e****p
发帖数: 354 | 1 部分序列
。。。。
GCTTAACATCAAAATGAAGCAGAAAAAAGCTAACAGCACTCAAGTAAAGGAGCTATGCACCACTCTGATCTTCCTT
GACAGCTTTTGAACTTAGCTTTTCCCCGCTACAGTATCCTGTTTGTTCTCTAATTATTTTTAACAATGCTCTATTT
ATTTGTGTACAAAAGTACAGTGAACTTTCTTTTGAGTTGCATACACCTATGGATCATTTTATAATCAACTTATTTT
CTCTGAATGATTAAAAGCACATTAAAAAAAA
想要扩全长，但下游引物无论怎么设计GC含量都很低。。。
请问各位大虾下游引物GC含量很低<30%，能不能有可能P出来啊？ 有没有其他方法来克
服这个问题， 谢谢！！ |
c******r
发帖数: 3778 | 2 go ahead try it. should be ok, as long as you design the primers with proper
melting temperature. For better result, keep the last two base pairs on the
primer as C or G, which will ensure better binding. |
m**z
发帖数: 787 | 3 re this. just try it
proper
the
【在 c******r 的大作中提到】
: go ahead try it. should be ok, as long as you design the primers with proper
: melting temperature. For better result, keep the last two base pairs on the
: primer as C or G, which will ensure better binding.
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zc
发帖数: 111 | 4 extension at 60-65, not 72
GCTTAACATCAAAATGAAGCAGAAAAAAGCTAACAGCACTCAAGTAAAGGAGCTATGCACCACTCTGATCTTCCTT
GACAGCTTTTGAACTTAGCTTTTCCCCGCTACAGTATCCTGTTTGTTCTCTAATTATTTTTAACAATGCTCTATTT
ATTTGTGTACAAAAGTACAGTGAACTTTCTTTTGAGTTGCATACACCTATGGATCATTTTATAATCAACTTATTTT
【在 e****p 的大作中提到】
: 部分序列
: 。。。。
: GCTTAACATCAAAATGAAGCAGAAAAAAGCTAACAGCACTCAAGTAAAGGAGCTATGCACCACTCTGATCTTCCTT
: GACAGCTTTTGAACTTAGCTTTTCCCCGCTACAGTATCCTGTTTGTTCTCTAATTATTTTTAACAATGCTCTATTT
: ATTTGTGTACAAAAGTACAGTGAACTTTCTTTTGAGTTGCATACACCTATGGATCATTTTATAATCAACTTATTTT
: CTCTGAATGATTAAAAGCACATTAAAAAAAA
: 想要扩全长，但下游引物无论怎么设计GC含量都很低。。。
: 请问各位大虾下游引物GC含量很低<30%，能不能有可能P出来啊？ 有没有其他方法来克
: 服这个问题， 谢谢！！
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s******s
发帖数: 13035 | 5 没啥。引物长一点30+，extension温度低一点68C or lower。 这个做阿米巴虫，
或者研究DNA甲基化用bisulfite seq的，都是这种程度的低GC，没啥问题
GCTTAACATCAAAATGAAGCAGAAAAAAGCTAACAGCACTCAAGTAAAGGAGCTATGCACCACTCTGATCTTCCTT
GACAGCTTTTGAACTTAGCTTTTCCCCGCTACAGTATCCTGTTTGTTCTCTAATTATTTTTAACAATGCTCTATTT
ATTTGTGTACAAAAGTACAGTGAACTTTCTTTTGAGTTGCATACACCTATGGATCATTTTATAATCAACTTATTTT
【在 e****p 的大作中提到】
: 部分序列
: 。。。。
: GCTTAACATCAAAATGAAGCAGAAAAAAGCTAACAGCACTCAAGTAAAGGAGCTATGCACCACTCTGATCTTCCTT
: GACAGCTTTTGAACTTAGCTTTTCCCCGCTACAGTATCCTGTTTGTTCTCTAATTATTTTTAACAATGCTCTATTT
: ATTTGTGTACAAAAGTACAGTGAACTTTCTTTTGAGTTGCATACACCTATGGATCATTTTATAATCAACTTATTTT
: CTCTGAATGATTAAAAGCACATTAAAAAAAA
: 想要扩全长，但下游引物无论怎么设计GC含量都很低。。。
: 请问各位大虾下游引物GC含量很低<30%，能不能有可能P出来啊？ 有没有其他方法来克
: 服这个问题， 谢谢！！
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e****p
发帖数: 354 | 6 hao, 谢谢！
GCTTAACATCAAAATGAAGCAGAAAAAAGCTAACAGCACTCAAGTAAAGGAGCTATGCACCACTCTGATCTTCCTT
GACAGCTTTTGAACTTAGCTTTTCCCCGCTACAGTATCCTGTTTGTTCTCTAATTATTTTTAACAATGCTCTATTT
ATTTGTGTACAAAAGTACAGTGAACTTTCTTTTGAGTTGCATACACCTATGGATCATTTTATAATCAACTTATTTT
【在 s******s 的大作中提到】
: 没啥。引物长一点30+，extension温度低一点68C or lower。 这个做阿米巴虫，
: 或者研究DNA甲基化用bisulfite seq的，都是这种程度的低GC，没啥问题
:
: GCTTAACATCAAAATGAAGCAGAAAAAAGCTAACAGCACTCAAGTAAAGGAGCTATGCACCACTCTGATCTTCCTT
: GACAGCTTTTGAACTTAGCTTTTCCCCGCTACAGTATCCTGTTTGTTCTCTAATTATTTTTAACAATGCTCTATTT
: ATTTGTGTACAAAAGTACAGTGAACTTTCTTTTGAGTTGCATACACCTATGGATCATTTTATAATCAACTTATTTT
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x*****e
发帖数: 309 | 7 对，搞长点，Tm高点，基本上都能搞定
GCTTAACATCAAAATGAAGCAGAAAAAAGCTAACAGCACTCAAGTAAAGGAGCTATGCACCACTCTGATCTTCCTT
GACAGCTTTTGAACTTAGCTTTTCCCCGCTACAGTATCCTGTTTGTTCTCTAATTATTTTTAACAATGCTCTATTT
ATTTGTGTACAAAAGTACAGTGAACTTTCTTTTGAGTTGCATACACCTATGGATCATTTTATAATCAACTTATTTT
【在 s******s 的大作中提到】
: 没啥。引物长一点30+，extension温度低一点68C or lower。 这个做阿米巴虫，
: 或者研究DNA甲基化用bisulfite seq的，都是这种程度的低GC，没啥问题
:
: GCTTAACATCAAAATGAAGCAGAAAAAAGCTAACAGCACTCAAGTAAAGGAGCTATGCACCACTCTGATCTTCCTT
: GACAGCTTTTGAACTTAGCTTTTCCCCGCTACAGTATCCTGTTTGTTCTCTAATTATTTTTAACAATGCTCTATTT
: ATTTGTGTACAAAAGTACAGTGAACTTTCTTTTGAGTTGCATACACCTATGGATCATTTTATAATCAACTTATTTT
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