i*********0 发帖数: 915 | 1 最近做一个实验,用E14.5和E13.5时期isolated 的MEF (primary)来做实验,我发现
用4-OHT做gene inducible deletion5天,然后wash out 4-OHT以后,E14.5的mutant
细胞相对E14.5的control cell line proliferation降低,但是E13,5 的mutant cell
相对control cell line的proliferation居然升高了 (我每个时期的细胞系都有2个
control 2个mutant),一头雾水呀。 |
s******y 发帖数: 28562 | 2 这种细胞实验很难说清楚的,
因为你分离fibroblast的操作就不是一个很consistent 的过程,
而且大部分proliferation assay 的S/N也很低。
最最重要的一点是:你是否都是在scarce culture 里面作的proliferation assay?
如果你的细胞系是在dense culture 里做的话,会引入sensitivity to contact
inhibition 这个因素,会导致非常大的误差。
如果你不同细胞之间的culture density 不一样的话那就更完蛋了,根本就没有
办法直接比较。
cell
【在 i*********0 的大作中提到】 : 最近做一个实验,用E14.5和E13.5时期isolated 的MEF (primary)来做实验,我发现 : 用4-OHT做gene inducible deletion5天,然后wash out 4-OHT以后,E14.5的mutant : 细胞相对E14.5的control cell line proliferation降低,但是E13,5 的mutant cell : 相对control cell line的proliferation居然升高了 (我每个时期的细胞系都有2个 : control 2个mutant),一头雾水呀。
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i*********0 发帖数: 915 | 3 谢谢回复呀。
我一般都是seed 1x10^5 cells/6 well. 细胞生长的也不是很dense,而且我重复了一
次,结果是一样的。搞得结果很难解释。我现在就是想是不是这个OHT对我的细胞有影
响,还是我研究的这个gene 对 OHT treatment 有response。
其实这个gene我们propose和stem cell 的分裂和分化有关,一个naive的想法就是E13.
5的primary细胞是不是保留了更多的stem cell identity?
【在 s******y 的大作中提到】 : 这种细胞实验很难说清楚的, : 因为你分离fibroblast的操作就不是一个很consistent 的过程, : 而且大部分proliferation assay 的S/N也很低。 : 最最重要的一点是:你是否都是在scarce culture 里面作的proliferation assay? : 如果你的细胞系是在dense culture 里做的话,会引入sensitivity to contact : inhibition 这个因素,会导致非常大的误差。 : 如果你不同细胞之间的culture density 不一样的话那就更完蛋了,根本就没有 : 办法直接比较。 : : cell
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s******y 发帖数: 28562 | 4 有可能
老鼠胚胎每过一天都会大变样,所以分离出来的细胞有差别是可能的
E13.
【在 i*********0 的大作中提到】 : 谢谢回复呀。 : 我一般都是seed 1x10^5 cells/6 well. 细胞生长的也不是很dense,而且我重复了一 : 次,结果是一样的。搞得结果很难解释。我现在就是想是不是这个OHT对我的细胞有影 : 响,还是我研究的这个gene 对 OHT treatment 有response。 : 其实这个gene我们propose和stem cell 的分裂和分化有关,一个naive的想法就是E13. : 5的primary细胞是不是保留了更多的stem cell identity?
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