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Biology版 - 谁跑总RNA变性胶碰到过这种奇异怪事?
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e********r
发帖数: 147
1
用甲醛-MOPS变性琼脂糖胶跑细菌总RNA电泳,发现样品完全降解。做实验逐一排除,发
现MOPS缓冲液,去离子甲酰胺和总RNA分别混合后65度处理都没问题,而只要把甲醛和
RNA混合后就会降解。奇怪的是,换了几瓶甲醛都是这个结果,而别人的总RNA用同样的
甲醛没问题,极为郁闷,难道我们的总RNA和甲醛不对付?RP不够?
各位说说看这该如何是好?
a***e
发帖数: 1010
2
run other lab's sample side by side with your sample.
then use their protocol.
a***y
发帖数: 19743
3
好可怜
前些天我提RNA在普通TBE琼脂糖胶上跑都不降解。
不过我没经验所以不能给你建议了。

【在 e********r 的大作中提到】
: 用甲醛-MOPS变性琼脂糖胶跑细菌总RNA电泳,发现样品完全降解。做实验逐一排除,发
: 现MOPS缓冲液,去离子甲酰胺和总RNA分别混合后65度处理都没问题,而只要把甲醛和
: RNA混合后就会降解。奇怪的是,换了几瓶甲醛都是这个结果,而别人的总RNA用同样的
: 甲醛没问题,极为郁闷,难道我们的总RNA和甲醛不对付?RP不够?
: 各位说说看这该如何是好?

e********r
发帖数: 147
4
很郁闷,因为以前都没出过这种事,难道这一批Trizol有点问题?
t******t
发帖数: 1123
5
Note: sometimes the smear signal is not due to degradation of RNA, instead
due to genomic DNA in the samples (which occurs above the rRNAs bands). It
causes a lot of trouble for the following assays. And it also makes the
results look like degradation.
It may not be your case. Just a reminder.
f****e
发帖数: 184
6
Check your loading buffer, this is the most common problem.
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