v***a 发帖数: 1242 | 1 读过一篇文章,上面谈到蛋白A在老鼠某器官中的作用,说在A的KO mice中发现该器官
功能没有任何损伤,由此得出结论说A在该器官中的作用是dispensable的。
因为这个,联想到自己目前在做的2个蛋白,都有paper发表过说KO mice无异常(也是
跟我做的一样的system),如果由以上提及的paper的思路,那是不是代表我在本
system中对这样的蛋白进行研究也不可能有什么意义了?因为这么说,这些蛋白尽管在
system中的表达量很高,但没有了似乎也不会有什么影响,它的功能是可以被另外的蛋
白取代的。如果我做出了significance,那又会与KO mice的表型相违背,数据无法解
释。现在我很困惑,想听听大家对此有什么意见吗?谢谢。 |
n********k 发帖数: 2818 | 2 all we do in the lab or even in the wild:) is conditional or in another somewhat frightening word--artifact, so I don't see why you cannot do that
as long as the data is scientifically comprehensive and sound...For example, the gene could be
involved in stress response...or it works with modifier etc etc...after all
robustness and redundancy rule in biology systems...but they only rule
conditionally too...
【在 v***a 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 读过一篇文章,上面谈到蛋白A在老鼠某器官中的作用,说在A的KO mice中发现该器官 : 功能没有任何损伤,由此得出结论说A在该器官中的作用是dispensable的。 : 因为这个,联想到自己目前在做的2个蛋白,都有paper发表过说KO mice无异常(也是 : 跟我做的一样的system),如果由以上提及的paper的思路,那是不是代表我在本 : system中对这样的蛋白进行研究也不可能有什么意义了?因为这么说,这些蛋白尽管在 : system中的表达量很高,但没有了似乎也不会有什么影响,它的功能是可以被另外的蛋 : 白取代的。如果我做出了significance,那又会与KO mice的表型相违背,数据无法解 : 释。现在我很困惑,想听听大家对此有什么意见吗?谢谢。
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y****i 发帖数: 2194 | 3 这种状况 除非你们能拿到这些老鼠
然后按照你们的数据去stress老鼠看看能不能看到别人以前没看过的phenotype
如果你们没有自己的动物模型
光靠你们的in vitro的结果 人家又发表过in vivo的negative result的话
确实很难搞出什么很有意思的东西 至少paper肯定发不大
【在 v***a 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 读过一篇文章,上面谈到蛋白A在老鼠某器官中的作用,说在A的KO mice中发现该器官 : 功能没有任何损伤,由此得出结论说A在该器官中的作用是dispensable的。 : 因为这个,联想到自己目前在做的2个蛋白,都有paper发表过说KO mice无异常(也是 : 跟我做的一样的system),如果由以上提及的paper的思路,那是不是代表我在本 : system中对这样的蛋白进行研究也不可能有什么意义了?因为这么说,这些蛋白尽管在 : system中的表达量很高,但没有了似乎也不会有什么影响,它的功能是可以被另外的蛋 : 白取代的。如果我做出了significance,那又会与KO mice的表型相违背,数据无法解 : 释。现在我很困惑,想听听大家对此有什么意见吗?谢谢。
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v***a 发帖数: 1242 | 4 我从来没有接触过KO mice
可我目前得到的结果是,超量表达此蛋白后对机体影响特别大(in vivo,在我们的
system中)
所以觉得很难办。。。
【在 y****i 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 这种状况 除非你们能拿到这些老鼠 : 然后按照你们的数据去stress老鼠看看能不能看到别人以前没看过的phenotype : 如果你们没有自己的动物模型 : 光靠你们的in vitro的结果 人家又发表过in vivo的negative result的话 : 确实很难搞出什么很有意思的东西 至少paper肯定发不大
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h********n 发帖数: 4079 | 5 有一个可能性, 比如这个蛋白A1的family有另外两个:A2和A3. 如果A1没了, A2和A3能
补偿功能, 所以KO老鼠的器官没事. 但是, 有可能在这个器官里, 通常情况下都是A1
在工作, A2和A3基本没有(量很少). 在这个情况下, 你还是可以在in vitro的条件下
研究A1的功能, 不过可能文章档次上不去.
【在 v***a 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 读过一篇文章,上面谈到蛋白A在老鼠某器官中的作用,说在A的KO mice中发现该器官 : 功能没有任何损伤,由此得出结论说A在该器官中的作用是dispensable的。 : 因为这个,联想到自己目前在做的2个蛋白,都有paper发表过说KO mice无异常(也是 : 跟我做的一样的system),如果由以上提及的paper的思路,那是不是代表我在本 : system中对这样的蛋白进行研究也不可能有什么意义了?因为这么说,这些蛋白尽管在 : system中的表达量很高,但没有了似乎也不会有什么影响,它的功能是可以被另外的蛋 : 白取代的。如果我做出了significance,那又会与KO mice的表型相违背,数据无法解 : 释。现在我很困惑,想听听大家对此有什么意见吗?谢谢。
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v***a 发帖数: 1242 | 6 谢谢你的回答。这个蛋白确实属于一个存在很大overlapping function的家族。我现在
有in vitro和in vivo的结果,都是利用超量表达此A1蛋白,然后观察到了significant
的结果,所以很困惑。
A1
【在 h********n 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 有一个可能性, 比如这个蛋白A1的family有另外两个:A2和A3. 如果A1没了, A2和A3能 : 补偿功能, 所以KO老鼠的器官没事. 但是, 有可能在这个器官里, 通常情况下都是A1 : 在工作, A2和A3基本没有(量很少). 在这个情况下, 你还是可以在in vitro的条件下 : 研究A1的功能, 不过可能文章档次上不去.
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h********n 发帖数: 4079 | 7 overexpression approach is good.
but in this case, endogenous study might be important.
significant
【在 v***a 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 谢谢你的回答。这个蛋白确实属于一个存在很大overlapping function的家族。我现在 : 有in vitro和in vivo的结果,都是利用超量表达此A1蛋白,然后观察到了significant : 的结果,所以很困惑。 : : A1
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c*********7 发帖数: 148 | 8 那些KO mice 有没有被challenge过? |
D*a 发帖数: 6830 | 9 KO和高表达的表型不一定非要一样啊
关键是你们能不能给你们的数据一个合理的解释,单纯描述现象的话肯定会被疑问啊。
很多蛋白的功能都是大家认为没什么研究头了又发现重要功能的。大家也不知道你做什
么,只能靠你想想怎么challenge你的老鼠了。 |
v***a 发帖数: 1242 | 10 challenge是什么意思?不好意思啊,没有做过KO,不懂。。
【在 c*********7 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 那些KO mice 有没有被challenge过?
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F******p 发帖数: 2099 | 11 overexpress本身是一个不存在的现象(特例除外),所以你的后继研究结果缺乏一个
合理的前提。
合理的办法是在KO cell line里面rescue express. |
P******B 发帖数: 65 | 12 在in vitro或者in vivo把一个family的几个蛋白都knockdown,如果是重要的问题,通
常可以发很好的文章。
overexpression有phenotype实际上只是一个好的开端,说明此蛋白肯定有作用,要变
成story还要根据已有文献猜一下,再回来证实。 |
v***a 发帖数: 1242 | 13 谢谢!
【在 F******p 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : overexpress本身是一个不存在的现象(特例除外),所以你的后继研究结果缺乏一个 : 合理的前提。 : 合理的办法是在KO cell line里面rescue express.
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v***a 发帖数: 1242 | 14 谢谢!这个主意不错!
【在 P******B 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 在in vitro或者in vivo把一个family的几个蛋白都knockdown,如果是重要的问题,通 : 常可以发很好的文章。 : overexpression有phenotype实际上只是一个好的开端,说明此蛋白肯定有作用,要变 : 成story还要根据已有文献猜一下,再回来证实。
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D*a 发帖数: 6830 | 15 challenge是说你把老鼠根据你的蛋白可能的现象给他弄一些极端情况,比如
regeneration的把肝切除一块或者耳朵穿孔等等看愈合快慢,brain的做brain demage
的实验看老鼠严重程度和恢复程度,等等
【在 v***a 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : challenge是什么意思?不好意思啊,没有做过KO,不懂。。
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v***a 发帖数: 1242 | 16 懂了!多谢多谢!
demage
【在 D*a 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : challenge是说你把老鼠根据你的蛋白可能的现象给他弄一些极端情况,比如 : regeneration的把肝切除一块或者耳朵穿孔等等看愈合快慢,brain的做brain demage : 的实验看老鼠严重程度和恢复程度,等等
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