G***G
发帖数: 16778 | 1 早期的人类胎形和老鼠的，鱼的胎形很相近，都有尾巴和脊骨。
那么会有哪些因素导致几周后胎形的不同的呢？
1）基因
2）不解码的基因
3）蛋白质
4）调控机制
另外，我还有一个很基本的生物问题。关于鱼的。
单细胞生物，细胞质内就是dna。细胞分裂，dna复制，这个单细胞生物就长大了。
毫无疑问，每个细胞，每个细胞里的dna都是相同的（假设没有mutation）。
但是对于多细胞生物。最早就是fertilized egg. 就一个细胞。
这1个细胞怎么能分裂成多种多样的细胞，从而让某些细胞组成不同的organ。
如果从不同organs里面取出dna，比如liver， brain。
那么如果进行基因测序的话，liver里面和brain里面是不是应该完全一样的
dna序列（不考虑mutation）？
但是如果我们进行基因芯片分析，或者next generation sequencing，
我们能找到differentially expressed gene across organs。
这是不是说明liver和brain里面的dna序列都是存在的，而且是一模一样的。
但是有的organ里面表达得多，有的organ里面不表达，有的organ里面
表达的少？
如果是这样，我们怎么知道不同organ里面的dna序列都是一样的呢？ |
l****m
发帖数: 751 | 2 我不是搞生物实验的，不过这个机制貌似叫做“epigenetic”,要是不对请大牛纠正。
【在 G***G 的大作中提到】
: 早期的人类胎形和老鼠的，鱼的胎形很相近，都有尾巴和脊骨。
: 那么会有哪些因素导致几周后胎形的不同的呢？
: 1）基因
: 2）不解码的基因
: 3）蛋白质
: 4）调控机制
: 另外，我还有一个很基本的生物问题。关于鱼的。
: 单细胞生物，细胞质内就是dna。细胞分裂，dna复制，这个单细胞生物就长大了。
: 毫无疑问，每个细胞，每个细胞里的dna都是相同的（假设没有mutation）。
: 但是对于多细胞生物。最早就是fertilized egg. 就一个细胞。
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M*****n
发帖数: 16729 | 3 since you are talking about fish, I'd like to throw in some 2 cents worth
opinions.
Indeed, no one can claim all the cells in the organism carry the exact same
DNA in their genome (of coure, here we are not focusing on somatic mutations which
are relatively rare). I just went to a talk today and learned that during
development of Drosophila, polyploid cells do exist and during the formation
of polypoid cells the genome undergoes "underreplication", which means not
the whole genome is replicated. so following subsequent cell divisions, some
cells will be aneuploid, i think this situation may not be included into
somatic mutations in a narrower sense.
does this give a little hint to the question you raised?
【在 G***G 的大作中提到】
: 早期的人类胎形和老鼠的，鱼的胎形很相近，都有尾巴和脊骨。
: 那么会有哪些因素导致几周后胎形的不同的呢？
: 1）基因
: 2）不解码的基因
: 3）蛋白质
: 4）调控机制
: 另外，我还有一个很基本的生物问题。关于鱼的。
: 单细胞生物，细胞质内就是dna。细胞分裂，dna复制，这个单细胞生物就长大了。
: 毫无疑问，每个细胞，每个细胞里的dna都是相同的（假设没有mutation）。
: 但是对于多细胞生物。最早就是fertilized egg. 就一个细胞。
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M*****n
发帖数: 16729 | 4 no epigenetics is another issue.
正。
【在 l****m 的大作中提到】
: 我不是搞生物实验的，不过这个机制貌似叫做“epigenetic”,要是不对请大牛纠正。
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G***G
发帖数: 16778 | 5 取出同一个人的liver和brain。分别对这两个organ进行测序。
它们的基因序列一样吗？
为什么我们总是说“找到了不同表达（一个表达，另一个不表达）的基因在不同的
organs中”？
same
mutations which
formation
not
some
【在 M*****n 的大作中提到】
: since you are talking about fish, I'd like to throw in some 2 cents worth
: opinions.
: Indeed, no one can claim all the cells in the organism carry the exact same
: DNA in their genome (of coure, here we are not focusing on somatic mutations which
: are relatively rare). I just went to a talk today and learned that during
: development of Drosophila, polyploid cells do exist and during the formation
: of polypoid cells the genome undergoes "underreplication", which means not
: the whole genome is replicated. so following subsequent cell divisions, some
: cells will be aneuploid, i think this situation may not be included into
: somatic mutations in a narrower sense.
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M*****n
发帖数: 16729 | 6 the central dogma of developmental biology is that genes (DNA)are
differentially transcribed and expressed in different types of cells and
hence confer these cells different fates and functionalities. this is under
the assumption that the genome (genes on DNA level) remains the same in all
the cells in that oragnism.
but this is not true in reality. the genome in every cell is not all identical.
there will be rearrangement such as in B cells. there will be copy number
variations such as in the polyploid cells I just mentioned. (less to say in
cancer cells, but that is not under normal condition).
of course epigenetics is another type of differentiation of the genome on
DNA level. but I guess this is not what you asked about.
【在 G***G 的大作中提到】
: 取出同一个人的liver和brain。分别对这两个organ进行测序。
: 它们的基因序列一样吗？
: 为什么我们总是说“找到了不同表达（一个表达，另一个不表达）的基因在不同的
: organs中”？
:
: same
: mutations which
: formation
: not
: some
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s******s
发帖数: 13035 | 7 看了这个问题，看来你也是生科男？
第一个问题，我不知道正解是什么，感觉上发育开始
的调控应该都是一些比较基本普遍保守的功能，而且本
早期生理结构就比较简单，自然看上去像了。后面不那
么保守的功能开始发挥作用，而且细胞种类，组织结构
也复杂了。
第二个问题，最早当然是一些物理作用，比如重力，
比如某个成分在一个细胞里面多了几个分子，比如一个
细胞恰好随机长的快点，然后就是一些细胞间的相互作
用，接触啊，距离啊，细胞因子啊等等，当然不会一样。
说假设没有mutation，当然除了特例以外，大多数细胞
DNA是应该一样的。不过这个mutation的定义就有问题，
不一样的细胞的突变率就不会一样，也不一定是随机的，
很可能有些DNA变化跟细胞功能有关，只是难研究而已
【在 G***G 的大作中提到】
: 早期的人类胎形和老鼠的，鱼的胎形很相近，都有尾巴和脊骨。
: 那么会有哪些因素导致几周后胎形的不同的呢？
: 1）基因
: 2）不解码的基因
: 3）蛋白质
: 4）调控机制
: 另外，我还有一个很基本的生物问题。关于鱼的。
: 单细胞生物，细胞质内就是dna。细胞分裂，dna复制，这个单细胞生物就长大了。
: 毫无疑问，每个细胞，每个细胞里的dna都是相同的（假设没有mutation）。
: 但是对于多细胞生物。最早就是fertilized egg. 就一个细胞。
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b*******e
发帖数: 30 | 8 LZ所提到的那几幅相似胎形的发育图 已经被证实了是造假的吧 |
T**********t
发帖数: 1604 | 9 不同表达（一个表达，另一个不表达）
意思应该是一个transcribe成了mRNA，一个没有。这个应该是用的RNAseq技术，测的是
不同organ里的mRNA吧。
【在 G***G 的大作中提到】
: 取出同一个人的liver和brain。分别对这两个organ进行测序。
: 它们的基因序列一样吗？
: 为什么我们总是说“找到了不同表达（一个表达，另一个不表达）的基因在不同的
: organs中”？
:
: same
: mutations which
: formation
: not
: some
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B*******l
发帖数: 144 | 10 I believe the polypoloidy cells you mentioned are from slavery gland.
The peri-centromeric heterochromatin of these cells are under replicated
based on cytological data, (I am not sure these regions are under replicated
or more compact). However these cells will not divide.
same
mutations which
formation
not
some
【在 M*****n 的大作中提到】
: since you are talking about fish, I'd like to throw in some 2 cents worth
: opinions.
: Indeed, no one can claim all the cells in the organism carry the exact same
: DNA in their genome (of coure, here we are not focusing on somatic mutations which
: are relatively rare). I just went to a talk today and learned that during
: development of Drosophila, polyploid cells do exist and during the formation
: of polypoid cells the genome undergoes "underreplication", which means not
: the whole genome is replicated. so following subsequent cell divisions, some
: cells will be aneuploid, i think this situation may not be included into
: somatic mutations in a narrower sense.
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M*****n
发帖数: 16729 | 11 NO,
those cells are in the hindgut of drosophila and they will divide. just learned from a talk I went.
replicated
【在 B*******l 的大作中提到】
: I believe the polypoloidy cells you mentioned are from slavery gland.
: The peri-centromeric heterochromatin of these cells are under replicated
: based on cytological data, (I am not sure these regions are under replicated
: or more compact). However these cells will not divide.
:
: same
: mutations which
: formation
: not
: some
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G*****m
发帖数: 198 | 12 then the iPS cells' genome may not be complete....cause problem in the
future?
learned from a talk I went.
【在 M*****n 的大作中提到】
: NO,
: those cells are in the hindgut of drosophila and they will divide. just learned from a talk I went.
:
: replicated
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m*p
发帖数: 226 | 13 The gene dosage effect can contribute to the differentiation process and
cell identity. The DNA sequence of
cells from different organs will not be much difference, if not considering
somatic mutation. Maybe some
moving elements in different organs insert to different place and partially
contributes to the difference.
same
mutations which
formation
not
some
【在 M*****n 的大作中提到】
: since you are talking about fish, I'd like to throw in some 2 cents worth
: opinions.
: Indeed, no one can claim all the cells in the organism carry the exact same
: DNA in their genome (of coure, here we are not focusing on somatic mutations which
: are relatively rare). I just went to a talk today and learned that during
: development of Drosophila, polyploid cells do exist and during the formation
: of polypoid cells the genome undergoes "underreplication", which means not
: the whole genome is replicated. so following subsequent cell divisions, some
: cells will be aneuploid, i think this situation may not be included into
: somatic mutations in a narrower sense.
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C*******e
发帖数: 4348 | 14 顶这个
我也记得有这么一说
【在 b*******e 的大作中提到】
: LZ所提到的那几幅相似胎形的发育图 已经被证实了是造假的吧
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M*****n
发帖数: 16729 | 15 do we call the imunoglobin gene rearrangement somatic mutations? I think in
a broader sense yes.
the term of somatic mutation is rather vague.
considering
partially
【在 m*p 的大作中提到】
: The gene dosage effect can contribute to the differentiation process and
: cell identity. The DNA sequence of
: cells from different organs will not be much difference, if not considering
: somatic mutation. Maybe some
: moving elements in different organs insert to different place and partially
: contributes to the difference.
:
: same
: mutations which
: formation
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s******y
发帖数: 28562 | 16 真是的胚胎发育期里面确实有相似的形态时期。
比方说老鼠胚胎在特别早的时期确实象鱼。
不过那个特别著名的图确实有美化成份在内，有夸张相似程度的嫌疑。但并不是纯粹造
假。
【在 b*******e 的大作中提到】
: LZ所提到的那几幅相似胎形的发育图 已经被证实了是造假的吧
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a***a
发帖数: 40617 | 17 才戒网1个月就复出了？
【在 s******y 的大作中提到】
: 真是的胚胎发育期里面确实有相似的形态时期。
: 比方说老鼠胚胎在特别早的时期确实象鱼。
: 不过那个特别著名的图确实有美化成份在内，有夸张相似程度的嫌疑。但并不是纯粹造
: 假。
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s******y
发帖数: 28562 | 18 上来拜年而已：）
还要继续戒的。
【在 a***a 的大作中提到】
: 才戒网1个月就复出了？
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a***a
发帖数: 40617 | 19 给我发个红包，你就可以走了，新年好！
【在 s******y 的大作中提到】
: 上来拜年而已：）
: 还要继续戒的。
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n***w
发帖数: 2405 | 20 大家是不是都看了最近的一期science受启发了。。。。＝＝ |
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b****r
发帖数: 17995 | 21 看了这么多牛人的回复，看来很多本版的生物大牛都不知道啊，人的肝脏细胞相当部分
是多倍体
的，四倍体八倍体都很多
其实我觉得生物界有一个很大的空白（当然不是完全没人做），乙型肝炎这样一个极其
流行，全
球有数亿携带者和患者的病，在CNS上可能几年都看不到一篇文章。也就是肝脏代谢和
肥胖做的人
稍微多点
【在 G***G 的大作中提到】
: 取出同一个人的liver和brain。分别对这两个organ进行测序。
: 它们的基因序列一样吗？
: 为什么我们总是说“找到了不同表达（一个表达，另一个不表达）的基因在不同的
: organs中”？
:
: same
: mutations which
: formation
: not
: some
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j****x
发帖数: 1704 | 22 HBV也就是亚洲和非洲大流行，欧美不是个大问题，预防性疫苗免疫问题早解决了，药
物治疗策略也比较清晰（虽然根本问题还远没有解决），免疫学病毒学本身也远不如
HIV那么吸引人。所以这么多年，HBV的研究只能眼看着HIV和HCV的大热。
不过在中国，这个方向还是很有钱的，只是水平一般，呵呵
【在 b****r 的大作中提到】
: 看了这么多牛人的回复，看来很多本版的生物大牛都不知道啊，人的肝脏细胞相当部分
: 是多倍体
: 的，四倍体八倍体都很多
: 其实我觉得生物界有一个很大的空白（当然不是完全没人做），乙型肝炎这样一个极其
: 流行，全
: 球有数亿携带者和患者的病，在CNS上可能几年都看不到一篇文章。也就是肝脏代谢和
: 肥胖做的人
: 稍微多点
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M*****n
发帖数: 16729 | 23 我们有个faculty candidate就是propose要研究这个。
的确是个hot topic
【在 b****r 的大作中提到】
: 看了这么多牛人的回复，看来很多本版的生物大牛都不知道啊，人的肝脏细胞相当部分
: 是多倍体
: 的，四倍体八倍体都很多
: 其实我觉得生物界有一个很大的空白（当然不是完全没人做），乙型肝炎这样一个极其
: 流行，全
: 球有数亿携带者和患者的病，在CNS上可能几年都看不到一篇文章。也就是肝脏代谢和
: 肥胖做的人
: 稍微多点
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