k********n 发帖数: 136 | 1 有个系的老鼠要做qPCR鉴定转基因是杂合子还是纯合子.
方法1 尽量把尾巴剪得一样长,用蛋白酶K消化后,用乙酸氨沉淀蛋白,再用异丙醇
或乙醇沉淀,都是浑浊的雾状,消化好的,可以看到螺旋絮状DNA,但qPCR结果
不好.
方法2 NaOH消化后,Tris-HCl中和,离心直接qPCR.
两个方法好像结果的变异都比较大,有时候很难区分1copy和2copy.
大侠们觉得我哪里做的有问题呢? 先谢谢了 |
h****6 发帖数: 229 | 2 How many samples do you have? Can yo use a kit just to verify that your
method works on true pure DNA? Without internal control, i think 1 Ct
difference is hard to be consistently detected. |
k********n 发帖数: 136 | 3 是用taqman的probe做引物的,用持家基因的probe做内参.
给我们老鼠的组也说没法完全分开,他们的方法是,不清楚的用southern b
lot鉴定.....
【在 h****6 的大作中提到】 : How many samples do you have? Can yo use a kit just to verify that your : method works on true pure DNA? Without internal control, i think 1 Ct : difference is hard to be consistently detected.
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k********n 发帖数: 136 | 4 我没用southern,刚开始老鼠少,还可以采样后做in situ鉴定,现在
baby boom, 这么搞要累死人的
【在 h****6 的大作中提到】 : How many samples do you have? Can yo use a kit just to verify that your : method works on true pure DNA? Without internal control, i think 1 Ct : difference is hard to be consistently detected.
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a*****g 发帖数: 543 | 5 既然这么重要,弄个kit 提genomic DNA吧。
然后最好用plasmid做个standard curve
【在 k********n 的大作中提到】 : 有个系的老鼠要做qPCR鉴定转基因是杂合子还是纯合子. : 方法1 尽量把尾巴剪得一样长,用蛋白酶K消化后,用乙酸氨沉淀蛋白,再用异丙醇 : 或乙醇沉淀,都是浑浊的雾状,消化好的,可以看到螺旋絮状DNA,但qPCR结果 : 不好. : 方法2 NaOH消化后,Tris-HCl中和,离心直接qPCR. : 两个方法好像结果的变异都比较大,有时候很难区分1copy和2copy. : 大侠们觉得我哪里做的有问题呢? 先谢谢了
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