d****u
发帖数: 1553 | 1 beta-catenin单独是没有转录活性的，严格来说是个转录激活因子，必须和TCF/LEF结
合才有转录活性。 |
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e********r
发帖数: 147 | 2 细菌里有个测序后annotated的基因（编码一个还原酶），我们有RT-PCR的证据表明这
个基因不但有正义的mRNA转录，同时也有反义的非编码RNA转录，原以为应该是个作用
于自身的cis-encoded antisense RNA，很感兴趣打算继续分析下去。
用大肠杆菌表达了这个基因的产物（表达量那叫一个高），制备了抗体以后做Western
（多抗那叫一个好），呵呵，现在麻烦出来了：至少在我们目前的诱导条件和上样量（
15 μg总蛋白）下，在该细菌里一点都没检测到这个蛋白的表达。难到它是个假基因？
那转录正义和反义干啥？这个东西自已觉得很有趣，对于如何开展下一步，请大家帮忙
出出主意，谢了先！ |
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s******3
发帖数: 28 | 3 我觉得以后得用genom说话，表型也放一边，你说是cancer sc那他有什么基因标记？哪
个基因有问题啦？基因组的表观遗传有什么特殊？信号通路研究了这么多年，也没见什
么突飞猛进的进展。我觉得重点应该转移到细胞核里面去才对，从细胞核里面事情的差
异来说事，现在疾病和信号通路是单对多，或者多对多，而且超级不明白，一团浆糊的
状态，牛逼啦，你去转录水平说事，也弄个转录水平的疾病信号机制，但是转录似乎都
搞不明白是怎么回事。这么多年的科研，不知道方向到底该去哪里 |
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d**********t
发帖数: 20415 | 4 最近realtime PCR遇到怪事了，请大家帮忙分析下原因：
问题：几个基因的值出现很多undetermined的结果，但是之前一直在同一个cell line
里做，一直都可以检测到
条件：Realtime的template是RNA反转录的cDNA
cell line和RNA抽提的方法都和以前一样，处理方法也一致
引物用的是刚刚从stock里面稀释出来的，和之前的实验来自同一管stock
拿之前证明可以检测到的RNA作为阳性对照，也是undetermined
反转录kit整个实验室公用，其他人没有遇到问题
反转录试过oligo dT和random primer，结果没有差别
其中一个基因刚刚设计了一对新引物结果也是undetermined
作为positive control的基因可以检测到没有问题
多谢了
如果需要更多细节，我会补充 |
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Z******5
发帖数: 435 | 5 此外，上面提到的是大致确定promoter和转录起始位点的方法。关于找调控序列/因子
的方法，目前有很多基于序列的预测软件，但是我觉得都不太靠谱。 可信度最高的还
是UCSC上面那些已经做了ChIP的转录因子。要注意的是这种结合也有可能是间接的。
当然，如果你要研究的转录因子还没有这些数据，就只能去做一些基于序列的预测了。
我建议最好再结合功能的推测和GEO上表达的情况的分析会更好一些。 |
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H****s
发帖数: 301 | 6 这个想法不错，但是要注意一下GFP融合的问题，你是在N端还是在C端融合？这要结合
转录因子的具体情况来进行。因为很可能的情况是GFP融合以后导致转录因子活性丧失
（或者是活性降低）。如果没有融合导致活性降低的问题，你可以买一个随机片段
array，基本上可以很快调出来该转录因子的结合片段了。祝好运。
， |
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b****n
发帖数: 311 | 7 我觉得未来生物学最激动人心的是bioengineering.我的bioengineering指的是广义的
生物学原理的应用。现在比较流行的复杂化合物的生物合成之类的只能算很简单的。复
杂的如组织器官再生。
对这些很庞大，目前看起来很遥远的目标来说，我们目前最大的障碍来自对机体发育和
工作的基本原理还很不够。举个具体的例子，肢体（手或腿）的再生。泛泛一看，我们
对肢体发育知到很多，从Hox gene决定位置，到不同类型的stem cell及其关键转录因
子，还有神经和肌肉的发育和各种各样细胞联系的形成。哪个人都能举出无数的具体知
识，但哪个人都无法了解全部。即使这样，面对再造肢体这样一个问题的时候，我们仍
然无从下手。我们需要多少种起始细胞？数量？如何启动各自的发育程序？如何协调他
们？如何终止？更进一步，我们能不能做出具有更强大神经和肌肉的肢体？
来看个具体的人物的研究，UC Berkeley的 Mike Levine和他lab出来的一些postdoc做
果蝇早期发育的转录研究，他们从简单的研究某些有明显表型的关键基因发展到全基因
组的转录研究。放本版绝大多数的人要嘲笑浪费钱去研究fl... 阅读全帖 |
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m***o
发帖数: 272 | 8 在做5-race，目的是得到一个蛋白的short form。已经得到了一个从exon6开始转录的
短的RNA，而且也得到一些UTR序列在5intorn。 用的是ambion First choice RLM RACE
KIT. 得到的片段测序，mRNA起始的位点总是不一样。起始点最长有60bp的差别。而且
在UTR序列里面有3个ATG都在读码框架里，请问怎么知道哪个ATG是真正的翻译起始点？
除了RACE，还有什么实验可以确定mRNA的起始点呢？
另外一个问题，在做另一个蛋白的RACE时候，得到过两次先表达Exon5,然后是exon2的
序列，有这样的exon rearrangement 吗？就是先转录下游的exon然后再回过头转录上
游的exon? 第一次得到这个结果的时候觉得可能是artificial，但是用不同的primer又
得到了一次这样的结果。而且还是complete的exon序列。请各位发表点意见建议吧，我
google也没有找到类似的事情。 |
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g*********d
发帖数: 233 | 9 MicroRNA 和病毒
作者：王磊
上海交通大学生命学院研究生
摘要：
microRNA(miRNA)是真核生物体内一组内源性的 21—25nt 长的非编码蛋白质的短序列
RNA，它们能通过碱基配对的方式与生物体中的 mRNA 分子相结合来参与调节基因的表
达。自 2000 年至今，miRNA 的研究发展的速度极快并且影响的范围也非常的广泛，而
且分别在2002年和2003年度中miRNA入选了Science杂志年度十大科技突破。因此，
miRNA是 RNA 研究的又一个突破，被称为 RNA 的第二次革命。目前的研究已发现
miRNA 参与了很多重要的生命活动过程涵盖了发育、凋亡、代谢、人类疾病以及病毒侵
染等方面。在病毒侵染宿主和宿主抵抗病毒的过程中病毒编码的 miRNAs 和宿主编码的
miRNAs 均发挥了重要的作用。这无疑为病毒的侵染以及宿主抵抗病毒的侵染的研究提
供了新的思路和新的领域。因此，本文的主要目的在于阐述 miRNA 的一些基本概况以
及在病毒中主要的研究方向和进展，最后对这个具有跨时代意义的小分子进行展望。
关键词：miRNA vmiRNA 功能 宿主的 miR... 阅读全帖 |
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g*********d
发帖数: 233 | 10 RNA干扰及其在动物繁殖中的应用
2009-12-28
RNA 干扰(RNA interference, RNAi)是生物进化过程中遗留下来的一种在转录后通
过 RNA 调控基因表达的机制, 它是指在真核细胞中引入双链 RNA分子从而导致具有序
列同源性的基因产生特异性基因沉默 (gene silencing)的现象 。由于 RNA干扰可以阻
断特定的基因表达, 具有超越疫苗和抗病毒药物的诸多优点, 因此在阐述基因功能以及
蛋白质相互作用等方面, 表现出诱人的前景。近年来随着分子生物学的发展, RNAi 的
机制也不断被阐明, 同时国内外研究也证实 RNAi 技术可以为动物繁殖过程中所涉及的
基因功能提供一条新的思路, 这在科研和生产实践上都具有重要的意义。
1 RNAi的发现
Matzke 等于 1989 年报道了启动子介导的序列同源性基因共转染烟草可引起转
基因表达发生沉默。 1990 年, Napoli 和 Van der Krol 等为了让矮牵牛花的颜色更
加鲜艳, 把与紫色相关的查尔酮(chalcone)基因转染到牵牛花内, 结果意外发现, 植物
体的颜色... 阅读全帖 |
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d****i
发帖数: 2346 | 11 我们用的就是第一种方法，蛮好的，我没觉得有什么问题。因为就算是这个plasmid的
所有sequence都被methylated了也无所谓，转到细胞内以后只关心我的promoter和
luciferase的转录表达，其余backbone上的序列不要也无所谓，有没有转录表达没关系
。再说你肯定要做一个control。
第二种方法看上去确实是更严谨，但是我个人认为和luciferase转录表达有关的，来自
plasmid的只有promoter和后面的polyA了，不一定对啊。
如果你实在不放心可以去要这个质粒：(pCpGl-basic)。backbone上都是修饰过的没有
潜在methylation位点的。整个plasmid拿来做in vitro methylation对backbone没有影
响。
http://www.ag-rehli.de/materials.htm#pCpGL |
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b**********8
发帖数: 349 | 12 2. 由于蛋白A本身又可以和Histone H1竞争与Linker DNA binding, 有无可能所见到的
acetyl-H3K9在genes B promoter region处的结合率降低是由于高表达的蛋白A本身取
代了endogenous H3 和acetylated-H3?
这个还真有可能。很多蛋白不但调节其他转录因子，他本身也可以作为转录因子直接参
与调控靶基因转录。要不再用A蛋白的抗体做个ChIP试试？另外，你可以做个western看
看pan-acetyl-H3K9的水平有没有降低。
楼下继续。 |
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g**v
发帖数: 345 | 13 对翻译的调控机制仅知皮毛，想在这里请教一下大家怎么入手及继续现在面临的一个很可能涉及翻译调控的比较初级的问题。
先简单描述一下已有的结果和分析：A基因突变后，B基因的转录没有改变（RT-PCR及reporter assay), 但B蛋白却没有出现（抗体免疫荧光）。
在特定的发育阶段，B要在一些细胞里表达的. 而在A LOF的动物里，尽管B依然可以转录，但却没有蛋白出来。所以B翻译后被降解的可能性应该很小，我们认为A 调控了B 的翻译。
因为A还算个很popular的基因，它是否参与翻译是大家还不知道的，所以我想顺着目前的结果往下做一做。这里想向大家请教的是该怎么往下做呢？确证翻译水平的调控还要做点什么吗？如果是翻译的调控，可能是怎么调控的呢，怎么回答这个问题呢？
（A 是个转录因子.研究对象是果蝇）。
不知信息提供的可充分？任何批评或建议性的意见都欢迎并感谢。 |
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b****r
发帖数: 17995 | 14 假设我的假说是A蛋白的表达会增强转录因子B与其已知binding DNA region的结合能力。
我的实验方法是：我用293细胞，分两组： 一个做mock transfection，一个转了我的
基因A表达质粒。然后我做ChIP（用抗转录因子B蛋白的抗体），用realtime检测转录因
子B的已知binding DNA region（看看A的过表达是否改变B与它已知的binding region
的binding 能力）。
我现在的问题是，我应该如何控制mock transfection 和基因A过表达 这两组的input
DNA量？我可以通过控制开始的细胞总数一致吗？ |
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r*****t
发帖数: 4793 | 15 自己偷偷做的东西，因为老板不喜欢
一个蛋白A，调节转录。可以和另一蛋白B结合。
偶然发现，A的突变体a(仍然可以结合B），导致细胞中B蛋白减少。这种调节不是转录
水平的，因为RT-qPCR和RNA-seq都表明，A和a都不带来B基因转录的明显变化。
考虑是蛋白降解水平的调节，用MG132 处理也确实发现，a不再导致B的下降。可是B蛋
白水平的恢复并不伴随其泛素化的增加。试着看了看是否a改变B与某些E3 ligase的结
合，结果也不理想。
不知道怎么做下去了。还不能问老板，it对我这个小项目一点都不喜欢。shit |
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D*a
发帖数: 6830 | 16 狗狗了一下没找到科学刊物的消息，都是通俗报纸的科学版 但是报道的媒体已经很多
了。
医生心急得有点扯淡啊，就为了赶七月那个会议嘛！这可倒好，刚开完会下了飞机就发
现病毒了，寄希望于第二个能抗住，结果也扛不住了。
新华网华盛顿１２月６日电（记者林小春）美国哈佛大学一家附属医院的研究人员６日
宣布，两名在接受骨髓移植后似乎被治愈的艾滋病患者病情复发，艾滋病病毒已经在他
们体内重新出现。对苦苦找寻艾滋病治疗突破方向的医学界而言，这一令人失望的消息
可谓是沉重打击。
美国波士顿布莱根妇女医院的蒂莫西·亨里奇医生当天在发给新华社记者的一封电子邮
件声明中说，艾滋病病毒在他们的患者体内“回归”的事实说明，它在人体内“潜伏”
得比科学家此前预想的“更深、更持久”，血液之外可能还有其他持久而重要的艾滋病
病毒“藏身地”。
亨里奇说：“令人失望的是，我们的病人体内重新检测到艾滋病病毒，但从科学研究上
讲意义重大。我们已经证实，人体内的艾滋病病毒水平可以减少至用高敏感仪器也检测
不到的程度，不过病毒依然会存在。我们的研究也表明，在抗逆转录病毒疗法停止后，
现有艾滋病病毒检测标准也许还不足以判断病毒是否已被... 阅读全帖 |
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j****x
发帖数: 1704 | 17 在非分裂细胞的上效果未必会那么好了
也有研究表明，转录活跃的质粒更容易入核，如果抑制转录，则入核效率极大降低。提
示DNA和转录因子的结合可能在入核过程中有重要的作用。
不过这一块好像没什么系统性的研究，到现在也还是半清不楚的 |
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Z******5
发帖数: 435 | 18 大部分蛋白貌似是300bp左右，但是也有几kb的。
你这个实验做RT的时候阴性对照一定要做好。首先在反转录之前用DNase1 treat一下
RNA。然后反转录的时候做一个不加反转录酶的对照，看看是不是有DNA污染。 |
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r*******1
发帖数: 28 | 19 课题四 害虫生防真菌致病,抗逆的分子机理与遗传改良
1.主要研究内容
(1)害虫生防真菌致病与抗逆基因鉴定与功能分析:从寄主表皮穿透相关的作用酶系研究
深入到真菌侵入寄主体内后的菌-虫动态互作关系研究为突破口,重点探索研究真菌-昆
虫实时分子互作的转录组,由此发掘鉴定新的毒力基因.同时,在模拟夏季高温和强紫外
辐射的胁迫条件下进行生防真菌的转录组研究,发掘鉴定抗逆相关的新基因.
(2)高效抗逆多靶标生防真菌工程菌株的构建:在已建立的芽生孢子或农杆菌介导的生防
真菌遗传改造体系基础上,深入研究靶标害虫的血腔专性表达技术,控制高毒力基因在寄
主血腔中的专性表达.对鉴定的毒力基因,抗逆基因或外源昆虫特异性毒素多肽进行基因
合成,利用专性表达新技术对目标基因进行定位表达或组成型表达,获得单价或多价转化
的高效抗逆多靶标工程菌株.
(3)基于所获遗传改良的工程菌株研制新型真菌杀虫剂:利用已建立的时间-剂量-死亡率
模型和孢子衰变模型的模拟技术,研究建立适合新型真菌杀虫剂的应用配套技术体系.
2.研究目标
通过真菌杀虫剂转录组及功能基因组研究,克隆鉴定毒力和抗逆的新基因6-8个,并解析
不同基因在... 阅读全帖 |
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s*****g
发帖数: 7857 | 20 一个转录因子蛋白在药物处理5-10分钟后，从细胞质里进入细胞核，18小时和24小时
后下游信号蛋白量急增。。。然后再42-48小时减少到对照组一样甚至更少。
这个是转录（transcriptional）调控还是转录后调控？
谢谢 |
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s*****g
发帖数: 7857 | 21 是的，是磷酸化得变化导致转录因子出核或入核
今天正好从新制定研究计划，要看短时间点下游信号 mRNA变化和蛋白变化。
有趣得是这个转录因子在5－10分钟入核，然后游离出核，再在4小时时再入核。 然后
再出来。。。估计每次进去转录的基因是不同的。因为下游蛋白们的出现也是叠加在不
同时间段（目前只看了18小时以后的。）
1kb/min的信息很重要！
多谢！ |
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r*******1
发帖数: 28 | 22 浙大生科院中枪
科技部关于四起违反科研经费管理规定典型问题的通报
国科发财〔2014〕200号
各省、自治区、直辖市及计划单列市科技厅（委、局），新疆生产建设兵团科技局，各
有关单位：
近年来，国家财政科技投入持续增长，有效保障了科技事业的快速发展，社会各界在期
待科研工作更快更好地产出创新成果的同时，也日益关注财政科研经费配置的合理性，
以及经费使用的安全性和有效性。
为此，科技部会同相关部门，采取了一系列改革措施，在简政放权的同时，加强经费监
管，促进国家科技计划项目经费的规范管理和使用，强化科研项目课题承担单位的法人
责任，增强参与科研活动从业人员的规矩意识，加大预算评估评审、巡视检查、专项审
计、财务验收等科研经费监管工作力度。近期，科技部在经费监管中发现了4起违反科
研经费管理规定的典型问题，经研究决定，依据《国务院关于改进加强中央财政科研项
目和资金管理的若干意见》（国发〔2014〕11号）、《财政部 科技部关于调整国家科
技计划和公益性行业科研专项经费管理办法若干规定的通知》（财教〔2011〕434号）
、《国家科技计划和专项经费监督管理暂行办法》（国科发财字〔2007〕... 阅读全帖 |
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t*******y
发帖数: 36 | 23 楼主感兴趣的话可以看看UCSF Jonathan Weissman实验室，听说他们实验室根据cas9搞
的cas9a（activation)和cas9i (repression)效果还不错，暂时主要应用在genomic
screen上。我觉得以后用来做真核的synthetic biology非常好。同样在UCSF 的
Wendell Lim前一阵子把一些基本的基因调控原件应用在免疫细胞里面，效果还不错，
以后基于synthetic biology的基因治疗可能也有很好的发展....
搬到mit的james colins 也很好。
纯从转录调控说，个人感觉e coli 和 yeast 差别不是特别大，从 yeast 到其他的真
和模式生物差别非常大。虽然yeast同样有histone,但是对转录调控的影响比较简单。
在yeast里大概影响转录调控的variables都了解的差不多了，直接manipulate这些
variables的工具也相对齐全。在其他真核系统里，定量的研究感觉上还都是停留在对
一个gene的特定promoter的研究，从这个gene上发现的规律放到其他gene上面基本... 阅读全帖 |
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C*********m
发帖数: 213 | 24 我有个蛋白，平时都在核外，某个条件下跑到核内成为（疑似）转录因子。有两个组以
前做过转录活性，但是文章比较老了。我们自己也做过EMSA，看到和DNA的结合，也有
核内核外成像定位的数据。但关键是不能确定是否真的是转录因子。现在的数据也就够
个JBC之流的杂志。和两个实验室试图合作做Chip-Seq，但是对方都不卖力，迄今没有
进展，很失望。请问版上有哪位大哥大姐可以做这方面的实验，短期内能出一些数据，
可以合作写文章。
有兴趣的请私信联系。 |
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x******h
发帖数: 838 | 25 呵呵，我很少八卦，今天八卦牛人一下。
鱼哥确实不是这一行的，连几个著名八卦都不知道的感觉，连我都知道，哈哈。大家都
知道，真核转录的先驱、分离出三种转录酶的人是Bob Roeder，感觉基本认为他的贡献
得个炸药奖妥妥的，他自己也这么认为。记得几年前有他实验室的千老就说他自己直接
说俺要得炸药奖了……他确实早该得奖，但据说他人品差，不但他差，他徒子徒孙差的
也不少（不过也有人品好的），至少包括一名著名的华人教授。不知道是不是人品原因
，炸药奖一直和他无缘。
R kornberg 是著名的科二代大家应该是知道的，据说他爸临死前没少为他这炸药奖张
罗，炸药奖委员会大概也希望来个父子同堂。因此终于在2006年要发给他，你说这贡献
怎写？真核转录的奖很难避开Roeder的，只好来了这么个模棱两可的 molecular basis
，你爱怎么理解都行，包括理解为结构；但很明显措辞刻意避开倒霉或者说自作自受的
Roeder。
至于核小体，这个八卦就更严重了。染色质这方面有一本早期的经典书，作者是Ken
van Holde。里边直接把第一篇观察到核小体的论文的审稿意见登出来，当然那意见说
这个东西胡... 阅读全帖 |
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f******k
发帖数: 856 | 26 我这个问题很奇特，我用Invitrogen的dynabeads做ChIP-seq，最后拉下来的DNA量总是
比较高，做qPCR也没有enrichment，但是用同样的protocol，换回agarose beads，就
很少碰到这种问题。这不合理啊，dynabeads按理说背景要比agarose beads低很多才对
啊？！不知道大家有没有碰到这种情况？我试过好几种洗的方法和试剂，比如最常用的
就是低盐洗一次，高盐洗一次,LiCl洗一次，TE洗两次。也试过用RIPA洗过，也试过大
量延长洗的时间，但是最后elute下来DNA的量还是比较高。
另外，能不能请推荐一个比较好的做转录因子ChIP-seq的盒子或者详细的homemade
protocol？我做的这个转录因子，比较low abundant，可是我的材料是primary tissue
，又没法一次拿到很多的细胞（一次运气好的话可以有50-100million）。看有的文章
说现在10million就可以做转录因子的ChIP-seq了，可是我从来没成功过。现在真是快
被逼死啦。。。。快救救我 ：（ |
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b******s
发帖数: 1089 | 27 延续new yorker的辩论，究竟表观遗传和转录因子谁更重要。
饶毅的辩论技巧更好，紧紧抓住充分特异这个概念，但是感觉朱冰的论点更合理，cell
fate barrier本身就是命运调控的重要环节。饶毅紧紧抓住有限的几个成功用转录因
子进行命运重编程的例子，但是却忽视99%以上命运相关因子不能决定命运的例子，而
且成功的例子也是需要一定的背景，很难想象是绝对的充分条件，这个背景有可能就是
特定的表观状态。
比如植物里的确有叶变花，花变叶的情况，但是进化上花本身作为变态的叶片，表观背
景有可能就一致，除非同样的转录因子可以把根也变成花，那我真是服了。
不过我很欣赏饶毅一点的是他老学究的风格，讲究概念，寻根溯源，讲究知识传承。今
天包括表观，组学等领域灌水的实在太多，很多人都变成包工头，不讲究概念，不讲究
思辨，很多牛文无数的牛人基本概念都不是特别清晰。这点还是要赞饶毅，虽然他有一
点知识分子的做作和清高。 |
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l********e
发帖数: 415 | 28 转录本身不说明任何问题 所有intron都是转录的
: 我的目的就是研究intron序列的功能，因为是疾病相关。而且尤其那个region1是
: TGTGTGTGTG这种重复序列
: 如果能证明确实有noncoding RNA转录出来，也是功能发现啊；对于疾病来说就
是gain-
: of-function
: 你说的knockdown是loss-of-function我也在做
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y***e
发帖数: 6082 | 29 【 以下文字转载自 Chemistry 讨论区 】
发信人: yueke (小鱼儿~2008BB竞猜王), 信区: Chemistry
标 题: UCLA治艾研究突破：中药黄芪可成为治疗艾滋病的药物zz
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Nov 19 23:01:42 2008), 转信
美国科学家通过长期研究发现，中药黄芪中含有一种可有效抑制艾滋病病毒细胞分裂的
化学物质----TAT2，对治疗艾滋病有非凡的功效。
美国加利福尼亚大学洛杉矶分校艾滋病研究协会近日公布的最新研究成果显示，中药黄
芪中包含一种特殊的化学物质----TAT2，研究人员发现 TAT2是对付艾滋病主要元凶---
-“淋巴细胞杀手”的有效手段。黄芪有望取代传统的艾滋病治疗方式----抗逆转录病
毒疗法，成为治疗艾滋病的主要方式。
抗逆转录病毒药物可以阻止艾滋病病毒与宿主细胞结合。最近，德国一名医生在南非和
其他一些国家报纸上发表文章，提出抗逆转录治疗具有毒副作用。
此外美国研究人员还指出，黄芪还可以治疗其他免疫系统疾病，尤其对病毒性感染和慢
性病有奇效。
http://www.naturalnews.co |
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t*******d
发帖数: 2570 | 30 "总而言之，奥尼诗及其同事确信，他们发现那些表达上调的转录序列都是负责抑制
肿瘤的，而那些表达下调的转录序列都是促使肿瘤生长的，即所谓“致癌基因”。"
如果你读了原文的话你就会发现原文的结论比这句话弱很多。原文的结论是上调的转录
序列中有的所在的信号通道是跟肿瘤抑制有关的。根本没有"都是"。
不过这种研究方法是应该提倡的。 |
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i*****s
发帖数: 15215 | 31 东方蝾螈（红点蝾螈）可能是在近代才进化出了器官和肢体再生的能力。
人们一般认为，动物器官的再生能力是所有多细胞动物都具有的古老特质。然而，
对蝾螈的遗传分析表明，这种能力出现的时间并没有那么久远。
红点蝾螈（Notophthalmus viridescens）尽管十分小巧，但它的器官再生能力却
远超那些最高级的生物技术实验室。这种蝾螈可以再生失去的器官，包括心肌、中枢神
经系统成分，甚至眼睛的晶状体。
医生们希望这种能力是基于一个尽管潜在，但是对所有动物（包括哺乳动物）都普
遍存在的遗传程序基础，这样就可以将其应用于再生药物。例如，小鼠可以在心肌损伤
后产生新的心脏细胞。
然而，德国巴德诺海姆的马克斯普朗克心肺研究所的汤姆斯·布朗（Thomas Braun
）和同事的研究却表明，这远远没有那么简单。
寻找蝾螈中与人类、小鼠以及果蝇相同的遗传机制的研究早已停滞不前，因为蝾螈
的基因组非常庞大，超过人类基因组的十倍。于是，布朗和同事检查了蝾螈基因表达时
产生的RNA（称为“转录组”），并运用了3种分析技术来汇总数据。
团队首次汇总了红点蝾螈（N. viridescens）的全部RNA转录本... 阅读全帖 |
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s********e
发帖数: 239 | 32 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: xiaofish (小鱼儿), 信区: Biology
标 题: Re: 为什么那么多人说Roger Kornberg？
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Aug 22 14:07:47 2015, 美东)
呵呵，我很少八卦，今天八卦牛人一下。
鱼哥确实不是这一行的，连几个著名八卦都不知道的感觉，连我都知道，哈哈。大家都
知道，真核转录的先驱、分离出三种转录酶的人是Bob Roeder，感觉基本认为他的贡献
得个炸药奖妥妥的，他自己也这么认为。记得几年前有他实验室的千老就说他自己直接
说俺要得炸药奖了……他确实早该得奖，但据说他人品差，不但他差，他徒子徒孙差的
也不少（不过也有人品好的），至少包括一名著名的华人教授。不知道是不是人品原因
，炸药奖一直和他无缘。
R kornberg 是著名的科二代大家应该是知道的，据说他爸临死前没少为他这炸药奖张
罗，炸药奖委员会大概也希望来个父子同堂。因此终于在2006年要发给他，你说这贡献
怎写？真核转录的奖很难避开Roeder的，只好来了这么个模棱两可的 molecular bas... 阅读全帖 |
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m****g
发帖数: 530 | 33 最近，德国的癌症研究人员在细胞应答DNA破坏方面获得了新的进展。
这项研究结果发布在《Molecular Cell》上，研究人员表示，蛋白PARP-1能够在数秒内
检测到DNA破坏，并激活转录
因子NF-kappaB。NF-kappaB能够激起抑制细胞程序性死亡的生存程序的发生。NF-
kappaB的活化被认为是肿瘤细
胞对化疗和放疗抑制的潜在原因。
人类每个细胞的DNA每天都会就经历很多次破坏。紫外线辐射能导致DNA损伤，使得细胞
分裂出现错误，细胞代谢产物
异常等。破坏的染色体DNA能够最终导致严重的疾病，比如癌症。
然而，细胞本身具有复杂的系统在数秒内识别DNA损伤，确保该破坏能够被及时修复。
如果出现大量的DNA破坏，受到
影响的细胞能通过细胞凋亡自我消灭。
细胞凋亡能导致有缺陷的细胞自杀，从而全面保护生物。此外，另一个基因表达的调控
子是转录因子p53，但是p53并
不总能成功开启保护程序。
研究人员介绍说，NF-kappaB的功能与p53相反，其能激活生存程序保护受损细胞的毁灭
。NF-kappaB的激活程序被
认为是肿瘤细胞化疗和放疗抑制的一个潜在原因。
转录因子NF-k |
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m*****i
发帖数: 1205 | 34 下面是转自NTU BBS关于日本新剧《百年物语》的评论
作者: rprp (徽徽) 看板: Nanako
标题: [转录][转明]【东京快递】《百年物语》观后报告书
时间: Mon Sep 4 22:45:59 2000
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作者: jeremy (small) 看板: kyakuhonka
标题: [转明]【东京快递】《百年物语》观后报告书
时间: Mon Sep 4 17:42:39 2000
TBS电视台在离21世纪来临前的倒时计时，从8月28日起连续三个晚上
共7个半小时的时间，隆重推出本年度超大型代表作《百年物语》，
叙述四代女性（真正呈现的只有三代)， 在百年来，追求自我与爱情的故事。
连续三天的观后评语是「有倒吃甘蔗的感觉」，更严格的说：幸好他们找来松岛
菜菜子主演；而第三部中的 |
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p*****i
发帖数: 1183 | 35 有篇报道是啥报道？Science/Nature还是真理报？
植物细胞、动物细胞结构的巨大差异，DNA/RNA的蛋白质转录机制大家中学都学过
没有点切实的科学实验根据，很难相信植物细胞的DNA能被转录到动物细胞或细菌上
西，
不成
安全
题都 |
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N********y
发帖数: 66 | 36 艾滋病毒的发现者、2008年诺贝尔生理与医学奖获得者Luc Montagnier（吕克·蒙
塔尼）教
授为自己下一步的研究找到了新的合作伙伴：上海交通大学。2010年11月18日，我校聘
请吕克·蒙
塔尼担任大学讲席教授签约仪式在闵行校区南苏园隆重举行。校党委书记马德秀、校长
张杰，相关部
处、院系领导和教授代表出席签约仪式。仪式由常务副校长林忠钦主持。
校党委书记马德秀给蒙塔尼教授颁发上海交通大学聘书、佩戴校徽、颁发工作证时
，会议室里响
起了热烈的掌声。马德秀发表热情洋溢的致辞，对蒙塔尼教授成为“交大人”表示热烈
的欢迎，对这样
一位对人类健康做出了巨大贡献的学者加盟交大感到非常骄傲，对蒙塔尼教授把获得诺
奖之后的进一
步研究放在发展中国家表示敬意和钦佩，并相信Montagnier研究所能够在交大获得很好
的发展，为
中国、为世界、为全人类的健康做出更大贡献。
校长张杰向大家介绍了蒙塔尼教授的情况，蒙塔尼1983年发现AIDS的起因——HIV
，这一发现直
接引领了对血液样本中抵抗HIV病毒的研究，2008年，他因发现HIV而被授予诺贝尔生理
学和医学
奖，现任联合国教科文组织世界... 阅读全帖 |
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t*****g
发帖数: 7455 | 37 上午8:17（8 小时前）国内未知致命病毒从 政府丑闻 作者：Robert原始来源：http://www.douban.com/group/topic/13371669/
编辑说明：真假自辩。
特约记者：金微撰稿
49岁的上海人网名“林军”向本报发出近呼绝望的哀求，他说自已和家人正在遭受
一种未知病毒的折磨和摧残。
厄运是从07年开始的，那年林军的母亲突然胃出血，经医院治疗输入了3800CC的AB
型血和血浆，出院后他的母亲经常盗汗，并出现皮疹、手脚麻木、肠鸣、肌肉跳，关节
响，身体疼等现象，而且便秘和拉稀交替、人也变得消瘦。
次年5月，因为一次意外，林军接触到了母亲的血液，同样的症状在14天后出现。
而且他的下颌淋巴肿大，膝关节酸胀，并伴有膝关节响。右腹中部感到有硬块，肠鸣声
不断，小便颜色发黄，眼睛发红，皮肤压痕严重，皮下出血并出现皮疹，身体游走性疼
痛，吃一餐呕吐一餐。随后整个左半边脸开始肿大，经医院B超检查为，左侧腮腺淋巴
结炎、左侧颌下淋巴结炎。 半年的时间体重由原来的165斤下降到105斤。
在林军出现症状后的3个月，其妻子和孩子先后发过一次烧，此后，同样的症状开
始出现在... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 38 诺奖“风向标”预测4华裔科学家获奖
根据诺贝尔奖官网发布的消息，2014年诺贝尔奖将从10月6日起陆续揭晓。四位华裔科学家张首晟、杨培东、邓青云、钱泽南成夺奖热门人选。
根据汤森路透的预测，2014预测名单包含来自9个不同国家、27个不同学术和研究组织的27位研究人员，并首次同时出现四位华裔科学家。因已成功预测了35位诺贝尔奖得主，汤森路透的“引文桂冠奖”颇受关注。上年更是成功预测了11位诺奖得主中的8位。
与此前获诺奖的华裔科学家不同，张首晟、杨培东是改革开放后在中国内地接受教育的新一代，两人成为今年诺奖热门人选更令国人期待。杨培东和邓青云此前曾分别在武汉大学、华中科技大学讲学。
2014年诺奖公布时间
生理学或医学奖
北京时间6日17时30分
物理学奖
北京时间7日17时45分
化学奖
北京时间8日17时45分
和平奖
北京时间10日17时
经济学奖
北京时间13日19时
根据传统瑞典皇家科学院规定，文学奖公布时间，另行通知。
张首晟：
“拓扑绝缘体”
让电脑运算加速
1963年生于上海，1978年考入复旦大学，现为斯坦福大学教授
“他早就应该得诺贝尔奖了”，昨日，长期研究诺贝尔奖... 阅读全帖 |
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c***s
发帖数: 70028 | 39 今年诺贝尔奖于6日起陆续揭晓。汤森路透集团的预测名单包含来自9个国家的27位研究人员，首次同时出现四位华裔科学家。汤森路透主要根据学术论文引文等数据展开预测，上年成功预测了11位诺奖得主中的8位。点击视频，看看热门人选中的“黄皮肤”吧！
曾经35次成功预测大奖得主的汤森路透集团一下子看好了4位华人科学家。其中两位是改革开放后从中国大陆出国留学的新一代，尤其令全球华人瞩目。闲话少说，咱们现在就对这份“大拿”名单先睹为快吧。
杨培东——专长：纳米光子学
杨教授曾研制出第一个纳米导线激光器。他对纳米光子学的贡献有助于提高计算机存贮量。
杨培东现执教于加州大学伯克利分校，是美国文理科学院院士。
这位全球顶尖纳米材料专家1971年生于江苏苏州，1993年从中国科技大学毕业后赴美留学，年仅28岁便成为加州大学伯克利分校助理教授，5年后被聘为终身教授。
杨培东接受新华社记者采访时说，能被人看好“是一件好事”，但他对得奖并“没有特别的想法”。
张首晟——贡献：量子自旋霍尔效应与拓扑绝缘体
张首晟1963年生于上海，15岁考入复旦大学，出国留学后师从杨振宁，学术上开创出拓扑绝缘体这一学科，可谓一帆风顺、... 阅读全帖 |
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i***s
发帖数: 39120 | 40 多名接近俄罗斯空难调查的人士6日透露，先前找到的两个“黑匣子”对还原客机失事原因帮助不大，调查不能把“宝”全押在“黑匣子”上。
俄罗斯媒体《生意人报》援引这几名知情人士的话报道，调查人员已经转录了“黑匣子”里面储存的内容，并把数据交由专家分析。
报道说，“黑匣子”记录的数据显示，在飞机从起飞到坠机的20多分钟里，整个系统运行正常；但是，突然“发生某件事情以后”，“黑匣子”里面的飞行记录器被打断。
这几名知情人士说：“从A321客机飞行记录器里转录出来的数据没有帮助我们确定空难原因。”
他们暗示，机舱内“爆炸性减压”可能是客机坠毁的原因之一。不过，他们没有就此作出更多解释。
俄罗斯官员先前说，两个“黑匣子”的“状况良好”。但是西方媒体援引知情人士的话称，至少一个“黑匣子”损坏。
靠什么调查？
既然“黑匣子”靠不上，那调查人员下一步依靠什么深入调查？
路透社认为，对飞机残骸的科学鉴定和对遇难者遗体的尸检可能成为调查取得进展的突破口。此外，调查人员也可以借鉴1988年洛克比空难和1989年法国联航空难的调查。
多名参与调查的人员告诉记者，通过对现场各种痕迹的分析，借助科学手段，调查人员正在试... 阅读全帖 |
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J********3
发帖数: 3151 | 41 并列一作放第第一和第二位哪能没区别呢？
另外这篇论文肯定这个吹牛小伙没有那个日本人松井贡献大，通讯作者京都大学教授真贝洋一接受采访也没敢提根治癌症哈,只不过这个基因正常的话可以有效抑制体内内源反转录病毒活化，该基因突变，则体内内源反转录病毒活性化，可以诱发基因突变，从而易发癌症，人类也可能有类似作用而已，离根治癌症还有十万八千里！ |
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c*****r
发帖数: 8227 | 42 此前，国内高校尚鲜有聘请诺奖获得者作全职教授的先例。因此这一合作被认为具有突
破性意义。
人民网上海11月18日电 （记者 姜泓冰）18日晚，一个聘任仪式在上海交通大学闵行
校区悄然举行。艾滋病毒的发现者、2008年诺贝尔生理与医学奖获得者吕克·蒙塔尼（
Luc Montagnier）教授从上海交通大学党委书记马德秀手中接过学校聘书、工作证，佩
戴上校徽，正式成为该校讲席教授。此前，国内高校尚鲜有聘请诺奖获得者作全职教授
的先例。因此这一合作被认为具有突破性意义。
根据协议，上海交通大学闵行校区的生命科学技术学院大楼里，将出现以2008年诺
贝尔生理学与医学奖获得者、联合国教科文组织世界艾滋病研究与防治基金会主席蒙塔
尼教授的名字命名的蒙塔尼研究所。今后蒙塔尼教授本人的主要学术工作将会在这里进
行。
蒙塔尼教授在受聘仪式上表示，他相信能在交通大学继续从事一流的科学研究，找
到治疗艾滋病的方法，为人类健康作出贡献。他说，选择到上海交大从事科研，因为看
到了中国经济的高速发展和中国大学的快速发展，上海交通大学快速发展的生命学科、
医学学科、物理、化学等学科及一批先进的交叉学科平台，以及一... 阅读全帖 |
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w*********g
发帖数: 30882 | 43 光合作用为农业可持续发展提供支撑
——光合作用分子机理研究“973”项目获得一系列突破性成果
■本报记者 丁佳
光合作用是地球上最大规模的利用太阳能把二氧化碳和水等无机物合成有机物并放出氧
气的过程。它为几乎所有的生命活动提供有机物、能量和氧气。如果没有植物的光合作
用，就不可能有人类社会的生存和持续发展。当今人类面临的粮食、能源和环境资源等
问题与光合作用密切相关。现代人类文明所需的生物燃料，无论是煤、石油和天然气都
是由古代植物光合作用直接和间接的产物转化而来。光合作用机理的研究一直是自然科
学的核心问题之一，也是生命科学研究的前沿领域和热点之一。
由于光合作用在理论和实践上的重要意义，在我国非常重视光合作用的研究。于2009年
，在国家重点基础研究计划资助下，来自中科院植物所、上海植物生理生态研究所、遗
传发育生物研究所和北京大学、山东农业大学、中国农科院作物研究所等优势单位联手
组建了一支研究队伍，在该项目首席科学家，中科院植物所研究员张立新主持下，开展
了“光合作用分子机理及其在农业生产中应用的基础研究”。
通过5年的合作攻关，目前已在光能传递、光合膜复合物生成机制、叶绿体信... 阅读全帖 |
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w*********g
发帖数: 30882 | 44 光合作用为农业可持续发展提供支撑
——光合作用分子机理研究“973”项目获得一系列突破性成果
■本报记者 丁佳
光合作用是地球上最大规模的利用太阳能把二氧化碳和水等无机物合成有机物并放出氧
气的过程。它为几乎所有的生命活动提供有机物、能量和氧气。如果没有植物的光合作
用，就不可能有人类社会的生存和持续发展。当今人类面临的粮食、能源和环境资源等
问题与光合作用密切相关。现代人类文明所需的生物燃料，无论是煤、石油和天然气都
是由古代植物光合作用直接和间接的产物转化而来。光合作用机理的研究一直是自然科
学的核心问题之一，也是生命科学研究的前沿领域和热点之一。
由于光合作用在理论和实践上的重要意义，在我国非常重视光合作用的研究。于2009年
，在国家重点基础研究计划资助下，来自中科院植物所、上海植物生理生态研究所、遗
传发育生物研究所和北京大学、山东农业大学、中国农科院作物研究所等优势单位联手
组建了一支研究队伍，在该项目首席科学家，中科院植物所研究员张立新主持下，开展
了“光合作用分子机理及其在农业生产中应用的基础研究”。
通过5年的合作攻关，目前已在光能传递、光合膜复合物生成机制、叶绿体信... 阅读全帖 |
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J******y
发帖数: 1442 | 45 那是因为前总统姆贝基：
1. 不承认黑人艾滋病高发率，声称艾滋病是一种“西方人带来的种族主义祸害”。有
人喜欢渲染我们这里的艾滋病，这是一种西方式的种族主义偏见。
2. 唯利是图的西方生产商提供的抗逆转录病毒药物太昂贵，有毒而且无效。
3. 2004年小布什提出5亿美元援助FDA1997年批准使用的抗艾滋病新药奈韦拉平和其他
医疗手段，是美国想用非洲人做试验新药的“小白鼠”。
4. 大力推广黑人民族瑰宝的传统医药——一种用橄榄油、大蒜、甜菜根和其他一些东
西配制的东西——的抗艾神效，声称胜过抗逆转录病毒药物。 |
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w***7
发帖数: 1637 | 46 http://cn.tmagazine.com/health/20140306/t06hiv/
波士顿——去年，科学家宣布了一则令人震惊的消息，称有名先天携带人类免疫缺陷病
毒(HIV)的婴儿经过出生仅30个小时后即开始的高强度治疗被治愈。随后，立即有人质
疑这个孩子可能根本就没有被感染。
但是，周三在这里召开的一个艾滋病(AIDS)研讨会上宣布发现了另一个情况相同的婴儿
，基本证明这种治疗方案是有效的。一位主要研究员说，加拿大可能还有五个这样的病
例，南非有三例。
另一名研究员说，他们即将展开临床试验，届时将有60个先天感染艾滋病的婴儿在48小
时内接受药物治疗。
如果临床试验有效——还要花数年时间来对这些婴儿进行跟踪调查，才能决定是否已经
治愈——那么用来治疗世界上每年25万个新生受感染婴儿的方案无疑将被改写。
“这将带来巨大的变化，原因有两条，”美国国家过敏及传染性疾病研究所(National
Institute of Allergy and Infectious Diseases)所长安东尼·S·福奇(Anthony S.
Fauci)表示。“这都是为了孩子们的健康，因为这个证... 阅读全帖 |
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w*******e
发帖数: 15912 | 47 算是岛国学术界的美女呀，可惜了。
转自wiki
小保方晴子（日语：小保方 晴子／おぼかた はるこ Obokata Haruko ?，1983年－）
，日本细胞生物学家，现服务于理化学研究所。
2014年1月，在《自然 (期刊)》发表了世界首例有效制作STAP细胞的论文，被传媒视为
首位女性日本人诺贝尔奖得主的有力人选。
目录
1 教育背景
2 新闻事件
3 参考资料
4 外部链接
教育背景
早稻田大学理工学部 应用化学科毕业（2006年）
早稻田大学 应用化学硕士（2008年）
早稻田大学 生命医学博士（2011年）
新闻事件
小保方晴子于2014年1月30日发表在《自然 (期刊)》的STAP细胞的论文，引来了加州大
学戴维斯分校教授Paul Knoepfler等美国学者的攻击，他们声称论文中有2张照片疑似
照假。现阶段，小保方论文中的实验方法，也无法被其他学者成功重现[1]。2月下旬，
理化学研究所为此组成了独立调查团，早稻田大学也对小保方的博士论文展开调查[2]。
辟谣
《朝日新闻》2月19日报道，上述质疑只是“误植照... 阅读全帖 |
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x*****8
发帖数: 10683 | 48 一堆活细胞，堆出一只手: 3D打印，现在基本成功了。
一堆合成化学物质，堆出一个活细胞：现在科技水平暂时还实现不了，我们现在至少需
要下列物质：
1）模板--DNA，现在可以合成。
2）转录酶和转录因子--蛋白质，理论上可以合成，但我猜还是有蛋白质折叠的问题。
3）翻译机器--核糖体蛋白和核酸，其中核酸起催化作用，理论上可以合成，但我猜还
是有蛋白质和核酸折叠的问题。
不过离完全实现也就几十年时间了。 |
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m******r
发帖数: 4351 | 49 转基因作物的毒性问题 5
作者：石老人
科普几个问题：
一、关于植物基因组
植物中有核基因组、线粒体基因组和叶绿体基因组。它们各有独立的DNA复制系统，请
查自主复制这个概念。叶绿体是植物将太阳光的能量（“万物生长靠太阳”的根据在这
里）转变为化学能的场所（第一步是将光能转变成糖类，……）；线粒体是细胞一切活
动的能量来源场所，类似于一个城市的发电场。但它们在生物体内是相互依赖相互影响
的，这个问题太复杂。
举2个例子，植物的叶子是光合作用的主要场所，植物的光合作用由叶绿体负责，多数
植物的光合作用的最关键酶叫RUBP羧化酶（另一个叫 PEP羧化酶，存在于玉米、高粱等
C4植物中，但C4植物的二样化碳固定也主要靠RUBP羧化酶，只是多了一条C4途径），这
个酶的最主要作用是固定二氧化碳（不止这一个功能）。RUBP羧化酶含16个亚基，其中
的8个亚基是核基因组编码的，8个亚基是叶绿体编码的，分别来自核基因组和叶绿体基
因组的16个亚基组成一个很大很复杂的蛋白质，这就是RUBP羧化酶，植物叶片中水溶性
蛋白质的一大半是这个酶。叶绿体中捕捉光子的主要色素是叶绿素，包括A、B等（当... 阅读全帖 |
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M*********n
发帖数: 4839 | 50 诺奖“风向标”预测4华裔科学家获奖Mitbbs.com
根据诺贝尔奖官网发布的消息，2014年诺贝尔奖将从10月6日起陆续揭晓。四位华裔科
学家张首晟、杨培东、邓青云、钱泽南成夺奖热门人选。Mitbbs.com
根据汤森路透的预测，2014预测名单包含来自9个不同国家、27个不同学术和研究组织
的27位研究人员，并首次同时出现四位华裔科学家。因已成功预测了35位诺贝尔奖得主
，汤森路透的“引文桂冠奖”颇受关注。上年更是成功预测了11位诺奖得主中的8位。
Mitbbs.com
与此前获诺奖的华裔科学家不同，张首晟、杨培东是改革开放后在中国内地接受教育的
新一代，两人成为今年诺奖热门人选更令国人期待。杨培东和邓青云此前曾分别在武汉
大学、华中科技大学讲学。Mitbbs.com
2014年诺奖公布时间Mitbbs.com
生理学或医学奖Mitbbs.com
北京时间6日17时30分Mitbbs.com
物理学奖Mitbbs.com
北京时间7日17时45分Mitbbs.com
化学奖Mitbbs.com
北京时间8日17时45分Mitbbs.com
和平奖Mitbbs.com
北京时间10日... 阅读全帖 |
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