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Biology版 - 请问影响real-time qPCR扩增效率的因素?
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k****o
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1
假设引物和dNTP都是过量的,我一下能想到这些:
1. 引物的序列
2. 样品的杂质含量(genomic DNA,蛋白)
3. 混入的聚合酶抑制剂
请问还有其它什么吗?
Z******5
发帖数: 435
2
其实对于Real Time来说,对数期之前的扩增效率对你的实验结果才是至关重要的(就
是Ct值之前的地方)。比较重要的因素有:
1,引物的结合是否充分(重要的是引物序列,退火延伸温度,特异性;模板二级结构)
2,延伸反应是否完全,充分(延伸时间,虽然一般目的片段大小只有一到两百bp,但
是都会延伸1分钟;聚合酶抑制剂)
k****o
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3
多谢!我还有个问题:用梯度稀释法算扩增效率的时候,严格来说是不是应该每个样品
都做梯度稀释,然后分别算每个样品里目标基因和housekeeping基因的扩增效率?换句
话说,如果用来合成cDNA的RNA纯度不一样,其相应的扩增效率是否也不一样?
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