由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 请问各位:如何搜索genomic DNA 中的restriction site?
相关主题
求教: 细菌genome分析怎么找RNA splicing variants? 有相关的数据库吗?
exons for a gene 有包子奖励怎么查看别的LAB做出来的chip-seq data
请问怎么在线看某个基因的组蛋白修饰情况?请问怎么找一个基因的5’UTR
完成的cancer genome sequencing 数据现在有吗?Help! Public HIV whole genome sequences
基因序列求教Help!: RNA genomic position 数据库哪里下载?
求教:知道染色体的位置,如何找具体的序列?如何找transcriptional factor/repressor binding sites
[合集] 有什么方便快捷的方法把一个已知的蛋白的上游基因组序列拿出请教一个DNA sonication的问题
NCBI homo sapien (human) genome sequence知道一个mRNA snp和它在genome上的位置。如何知道编码的蛋白突变位点?
相关话题的讨论汇总
话题: dna话题: genomic话题: sites话题: sequence
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
s*********I
发帖数: 22
1
尝试过在NCBI上blast,不过由于query sequence太短无法返回结果。有人说可以用
perl,除此之外还有什么简单些的方法吗?多谢!
y*********1
发帖数: 46
2
For short sequence, you can copy and paste to NEB Cutter to get RE sites.
For long sequence, you can use UCSC genome browser to export single RE sites
in Bed format.
s*********I
发帖数: 22
3
Thanks a lot for the info. I gonna give it a try. Hope it works :)

sites

【在 y*********1 的大作中提到】
: For short sequence, you can copy and paste to NEB Cutter to get RE sites.
: For long sequence, you can use UCSC genome browser to export single RE sites
: in Bed format.

1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
知道一个mRNA snp和它在genome上的位置。如何知道编码的蛋白突变位点?基因序列求教
在ncbi下载whole genomce seq为什么都是2bit格式的?求教:知道染色体的位置,如何找具体的序列?
请问: 如何查找CpG site , 用什么software?[合集] 有什么方便快捷的方法把一个已知的蛋白的上游基因组序列拿出
怎样查一个基因的chromosomal localizationNCBI homo sapien (human) genome sequence
求教: 细菌genome分析怎么找RNA splicing variants? 有相关的数据库吗?
exons for a gene 有包子奖励怎么查看别的LAB做出来的chip-seq data
请问怎么在线看某个基因的组蛋白修饰情况?请问怎么找一个基因的5’UTR
完成的cancer genome sequencing 数据现在有吗?Help! Public HIV whole genome sequences
相关话题的讨论汇总
话题: dna话题: genomic话题: sites话题: sequence