由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 做lentivirus失败,来请教troubleshooting
相关主题
retrovirus转染human fibroblast 的问题.pBabe可以做lentivirus表达吗?
neo, hygro, puro, and zeo. which is better for stable transfection marker?求经验:G418, puromycin能用来杀死neuron吗?
lentivirus 转染问题求助已经筛到的stable cell line怎么又不表达外源蛋白了?
lentivirus实验请教有谁做tumor imaging么
about pBABE puro vector试验问题求助:Puromycin 和G418
pBABE-puro SV40 LT plasmid 问题puromycin浓度升高,细胞死的反而少了
包装lentivirus,psPAX2与PAX2两个质粒有啥区别呢请问啥是T2A puro?
还是慢病毒(update: 求建议)我什么时候才能学会not trusting anybody
相关话题的讨论汇总
话题: lentivirus话题: 细胞话题: pbabe话题: 失败
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
m**********d
发帖数: 137
1
之前做过很多lentivirus,都是超速离心virus之后infect细胞,transduction效率都
还不错,这次偷懒没离心,直接用的含有病毒的medium,可是puromycin select一两天
后细胞全死光了,以下是详细的protocol:
vector用的是pBABE-Luc (基于pBABE-puro,只不过也表达luciferase)
293T细胞,养在75cm2 flask里,用lipofectamine2000转染的,包装病毒用的是second
generation packaging system (PAX2,pMD2.G)
分别于转染后48hr和72hr collect medium,过了一下0.45uM的filter,又加了8ug/ml
的polybrene,就加到要transduce的细胞里去了,24hr之后开始puromycin selection
我能想到的问题可能是准备transduce的细胞有点太confluent了,但这也没法解释全死
光的结果,我想很可能是没有病毒包装,高人们帮忙看看这过程中可能是么出了问题
F*K
发帖数: 608
2
follow your old protocol, and do it again.

second
ml
selection

【在 m**********d 的大作中提到】
: 之前做过很多lentivirus,都是超速离心virus之后infect细胞,transduction效率都
: 还不错,这次偷懒没离心,直接用的含有病毒的medium,可是puromycin select一两天
: 后细胞全死光了,以下是详细的protocol:
: vector用的是pBABE-Luc (基于pBABE-puro,只不过也表达luciferase)
: 293T细胞,养在75cm2 flask里,用lipofectamine2000转染的,包装病毒用的是second
: generation packaging system (PAX2,pMD2.G)
: 分别于转染后48hr和72hr collect medium,过了一下0.45uM的filter,又加了8ug/ml
: 的polybrene,就加到要transduce的细胞里去了,24hr之后开始puromycin selection
: 我能想到的问题可能是准备transduce的细胞有点太confluent了,但这也没法解释全死
: 光的结果,我想很可能是没有病毒包装,高人们帮忙看看这过程中可能是么出了问题

G******7
发帖数: 1352
3
puromycin加太早了,感染2-3天后再筛选

second
ml
selection

【在 m**********d 的大作中提到】
: 之前做过很多lentivirus,都是超速离心virus之后infect细胞,transduction效率都
: 还不错,这次偷懒没离心,直接用的含有病毒的medium,可是puromycin select一两天
: 后细胞全死光了,以下是详细的protocol:
: vector用的是pBABE-Luc (基于pBABE-puro,只不过也表达luciferase)
: 293T细胞,养在75cm2 flask里,用lipofectamine2000转染的,包装病毒用的是second
: generation packaging system (PAX2,pMD2.G)
: 分别于转染后48hr和72hr collect medium,过了一下0.45uM的filter,又加了8ug/ml
: 的polybrene,就加到要transduce的细胞里去了,24hr之后开始puromycin selection
: 我能想到的问题可能是准备transduce的细胞有点太confluent了,但这也没法解释全死
: 光的结果,我想很可能是没有病毒包装,高人们帮忙看看这过程中可能是么出了问题

m*****u
发帖数: 15526
4
看infect啥细胞了。跟cell cycle有很大关系。肿瘤细胞很快,原代就慢。记得用GFP infect原代骨髓细胞,4,5天镜下才能看出绿来

second
ml
selection

【在 m**********d 的大作中提到】
: 之前做过很多lentivirus,都是超速离心virus之后infect细胞,transduction效率都
: 还不错,这次偷懒没离心,直接用的含有病毒的medium,可是puromycin select一两天
: 后细胞全死光了,以下是详细的protocol:
: vector用的是pBABE-Luc (基于pBABE-puro,只不过也表达luciferase)
: 293T细胞,养在75cm2 flask里,用lipofectamine2000转染的,包装病毒用的是second
: generation packaging system (PAX2,pMD2.G)
: 分别于转染后48hr和72hr collect medium,过了一下0.45uM的filter,又加了8ug/ml
: 的polybrene,就加到要transduce的细胞里去了,24hr之后开始puromycin selection
: 我能想到的问题可能是准备transduce的细胞有点太confluent了,但这也没法解释全死
: 光的结果,我想很可能是没有病毒包装,高人们帮忙看看这过程中可能是么出了问题

C**S
发帖数: 522
5
pBABE是Retroviral的

second
ml
selection

【在 m**********d 的大作中提到】
: 之前做过很多lentivirus,都是超速离心virus之后infect细胞,transduction效率都
: 还不错,这次偷懒没离心,直接用的含有病毒的medium,可是puromycin select一两天
: 后细胞全死光了,以下是详细的protocol:
: vector用的是pBABE-Luc (基于pBABE-puro,只不过也表达luciferase)
: 293T细胞,养在75cm2 flask里,用lipofectamine2000转染的,包装病毒用的是second
: generation packaging system (PAX2,pMD2.G)
: 分别于转染后48hr和72hr collect medium,过了一下0.45uM的filter,又加了8ug/ml
: 的polybrene,就加到要transduce的细胞里去了,24hr之后开始puromycin selection
: 我能想到的问题可能是准备transduce的细胞有点太confluent了,但这也没法解释全死
: 光的结果,我想很可能是没有病毒包装,高人们帮忙看看这过程中可能是么出了问题

m**********d
发帖数: 137
6
可lentivirus不也是retrovirus么

【在 C**S 的大作中提到】
: pBABE是Retroviral的
:
: second
: ml
: selection

s******y
发帖数: 28562
7
我也正觉得奇怪呢。
Lenti 和retro是不一样的,lentivirus 即使在细胞不分裂的时候也能感染细胞,
retrovirus 就必须细胞分裂的时候才能成功感染,所以假如target cell 进入
confluent status 发生contact inhibition 之后就会导致效率大大下降


【在 C**S 的大作中提到】
: pBABE是Retroviral的
:
: second
: ml
: selection

s*******d
发帖数: 370
8
直接用上清,细胞毒性很大
h******e
发帖数: 69
9
时间再长一点,我的病毒要48小时后才能看到荧光。
z********9
发帖数: 409
10
搭车问一下,lentivirus 0.45um 过滤真的必要吗,离心去掉debris,过滤去掉MVBs,
但对于非整合型的病毒,我的理解应该离心一下就行了吧,求教。
1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
(update: 求建议)我什么时候才能学会not trusting anybodyabout pBABE puro vector
有人用过Tet-pLKO-puro (shRNA vector)做 inducible protein overexpression 吗?pBABE-puro SV40 LT plasmid 问题
在基因的内含子里面加入一个poly(A)会影响其pre-mRNA和mature-包装lentivirus,psPAX2与PAX2两个质粒有啥区别呢
在肿瘤细胞里用CRISPR/HDR技术成功突变一个基因的两个拷贝还是慢病毒
retrovirus转染human fibroblast 的问题.pBabe可以做lentivirus表达吗?
neo, hygro, puro, and zeo. which is better for stable transfection marker?求经验:G418, puromycin能用来杀死neuron吗?
lentivirus 转染问题求助已经筛到的stable cell line怎么又不表达外源蛋白了?
lentivirus实验请教有谁做tumor imaging么
相关话题的讨论汇总
话题: lentivirus话题: 细胞话题: pbabe话题: 失败