h******y 发帖数: 351 | 1 请问大家在设计shRNA的时候,target靶序列的antisense应该放在loop的哪边?前面?
后面?还是
无所谓?
对于shRNA转变成siRNA,请问下面所示的两种情况,哪种(loop在双链的左边或者在双
链的右边)形
式更容易与Dicer结合,从而被切割成siRNA?
/ ̄\
5'-sense-----strand- | loop
3'-antisense-strand-\_/
/ ̄\
loop | -sense-----strand-3'
\_/-antisense-strand-5'
我看到很多人把antisense放在loop的后面,很多文献上也是这样示意的,但是
Genscript的人告诉
我放在哪边都无所谓。请问是这样吗?
多谢。 |
w******e 发帖数: 1187 | 2 bryan cullen has a paper on designing shRNA
【在 h******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 请问大家在设计shRNA的时候,target靶序列的antisense应该放在loop的哪边?前面? : 后面?还是 : 无所谓? : 对于shRNA转变成siRNA,请问下面所示的两种情况,哪种(loop在双链的左边或者在双 : 链的右边)形 : 式更容易与Dicer结合,从而被切割成siRNA? : / ̄\ : 5'-sense-----strand- | loop : 3'-antisense-strand-\_/ : / ̄\
|
h******y 发帖数: 351 | 3 Can you tell me which paper it is? Thank you very much.
【在 w******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : bryan cullen has a paper on designing shRNA
|
y****m 发帖数: 37 | 4 design your shRNA look like pre-miR-451,
I guarantee your knockdown effect unless your target is not accessible |