由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 请教蛋白质结构分析方法
相关主题
求一个能按照指定结构作homology model 的 软件/serverRecBCD敲除
请教:multi-domain protein占全体protein的percentage?有没有做蛋白质结构功能预测的牛哥牛姐?问个发文章的问题
Tony Pawson 去世【官方版】中科院神经科学研究所2010年年会蒲慕明所长的讲话
关于antibody / antigen的选择(有包子)想不到,想不到!
请问这种porins的结构怎么预测和画出来?有没有网站可以分析signaling pathways和不同germ layers的基因?
protein disorderRe: What cell will do when DNA damages happened?
Re: a bioinformatics questionRe: Help!!! A chromosome problem leads to miscarriage
现在大家都用什么软件模拟protein structureRe: 谁说说什么场合用ortholog,什么场合用homolog?
相关话题的讨论汇总
话题: 结构话题: 分析方法话题: 蛋白话题: 600aa话题: alignment
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
G********e
发帖数: 528
1
在做一个600AA左右的蛋白生物学功能,有细胞和老鼠模型
本人是蛋白结构盲,请教,
如果想从蛋白结构去分析推测它可能有的功能
不知道是否可能有免费的软件或者网络分析平台,或者人工读码?
Thanks
I*********r
发帖数: 8
2
Do sequence alignment and structure alignment first.
g**********t
发帖数: 475
3
可能的功能?如果是要很粗的分析,先做一个GO(gene ontology)分类。
f**********e
发帖数: 1994
4
先用 hmmer 看看 domain (600AA 大概有四个 domains), 再用
psipred 看看二级结构,顺便看看和已知结构有没有相似性,有的话
用 modeller 做 homology modeling, 和 structural
alignments.

【在 G********e 的大作中提到】
: 在做一个600AA左右的蛋白生物学功能,有细胞和老鼠模型
: 本人是蛋白结构盲,请教,
: 如果想从蛋白结构去分析推测它可能有的功能
: 不知道是否可能有免费的软件或者网络分析平台,或者人工读码?
: Thanks

1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
Re: 谁说说什么场合用ortholog,什么场合用homolog?请问这种porins的结构怎么预测和画出来?
Mouse vs. Humanprotein disorder
new paper on rice genomeRe: a bioinformatics question
Re: 跨膜蛋白的orientation?现在大家都用什么软件模拟protein structure
求一个能按照指定结构作homology model 的 软件/serverRecBCD敲除
请教:multi-domain protein占全体protein的percentage?有没有做蛋白质结构功能预测的牛哥牛姐?问个发文章的问题
Tony Pawson 去世【官方版】中科院神经科学研究所2010年年会蒲慕明所长的讲话
关于antibody / antigen的选择(有包子)想不到,想不到!
相关话题的讨论汇总
话题: 结构话题: 分析方法话题: 蛋白话题: 600aa话题: alignment