v***a
发帖数: 1242 | 1 一个gene，NCBI上对其的DEFINITION是：
PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 1 (C. elegans) (Dpy19l1)
括号里的C. elegans表示什么作用？最早发现于C. elegans么
谢谢 |
C*******e
发帖数: 4348 | 2 gene annotation有一大半信不得
除非是大家研究比较热的基因
不然错误的或者不准确的或者莫名其妙的标注是很多的
真核不清楚
但如果你知道细菌的基因组是怎么标注的，你就知道我说的什么意思了
比如有的时候测序是免费的，测序完了，根据序列同源性自动给出annotation
然后负责这个project的教授开门课
教教学生怎么annotate gene
然后给学生发布下去任务
学生能懂多少呢？也就是比较比较同源性，运用一下common sense
比较勤奋的学生也许去查一下文献？（不过我严重怀疑哈）
如果某个gene本身研究就很少，很多东西还不明朗的话，基于本来就不怎么正确的信息
上的标注就只
能更加不准确了。
所以，如果这个gene是你自己要研究的，我估计没有人能比你更了解啦
尽信annotation不如无annotation
【在 v***a 的大作中提到】
: 一个gene，NCBI上对其的DEFINITION是：
: PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 1 (C. elegans) (Dpy19l1)
: 括号里的C. elegans表示什么作用？最早发现于C. elegans么
: 谢谢
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v***a
发帖数: 1242 | 3 谢谢你的回答哈
我是在设计primer，然后blast出来说我的引物跟这个gene的identities非常高，但是
又搞不清这是个什么gene，所以就郁闷了。。。
【在 C*******e 的大作中提到】
: gene annotation有一大半信不得
: 除非是大家研究比较热的基因
: 不然错误的或者不准确的或者莫名其妙的标注是很多的
: 真核不清楚
: 但如果你知道细菌的基因组是怎么标注的，你就知道我说的什么意思了
: 比如有的时候测序是免费的，测序完了，根据序列同源性自动给出annotation
: 然后负责这个project的教授开门课
: 教教学生怎么annotate gene
: 然后给学生发布下去任务
: 学生能懂多少呢？也就是比较比较同源性，运用一下common sense
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C*******e
发帖数: 4348 | 4 这个gene也在你的模板里？
不试一下是不会知道primer好不好的
说不定你根本不用担心呢
【在 v***a 的大作中提到】
: 谢谢你的回答哈
: 我是在设计primer，然后blast出来说我的引物跟这个gene的identities非常高，但是
: 又搞不清这是个什么gene，所以就郁闷了。。。
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