e********r
发帖数: 2352 | 1 现在在做蛋白质结构的预测，想问一下下面的几个杂志在各个方向的档次和投稿的难易程度，一边确定一下接下来奋斗方向，谢谢哈.
Journal of Chemical Information and Modeling 3.82
Journal of Chemical Theory and Computation 5.14
JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY 4.05
JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 3.147
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY 1.28
BIOINFORMATICS 4.88
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY 1.6
JOURNAL OF COMPUTATIONAL PHYSICS 2.35
BMC BIOLOGY 5.2
JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 4.01
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND GENETICS 2.81
CURRENT PROTEIN & PEPTIDE SCIENCE 3.83 |
B******w
发帖数: 1040 | 2 这里很多人就盯着CNS
所以你问的这个估计没什么人知道 |
s********n
发帖数: 2939 | 3 不是做这方面的，不知道，听说J Phys Chem B 这个好像也可以，不是太难。加油！ |
e********r
发帖数: 2352 | 4 谢谢哈，主要是现在做的东西介于化学和生物之间，不知道在哪个版问比较好, 俺去查
一下JPC.
【在 s********n 的大作中提到】
: 不是做这方面的，不知道，听说J Phys Chem B 这个好像也可以，不是太难。加油！
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s********n
发帖数: 2939 | 5 蛋白质结构的预测和生物联系不大吧，基本上都是理论化学的方法，你可以去化学版再
问问。 |
e********r
发帖数: 2352 | 6 主要是组里的文章都是便生物的，以后可能投偏生物的可能性比较大哈.
【在 s********n 的大作中提到】
: 蛋白质结构的预测和生物联系不大吧，基本上都是理论化学的方法，你可以去化学版再
: 问问。
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p****s
发帖数: 3153 | 7 好像这类文章一般都发protein, 上面很多中国人，JMB也不错，bioinformatics估计也
成。你列的第一个杂志可能也能发。
JPCB是做应用物理化学的（非纳米），不知跟你的关系大么。JCP就更不行了，人属于化物
，重点是物理，估计你的文章差点。current protein and peptide science主要是实
验科学吧，我就看过一些文章。别的我就不知道了。这几个是我听说过的。其实这些杂
志看影响因子关系不大了，主要还是看杂志风格。比如JCP和JMB根本就不是一类杂志，
比较影响因子可能没太多意义，而且就我所知JCP在物化／化物方面算很好的了。
你要觉得自己做得特牛，说不定能试试JACS这样的综合性化学杂志，或者structure。
【在 e********r 的大作中提到】
: 谢谢哈，主要是现在做的东西介于化学和生物之间，不知道在哪个版问比较好, 俺去查
: 一下JPC.
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e********r
发帖数: 2352 | 8 谢谢指点哈，俺以前做过一段时间的物化，现在用的方法还是偏向以前的东西，而且俺
们这个方向很多都用的物化的理论，组里的文章都大都比较偏生物，俺一直都很喜欢
JCP，想看一下行情，根据你的分析还是Protein和JMB比较合适.
【在 p****s 的大作中提到】
: 好像这类文章一般都发protein, 上面很多中国人，JMB也不错，bioinformatics估计也
: 成。你列的第一个杂志可能也能发。
: JPCB是做应用物理化学的（非纳米），不知跟你的关系大么。JCP就更不行了，人属于化物
: ，重点是物理，估计你的文章差点。current protein and peptide science主要是实
: 验科学吧，我就看过一些文章。别的我就不知道了。这几个是我听说过的。其实这些杂
: 志看影响因子关系不大了，主要还是看杂志风格。比如JCP和JMB根本就不是一类杂志，
: 比较影响因子可能没太多意义，而且就我所知JCP在物化／化物方面算很好的了。
: 你要觉得自己做得特牛，说不定能试试JACS这样的综合性化学杂志，或者structure。
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p****s
发帖数: 3153 | 9 如果你的文章里有好几页公式的话，发JCP应该没问题...反正我看的都是这样的，虽然
是实验物化
【在 e********r 的大作中提到】
: 谢谢指点哈，俺以前做过一段时间的物化，现在用的方法还是偏向以前的东西，而且俺
: 们这个方向很多都用的物化的理论，组里的文章都大都比较偏生物，俺一直都很喜欢
: JCP，想看一下行情，根据你的分析还是Protein和JMB比较合适.
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e********r
发帖数: 2352 | 10 现在的东西前面部分可能有很大比重是推导公式，俺在JCP上也看到有类似的文章，理
论的东西不是很深，很容易理解的那种，但是重点在后边的对结果的应用，有点拿不定
主意，也还没有和老板商量好，之前因为在作物化的东西，被以前的老板灌输的对JCP
情有独钟，上来问一下各位，谢谢老兄指点迷津哈.
【在 p****s 的大作中提到】
: 如果你的文章里有好几页公式的话，发JCP应该没问题...反正我看的都是这样的，虽然
: 是实验物化
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p****s
发帖数: 3153 | 11 哈哈，我也就是胡说八道，凭着自己看过的一星半点随便侃侃，再说我不一定称得上老
兄呢
JCP
【在 e********r 的大作中提到】
: 现在的东西前面部分可能有很大比重是推导公式，俺在JCP上也看到有类似的文章，理
: 论的东西不是很深，很容易理解的那种，但是重点在后边的对结果的应用，有点拿不定
: 主意，也还没有和老板商量好，之前因为在作物化的东西，被以前的老板灌输的对JCP
: 情有独钟，上来问一下各位，谢谢老兄指点迷津哈.
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e********r
发帖数: 2352 | 12 客气哈.
【在 p****s 的大作中提到】
: 哈哈，我也就是胡说八道，凭着自己看过的一星半点随便侃侃，再说我不一定称得上老
: 兄呢
:
: JCP
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j****x
发帖数: 1704 | 13 结构预测这块不知道你做哪个方向，ab initio还是comparative或者另辟蹊径。
ab initio这块感觉目前基本做不下去了，除了超级大牛BAKER之外其他人或多或少都只
能打酱油，真所谓走自己的路让别人无路可走。而comparative这块想发好文章很难，
另外从近几次CASP结果来看，要想全面超过Yang Zhang的方法显然是非常的不容易，而
他们的文章主要都发在了Proteins/Plos one/Structure这个级别的杂志,
Bioinformatics和NAR这样IF稍高一点的并不很多见，奇怪的很。
当然，做个database或者webserver，然后投到NAR的database/webserver issue也是不
错的选择吧。Bioinformatics和BMC Bioinformatics有时候也收类似的文章。
易程度，一边确定一下接下来奋斗方向，谢谢哈.
【在 e********r 的大作中提到】
: 现在在做蛋白质结构的预测，想问一下下面的几个杂志在各个方向的档次和投稿的难易程度，一边确定一下接下来奋斗方向，谢谢哈.
: Journal of Chemical Information and Modeling 3.82
: Journal of Chemical Theory and Computation 5.14
: JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY 4.05
: JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 3.147
: COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY 1.28
: BIOINFORMATICS 4.88
: JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY 1.6
: JOURNAL OF COMPUTATIONAL PHYSICS 2.35
: BMC BIOLOGY 5.2
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s****T
发帖数: 100 | 14 nature science 咱就不提了，以下的
PNAS-->JACS,STRUCTURE-->Biophy J, JMB , JPCB --->Biochem, Proteins, Protein
Sci
易程度，一边确定一下接下来奋斗方向，谢谢哈.
【在 e********r 的大作中提到】
: 现在在做蛋白质结构的预测，想问一下下面的几个杂志在各个方向的档次和投稿的难易程度，一边确定一下接下来奋斗方向，谢谢哈.
: Journal of Chemical Information and Modeling 3.82
: Journal of Chemical Theory and Computation 5.14
: JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY 4.05
: JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 3.147
: COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY 1.28
: BIOINFORMATICS 4.88
: JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY 1.6
: JOURNAL OF COMPUTATIONAL PHYSICS 2.35
: BMC BIOLOGY 5.2
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e********r
发帖数: 2352 | 15 谢谢指点，对结构预测已经有类似的感觉了，这段时间新的方法不多，现在正在check
Yang Zhang的decoys， Baker的东西作的比较早，但是现在总有在凑东西的感觉.
另外请问又没有比较好的Decoys generator，俺想重新生成一些decoys，Yang Zhang的
那个都比较分散，俺想check一些局部密度比较高的decoy，谢谢哈.
【在 j****x 的大作中提到】
: 结构预测这块不知道你做哪个方向，ab initio还是comparative或者另辟蹊径。
: ab initio这块感觉目前基本做不下去了，除了超级大牛BAKER之外其他人或多或少都只
: 能打酱油，真所谓走自己的路让别人无路可走。而comparative这块想发好文章很难，
: 另外从近几次CASP结果来看，要想全面超过Yang Zhang的方法显然是非常的不容易，而
: 他们的文章主要都发在了Proteins/Plos one/Structure这个级别的杂志,
: Bioinformatics和NAR这样IF稍高一点的并不很多见，奇怪的很。
: 当然，做个database或者webserver，然后投到NAR的database/webserver issue也是不
: 错的选择吧。Bioinformatics和BMC Bioinformatics有时候也收类似的文章。
:
: 易程度，一边确定一下接下来奋斗方向，谢谢哈.
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e********r
发帖数: 2352 | 16 谢谢哈，平时读的文献主要是JMB, JCP还有Protein，对这个方向还比较陌生，多谢指
点迷津哈.
Protein
【在 s****T 的大作中提到】
: nature science 咱就不提了，以下的
: PNAS-->JACS,STRUCTURE-->Biophy J, JMB , JPCB --->Biochem, Proteins, Protein
: Sci
:
: 易程度，一边确定一下接下来奋斗方向，谢谢哈.
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s********n
发帖数: 2939 | 17 Baker现在的主要方向是protein ab initio design，利用现有的scaffolds design
novel catalysts or pharmaceuticals.
check
【在 e********r 的大作中提到】
: 谢谢指点，对结构预测已经有类似的感觉了，这段时间新的方法不多，现在正在check
: Yang Zhang的decoys， Baker的东西作的比较早，但是现在总有在凑东西的感觉.
: 另外请问又没有比较好的Decoys generator，俺想重新生成一些decoys，Yang Zhang的
: 那个都比较分散，俺想check一些局部密度比较高的decoy，谢谢哈.
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e********r
发帖数: 2352 | 18 请问是否可以推荐几个decoy的generator，俺需要重新生成一些decoys.
【在 s********n 的大作中提到】
: Baker现在的主要方向是protein ab initio design，利用现有的scaffolds design
: novel catalysts or pharmaceuticals.
:
: check
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