S**o
发帖数: 447 | 1 please recommend a server for next generation sequencing data analysis
budget: $80,000 |
s******s
发帖数: 13035 | 2 ft, 我们实验室的才$2k
【在 S**o 的大作中提到】
: please recommend a server for next generation sequencing data analysis
: budget: $80,000
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l*****e
发帖数: 424 | 3 NextGen sequencing storage is a big issue. You will need to purchase 100s of
TB of harddrive if you are generating a lot of reads. The requirement of
other hardware parts are not that high.
【在 S**o 的大作中提到】
: please recommend a server for next generation sequencing data analysis
: budget: $80,000
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t****b
发帖数: 47 | 4 如果做拼接之类，需要１T甚至２T内存的大家伙。外加存储。
$80000的预算不够。就是在国内买，都不够。 |
S**********l
发帖数: 3835 | 5 刚用6个server($5000*6)处理了SRA上所有的high throughput expression data,一个
多星期弄完了。
assembly就不知道了。
【在 S**o 的大作中提到】
: please recommend a server for next generation sequencing data analysis
: budget: $80,000
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t*m
发帖数: 4414 | 6 几个T，无疑是不够了。
【在 t****b 的大作中提到】
: 如果做拼接之类，需要１T甚至２T内存的大家伙。外加存储。
: $80000的预算不够。就是在国内买，都不够。
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S**********l
发帖数: 3835 | 7 外行问一句，de novo assembly的程序为啥不用上磁盘捏？都放在memory里也太烧钱了
【在 t*m 的大作中提到】
: 几个T，无疑是不够了。
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r****t
发帖数: 10904 | 8 就等着莎拉你来改进了。
【在 S**********l 的大作中提到】
: 外行问一句，de novo assembly的程序为啥不用上磁盘捏？都放在memory里也太烧钱了
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S**********l
发帖数: 3835 | 9 人家是不懂真心请教。你不要冷嘲热讽的
【在 r****t 的大作中提到】
: 就等着莎拉你来改进了。
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r****t
发帖数: 10904 | 10 哪敢，我是看了你的贴去读 wikipedia de novo assembly 条目的那水平。要不你给科
普个算法吧？或者推荐本书好不？
【在 S**********l 的大作中提到】
: 人家是不懂真心请教。你不要冷嘲热讽的
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l**********1
发帖数: 5204 | 11 Each sequence total number is in the range of 1e13 to 1e16. This large
number of particles is definitely not suitable for stochastic assembly?
if Run on Cloud system, then Run Error can not be avoided.
借生化路径随机分析Gepasi/COPASI 的英国坛子管理员的三回帖 回复萨拉大姐/小妹
去年夏天在那里夏季讲座时候 听说利用全英国的大学 N台 Unix机子 在15th week 礼
拜五晚上开始的时间专门运算 stochastic assembly
16th week礼拜一上午一看 靠Run Error Code 修正后 16th week周五晚重来一次
htp://www.copasi.org/tiki-view_forum_thread.php?comments_parentId=1388&
topics_offset=19&forumId=1
htp://www.copasi.org/tiki-view_forum_thread.php?comments_parentId=1445&
topics_offset=4&forumId=1
htp://www.copasi.org/tiki-view_forum_thread.php?comments_parentId=1438&
topics_offset=7&forumId=1
【在 S**********l 的大作中提到】
: 外行问一句，de novo assembly的程序为啥不用上磁盘捏？都放在memory里也太烧钱了
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l**********1
发帖数: 5204 | 12 just go to
htp://www.contigexpress.com/aboutus.html
【在 S**o 的大作中提到】
: please recommend a server for next generation sequencing data analysis
: budget: $80,000
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