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Biology版 - 各个大侠指导一下吧,qPCR Genotyping from tail DNA
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k********n
发帖数: 136
1
有个系的老鼠要做qPCR鉴定转基因是杂合子还是纯合子.
方法1 尽量把尾巴剪得一样长,用蛋白酶K消化后,用乙酸氨沉淀蛋白,再用异丙醇
或乙醇沉淀,都是浑浊的雾状,消化好的,可以看到螺旋絮状DNA,但qPCR结果
不好.
方法2 NaOH消化后,Tris-HCl中和,离心直接qPCR.
两个方法好像结果的变异都比较大,有时候很难区分1copy和2copy.
大侠们觉得我哪里做的有问题呢? 先谢谢了
h****6
发帖数: 229
2
How many samples do you have? Can yo use a kit just to verify that your
method works on true pure DNA? Without internal control, i think 1 Ct
difference is hard to be consistently detected.
k********n
发帖数: 136
3
是用taqman的probe做引物的,用持家基因的probe做内参.
给我们老鼠的组也说没法完全分开,他们的方法是,不清楚的用southern b
lot鉴定.....

【在 h****6 的大作中提到】
: How many samples do you have? Can yo use a kit just to verify that your
: method works on true pure DNA? Without internal control, i think 1 Ct
: difference is hard to be consistently detected.

k********n
发帖数: 136
4
我没用southern,刚开始老鼠少,还可以采样后做in situ鉴定,现在
baby boom, 这么搞要累死人的

【在 h****6 的大作中提到】
: How many samples do you have? Can yo use a kit just to verify that your
: method works on true pure DNA? Without internal control, i think 1 Ct
: difference is hard to be consistently detected.

a*****g
发帖数: 543
5
既然这么重要,弄个kit 提genomic DNA吧。
然后最好用plasmid做个standard curve

【在 k********n 的大作中提到】
: 有个系的老鼠要做qPCR鉴定转基因是杂合子还是纯合子.
: 方法1 尽量把尾巴剪得一样长,用蛋白酶K消化后,用乙酸氨沉淀蛋白,再用异丙醇
: 或乙醇沉淀,都是浑浊的雾状,消化好的,可以看到螺旋絮状DNA,但qPCR结果
: 不好.
: 方法2 NaOH消化后,Tris-HCl中和,离心直接qPCR.
: 两个方法好像结果的变异都比较大,有时候很难区分1copy和2copy.
: 大侠们觉得我哪里做的有问题呢? 先谢谢了

1 (共1页)
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再问两个关于ChIP的问题怎么GENOTYPE HOMOZYGOTE tg MICE
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