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c*********r
发帖数: 181
1
我刚做了一个ITRAQ的结果,可是不是太懂。
请问大家谁能指点我一下?
比如:
Protein probability
unique peptides
unique spectra
total spectra
Percentage of total spectra
还有很多,最好能留下邮箱,方便我请教,多谢!!!!
l**********1
发帖数: 5204
2
LZ can find almost answers from PhD dissertation
by Phadke, Nikhil D.
Issue Date: 2011 Univ of Michigan
"Use Of Proteomics For The Analysis Of Hard-To-Dissect Biological
Samples."
link:
//deepblue.lib.umich.edu/handle/2027.42/84528
and PDF link:
//deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/84528/1/nphadke_1.pdf

【在 c*********r 的大作中提到】
: 我刚做了一个ITRAQ的结果,可是不是太懂。
: 请问大家谁能指点我一下?
: 比如:
: Protein probability
: unique peptides
: unique spectra
: total spectra
: Percentage of total spectra
: 还有很多,最好能留下邮箱,方便我请教,多谢!!!!

p*****1
发帖数: 330
3
找蛋白质组数据搜索如mascot的manual

【在 c*********r 的大作中提到】
: 我刚做了一个ITRAQ的结果,可是不是太懂。
: 请问大家谁能指点我一下?
: 比如:
: Protein probability
: unique peptides
: unique spectra
: total spectra
: Percentage of total spectra
: 还有很多,最好能留下邮箱,方便我请教,多谢!!!!

l**********1
发帖数: 5204
4
Bingo
suppl:
Boehm AM et al. (2007)
Precise protein quantification based on peptide quantification using
iTRAQ^@TM
BMC Bioinformatics. 8:214.
its Fig. 2
The normal-probability-plot shows that a lognormal distribution
fits the peptide ratio data. The transformed experimental
data is plotted and lies on a line, so the data is nearly
normally distributed. The x-axis denotes the inverse function
of the normality and the y-axis represents the sorted logtransformed
values.
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17584939

【在 p*****1 的大作中提到】
: 找蛋白质组数据搜索如mascot的manual
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