c*********r 发帖数: 181 | 1 我刚做了一个ITRAQ的结果,可是不是太懂。
请问大家谁能指点我一下?
比如:
Protein probability
unique peptides
unique spectra
total spectra
Percentage of total spectra
还有很多,最好能留下邮箱,方便我请教,多谢!!!! |
l**********1 发帖数: 5204 | 2 LZ can find almost answers from PhD dissertation
by Phadke, Nikhil D.
Issue Date: 2011 Univ of Michigan
"Use Of Proteomics For The Analysis Of Hard-To-Dissect Biological
Samples."
link:
//deepblue.lib.umich.edu/handle/2027.42/84528
and PDF link:
//deepblue.lib.umich.edu/bitstream/2027.42/84528/1/nphadke_1.pdf
【在 c*********r 的大作中提到】 : 我刚做了一个ITRAQ的结果,可是不是太懂。 : 请问大家谁能指点我一下? : 比如: : Protein probability : unique peptides : unique spectra : total spectra : Percentage of total spectra : 还有很多,最好能留下邮箱,方便我请教,多谢!!!!
|
p*****1 发帖数: 330 | 3 找蛋白质组数据搜索如mascot的manual
【在 c*********r 的大作中提到】 : 我刚做了一个ITRAQ的结果,可是不是太懂。 : 请问大家谁能指点我一下? : 比如: : Protein probability : unique peptides : unique spectra : total spectra : Percentage of total spectra : 还有很多,最好能留下邮箱,方便我请教,多谢!!!!
|
l**********1 发帖数: 5204 | 4 Bingo
suppl:
Boehm AM et al. (2007)
Precise protein quantification based on peptide quantification using
iTRAQ^@TM
BMC Bioinformatics. 8:214.
its Fig. 2
The normal-probability-plot shows that a lognormal distribution
fits the peptide ratio data. The transformed experimental
data is plotted and lies on a line, so the data is nearly
normally distributed. The x-axis denotes the inverse function
of the normality and the y-axis represents the sorted logtransformed
values.
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17584939
【在 p*****1 的大作中提到】 : 找蛋白质组数据搜索如mascot的manual
|