由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 请教RNA-seq 软件的安装调试的问题!
相关主题
paper help!简单介绍 Bioinformatics Tools for NGS 分析
如何处理RNA-SeqNature 文章的明显错误!!
求科普RNA-sequencing【包子题】有啥好的RNAseq数据分析的书么
RNA-seq map工具Any suggestion about RNA-seq?
truth about RNAseq vs Microarray请问大家 RNA-Seq assembly 都用啥软件呢?
non strand specific RNA-seq数据分析大鼠的RNA-seq应该使用那个reference genome?
市场调查 Bioinformatics RNA-seq preprocessing toolRNA seq 数据统计分析问题请教
RNA-seq结果分析求助RNA-seq 表达量问题
相关话题的讨论汇总
话题: localhost话题: shared话题: download话题: file话题: rna
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
j***x
发帖数: 1469
1
我使用的是 topHat 和cufflinks 处理。 参考文献是 :
nature protocols VOL.7 NO.3 | 2012
:Differential gene and transcript expression analysis of RNA-seq
experiments with TopHat and Cufflinks。
最后CummeRbund需要 R 环境,我安装了, 结果调用gfortran的时候找不到一个文件夹
, 我安装了gfortran,最新版。
错误信息如下:
[jokex@localhost download]$ R
/usr/lib64/R/bin/exec/R: error while loading shared libraries: libgfortran.
so.1: cannot open shared object file: No such file or directory
[jokex@localhost download]$ su --
Password:
[root@localhost download]# R
/usr/lib64/R/bin/exec/R: error while loading shared libraries: libgfortran.
so.1: cannot open shared object file: No such file or directory
[root@localhost download]#
----------------
google可一天,也没有解决问题,有遇到类似情况的吗 ? 能不能告诉我解决办法,
谢了!
j***x
发帖数: 1469
2
已解决
y**********n
发帖数: 478
3
怎么解决的
是不是安上Galaxy全套更方便一些

【在 j***x 的大作中提到】
: 已解决
j*p
发帖数: 411
4
just get compiled binary
1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
RNA-seq 表达量问题truth about RNAseq vs Microarray
关于RNA-seq的问题non strand specific RNA-seq数据分析
如何检测 long noncoding RNA市场调查 Bioinformatics RNA-seq preprocessing tool
RNA seq分析求教RNA-seq结果分析求助
paper help!简单介绍 Bioinformatics Tools for NGS 分析
如何处理RNA-SeqNature 文章的明显错误!!
求科普RNA-sequencing【包子题】有啥好的RNAseq数据分析的书么
RNA-seq map工具Any suggestion about RNA-seq?
相关话题的讨论汇总
话题: localhost话题: shared话题: download话题: file话题: rna