v***a 发帖数: 1242 | 1 一个gene,NCBI上对其的DEFINITION是:
PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 1 (C. elegans) (Dpy19l1)
括号里的C. elegans表示什么作用?最早发现于C. elegans么
谢谢 |
C*******e 发帖数: 4348 | 2 gene annotation有一大半信不得
除非是大家研究比较热的基因
不然错误的或者不准确的或者莫名其妙的标注是很多的
真核不清楚
但如果你知道细菌的基因组是怎么标注的,你就知道我说的什么意思了
比如有的时候测序是免费的,测序完了,根据序列同源性自动给出annotation
然后负责这个project的教授开门课
教教学生怎么annotate gene
然后给学生发布下去任务
学生能懂多少呢?也就是比较比较同源性,运用一下common sense
比较勤奋的学生也许去查一下文献?(不过我严重怀疑哈)
如果某个gene本身研究就很少,很多东西还不明朗的话,基于本来就不怎么正确的信息
上的标注就只
能更加不准确了。
所以,如果这个gene是你自己要研究的,我估计没有人能比你更了解啦
尽信annotation不如无annotation
【在 v***a 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 一个gene,NCBI上对其的DEFINITION是: : PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 1 (C. elegans) (Dpy19l1) : 括号里的C. elegans表示什么作用?最早发现于C. elegans么 : 谢谢
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v***a 发帖数: 1242 | 3 谢谢你的回答哈
我是在设计primer,然后blast出来说我的引物跟这个gene的identities非常高,但是
又搞不清这是个什么gene,所以就郁闷了。。。
【在 C*******e 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : gene annotation有一大半信不得 : 除非是大家研究比较热的基因 : 不然错误的或者不准确的或者莫名其妙的标注是很多的 : 真核不清楚 : 但如果你知道细菌的基因组是怎么标注的,你就知道我说的什么意思了 : 比如有的时候测序是免费的,测序完了,根据序列同源性自动给出annotation : 然后负责这个project的教授开门课 : 教教学生怎么annotate gene : 然后给学生发布下去任务 : 学生能懂多少呢?也就是比较比较同源性,运用一下common sense
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C*******e 发帖数: 4348 | 4 这个gene也在你的模板里?
不试一下是不会知道primer好不好的
说不定你根本不用担心呢
【在 v***a 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 谢谢你的回答哈 : 我是在设计primer,然后blast出来说我的引物跟这个gene的identities非常高,但是 : 又搞不清这是个什么gene,所以就郁闷了。。。
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