c******9
发帖数: 338 | 1 很是郁闷，大家说说用NMR的方法做结构生物学的出来有什么前途吗？如果做不了
faculty,工业界有什么出路？ |
g*********r
发帖数: 9366 | 2 no, it is even worse than crsstallogrphy
【在 c******9 的大作中提到】
: 很是郁闷，大家说说用NMR的方法做结构生物学的出来有什么前途吗？如果做不了
: faculty,工业界有什么出路？
|
c******9
发帖数: 338 | 3 这也太打击了吧。。。
【在 g*********r 的大作中提到】
: no, it is even worse than crsstallogrphy
|
b******e
发帖数: 88 | 4 nmr做的好也能cns，不过做的不好就歇了
crystallography的不做学术了好歹还能做做base on structure的target screen
nmr好像就没戏了
但是反过来说
能做crystallography的人一大把，做的好的也一大把，能做nmr还懂得比较透的不多吧
？听说做nmr肯定能保一个位置，也有人愿意来合作 |
e*******e
发帖数: 118 | |
p****s
发帖数: 3153 | 6 谁说NMR不能筛药？做SAR的人多的是，不过我是不懂。还有人用NMR做代谢呢。
NMR一个好处是就算解不出结构也能解决一些关键问题，比如最近Influenza M2 proton
channel在nature和science上的
paper，xray没晶体能干毛？NMR还能做细胞里的蛋白，xray不行吧。两个技术的针对性
和特长不同，没法说哪个更好，
只不过xray成功的历史更悠久罢了。说实话NMR想发CNS比xray难多了，我估计主要还是
历史原因。现在最前沿的进展是
可以很快收集NMR数据，甚至可以做real time kinetics，这个常规晶体学方法肯定不
能做到吧。我不懂xray，也没怎么看
过xray文章，所以我不评价xray怎么样，当然了，大家都有辉煌的历史，都在科学研究
中做过巨大的贡献，一个看不起另
一个又何必呢。工业界我不了解，但是我相信NMR也有一席之地，毕竟我老板当时还拿
到过某公司的offer，要说drug
discovery, NMR也是重要方法之一吧，用NMR做GPCR的公司我也听过。
【在 b******e 的大作中提到】
: nmr做的好也能cns，不过做的不好就歇了
: crystallography的不做学术了好歹还能做做base on structure的target screen
: nmr好像就没戏了
: 但是反过来说
: 能做crystallography的人一大把，做的好的也一大把，能做nmr还懂得比较透的不多吧
: ？听说做nmr肯定能保一个位置，也有人愿意来合作
|
s******y
发帖数: 28562 | 7 NMR不管蛋白在什么状态下都能做，而且还能做动态图谱，理论上来说更
接近于蛋白在溶液里的自然状态。但是NMR的结构能力取决于仪器，
因为磁场的大小决定了磁量子的差分度, 也就是分辨率.
但是目前的仪器的限制，决定了NMR没有办法做大的蛋白。
而x-ray crystalgraphy 的分辨率主要由结晶的质量决定。 |
C*********m
发帖数: 213 | 8
这个其实是有争议的，NMR计算结构的时候一般不考虑水，解出来的结构看不到水分子
，相反，晶体结构中通常能观察到水分子
NMR不是不能做大蛋白，而是不能直接定大蛋白的结构，如果研究功能，上百KDa的蛋白
也是可以的
【在 s******y 的大作中提到】
: NMR不管蛋白在什么状态下都能做，而且还能做动态图谱，理论上来说更
: 接近于蛋白在溶液里的自然状态。但是NMR的结构能力取决于仪器，
: 因为磁场的大小决定了磁量子的差分度, 也就是分辨率.
: 但是目前的仪器的限制，决定了NMR没有办法做大的蛋白。
: 而x-ray crystalgraphy 的分辨率主要由结晶的质量决定。
|
p****s
发帖数: 3153 | 9 还好了，呵呵，用HD exchange大概也能知道什么地方有水，况且Xray看到的是水中的O
，NMR用的大部分是H，所以分
辨率有差异。
NMR发展到现在做25 kD以下的蛋白应该已经算常规了，大的也有人做，不过难点，需要
特殊标记。我好像见过上百 kD的
文章，但是这个不是NMR的特长，所以NMR很多精力都在动力学方面。反正就做别人不能
做的呗
【在 C*********m 的大作中提到】
:
: 这个其实是有争议的，NMR计算结构的时候一般不考虑水，解出来的结构看不到水分子
: ，相反，晶体结构中通常能观察到水分子
: NMR不是不能做大蛋白，而是不能直接定大蛋白的结构，如果研究功能，上百KDa的蛋白
: 也是可以的
|
p****s
发帖数: 3153 | 10 再说专门用NMR做hydration的似乎也有，不过那可就难了，我不懂。
【在 C*********m 的大作中提到】
:
: 这个其实是有争议的，NMR计算结构的时候一般不考虑水，解出来的结构看不到水分子
: ，相反，晶体结构中通常能观察到水分子
: NMR不是不能做大蛋白，而是不能直接定大蛋白的结构，如果研究功能，上百KDa的蛋白
: 也是可以的
|
|
|
s******y
发帖数: 28562 | 11
这个不是我的意思。
NMR解出来的结构，应该是该蛋白在水作为溶剂中最真实的结构。
你说的那个晶体中解出的作为heterogenity 存在的水分子，其实是共结晶的水，
一般是蛋白里面的盐桥之间的水分子，和作为溶剂的水不是一回事。
研究大蛋白功能的时候，只能看局部一小个区域，而且只能通过一些同位素标记
法间接的看。不但要直接定出一个大蛋白的结构目前不可能，要用NMR直接定出
一个大蛋白的局部区域的具体结构貌似也是不可以的,就是只有间接信息，没有直接信
息。
【在 C*********m 的大作中提到】
:
: 这个其实是有争议的，NMR计算结构的时候一般不考虑水，解出来的结构看不到水分子
: ，相反，晶体结构中通常能观察到水分子
: NMR不是不能做大蛋白，而是不能直接定大蛋白的结构，如果研究功能，上百KDa的蛋白
: 也是可以的
|
p****s
发帖数: 3153 | 12 这个您说错了，主要不是仪器的限制，仪器可以提高信噪比，所以磁场越高越好，现在
应该有950M-1G的吧
但是对于大蛋白来说，限制NMR的主要是transverse relaxation，蛋白越大转得越慢，
灵敏度sensitivity就越低了。这个
大概不是提高磁场就能很好解决的，我想对于一个50 kDa的蛋白来说600 M和800 M没啥
大区别。现在常用的方法就是避
免relaxation造成的低灵敏度，方法有TROSY和methyl labeling，还有在高温下做(
thermophilic system)。蛋白大的另
一个问题是残基太多，峰的位置重复，但是这个可以用高维NMR解决，现在不是都有7维
了么。
【在 s******y 的大作中提到】
: NMR不管蛋白在什么状态下都能做，而且还能做动态图谱，理论上来说更
: 接近于蛋白在溶液里的自然状态。但是NMR的结构能力取决于仪器，
: 因为磁场的大小决定了磁量子的差分度, 也就是分辨率.
: 但是目前的仪器的限制，决定了NMR没有办法做大的蛋白。
: 而x-ray crystalgraphy 的分辨率主要由结晶的质量决定。
|
p****s
发帖数: 3153 | 13 我觉得原则上是可能的，用selective labeling，蛋白不同的部分relaxation不同，有
的特别灵活就可以用NMR做。我没太
关注过这方面的东西，不过我是觉得NMR的重点不在这里，有很多Xray根本没法做的东
西(RNA, dynamics，RNA-
protein interaction），这些问题做为NMR研究来说应该是比单纯的静态结构有意思多
了。
【在 s******y 的大作中提到】
:
: 这个不是我的意思。
: NMR解出来的结构，应该是该蛋白在水作为溶剂中最真实的结构。
: 你说的那个晶体中解出的作为heterogenity 存在的水分子，其实是共结晶的水，
: 一般是蛋白里面的盐桥之间的水分子，和作为溶剂的水不是一回事。
: 研究大蛋白功能的时候，只能看局部一小个区域，而且只能通过一些同位素标记
: 法间接的看。不但要直接定出一个大蛋白的结构目前不可能，要用NMR直接定出
: 一个大蛋白的局部区域的具体结构貌似也是不可以的,就是只有间接信息，没有直接信
: 息。
|
C*********m
发帖数: 213 | 14 H/D 交换看的是氢键不是水。
的O
【在 p****s 的大作中提到】
: 还好了，呵呵，用HD exchange大概也能知道什么地方有水，况且Xray看到的是水中的O
: ，NMR用的大部分是H，所以分
: 辨率有差异。
: NMR发展到现在做25 kD以下的蛋白应该已经算常规了，大的也有人做，不过难点，需要
: 特殊标记。我好像见过上百 kD的
: 文章，但是这个不是NMR的特长，所以NMR很多精力都在动力学方面。反正就做别人不能
: 做的呗
|
p****s
发帖数: 3153 | 15 嗯，您说得对，我表达错了，可以看water resonance
【在 C*********m 的大作中提到】
: H/D 交换看的是氢键不是水。
:
: 的O
|
s******y
发帖数: 28562 | 16 啊？可是磁场低的话，各个峰的能量分得不够开，就全部叠在一起成了一个胖峰了，分
辨率不就下去了吗？我怎么记得那个ppm值和磁场强度是有关系的？
不过，我确实没有考虑到你说的那个rotation 的问题。这个确实对大蛋白不利
【在 p****s 的大作中提到】
: 这个您说错了，主要不是仪器的限制，仪器可以提高信噪比，所以磁场越高越好，现在
: 应该有950M-1G的吧
: 但是对于大蛋白来说，限制NMR的主要是transverse relaxation，蛋白越大转得越慢，
: 灵敏度sensitivity就越低了。这个
: 大概不是提高磁场就能很好解决的，我想对于一个50 kDa的蛋白来说600 M和800 M没啥
: 大区别。现在常用的方法就是避
: 免relaxation造成的低灵敏度，方法有TROSY和methyl labeling，还有在高温下做(
: thermophilic system)。蛋白大的另
: 一个问题是残基太多，峰的位置重复，但是这个可以用高维NMR解决，现在不是都有7维
: 了么。
|
p****s
发帖数: 3153 | 17 ppm是相对值，跟磁场强度无关，要不不同场下的谱怎么比较？如果分不开就用高维呗
，三维以上怎么样都分开了
如果您是说linewidth，那是另一个问题，可能跟磁场稍微有点关系，但是主要还是看
蛋白的动力学性质
【在 s******y 的大作中提到】
: 啊？可是磁场低的话，各个峰的能量分得不够开，就全部叠在一起成了一个胖峰了，分
: 辨率不就下去了吗？我怎么记得那个ppm值和磁场强度是有关系的？
: 不过，我确实没有考虑到你说的那个rotation 的问题。这个确实对大蛋白不利
|
s******y
发帖数: 28562 | 18 你这个和我说的意思上是一样的，其实：）
就是需要对某些部分特异性标记，但是有些蛋白的某些部位不是那么容易特异性
标记的。
能发出文章的都是因为可以找到能特异性标记的。找不到方法的就只能算了。
【在 p****s 的大作中提到】
: 我觉得原则上是可能的，用selective labeling，蛋白不同的部分relaxation不同，有
: 的特别灵活就可以用NMR做。我没太
: 关注过这方面的东西，不过我是觉得NMR的重点不在这里，有很多Xray根本没法做的东
: 西(RNA, dynamics，RNA-
: protein interaction），这些问题做为NMR研究来说应该是比单纯的静态结构有意思多
: 了。
|
p****s
发帖数: 3153 | 19 可以用native ligation，当然麻烦点，但是应该也不是没有，您说的那多半是ILV标记
法，但是那不利于assignment
当然了，大家不是一古脑的都做巨型蛋白，毕竟没有天然优势，不过去年有人用NMR研
究proteosome的机制我觉得还挺有
意思的，当然没有解结构了，我总是认为结构是重要的，但也不是唯一重要的问题。
【在 s******y 的大作中提到】
: 你这个和我说的意思上是一样的，其实：）
: 就是需要对某些部分特异性标记，但是有些蛋白的某些部位不是那么容易特异性
: 标记的。
: 能发出文章的都是因为可以找到能特异性标记的。找不到方法的就只能算了。
|
C*********m
发帖数: 213 | 20
NMR计算结构的时候，所有的约束条件作模拟退火的时候都是假定真空状态。Hydration
不是不可以做，但是5年前肯定是不能直接用在结构计算中的。
错了，你肯定没有学过晶体学。
什么叫间接的看？晶体看到的也是间接的看，看到的电子云密度不过是用Fourier
Transformation算出来的。
NMR直接定出
Segmental labeling NMR，看你多大的蛋白。
【在 s******y 的大作中提到】
: 你这个和我说的意思上是一样的，其实：）
: 就是需要对某些部分特异性标记，但是有些蛋白的某些部位不是那么容易特异性
: 标记的。
: 能发出文章的都是因为可以找到能特异性标记的。找不到方法的就只能算了。
|
|
|
s******y
发帖数: 28562 | 21 我越听越糊涂了。。。当然，我本来就是三脚猫。但是，这个ppm不就是两个
磁量子态在磁场下产生能量差分而出现的么？然后。。。。这个。。。
能量是不是和频率成正比的？还是我把这个和其他概念搞错了？
【在 p****s 的大作中提到】
: ppm是相对值，跟磁场强度无关，要不不同场下的谱怎么比较？如果分不开就用高维呗
: ，三维以上怎么样都分开了
: 如果您是说linewidth，那是另一个问题，可能跟磁场稍微有点关系，但是主要还是看
: 蛋白的动力学性质
|
C*********m
发帖数: 213 | 22 7D NMR也就是做做小蛋白的,脉冲程序那么长,信号基本上衰减完了. Reduced
dimensional NMR 还好一点，数据处理比较麻烦。 |
s******y
发帖数: 28562 | 23
【在 s******y 的大作中提到】
: 我越听越糊涂了。。。当然，我本来就是三脚猫。但是，这个ppm不就是两个
: 磁量子态在磁场下产生能量差分而出现的么？然后。。。。这个。。。
: 能量是不是和频率成正比的？还是我把这个和其他概念搞错了？
|
p****s
发帖数: 3153 | 24 哈哈，我觉得您是不懂
ppm=(hz(resonance)-hz(standard))/Mhz(main field)
standard和你要看的resonance的频率都和主磁场成正比，所以当然ppm就是个相对值了
主磁场越大相应的频率也就越大，但是相对值是个定值
如果您还不理解的话可以去看看understanding NMR spectroscopy那书，网上有下载
【在 s******y 的大作中提到】
: 我越听越糊涂了。。。当然，我本来就是三脚猫。但是，这个ppm不就是两个
: 磁量子态在磁场下产生能量差分而出现的么？然后。。。。这个。。。
: 能量是不是和频率成正比的？还是我把这个和其他概念搞错了？
|
p****s
发帖数: 3153 | 25 哈哈，赞专业！我不懂那些，不过数据处理似乎也是NMR的一大发展方向
【在 C*********m 的大作中提到】
: 7D NMR也就是做做小蛋白的,脉冲程序那么长,信号基本上衰减完了. Reduced
: dimensional NMR 还好一点，数据处理比较麻烦。
|
s******y
发帖数: 28562 | 26 等一下。。。我又想了一下，我好像的确把几个概念搞混了。
ppm是外来集团对本地磁状态的影响而产生的偏差，不是我刚才图里面画的那个
两个磁量子态的能量差。 ppm 的确是与外磁好像是无关的。
那么那个两个磁量子态能量差这个概念影响的是什么？难道这个不影响分辨率么？ |
p****s
发帖数: 3153 | 27 ppm是没有单位的，hz是单位，但是ppm是hz/hz，上面的hz是能量差，下面的hz是主磁
场，能量差和主磁场成正比
【在 s******y 的大作中提到】
|
p****s
发帖数: 3153 | 28 那是larmor frequency，就是要观测的东西啊
【在 s******y 的大作中提到】
: 等一下。。。我又想了一下，我好像的确把几个概念搞混了。
: ppm是外来集团对本地磁状态的影响而产生的偏差，不是我刚才图里面画的那个
: 两个磁量子态的能量差。 ppm 的确是与外磁好像是无关的。
: 那么那个两个磁量子态能量差这个概念影响的是什么？难道这个不影响分辨率么？
|
s******y
发帖数: 28562 | 29 是啊，不好意思，的确是我搞错了。ppm应该是一个相对值。
【在 p****s 的大作中提到】
: 哈哈，我觉得您是不懂
: ppm=(hz(resonance)-hz(standard))/Mhz(main field)
: standard和你要看的resonance的频率都和主磁场成正比，所以当然ppm就是个相对值了
: 主磁场越大相应的频率也就越大，但是相对值是个定值
: 如果您还不理解的话可以去看看understanding NMR spectroscopy那书，网上有下载
|
s******y
发帖数: 28562 | 30 呵呵呵，这么说来那个分裂值所对应的频率就是该对应原子在该磁场里的
理论主峰对吧？
然后那些个ppm 就是该原子的本地磁性质受外来磁集团影响而产生的偏差对吧？
【在 p****s 的大作中提到】
: 那是larmor frequency，就是要观测的东西啊
|
|
|
p****s
发帖数: 3153 | 31 嗯，差不多这个意思（我没有用中文学过NMR...）
【在 s******y 的大作中提到】
: 呵呵呵，这么说来那个分裂值所对应的频率就是该对应原子在该磁场里的
: 理论主峰对吧？
: 然后那些个ppm 就是该原子的本地磁性质受外来磁集团影响而产生的偏差对吧？
|
s******y
发帖数: 28562 | 32 咦，可是为什么那些做NMR的人都一个个疯狂的上超导磁场什么的？
如果这个对提高分辨率没有什么好处的话，他们耗那么大力气买那么贵的仪器干吗？
我的印象中是有人（某合作者）跟我说过这个可以提高什么什么率。不知道是不是
可以把峰变sharp?还是怎么回事？
【在 p****s 的大作中提到】
: 嗯，差不多这个意思（我没有用中文学过NMR...）
|
p****s
发帖数: 3153 | 33 那是信噪比，提高了信噪比当然能做很多以前不能做的东西了，比如以前要一个星期的
实验可能现在只需要一天之类的。
当然了，我说的肯定有点误导您。根据boltzmann分布，能量差跟磁场有关，而能收到
的信号和能量差(polarization)有
关。如果能提高信噪比，那我觉得在某种程度上也可以把峰变窄吧，但是不能本质上解
决大分子量的问题。
【在 s******y 的大作中提到】
: 咦，可是为什么那些做NMR的人都一个个疯狂的上超导磁场什么的？
: 如果这个对提高分辨率没有什么好处的话，他们耗那么大力气买那么贵的仪器干吗？
: 我的印象中是有人（某合作者）跟我说过这个可以提高什么什么率。不知道是不是
: 可以把峰变sharp?还是怎么回事？
|
s******y
发帖数: 28562 | 34 嗯，谢谢！ 清楚多了！
【在 p****s 的大作中提到】
: 那是信噪比，提高了信噪比当然能做很多以前不能做的东西了，比如以前要一个星期的
: 实验可能现在只需要一天之类的。
: 当然了，我说的肯定有点误导您。根据boltzmann分布，能量差跟磁场有关，而能收到
: 的信号和能量差(polarization)有
: 关。如果能提高信噪比，那我觉得在某种程度上也可以把峰变窄吧，但是不能本质上解
: 决大分子量的问题。
|
p****s
发帖数: 3153 | 35 简单说吧，高磁场解决的是sensitivity的问题，因为从本质上来说NMR是不灵敏的方法
（所以我们才用ppm），而
resolution的问题很大程度上取决于蛋白本身。如果蛋白太大的话，高磁场也不能解决
sensitivity的问题了。
【在 s******y 的大作中提到】
: 咦，可是为什么那些做NMR的人都一个个疯狂的上超导磁场什么的？
: 如果这个对提高分辨率没有什么好处的话，他们耗那么大力气买那么贵的仪器干吗？
: 我的印象中是有人（某合作者）跟我说过这个可以提高什么什么率。不知道是不是
: 可以把峰变sharp?还是怎么回事？
|
C*********m
发帖数: 213 | 36 峰宽是用Hz量的，峰间距是用ppm量的，这是高场好处之一。
高场的第二好处是trosy效应，当然不是所有的核都越高越好，15N到1T就到顶了，13C
好像是在600M附近.s/n当然也是一个因素。另外有些RDC也是用Hz量的，所以场越高越
好。
不过Solution NMR解结构基本上走到头了，剩下的改进多数是奇技淫巧。固体NMR和MRI
是前途。话说回来，任何一门学科发展到工程化，学科本身就沦落为一种工具。结构生
物学发展到structural proteomics阶段之后，结构生物学本身就沦落成一门工具。结
构生物学的黄金时期早已过去，新兴的是各种 -omics技术，或者就回到生物学问题本
身。做生物研究，体系比方法更重要。楼主问NMR能找啥工作，还不如问问自己做的是
什么生物问题。
【在 s******y 的大作中提到】
: 咦，可是为什么那些做NMR的人都一个个疯狂的上超导磁场什么的？
: 如果这个对提高分辨率没有什么好处的话，他们耗那么大力气买那么贵的仪器干吗？
: 我的印象中是有人（某合作者）跟我说过这个可以提高什么什么率。不知道是不是
: 可以把峰变sharp?还是怎么回事？
|
p****s
发帖数: 3153 | 37 哈哈，您这话真不错，十分同意
13C
MRI
【在 C*********m 的大作中提到】
: 峰宽是用Hz量的，峰间距是用ppm量的，这是高场好处之一。
: 高场的第二好处是trosy效应，当然不是所有的核都越高越好，15N到1T就到顶了，13C
: 好像是在600M附近.s/n当然也是一个因素。另外有些RDC也是用Hz量的，所以场越高越
: 好。
: 不过Solution NMR解结构基本上走到头了，剩下的改进多数是奇技淫巧。固体NMR和MRI
: 是前途。话说回来，任何一门学科发展到工程化，学科本身就沦落为一种工具。结构生
: 物学发展到structural proteomics阶段之后，结构生物学本身就沦落成一门工具。结
: 构生物学的黄金时期早已过去，新兴的是各种 -omics技术，或者就回到生物学问题本
: 身。做生物研究，体系比方法更重要。楼主问NMR能找啥工作，还不如问问自己做的是
: 什么生物问题。
|
s********n
发帖数: 2939 | 38 NMR挺好的，就是不容易入门，光是一个thermodynamics，crystallography就做不了，
更不要说其他的了。 |
C*******e
发帖数: 4348 | 39 不知道现在怎么样了
反正我读phd的时候据说主要瓶颈在于计算机的处理能力
【在 s******y 的大作中提到】
: NMR不管蛋白在什么状态下都能做，而且还能做动态图谱，理论上来说更
: 接近于蛋白在溶液里的自然状态。但是NMR的结构能力取决于仪器，
: 因为磁场的大小决定了磁量子的差分度, 也就是分辨率.
: 但是目前的仪器的限制，决定了NMR没有办法做大的蛋白。
: 而x-ray crystalgraphy 的分辨率主要由结晶的质量决定。
|
C*******e
发帖数: 4348 | 40 受教
建议斑竹mark一下
【在 p****s 的大作中提到】
: 这个您说错了，主要不是仪器的限制，仪器可以提高信噪比，所以磁场越高越好，现在
: 应该有950M-1G的吧
: 但是对于大蛋白来说，限制NMR的主要是transverse relaxation，蛋白越大转得越慢，
: 灵敏度sensitivity就越低了。这个
: 大概不是提高磁场就能很好解决的，我想对于一个50 kDa的蛋白来说600 M和800 M没啥
: 大区别。现在常用的方法就是避
: 免relaxation造成的低灵敏度，方法有TROSY和methyl labeling，还有在高温下做(
: thermophilic system)。蛋白大的另
: 一个问题是残基太多，峰的位置重复，但是这个可以用高维NMR解决，现在不是都有7维
: 了么。
|
|
|
g*****n
发帖数: 36 | 41
理论上1G Hz的超导磁体给出最好的分辨率。也就是把峰变窄。
【在 s******y 的大作中提到】
: 咦，可是为什么那些做NMR的人都一个个疯狂的上超导磁场什么的？
: 如果这个对提高分辨率没有什么好处的话，他们耗那么大力气买那么贵的仪器干吗？
: 我的印象中是有人（某合作者）跟我说过这个可以提高什么什么率。不知道是不是
: 可以把峰变sharp?还是怎么回事？
|
g*****n
发帖数: 36 | 42 做结构NMR肯定不如Crystal，CNS文章没几篇是NMR做出来了，相反Crystal的文章，几
乎每期都有。
这里有一个有意思的关于NMR专业毕业出路讨论。
http://www.chinanmr.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=5594 |
y*****s
发帖数: 1047 | |
p*********n
发帖数: 556 | 44 人家问前途，瞧这楼歪到纯技术去了。
我的phd thesis就是做dynamics。我有同实验室的用NMR解结构，还不是什么很大的蛋
白，就痛苦的不行了。所以我觉得protein NMR适合跟人搞合作，有特定的问题用NMR的
方法很有用。另外一个不能忽视的问题就是要把蛋白表达到比较高的浓度，又不沉淀也
不是那么容易的。很多人3，4年都用在表达蛋白上，剩下1，2年真正做NMR实验。 |
y*****s
发帖数: 1047 | 45 没什么前途，据说一般都得做个四五年博后，看看agilent最近贴的招人广告，明确要
求8年毕业之后的experience
【在 p*********n 的大作中提到】
: 人家问前途，瞧这楼歪到纯技术去了。
: 我的phd thesis就是做dynamics。我有同实验室的用NMR解结构，还不是什么很大的蛋
: 白，就痛苦的不行了。所以我觉得protein NMR适合跟人搞合作，有特定的问题用NMR的
: 方法很有用。另外一个不能忽视的问题就是要把蛋白表达到比较高的浓度，又不沉淀也
: 不是那么容易的。很多人3，4年都用在表达蛋白上，剩下1，2年真正做NMR实验。
|
x****n
发帖数: 43 | 46 Besides SNR, high field will increase spectral resolution, since 1) larger
spectral width for the same ppm range
and 2) J-coupling does not scale with main field.
【在 p****s 的大作中提到】
: ppm是相对值，跟磁场强度无关，要不不同场下的谱怎么比较？如果分不开就用高维呗
: ，三维以上怎么样都分开了
: 如果您是说linewidth，那是另一个问题，可能跟磁场稍微有点关系，但是主要还是看
: 蛋白的动力学性质
|
x****n
发帖数: 43 | 47 depends on how much you understand about NMR. If you know enough spin
physics and have enough
experience with sequence programming. You should have good positions (
either academia or industry) when
coupled with a couple good applications. However, if you only use it as a
tool, then you don't have as much an
edge.
【在 y*****s 的大作中提到】
: 没什么前途，据说一般都得做个四五年博后，看看agilent最近贴的招人广告，明确要
: 求8年毕业之后的experience
|
x****n
发帖数: 43 | 48 in certain sense, MRI is NMR's 奇技淫巧, hehe.
13C
MRI
【在 C*********m 的大作中提到】
: 峰宽是用Hz量的，峰间距是用ppm量的，这是高场好处之一。
: 高场的第二好处是trosy效应，当然不是所有的核都越高越好，15N到1T就到顶了，13C
: 好像是在600M附近.s/n当然也是一个因素。另外有些RDC也是用Hz量的，所以场越高越
: 好。
: 不过Solution NMR解结构基本上走到头了，剩下的改进多数是奇技淫巧。固体NMR和MRI
: 是前途。话说回来，任何一门学科发展到工程化，学科本身就沦落为一种工具。结构生
: 物学发展到structural proteomics阶段之后，结构生物学本身就沦落成一门工具。结
: 构生物学的黄金时期早已过去，新兴的是各种 -omics技术，或者就回到生物学问题本
: 身。做生物研究，体系比方法更重要。楼主问NMR能找啥工作，还不如问问自己做的是
: 什么生物问题。
|
C*********m
发帖数: 213 | 49 哈哈。我觉得fMRI很有用，无论是研究还是临床应用。
【在 x****n 的大作中提到】
: in certain sense, MRI is NMR's 奇技淫巧, hehe.
:
: 13C
: MRI
|
C*********m
发帖数: 213 | 50 应该比较一下世界上做晶体有多少个组，做核磁多少个组，然后比一下发CNS文章的比
例。
【在 g*****n 的大作中提到】
: 做结构NMR肯定不如Crystal，CNS文章没几篇是NMR做出来了，相反Crystal的文章，几
: 乎每期都有。
: 这里有一个有意思的关于NMR专业毕业出路讨论。
: http://www.chinanmr.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=5594
|
|
|
d****z
发帖数: 75 | 51 刚看到此文，很同意你的观点。其实结晶也是一工具， 不比核磁好到哪去。关键是体
系。
13C
MRI
【在 C*********m 的大作中提到】
: 峰宽是用Hz量的，峰间距是用ppm量的，这是高场好处之一。
: 高场的第二好处是trosy效应，当然不是所有的核都越高越好，15N到1T就到顶了，13C
: 好像是在600M附近.s/n当然也是一个因素。另外有些RDC也是用Hz量的，所以场越高越
: 好。
: 不过Solution NMR解结构基本上走到头了，剩下的改进多数是奇技淫巧。固体NMR和MRI
: 是前途。话说回来，任何一门学科发展到工程化，学科本身就沦落为一种工具。结构生
: 物学发展到structural proteomics阶段之后，结构生物学本身就沦落成一门工具。结
: 构生物学的黄金时期早已过去，新兴的是各种 -omics技术，或者就回到生物学问题本
: 身。做生物研究，体系比方法更重要。楼主问NMR能找啥工作，还不如问问自己做的是
: 什么生物问题。
|
D******9
发帖数: 2665 | 52 认识三个人做NMR,都是美国名校实验室PHD， PHD都发了10片以上的文章， 没有CNS，
都是JBC,JMB一类的文章。 一个回了中国， 现在已经不做NMR 了， 另一个博士毕业直
接去了一个制药公司， 当了个NMR manager， 其实就是替大家RUN一下样品，都只要是
一维的， 实在太简单了。 最后一个换了方向， 该做晶体， 做了两轮薄厚， 找了一
个AP. |
