s******n
发帖数: 47 | 1 准备做RNA-seq，一些protocol上提到 illumina barcoded adapter，
请问，这个barcoded adapter 跟 non-barcoded adapter 有什么区别？
不甚感激！！！ |
w******y
发帖数: 8040 | 2 可以同时做多个样品吧
【在 s******n 的大作中提到】
: 准备做RNA-seq，一些protocol上提到 illumina barcoded adapter，
: 请问，这个barcoded adapter 跟 non-barcoded adapter 有什么区别？
: 不甚感激！！！
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c*******d
发帖数: 192 | 3 If you wanna sequence multiple samples in same lane (Illumina) / spot (SOLiD
), you use barcodes (illumina) / indices (SOLiD) to ID them.
Normally, barcodes/indices are short oligotides of 6 mer in length. |
s******n
发帖数: 47 | 4 多谢大侠回复！！
请问有大侠从illumina单独定购过barcoded adapter么，还是必须order整个kit？
（实验室第一次做deep seq，本人比较菜，好像在illumina网站上找了半天没找到单买
的barcoded adapter）
不甚感激！ |
s******n
发帖数: 47 | 5 看到一个protocol， 不太理解这句话
Illumina adapters with T-overhangs and customized to include 3-nt “barcodes
” were ligated to the cDNA？
请问Illumina adapters with T-overhangs and customized to include 3-nt “
barcodes” 是不是就是可以直接order的barcoded adapter？？
谢谢！！ |
s******s
发帖数: 13035 | 6
barcodes
不是。这个是home-made的adapter，就是T前面加几个code就行了。
Illumina的barcoded adaptor复杂多了，自己去读manual吧
【在 s******n 的大作中提到】
: 看到一个protocol， 不太理解这句话
: Illumina adapters with T-overhangs and customized to include 3-nt “barcodes
: ” were ligated to the cDNA？
: 请问Illumina adapters with T-overhangs and customized to include 3-nt “
: barcodes” 是不是就是可以直接order的barcoded adapter？？
: 谢谢！！
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