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Biology版 - 问一个关于细菌基因重组的菜鸟级问题
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论文求助,救命啊。异想天开,集思广益 ,如何在某一段特定位点后插入一段polyA使
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h*****u
发帖数: 201
1
如果要把一段外来的基因(比如一个plasmid或者染色体里面的一段已知基因)复制出
来,插入到另一个plasmid或者染色体的特定位置去,是怎么操作的?定位的原理是什
么?
我找了些资料,似乎传统的方法是根据特殊的restriction enzymes和DNA ligases来定
位。又发现最近的一些文献里用lambda red system来进行基因改造。两种方法的原理
我都没看明白,请版上的朋友不吝赐教。。。谢谢!
I***a
发帖数: 13467
2
可以让基因A两端带有特定位子的相同序列,
然后通过同源重组插入到这个位子。
h*****u
发帖数: 201
3
谢谢!能否详细说说这个过程是怎么实现的?比如说要把一个plasmid里的一段A基因序
列插入到细菌染色体里的序列B-C的中间,是不是得先把A、B、C克隆出来,在A两边连
上B和C(怎么连接?),然后把B-A-C片段引入细菌,然后细菌能自己把B-A-C片段整合
到自己的染色体中,并且是取代原来的B-C序列?这些问题可能很傻,所以我会有大包
子酬谢 :)

【在 I***a 的大作中提到】
: 可以让基因A两端带有特定位子的相同序列,
: 然后通过同源重组插入到这个位子。

I***a
发帖数: 13467
4
你说的差不多是的,
怎么连接?可以加酶切位点,然后一步一连起来,也可以通过PCR连起来,
还要有个筛选标记,帮你筛选出你要的
h**********r
发帖数: 671
5
差不多是这样的,还要看你要做啥细菌。
有的细菌抗拒这种同源重组
google一下suicide plasmid之类的
可以做knock out,knock in
还能利用marker负选择把抗性基因给去掉
A********2
发帖数: 107
6
i) clone your target gene into a plasmid upstream of an antibiotic
resistance gene (e.x. Kanamycin) ii) amplify the two-gene cassette using
primers with 40nt homologous sequences iii) transform the linear fragments
into a recipient strain (e.x. E. coli) with an inducible Lamda Red System iv
) flip out the cassette with or without leaving a scar sequence, depending
on if there is FRT seq or I-sceI site in the cassette
C*******e
发帖数: 4348
7
lambda red system的有一个2002年的PNAS
那个实验室有这个E.coli菌株
插入片段两端有46nts的flanking region就可以了
线性DNA片段和目标plasmid一起电转化到那个E.coli菌株就行
就是你要有个方法筛
比如线性DNA片段上有另外一个抗性之类的
不然大海捞针

【在 h*****u 的大作中提到】
: 如果要把一段外来的基因(比如一个plasmid或者染色体里面的一段已知基因)复制出
: 来,插入到另一个plasmid或者染色体的特定位置去,是怎么操作的?定位的原理是什
: 么?
: 我找了些资料,似乎传统的方法是根据特殊的restriction enzymes和DNA ligases来定
: 位。又发现最近的一些文献里用lambda red system来进行基因改造。两种方法的原理
: 我都没看明白,请版上的朋友不吝赐教。。。谢谢!

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