How to test if a nuclear protein is a DNA binding protein? - Biology版 - 未名存档

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档，一周内的贴子最多显示50字，超过一周显示500字访问原贴

Biology版 - How to test if a nuclear protein is a DNA binding protein?

相关主题
● 有人做EMSA?
● EMSA 的问题
● Histone DNA binding
● DNA结合序列已知，如何筛选鉴定与之作用的转录因子？
● 有10bp左右的DNA, 如何判断是哪个转录因子TF的binding sequence?
● 怎么从本质上确定一个蛋白确实是一个transcription factor? 跪求大牛帮忙
● 又熟悉NfkB的大牛吗？EMSA和luciferase reporter的结果不一致，请教！
● 两个蛋白相互作用dependent on DNA?
● EMSA 没有结果
● [合集] 牛文欣赏， Michael G. Rosenfeld and Xiang-Dong Fu

相关话题的讨论汇总
话题: protein话题: dna话题: binding话题: nuclear话题: test

进入Biology版参与讨论

1

(共1页)

F*K 发帖数: 608	1 Thanks for your advice
o**d 发帖数: 3080	2 如果你知道这个蛋白可能结合到DNA上的序列，可以做EMSA。
F*K 发帖数: 608	3 At this stage I want to know if it binds to DNA. 【在 o**d 的大作中提到】 : 如果你知道这个蛋白可能结合到DNA上的序列，可以做EMSA。
c********r 发帖数: 189	4 1) FRAP to see the protein's mobility in nucleus. 2) cell fractionation to see if the protein only in DNA binding fraction
v*********d 发帖数: 382	5 EMSA 就是用来干这个的，当然只是in vitro 可以参考这个: http://tools.invitrogen.com/content/sfs/manuals/mp33075.pdf in vivo 很难证明是direct binding，要是你有目的序列，可以ChIP 【在 F*K 的大作中提到】 : At this stage I want to know if it binds to DNA.
l**********1 发帖数: 5204	6 plus if your nuclaer protein is Proline-Rich Homeodomain protein (PRH) you can try oligomeric assembly Please go to 2010 one paper: //www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20675722 【在 v*********d 的大作中提到】 : EMSA 就是用来干这个的，当然只是in vitro : 可以参考这个: : http://tools.invitrogen.com/content/sfs/manuals/mp33075.pdf : in vivo 很难证明是direct binding，要是你有目的序列，可以ChIP

1

(共1页)

进入Biology版参与讨论

相关主题
● [合集] 牛文欣赏， Michael G. Rosenfeld and Xiang-Dong Fu
● 关于小鼠组织内源蛋白western的问题
● 想了解一下实际工作中需要解决的 NP-complete 问题？
● 从纯化到星辰---CSH蛋白质纯化课侧记（十五）
● 问各位做Promoter的达人两个小问题
● 求paper
● 做SDSPAGE胶总是凝太快做不漂亮请支招！
● 请问哪个公司的EMSA　KIT好用啊？
● 帮忙查篇文章，非常感谢！
● 推荐一下 in vitro RNA labeling kit

相关话题的讨论汇总
话题: protein话题: dna话题: binding话题: nuclear话题: test