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Biology版 - 做literature mining的大侠请看过来~~~~~
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1 (共1页)
y******e
发帖数: 277
1
请问有没有啥literature mining tool可以同时搜索几百个基因 x keyword(e.g.
development),之后直接batch download所有相关文章的abstracts?用PubMatrix试了
试,只提供连接,每个基因要单独打开才能看到相关文章……几百个,点抽筋了
>_<
新手上路,请大侠们不吝赐教,万分感谢;)
送黑糖刨冰一碗~防暑降温v^_^v
t*d
发帖数: 1290
2
这个太不够意思了。看得口水之流,可是吃不着。
所以估计没人赐教了,呵呵。

【在 y******e 的大作中提到】
: 请问有没有啥literature mining tool可以同时搜索几百个基因 x keyword(e.g.
: development),之后直接batch download所有相关文章的abstracts?用PubMatrix试了
: 试,只提供连接,每个基因要单独打开才能看到相关文章……几百个,点抽筋了
: >_<
: 新手上路,请大侠们不吝赐教,万分感谢;)
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y**u
发帖数: 7459
3
那个黄色的是什么东西?芒果冻?
C*********m
发帖数: 213
4
你要是知道基因的GeneID来下载相关文献 (NCBI Gene) 倒是方便很多。不过你要查
keyword就不知道怎么和基因联系起来了

【在 y******e 的大作中提到】
: 请问有没有啥literature mining tool可以同时搜索几百个基因 x keyword(e.g.
: development),之后直接batch download所有相关文章的abstracts?用PubMatrix试了
: 试,只提供连接,每个基因要单独打开才能看到相关文章……几百个,点抽筋了
: >_<
: 新手上路,请大侠们不吝赐教,万分感谢;)
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X***n
发帖数: 366
5
biopython
from Bio import Entrez
Entrez.email = "A*******[email protected]"
handle = Entrez.esearch(db="pubmed", term="biopython")
record = Entrez.read(handle)
record["IdList"]
handle = Entrez.efetch(db="pubmed", id="186972394")
l******u
发帖数: 936
6
gopubmed 其实还不错。

【在 y******e 的大作中提到】
: 请问有没有啥literature mining tool可以同时搜索几百个基因 x keyword(e.g.
: development),之后直接batch download所有相关文章的abstracts?用PubMatrix试了
: 试,只提供连接,每个基因要单独打开才能看到相关文章……几百个,点抽筋了
: >_<
: 新手上路,请大侠们不吝赐教,万分感谢;)
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y******e
发帖数: 277
7
多谢大侠们赐教 =)
那个黄色的应该是香草冰激淋\^O^/
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