k*******3
发帖数: 1909 | 1 对illumina出来的pair-end reads几个问题
1. 这些reads都在positive strand上？还是都在negative strand上？还是既可能在
positive strand上也可能在negative strand上？
2. 这些reads的方向都是5'->3'吧？
谢谢！ |
B******o
发帖数: 496 | 2 1. 不一定。得看你的library是怎么制作的。如果是Directional RNA-seq.你能知道具
体是从哪条strand出来的。
2. 是的
【在 k*******3 的大作中提到】
: 对illumina出来的pair-end reads几个问题
: 1. 这些reads都在positive strand上？还是都在negative strand上？还是既可能在
: positive strand上也可能在negative strand上？
: 2. 这些reads的方向都是5'->3'吧？
: 谢谢！
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k*******3
发帖数: 1909 | 3 DNA-seq能知道具体是从那条strand出啦的吗？
【在 B******o 的大作中提到】
: 1. 不一定。得看你的library是怎么制作的。如果是Directional RNA-seq.你能知道具
: 体是从哪条strand出来的。
: 2. 是的
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B******o
发帖数: 496 | 4 不太明白你的意思。你是指测genome？为啥要知道从哪条strand出来的？
测序都是测的DNA library。 你的DNA-seq到底指的是啥？
【在 k*******3 的大作中提到】
: DNA-seq能知道具体是从那条strand出啦的吗？
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k*******3
发帖数: 1909 | 5 我指的是测genome的DNA啊， DNA不是双链吗？ 我想知道出来的read的哪条链的。
【在 B******o 的大作中提到】
: 不太明白你的意思。你是指测genome？为啥要知道从哪条strand出来的？
: 测序都是测的DNA library。 你的DNA-seq到底指的是啥？
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k*******6
发帖数: 103 | |
k*******3
发帖数: 1909 | 7 thanks
【在 k*******6 的大作中提到】
: +,- 链都有~
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