPR即此被全球数以千计的实验室运用于广泛的
领域,如创建人类遗传疾病和癌症的复杂动物模型;... 阅读全帖
f***y
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8
国家应该花大钱引进这类人才。
哈工大报讯(闫明星/文)1月9日,我校生命学院黄志伟教授研究组在《自然》(《
Nature》)在线发表了题目为《艾滋病病毒Vif“劫持"人CBF-β和CUL5 E3 连接酶复合
物的分子机制》(Structural basis for hijacking CBF-β and CUL5 E3 ligase
complex by HIV-1 Vif)的研究论文。该项研究第一次揭示了艾滋病病毒研究领域一直
关注的艾滋病病毒毒力因子(Vif)的结构,破解了这一领域30余年的谜团;阐明了Vif
如何“劫持”人CBF-β以及CUL5 E3 连接酶复合物的分子机制;为理性设计靶向该复合
物的全新艾滋病药物提供了结构基础。该项艾滋病研究领域里程碑意义的研究成果对人
类最终攻克艾滋病具有非常重要的科学意义和临床应用价值,也标志着我校在艾滋病结
构生物学研究领域走在世界最前沿。
该文章被选为精选文章在同期《自然》杂志《新闻与视点》栏目中撰文重点推荐。
该文章发表实现了我校在《自然》(影响因子:38.60)杂志上发表研究论文零
的突破。黄志伟教授为本研究... 阅读全帖
g*********d
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9
目前表观遗传学(Epigenetics)通常被定义为基因表达通过有丝分裂或减数分裂发生了
可遗传的改变, 而DNA 序列不发生改变[1, 2]。表观遗传学的机
制主要包括DNA 甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA。DNA 甲基化(DNA methylation)是指
在DNA甲基转移酶(DNA-methyltransferases, DNMTs)的催化下, CpG 二核苷酸中的胞嘧
啶被选择性地添加甲基, 形成5-甲基胞嘧啶[3, 4]。DNA 甲基转移酶有两种, 其中
DNMT1 主要起维持甲基化的作用, 能使半甲基化的DNA 双链分子上与甲基胞嘧啶相对应
的胞嘧啶甲基化, 可参与DNA 复制双链中新合成链的甲基化[5]; 而DNMT3a 和DNMT3b
主要起形成甲基化的作用, 能在未发生甲基化的DNA 双链上进
行甲基化[6]。DNA 甲基化一般与基因的沉默相关,DNA 去甲基化则与基因的活化相关[7
~9]。
组蛋白修饰(Histone modifications) 是指组蛋白的基础氨基末端尾部突出于核小体,
常在转录后发生变化, 包括甲基化、乙酰化、磷酸化和泛素化等翻译后的修饰... 阅读全帖
g*********d
发帖数: 233
10
导读:治癌症,中国民间一直流传着以毒攻毒的说法,用小剂量的砒霜可治愈癌症。但
多少年以来,
人们对于砒霜为什么能够以毒攻毒却知之甚少,而新近上海血学研究所的专家却为世人
揭开了这层神
秘的面纱,从分子学的角度阐述了砒霜的作用机理。砒霜是中国民间自古以来就有的药
方,这也将为
中医药治疗疾病提供了西医的解读途径。
三氧化二砷俗称“砒霜”,经证实可用于治疗急性白血病,但“以毒攻毒”的分子机制
一直是个难题。我
国研究人员最近在这个领域取得重大突破,上海交通大学医学院附属瑞金医院上海血液
学研究所、医
学基因组学国家重点实验室等,近日在国际权威杂志《科学(Science)》上发表了“
三氧化二砷治
疗急性早幼粒白血病(APL)分子机制”的最新研究成果,研究揭示癌蛋白PML-RARα是
砷剂治疗APL
的直接药物靶点。
APL曾经被认为是最为凶险的白血病之一,很多患者在发病早期即死于严重出血,缺乏
有效治疗方
法。上世纪90年代,上海血研所陈竺、陈赛娟研究员等经过临床证实,全反式维甲酸和
三氧化二砷联
合应用,可以使约90%的APL患者达到5年无病生存。但三氧化二砷的直接分子靶点和分
子机理,... 阅读全帖
d*********o
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http://science.caixin.com/2020-03-20/101531574.html
【财新网】(记者 杨睿)新冠病毒在繁殖倍增的过程中若发生了基因突变,会否影响
其感染能力?3月17日,论文预印平台bioRxiv上发表了一篇与新冠病毒的受体结合结构
域(RBD)突变有关的研究,称突变增强了新冠病毒表面刺突蛋白的结构稳定性,突变
病毒株与受体结合的亲和力显著增强。论文作者强调,病毒的传染性还受其他因素的影
响,尽管如此,传染性提高应该是大概率事件。
这篇题为《从流行的新冠病毒序列中发现的RBD突变会增强刺突蛋白结构稳定性及
传染性》的论文,由南方医科大学公共卫生学院教授张其威、暨南大学生命与健康工程
研究院张弓共同担任通讯作者。研究团队从公共数据库(NCBI GenBank和GISAID等)下
载了244条新冠病毒毒株的基因序列全长,并筛选出S蛋白及其RBD区域发生突变的序列
进行分析。从研究者绘制的毒株序列分布地图来看,现阶段这244个新冠病毒毒株中绝
大多数毒株的S蛋白受体结合结构域(RBD)没有发生突变。只有10条序列在RBD区域存
在氨基酸突变,它们分别采集自... 阅读全帖
t**m
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12
来自主题: Biology版 - 颜宁解了人的GLUT1
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature1
结合以前发表的工作, 可以看出她的工作是相当成体系的.
在糖转运蛋白结构及作用机制这个领域, 颜宁应该具有无可争议的地位.
以下是清华的新闻稿
====================================
颜宁研究组揭示人源葡萄糖转运蛋白 GLUT1的结构及工作机理
2014年5月18日,清华大学医学院教授颜宁研究组在Nature在线发表了题为 “Crystal
structure of the human glucose transporter GLUT1”的Article,在世界上首次报
道了人源葡萄糖转运蛋白GLUT1的晶体结构,初步揭示其工作机制以及相关疾病的致病
机理。
葡萄糖(D-glucose)是地球上包括从细菌到人类各种生物已知最重要、最基本的能量
来源,也是人脑和神经系统最主要的供能物质;据估算,大脑平均每天消耗约120克葡
萄糖,占人体葡萄糖总消耗量的一半以上。葡萄糖代谢的第一步就是进入细胞:亲水的
葡萄糖不能自由穿透疏水的细胞... 阅读全帖
o*******d
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13
试看今日之域中,竟是谁家的天下!”
——读《刘国光旋风实录》
蔡仲德
一、不录常的“刘旋风”很正常
打开《刘国光旋风实录》,得知刘国光生于中国共产党创立两年之后。
新民周刊记者说得好:“从某种程度上说,刘国光的思想轨迹和个人履历清晰地表明了
中国经济学家如何在复杂的政治与社会变迁中进行探索的历程。”
这位记者说:“在20世纪50年代成长起来的经济学家中,刘国光无疑是成果卓著、最具
实力的重量级学者之一。在过去的25年里,每逢中国经济发展处于关键时刻,刘国光总
能以其具有创新意义的思想和政策建议对政府的决策产生重要的影响。在经济学界,刘
国光因其在宏观经济决策和国家大政方针确定方面的卓越贡献而享有‘官方权威经济学
家’的称号”。
著名经济学家程恩富说他是“我国最早主张‘缩小指令性计划和市场改革取向’第一人
”。
享有盛名的老经济学家高鸿业称之为“我国经济学界的一位大师,也是一面旗帜。”
6月2日,在上海大江书社召开的读者座谈会上,高为学教授在发言中讲到,一位主管意
识形态的中央领导人在批示中说:“刘国光同志是一位有影响、有贡献的经济学家,一
贯坚持马克思主义为指导,从改革开放以来,发表了... 阅读全帖

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来自主题: Military版 - 武汉新型冠状病毒的科学难题
去年爆发自武汉的新型冠状病毒,一个月之内疫情严峻,迄今全球科学家对它的认识依
然有限。
瑞士生物技术公司SunRegen Healthcare AG首席科学官及共同创办人董宇红(Yuhong
Dong,音译)撰文提出武汉新型冠状病毒的科学难题。以下是全文内容。
武汉新型冠状病毒(2019-nCoV)的突然爆发扩散到整个中国,并且震惊全球。这个新
型“病毒”具有极高的传输速度(基本繁殖数R0高)以及高致死率特征,对人类构成前
所未有的巨大威胁。由于目前来自中国的信息有限,科学界对这个病毒的起源、人与人
之间传播持续时间,以及受感染者的临床管理等方面的认识存在很大差距。科学家最近
发表有关该病毒的研究论文,确定它的起源与自然界的基因重组无关以及从动物传播给
人类,但是仍有多项难题待进一步探讨。
新型冠状病毒的起源似乎与自然重组无关
大多数论文指出,2019-nCoV与蝙蝠冠状病毒的相似度为88%,与SARS的冠状病毒的相似
度为79%,与MERS则仅50%。中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家生物安全重点
实验室陆柔剑(Roujian Lu)2020年1月30日在《柳叶刀》期刊发表论文... 阅读全帖
p******n
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15
很多人都说施做的不系统,看了看他的主页和论文目录,觉得非常系统。
而且听说他虽然自己是做晶体的,但是早在2008年就力排众议要求清华将结构生物学重
点放到电镜上,一口气招了三个电镜PI,建了电镜平台,有了这个基础后来就争取到国
家蛋白质基础设施的电镜平台放在清华(上海是同步辐射、军科院是质谱组学,现在就
电镜冒尖了)。那时候谁能料到2013年以后电镜大爆呢?说明这个人的眼光相当精准,
不是对领域有深入判断,不可能这么有远见。
http://life.tsinghua.edu.cn/faculty/faculty/317.html
隔行如隔山,请内行来说说他的工作是系统还是追热点,或者兼顾了?我这里抛砖引玉。
主要科研领域与方向:
1.主要运用结构生物学和生物化学的手段研究肿瘤发生和细胞调亡的分子机制,集中于
肿瘤抑制因子和细胞凋亡调节蛋白的结构和功能研究
2.与重大疾病相关膜蛋白的结构与功能的研究
3. 细胞内生物大分子机器的结构与功能研究
第一个方向是施的老本行,从1999年发第一篇论文,到2015年最新G&D论文,前后17年
,细胞凋亡从来没停过;
第二个方向膜蛋白,主要是在做膜内... 阅读全帖
c*********a
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16
宇宙模型之幻方结构
——描述整个宇宙的一个“简单的理论”
陈振华
第三章/一百章:物质初始构建的“邻近性”聚合
概要:无穷数序队列中幻方公式n取数最小的3最容易组合,对应描述的是:原始粒子的
初始构建,是无穷中心的邻近性构建加上层级扩大构建的向外延伸,从而形成大宇宙内
所有物质的网络般联系,实现大宇宙所有物质的总聚合。
幻方公式表明,无穷数序聚合成一个单一幻方结构系理论上是成立的,但是无穷数的不
确定性决定了有聚合之“意”,具体的“形”却永远实现不了;而且n取数较大时也难
以构成幻方结构系,原因是什么?
仅从数阵的组成来看,数千年前人们就发现幻方关系,研究并运用它,如中华古人神化
“洛书”,埃及古人敬用幻方,宋人杨辉研究幻方,当今更是出现众多的幻方发烧友。
但他们穷尽精力,也只能组合出一些“低阶”(n取数小的)幻方,试想一下,如果n取
值较大,如取100,取1000,取10000……这样的数阵极难排成,就是用计算机也不容易
排成。
其原因在于:幻方结构系的构建过程中,各数序个体有一个互找对象,以达到在结构系
中各个方向互补嵌合从而实现集约数的整合过程。就例1数阵中1至9的九个简单数序... 阅读全帖
c*********a
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宇宙模型之幻方结构
——描述整个宇宙的一个“简单的理论”
陈振华
第三章/一百章:物质初始构建的“邻近性”聚合
概要:无穷数序队列中幻方公式n取数最小的3最容易组合,对应描述的是:原始粒子的
初始构建,是无穷中心的邻近性构建加上层级扩大构建的向外延伸,从而形成大宇宙内
所有物质的网络般联系,实现大宇宙所有物质的总聚合。
幻方公式表明,无穷数序聚合成一个单一幻方结构系理论上是成立的,但是无穷数的不
确定性决定了有聚合之“意”,具体的“形”却永远实现不了;而且n取数较大时也难
以构成幻方结构系,原因是什么?
仅从数阵的组成来看,数千年前人们就发现幻方关系,研究并运用它,如中华古人神化
“洛书”,埃及古人敬用幻方,宋人杨辉研究幻方,当今更是出现众多的幻方发烧友。
但他们穷尽精力,也只能组合出一些“低阶”(n取数小的)幻方,试想一下,如果n取
值较大,如取100,取1000,取10000……这样的数阵极难排成,就是用计算机也不容易
排成。
其原因在于:幻方结构系的构建过程中,各数序个体有一个互找对象,以达到在结构系
中各个方向互补嵌合从而实现集约数的整合过程。就例1数阵中1至9的九个简单数序... 阅读全帖
m****g
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来自主题: _Harvard_Medical_School版 - 鸭嘴兽中发现新免疫球蛋白类型
日前,中国农业大学生物学院赵要风教授、李宁院士在9月份出版的两期免疫学杂志(
the Journal of Immunology)上
连续发表文章探讨动物免疫球蛋白基因的进化问题。
通过与澳大利亚、瑞典科学家以及云南大学张亚平院士研究组、本校生物学院张子丁教
授的合作,两位教授研究小组在一
种原始哺乳动物鸭嘴兽中发现了一种新的免疫球蛋白类型并命名为IgO (the Journal
of Immunology, 2009,
183(5):3285-93)。 IgO是近几十年来在哺乳动物中发现的除IgM, IgD, IgG, IgA
和IgE外的唯一新类型,它包括四个
固定区结构域和一个铰链区结构,在结构表现为低等动物IgY与哺乳动物IgG的中间体形
式而且与两者均具有基因序列同源
性,明确证明了哺乳动物IgG来源于低等动物的IgY。同时他们发现鸭嘴兽IgD(包含10
个固定区结构域,无铰链区)与高等
哺乳动物IgD结构(2到3个固定区结构域和一段铰链区)上具有显著差异,但与鱼类
、两栖类和爬行类IgD结构上相同。
这些结果表明作为最原始的哺乳动物,鸭嘴兽免疫
p******n
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19
很多人都说施做的不系统,那就来看看:
http://life.tsinghua.edu.cn/faculty/faculty/317.html
主要科研领域与方向:
1.主要运用结构生物学和生物化学的手段研究肿瘤发生和细胞调亡的分子机制,集中于
肿瘤抑制因子和细胞凋亡调节蛋白的结构和功能研究
2.与重大疾病相关膜蛋白的结构与功能的研究
3. 细胞内生物大分子机器的结构与功能研究
第一个方向是施的老本行,从1999年发第一篇论文,到2015年最新G&D论文,前后17年
,细胞凋亡从来没停过;
第二个方向膜蛋白,主要是在做膜内水解酶,从2006年第一篇论文到本周Nature,前后
10年,一直产出;
第三个方向,好像就是一直在做proteosome和spliceosome。与proteosome相关的第一
篇发表在2005年,spliceosome听说是2008年回清华就开始布局做了。第一篇论文发表
在2013年,
他这些随便哪一个方向拿出来都是可圈可点。
而且施的特点就是基本没有单纯结构文章,都是以机理为主,甚至不少单纯的生化论文
。syg这个人你可以不喜欢,但人家的水平在那里,没必要为... 阅读全帖
m*******h
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20
来自主题: Returnee版 - 享受科研 快乐育人
与颜宁初次见面,还是在2008年春。当我赶到医学院的时候,院办的老师说,颜宁老师
还在做实验,一会儿就过来。过了几分钟,那位老师指着走廊中过来的几位学生说:“
看,颜宁来了!”我左看右看找不到哪位是老师,最后走在一位高个子男生后面的“女
生”跟我打招呼:“你找我?”我顿时语塞——这是颜宁?这分明是一个清纯的“清华
女生”——这是颜宁留给我的最初印象。
后来接触得多了,才真正感觉到:年轻,正是颜宁的特质。如果说1977年出生的她
,有着“80后”的外表,那么她的内心更藏着一个“90后”的精灵。科学研究,在她那
里从来不是一个沉重的话题和事物,而是一种非常让人着迷的快乐。而生活中的她有着
活泼的性格和直爽的性子——和她谈话,不由自主地也变得天真起来。
“现在回头看,
回国是完全正确的选择”
对颜宁影响最大的母校有两个——清华大学和普林斯顿大学。在清华大学,颜宁走
入生物系进行了本科阶段的学习,清华严谨的学风和扎实的培养给了她做学问的基础;
在普林斯顿大学,颜宁师从施一公教授进行了博士和博士后阶段的研究,进而对微观世
界下的生命过程产生了极为浓厚的兴趣,而普林斯顿大学严格的科研训练也给了她在... 阅读全帖
w*****s
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21
来自主题: XML版 - XML 结构

XML 结构
翻译:褚健
XML语言,XML名域和DOM是W3C建议的,这是W3C发展过程中决定性的一步。由于它们已经成为正式的规范,开发人员能够用XML的格式标
记和交换数据。XML在三层架构上为数据处理提供了很好的方法。
使用可升级的三层模型,XML可以从存在的数据中产生出来。使用XML结构化的数据可以从商业规范和表现形式中分离出来。数据的集成、发送、处理和显示是下面
过程中的每一个步骤.我们看下图的总结:


数据结构,名域
XML名域允许开发人员在可识别的情况下定义元素的名称,以避免同名元素间瞇返回首页][返回资源]

XML 结构
C*********m
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22
有什么办法可以把序列分组然后一起align? 问题来自多结构域蛋白序列的排对,比如
序列 1-10,
1-3, 4-6, 7-10 从结构域构架分类分成3组,但是偏偏 序列 5 有个结构域 和2一样,
直接用
clustalw 出来的 phylogenetic tree上 把序列5 就归到 序列2 旁边去了。有什么程
序可以
做出结果是先分组然后一起align的?
C*********m
发帖数: 213
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来自主题: Biology版 - 这里有做CHIP-Seq的兄弟么
不是常见的结构域,晶体结构我们已经搞出来了。根据结构做了突变,正在做突变之后
的DNA结合的变化。
同一结构域在PDB里面有一个和DNA结合的复合物。
GAL4的试验别人以前做过,有转录激活作用。但是文献很老了。
i***0
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来自主题: Biology版 - 蛋白表达问题
?楼主要表达蛋白干什么用,生化, 细胞,还是结构,要在哺乳动物细胞里表达么?
胞外结构域可以加一个分泌序列让他直接分泌到胞外,然后收培养液提纯即可。我们组
用昆虫细胞感染病毒表达胞外结构域分泌到培养液,免去裂解细胞离心等步骤,很方便
s****y
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http://www.wyzxsx.com/Article/Class10/200609/9957.html
一、前言
传统中国县以下的基层权力结构,始终是中外历史学家和社会学家十分关注的研究对象
。费孝通先生早在20世纪40年代末即巳注意到“从县衙门到每家大门之间的一般情形”
“是有趣的,同时也是很重要的”。之所以重要,是“因为这是中国传统中央集权的专
制体制和地方自治的民主体制打交涉的关键。如果不弄明白这个关键,中国传统政治是
无法理解的” 。在中国二千年来的地方政府层级变迁过程中,县级政区是最稳定的一
级基层政区。皇帝任命的地方官员到县级为止。但是,我们不能据此而认为县衙以下处
于一种 “权力真空”状态。事实上,在县衙以下的基层社会,实际存在着三个非正式
的权力系统在运作:其一,是附属于县衙的职业化吏役群体。如清代州县吏役人数,大
县逾千,小县亦多至数百名 。其二,是里甲、保甲等乡级准政权组织中的乡约地保群
体。这一群体每县亦有数十至数百人不等 。其三,是由具有生员以上功名及退休官吏
组成的乡绅群体。据张仲礼研究,19世纪前半期中国士绅总数巳达到100余万 ,平均每
县有六七百名... 阅读全帖
T*********r
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26
来自主题: Japan版 - 大家怎么看待XFEL的发展?
你说中国的同步辐射装置看不了蛋白质结构?
不至于吧
我刚google了下上海光源
就看到一条新闻
http://www.sinap.ac.cn/content/ShowDetail.aspx?id=bff52e3d-f489-4555-a58c-337c1f1ab17f
上海光源(SSRF)生物大分子晶体学线站用户、清华大学医学院教授颜宁领导的研究组
与生命学院王佳伟博士、龚海鹏博士,合作开展大肠杆菌岩藻糖(L-fucose)转运蛋白
(FucP)结构与功能的研究,揭示了FucP在底物识别和转运,以及质子传递偶联过程中
起关键作用的残基D46和E135,为理解MFS家族提供了一个新的重要研究系统。相关论文
于9月27日在线发表在Nature杂志。文章报道两个结构,其中一个结构(FucP-N162A)
的数据完全在SSRF上收集。
FucP从属于Major Facilitator Superfamily (MFS)超家族。MFS超家族转运蛋白是
一类非常古老、在各个物种中都起着重要作用的转运蛋白,目前已知一级序列的家族成
员超过一万个,它们在营养物质和代谢产物的转运、细菌抗药性以... 阅读全帖
r*****8
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27
C语言,结构体转字符串。简单的难题
结构体转字符串怎么做?我有一个野外站点,通过铱星发回来数据,10个字符1分
钱。为了降低费用,要压缩字符数量。结构体的位域(bit fields)很理想,以下例子
3个数据只要2个字符就够了。
结构体做好以后,要用字符传送(short burst message),怎么把结构体变成字
符串?我用的是个笨办法,把结构体写入一个文件。然后把文件的字符串读出来。
各位大侠有更好的方法吗?
如果有时间细看以下是程序。
// #############################################
#include // Standard input output.
#include // Standard library.
#include // String handling
#include /* POSIX terminal co... 阅读全帖
s*x
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28
黑域内的时空结构完全不同了,两地间最短距离是测地线,而黑域内测地线是闭合的,
没有从黑域向外的方向了。也就是类似于黑洞,一旦进入视界面就无法回头了。
x****6
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29
她有贴具体的分析数据吗?
非编码区域的进化速度不会比编码区域慢,在有的情况下甚至更快,比如人的基因组了
(如果我没记错的话)
并且非编码区的调控序列控制突变 这一说法是错误/误导。
病毒的突变率是由 聚合酶决定的,在新冠这里是 RNA-dependent RNA polymerase。它
也是remdesivir的成药靶点。这种酶是出了名的制造高突变率,因为和它的亲戚 DNA
polymerase比起来,它的蛋白少了一整个结构域。而这个结构域是用来校对聚合过程中
的出错的。
t****b
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30
2012年11月13日,新的生物学刊物eLife发表论文:中国科学家攻克了一个长期困扰国
际科学界的难题,而这一基础科学问题也与人类、特别是中国人民的健康相关。
过去,世界和中国忽略了1980年代我国科学家在条件艰苦时代做出重要贡献,我们现在
应该赞广西肿瘤防治研究所的严瑞琪和苏建家等、北京第二传染病院的余昌晏等和中国
医学科学院的庞其方等建立乙肝动物模型;
现在,我国已经有条件和能力改革科学管理体制机制、提供适当环境,让一些科研机构
年富力强的科学家心无旁骛,如北京生命科学研究所的李文辉带领学生和同事发现乙肝
病毒受体;
将来,希望全国科研机构能推广适合各个学科和机构自身规律的体制机制改革,使大批
年轻人集中精力在专业上充分发挥作用,他们大有作为才能使中国的科学大有希望。
肝炎和肝炎病毒
肝炎在全世界有广泛的危害,中国人群肝炎患病率尤其高。多种病毒导致病毒性肝炎:
甲、乙、丙、丁、戊(A、B、C、D、E)等。
全球二十亿人曾感染乙型肝炎病毒(HBV),慢性乙肝感染超过3.5亿人。即使在乙肝疫
苗已经研制成功多年以后,我国还有逾九千万人感染过乙肝病毒,上千万乙肝患者,每
年感染超过百万... 阅读全帖
C**S
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31
来自主题: Biology版 - 把蛋白截成片段,如何设计?
在做一个200kD大蛋白,关于其结构域报导的不多。我做mapping,需要截成小段(比如
20-30kD左右),如何设计从哪里断开,不破坏每个结构域的三维构像?有软件预测吗
?谢谢。
d*********o
发帖数: 6388
32
http://tech.sina.com.cn/csj/2020-02-11/doc-iimxxstf0513402.shtml
月初,一篇印度德里大学和印度理工学院研究人员联合创作的论文横空而出,指出病毒
更像“人为”而非“天然”,影射中科院武汉病毒研究所研究员石正丽团队,暗示其有
意或无意间将病毒泄露造成今天的疫情灾难。
密西根大学张阳教授团队最新研究成果证实:“人造病毒说”不成立
近日,密西根大学张阳教授领导团队开展了一项研究,系统检索对比印度学者给出的4
个来自新冠病毒的“独有”基因片段、及微生物病毒基因数据库数据的相似性。研究结
果同样发表在预印本网站bioRixv。
通过对病毒序列、结构数据库系统的分析,张阳教授团队发现印度学者所说的,来自于
艾滋病的基因片段,实际上广泛的出现在其他类型的细菌或病毒的基因上。
与包括SARS-CoV、MERS-CoV、HCoV-HKU1、HCoV-229E、HCoV-OC43及HCoV-NL63在内的6
种可以感染人类的冠状病毒,以及被广泛认为是病毒源头的蝙蝠冠状病毒(RaTG13)高
度相似。甚至部分基因片段在上述六种冠状病毒上发现了相似... 阅读全帖
V**3
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33
关于 新冠病毒来源 的专业分析
新冠病毒神秘来源
Original 刘永 大卫深观察 2 days ago
随着新冠肺炎对全球的威胁与日俱增,越来越多的各国专家也对新冠病毒(2019-nCoV
或SARS-CoV-2)的来源投下更多关注的目光。本文从流行病学调查、病毒基因比对、跨
物种感染研究以及关键的“中间宿主”等领域,对新冠病毒来源进行了全景式梳理与深
度挖掘,为读者提供一个深刻而全新的视角。
一、华南海鲜市场:备受争议的“疫源地”
二、病毒学证据:武汉新冠病毒2019-nCoV的基因异样之处
三、石正丽:疑云笼罩的冠状病毒跨物种感染研究
四、穿山甲之谜:突如其来的“中间宿主”
自从武汉爆发新冠肺炎迄今,已经过去了两个月,但科学界对这个神秘的新冠状病毒“
2019-nCoV”(也叫SARS-CoV-2,本文简称新冠病毒)的认识依然十分有限。此次疫情
爆发的源头是华南海鲜市场吗?当局称新冠病毒来自原始宿主蝙蝠,华南农业大学几位
学者甚至声称他们找到了中间宿主穿山甲。但科学界对病毒基因序列的研究以及大量科
学文献的比对查证,均显示这个病毒的来源并非如此简单。
一、华南海鲜市场:备受... 阅读全帖
f***y
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34
http://360zhyx.com/home-research-index-rid-66033.shtml
2016年9月15日,南京大学的周国华研究员、赵庆顺教授和朱敏生教授在《Genome
Biology》杂志上发表了一项重要的研究,一种新DNA编辑工具:结构引导内切酶SGN(
structure-guided endonuclease)。SGN工具与现有的DNA编辑工具不同,最强大之处
就是不受靶序列的限制,能特异性识别和捕获目标,来准确切割任何DNA序列。
而目前,其他DNA编辑技术,如最热门的CRISPR-Cas技术,争议最大的韩春雨发现的
NgAgo技术,还有ZFN、TALEN等技术,都是通过序列识别来实现靶向切割的,会受到序
列偏好的限制。
2016年5月,河北科技大学的韩春雨教授在《Nature Biotechnology》杂志上发布了一
种可以替代CRISPR-Cas的基因组编辑技术:NgAgo技术。因为这样一篇突破性的研究论
文,韩春雨教授从一个学术圈的“泛泛之辈”一跃成为“诺贝尔奖级别的科学家”。然
而,由于实验重复性的问题,很多国内外学者发现实验无法重复,韩春... 阅读全帖
c*********i
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35
战争已经打响,没有硝烟,不少死人!
1月21日,中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、军事医学研究院国家应急防控药
物工程技术研究中心钟武研究员和中科院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室李轩
研究员合作,在《中国科学:生命科学》英文版在线发表论文,为武汉新型冠状病毒的
进化来源和传染人的机制给出了学术解释。
其中最重要的结论是:武汉新型冠状病毒虽然换掉了4个关键蛋白,但是与人ACE2的亲
和力还是很强。
研究人员在吃惊之余,又仔细的比较了SARS的S-蛋白与武汉新型冠状病毒的S-蛋白结构
,结果发现,虽然替换了4个关键氨基酸,但是结构并没有发生变化,二者RBD结构域的
3D结构几乎相同,难怪和SARS那么像。
很容易把人误导为是SARS病毒而走入误区。
这个研究说明武汉新型冠状病毒应该是通过S-蛋白与人ACE2相互作用,来感染人的呼吸
道上皮细胞。
而且,这个结果也暗示,武汉新型冠状病毒具有很强的对人感染能力。
本研究为我国医务人员科学防控武汉新型冠状病毒,以及开发检测和干预技术手段奠定
了科学理论基础。
看完报告,让人在惊恐之余更加愤怒无比!
关键在于:“武汉新型冠状病毒换掉了4个... 阅读全帖
s*******t
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36
来自主题: Military版 - 美帝搞的鬼, 没跑了
1月21日,中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、军事医学研究院国家应急防控药
物工程技术研究中心钟武研究员和中科院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室李轩
研究员合作,在《中国科学:生命科学》英文版在线发表论文,为武汉新型冠状病毒的
进化来源和传染人的机制给出了学术解释。其中最重要的结论是:武汉新型冠状病毒虽
然换掉了4个关键蛋白,但是与人ACE2的亲和力还是很强。研究人员在吃惊之余,又仔
细的比较了SARS的S-蛋白与武汉新型冠状病毒的S-蛋白结构,结果发现,虽然替换了4
个关键氨基酸,但是结构并没有发生变化,二者RBD结构域的3D结构几乎相同,难怪和
SARS那么像。很容易把人误导为是SARS病毒而走入误区。这个研究说明武汉新型冠状病
毒应该是通过S-蛋白与人ACE2相互作用,来感染人的呼吸道上皮细胞。
而且,这个结果也暗示,武汉新型冠状病毒具有很强的对人感染能力。本研究为我国医
务人员科学防控武汉新型冠状病毒,以及开发检测和干预技术手段奠定了科学理论基础
。看完报告,让人在惊恐之余更加愤怒无比!关键在于:“武汉新型冠状病毒换掉了4
个关键蛋白”。第一其目地就是为了伪装成SARS... 阅读全帖

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来自主题: Military版 - 美帝搞的鬼, 没跑了
re

1月21日,中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、军事医学研究院国家应急防控药
物工程技术研究中心钟武研究员和中科院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室李轩
研究员合作,在《中国科学:生命科学》英文版在线发表论文,为武汉新型冠状病毒的
进化来源和传染人的机制给出了学术解释。其中最重要的结论是:武汉新型冠状病毒虽
然换掉了4个关键蛋白,但是与人ACE2的亲和力还是很强。研究人员在吃惊之余,又仔
细的比较了SARS的S-蛋白与武汉新型冠状病毒的S-蛋白结构,结果发现,虽然替换了4
个关键氨基酸,但是结构并没有发生变化,二者RBD结构域的3D结构几乎相同,难怪和
SARS那么像。很容易把人误导为是SARS病毒而走入误区。这个研究说明武汉新型冠状病
毒应该是通过S-蛋白与人ACE2相互作用,来感染人的呼吸道上皮细胞。
而且,这个结果也暗示,武汉新型冠状病毒具有很强的对人感染能力。本研究为我国医
务人员科学防控武汉新型冠状病毒,以及开发检测和干预技术手段奠定了科学理论基础
。看完报告,让人在惊恐之余更加愤怒无比!关键在于:“武汉新型冠状病毒换掉了4
个关键蛋白”。第一其目地就是为了伪装成... 阅读全帖
B*******c
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38
2016年9月15日,南京大学的周国华研究员、赵庆顺教授和朱敏生教授在《Genome
Biology》杂志上发表了一项重要的研究,一种新DNA编辑工具:结构引导内切酶SGN(
structure-guided endonuclease)。SGN工具与现有的DNA编辑工具不同,最强大之处
就是不受靶序列的限制,能特异性识别和捕获目标,来准确切割任何DNA序列。
而目前,其他DNA编辑技术,如最热门的CRISPR-Cas技术,争议最大的韩春雨发现的
NgAgo技术,还有ZFN、TALEN等技术,都是通过序列识别来实现靶向切割的,会受到序
列偏好的限制。
2016年5月,河北科技大学的韩春雨教授在《Nature Biotechnology》杂志上发布了一
种可以替代CRISPR-Cas的基因组编辑技术:NgAgo技术。因为这样一篇突破性的研究论
文,韩春雨教授从一个学术圈的“泛泛之辈”一跃成为“诺贝尔奖级别的科学家”。然
而,由于实验重复性的问题,很多国内外学者发现实验无法重复,韩春雨的NgAgo技术
,被学术界和媒体引入了强烈的争议风波。
可是,目前SGN工具的出现,让争议不断的NgAgo... 阅读全帖
S*****3
发帖数: 720
39
“中国百篇最具影响优秀国际学术论文” 评选所选论文代表了我国科技论文发展的最
高水平。论文源为前一年被SCI(科学引文索引)收录的中国论文。评选综合考虑发表
论文的期刊水平(影响因子和单篇引用次数)、论文类型、热点论文、论文的合作强度
、参考文献数和论文的完整性等方面。
其中生物类包括:
论文题目: Acute promyelocytic leukemia: from highly fatal to highly
curable
论文作者: Wang, Zhen-Yi; Chen, Zhu
所属机构: 上海交通大学医学院瑞金医院
来源期刊: BLOOD, 2008, 111(5):2505-2515
被引次数: 29
作者简介:
陈竺
卫生部部长,中国科学院院士,博士生导师
白血病系统生物学研究组组长
论文题目: Sorting of small RNAs into Arabidopsis argonaute complexes
is directed by the 5 ' terminal nucleotide
论... 阅读全帖
k****u
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40
千年前"裸体天神"亮相陕西历史博物馆 发型夸张关闭-
关闭-
来源: 光明网
作者:2015-04-21 11:04:38【字号:大 中 小】【打印】【纠错】热点
推荐做到这5点 你就是绝世好男人 陶渊明与中国菊花文化 美女手绘苏州美景!美翻了
! 00后小学生晒性感照引热议 小龙女疑暗指母亲给垃圾食物 江苏省健康管理学会在
宁成立   出土于新疆和田地区的佛教壁画,天神裸体的形象堪称大尺度。
西部网讯(记者敬泽昊)遍观中原地区从古至今的佛教艺术作品,绝少有裸体特别是
全裸人物出现。不过在离佛教发源地印度更近的新疆和田地区,就没有中原佛教这般的
忌讳。5幅出土于该地区的,公元8世纪前后绘制的伎乐天神壁画,就已其奇异夸张的发
型,肥硕的躯体,以及特意勾勒出的生殖器让人眼界大开。
4月21日至7月4日,包括这5幅壁画在内的,51幅出土于新疆和田地区策勒县达玛沟
乡一带的珍贵壁画,将在陕西历史博物馆免费向公众开放。
牧羊人意外发现的遗存
新疆和田地区位于昆仑山脉中段,塔克拉玛干沙漠南端,古称“于阗”。自古以来
和田就被称为西域佛国,是我国著名的佛教中心之一,甚至有专家考证,汉语中“佛”
字的... 阅读全帖
l*****r
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41
来自主题: TVChinese版 - 推荐 我是老板和 罪域
我是老板, 姜武的,很逗很逗,好久没看过这个逗的国产喜剧片了.
罪域,我妈妈最喜欢的题材,反贪打黑的,就是演到最后没几个好人。没什么名演员,
不过结构还挺紧凑的,爸妈那个年龄喜欢看的。
c******e
发帖数: 1351
42
国内论坛上的千老有发帖子,看上去像回事儿,版上的内行可以鉴定一下(以下转载):
昨晚收到的消息,中科院石正丽教授组发现武汉冠状病毒最高同源度蝙蝠亲本株,算是
重大突破,特此刊文。
中科院石正丽教授是从事国内蝙蝠冠状病毒长期研究工作的科学家,其在蝙蝠冠状病毒
领域发文权威性目前业内最高,早前SARS病毒亲本蝙蝠株溯源也是由该组最早完成的。
这次获得的蝙蝠亲本株同源性极高,DNA相似度达到96%以上,可以基本确认这次武汉冠
状病毒来源于中华果蝠,样本分离于云南,具体传播路径,宿主来源有待进一步研究,
需要对传播链条上周边所有蝙蝠及相关动物进行采样,建构完成传播链。
蛇作为中间宿主的研究因为北大组研究方法有问题,导师下了任务,我这边在重复北大
组的实验结果,扩大研究样本,近日会发布,北大组结果可能会被推翻。
接下来看文章,文章标题:
《Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia
outbreak in humans and its potential bat origin》
发表于预印本,原文链接... 阅读全帖
f**********e
发帖数: 1994
43
一种 glycoprotein hormone,1.9A 晶体结构由我以前的邻居 Bob Stroud 解出。有
166 个氨基酸残基,一个结构域,主要是 alpha 螺旋。
p*****h
发帖数: 1369
44
任何理论都可能只是一定尺度能标下的有效理论,光速可变作为一个少数派理论也不是
没人想过,并且是可以通过恒星光谱来测量精细结构常数来间接检验的
而且现在的宇宙大尺度结构的观测已经显示广相在星系以上的尺度很可能是存在重大修
正的,暗物质暗能量纯属盲人摸象
B******s
发帖数: 52
45
另外,publication是个很大的问题
现状是 很多 积累data的文章太容易publish
而不是很多创新的文章
只因为我这个基因或者蛋白更重要 所以其功能和结构就应该比其他的蛋白或者基因创
新。。。我只能呵呵了
而funding很大程度上又跟publication 挂钩
我还记得10年暑假回上海生科院,赶上一次生化所的报告。。。那次报告是个所谓的大
牛,,,publication很多,funding很多
他报告里讲 我们 knock out 了这个基因,那个基因 等等等等 然后他说我们现在知
道了 肿瘤跟免疫跟XXX 都相关,因为那些signal transduction都能相连 等等 这
个很复杂等等
呵呵,我问了个问题,很明显 这些信号转导蛋白,只要有可相互作用的结构域而且在
时间和空间上分布一样就可以发生发应,(这个基本早就是共识了吧),你们怎么去研
究这些信号转导的通路是如何共同影响细胞表型的??
然后 大牛说,现在来说还不太现实,可以做组合敲除 但这个太复杂,我们很难做,确
实有很多问题不知道,我们还有更多的去了解。。。
说到底也没跳出自己的框框。。。... 阅读全帖
c******a
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46
来自主题: Biology版 - 两篇s引发的一通感慨
Antiviral Innate immunity 的最新进展
最近看到science上面有个innate immunity的牛人连灌两篇,心里很是xmjdh,于是决定
写点自己的浅见来表示对这个领域的大牛的仰慕之情。
就先从这两篇science说起吧。确实这是该领域的突破性进展,发S也是当之无愧。一篇
文章阐述了对于DNA virus 引起的antiviral interferin response的全新机理。以前
该领域一直致力寻找直接结合双链DNA的受体,也找到了好几个,但是在KO小鼠上面表
型并不十分明显。
而Dallas的james chen领导的小组发现DNA virus or ds DNA经常在细胞里诱导核苷酸
的转化,其产物cGAMP则能够直接激活下游的interferin responses. 所以这个cGAMP
就是在这个天然免疫反应里面一个secondary messager。当病毒或者细菌DNA进入细胞
被降解转换的时候,cGAMP 的产生能激活抗病毒免疫反应来诱导干扰素反应和阻止病毒
或者细菌的复制。
那么,自然这个负责转化病毒或者细菌DNA产生第二信使产物的... 阅读全帖
a*******e
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47
【 以下文字转载自 WorldNews 讨论区 】
发信人: atnowhere (中顽童), 信区: WorldNews
标 题: 看天朝最新科技成果,解决人类死亡问题
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Aug 31 01:25:18 2009, 美东)
图为外国媒体曾报道过的纳米机器人,关于此类机器人的部分应用,是注入人体中,幷
在人体内进行复制。这是相当危险的,有可能不但没有增强人体的免疫能力,反而会完
全摧残人体的免疫系统。(资料图)
北京8月29日电/纳米级分子机器是人类征服自然的整个宏伟蓝图中最富有想像力
和创造力的部分。
为了实现建造“多结构域蛋白质分子机器”的梦想,四川大学华西临床医学院生物
膜与膜蛋白实
验室主任丘小庆和他领导的研究集体进行了为期10年的研究,他们以数种细菌信息素、
抗体模拟无核大肠菌素等为模本,构建了数种融合蛋白(抗菌多肽和免疫毒素)。它们均
特异性地攻击了选定的靶细菌或靶细胞,其杀伤效力远远高于现有抗菌素和免疫毒素,
而毒副作用却远低于现有抗菌素和免疫毒素。
目前,科学家试图在分子尺寸上组装一种极其微小的装置,其在医学上应用前景广
阔。
O**W
发帖数: 58
48
来自主题: Military版 - 豪猪?!兼科普PRRA
以下无责任转载,请各位将军研判。本人非钱老不保证正确性
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宿主目前可以看到的比较接近的是蝙蝠和穿山甲。
但这两个宿主,其身上携带的病毒,跟这次出现在人类身上的,都有着不一样的地方。
根据SZL课题组于2020年2月3日发表在Nature上的文章(2020年1月23日,该文章发表在
预印本网站BioRxiv)指出,蝙蝠冠状病毒RaTG13 (Bat CoV RaTG13)和新冠病毒在全
基因组层面的序列相同度(sequence identity,也常被称作序列一致性,但不应称作
序列相似性)高达96%。
但在关键的刺突蛋白(图中简称S)上,却又是序列相同度最低的地方,特别是刺突的
受体结合区域(receptor binding domain,简称RBD)。
目前已知的病毒中,蝙蝠冠状病毒RaTG13(上图蓝线)和新冠病毒最近,全基因组层面
的序列相同度达96%。但在关键的刺突蛋白(S)的受体结合区域,序列相同度最低(~
90%)。上图横坐标是新冠病毒基因组核酸位点编号,纵坐标是核酸序列相同度,图片
来自石Zl课题... 阅读全帖
a*******e
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49
图为外国媒体曾报道过的纳米机器人,关于此类机器人的部分应用,是注入人体中,幷
在人体内进行复制。这是相当危险的,有可能不但没有增强人体的免疫能力,反而会完
全摧残人体的免疫系统。(资料图)
北京8月29日电/纳米级分子机器是人类征服自然的整个宏伟蓝图中最富有想像力
和创造力的部分。
为了实现建造“多结构域蛋白质分子机器”的梦想,四川大学华西临床医学院生物
膜与膜蛋白实
验室主任丘小庆和他领导的研究集体进行了为期10年的研究,他们以数种细菌信息素、
抗体模拟无核大肠菌素等为模本,构建了数种融合蛋白(抗菌多肽和免疫毒素)。它们均
特异性地攻击了选定的靶细菌或靶细胞,其杀伤效力远远高于现有抗菌素和免疫毒素,
而毒副作用却远低于现有抗菌素和免疫毒素。
目前,科学家试图在分子尺寸上组装一种极其微小的装置,其在医学上应用前景广
阔。
8月中旬正是巴蜀大地还未脱离溽暑和大雨反覆煎熬的时节,丘小庆博士仍在他的
实验室中为圆满完成“蛋白质分子机器”的构思埋头苦干。
作为四川大学华西临床医学院生物膜与膜蛋白实验室主任,他充满信心地告诉记者
,需要对蛋白质进行加工和改造使之成为满足人类需要的纳米级分子机器
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