m*****n
发帖数: 5245 | 1 问大家一个问题：
公司想开发一个癌症免疫疗法，已经知道，该疗法的临床效果不好，只有15~20%的反应
率（含完全治愈和部分治愈）；和目前已经上市的小分子靶向药物相比，后者能暂时延
缓癌症的发展，但不能治愈，如长期使用的话，就会产生抗药性导致药物失效。
我们打算在开发该疗法的同时，开发一种配套的检测试剂盒，对入组的患者进行初步筛
选，以期筛查对该疗法敏感的患者，这样的临床试验效果会更好。具体是打算从癌症患
者的肿瘤组织和血液免疫细胞同时着手，通过体外试验进行biomarker的筛选。
大家看看，这个方案的成功率有多大？ |
i*******n
发帖数: 48 | 2 这种事情和做实验一样，只有你自己做了才能知道。
这是clinical trial里面很常规的作法，如TKI, 如EGFR monoclonal antibody
TKI是检测EGFR mutation
EGFR antibody是检测EGFR overexpression或有correlation的biomarker
到底能否work取决于你选择的biomarker
这个也是需要做clinical trial才能知道的。 |
s******y
发帖数: 28562 | 3 可以试试，有过成功的例子。
但是从头做太花钱了，而且你们现在等于是盲检，这样未必有什么效果。
我的建议是你们不如回过头去检查上一批病人，把那些对这个药物
有良好反映的病人和没有反映的病人之间的biomarker 有什么差别，在此基础
之上重新设计一个优化的检测kit，然后看看这个kit 在新病人身上是否能够
正确预测他们对这个药的反映。
【在 m*****n 的大作中提到】
: 问大家一个问题：
: 公司想开发一个癌症免疫疗法，已经知道，该疗法的临床效果不好，只有15~20%的反应
: 率（含完全治愈和部分治愈）；和目前已经上市的小分子靶向药物相比，后者能暂时延
: 缓癌症的发展，但不能治愈，如长期使用的话，就会产生抗药性导致药物失效。
: 我们打算在开发该疗法的同时，开发一种配套的检测试剂盒，对入组的患者进行初步筛
: 选，以期筛查对该疗法敏感的患者，这样的临床试验效果会更好。具体是打算从癌症患
: 者的肿瘤组织和血液免疫细胞同时着手，通过体外试验进行biomarker的筛选。
: 大家看看，这个方案的成功率有多大？
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m*****n
发帖数: 5245 | 4
那筛出这个或者这组biomarker的可能性有多大？
【在 i*******n 的大作中提到】
: 这种事情和做实验一样，只有你自己做了才能知道。
: 这是clinical trial里面很常规的作法，如TKI, 如EGFR monoclonal antibody
: TKI是检测EGFR mutation
: EGFR antibody是检测EGFR overexpression或有correlation的biomarker
: 到底能否work取决于你选择的biomarker
: 这个也是需要做clinical trial才能知道的。
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s******y
发帖数: 28562 | 5 有过先例，如果认真筛，在理论上是非常大，但是实践上要看你怎么设计你的
测试盒。
【在 m*****n 的大作中提到】
:
: 那筛出这个或者这组biomarker的可能性有多大？
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i*******n
发帖数: 48 | 6 这个东西不是那么容易做的。
提出hypothesis很容易，test起来很花钱。
和你的药物的作用机理有关系。
找biomarker方法很多，microarray, RNA seq, metabolomics,还是dependent on
mechanism of action.
先做回顾性数据：
如Cetuximab，BMS取了两组病人，response好的和不好的病人的tumor sample
->microarray->找到一堆相关的gene->QPCR quantitation
看和疗效的统计相关性
然后再做前瞻性实验：
有时一组clinical trial,用你的biomarker对病人分类，用Cetuximab+化疗(biomarker
postivie,他们根据QPCR结果打分>200)，or 化疗only(biomarker negative<200).-》
果然有效。
so 这一组biomarker可以用于Cetuximab的病人选择及预测。
so 准备好money,再开展工作。
【在 m*****n 的大作中提到】
:
: 那筛出这个或者这组biomarker的可能性有多大？
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n******e
发帖数: 110 | 7 我想既然是免疫疗法，那么靶分子在患者的免疫反应反应中应该会有表现。我想要是能
够比较全面的分析体内循环抗体的profile（这个怎么用中文讲呢？），然后比较有反
应的患者和无反应患者的差异，应该能够发现一些抗体生物标记吧 |
M*P
发帖数: 6456 | 8 你这个是作业题么？
【在 m*****n 的大作中提到】
: 问大家一个问题：
: 公司想开发一个癌症免疫疗法，已经知道，该疗法的临床效果不好，只有15~20%的反应
: 率（含完全治愈和部分治愈）；和目前已经上市的小分子靶向药物相比，后者能暂时延
: 缓癌症的发展，但不能治愈，如长期使用的话，就会产生抗药性导致药物失效。
: 我们打算在开发该疗法的同时，开发一种配套的检测试剂盒，对入组的患者进行初步筛
: 选，以期筛查对该疗法敏感的患者，这样的临床试验效果会更好。具体是打算从癌症患
: 者的肿瘤组织和血液免疫细胞同时着手，通过体外试验进行biomarker的筛选。
: 大家看看，这个方案的成功率有多大？
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g****0
发帖数: 425 | 9 我想成功率在于对于这个疗法的机理研究程度。用回顾性方法找出一堆biomarker相对
容易，但是前瞻性验证就很难。总的来说成功率不大。但是，可以分两步走，先找可能
的biomarker来“骗”钱，然后再找多人同时合作验证。有时候，"成功"要自己定义。
【在 m*****n 的大作中提到】
: 问大家一个问题：
: 公司想开发一个癌症免疫疗法，已经知道，该疗法的临床效果不好，只有15~20%的反应
: 率（含完全治愈和部分治愈）；和目前已经上市的小分子靶向药物相比，后者能暂时延
: 缓癌症的发展，但不能治愈，如长期使用的话，就会产生抗药性导致药物失效。
: 我们打算在开发该疗法的同时，开发一种配套的检测试剂盒，对入组的患者进行初步筛
: 选，以期筛查对该疗法敏感的患者，这样的临床试验效果会更好。具体是打算从癌症患
: 者的肿瘤组织和血液免疫细胞同时着手，通过体外试验进行biomarker的筛选。
: 大家看看，这个方案的成功率有多大？
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m*****n
发帖数: 5245 | 10
抗体标记估计很难找。
如果收集患者的血清，进行cytokine/chemokine的profiling，
同时，收集患者的PBMC，通过FACS进行免疫细胞表面标记的profiling；然后用相关的
免疫药物处理，通过PCR分析cytokine/chemokine的表达差异，这样的immuno-
profiling是不是也可行？
【在 n******e 的大作中提到】
: 我想既然是免疫疗法，那么靶分子在患者的免疫反应反应中应该会有表现。我想要是能
: 够比较全面的分析体内循环抗体的profile（这个怎么用中文讲呢？），然后比较有反
: 应的患者和无反应患者的差异，应该能够发现一些抗体生物标记吧
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m*****n
发帖数: 5245 | 11
biomarker
你的方案很好，可惜太花银子了。
而且现在的化疗也有效，如果筛不出来，就开临床，这么低的反应率（CR+PR），估计
伦理学就通不过。
【在 i*******n 的大作中提到】
: 这个东西不是那么容易做的。
: 提出hypothesis很容易，test起来很花钱。
: 和你的药物的作用机理有关系。
: 找biomarker方法很多，microarray, RNA seq, metabolomics,还是dependent on
: mechanism of action.
: 先做回顾性数据：
: 如Cetuximab，BMS取了两组病人，response好的和不好的病人的tumor sample
: ->microarray->找到一堆相关的gene->QPCR quantitation
: 看和疗效的统计相关性
: 然后再做前瞻性实验：
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b****r
发帖数: 17995 | |
n******e
发帖数: 110 | 13 那么直接用抗体的profile来作为生物标记呢？用单个的抗原作为生物标记特异性确实
比较低。如果直接用整个血液中的抗体的profile来区分不同的患者是不是有很大的可
能找到特意的profile？
而且这个不需要很复杂的操作流程，直接用收集不同的血清样本然后在芯片上做
profile分析，最后用另一组临床样品来检测就可以了。
【在 m*****n 的大作中提到】
:
: biomarker
: 你的方案很好，可惜太花银子了。
: 而且现在的化疗也有效，如果筛不出来，就开临床，这么低的反应率（CR+PR），估计
: 伦理学就通不过。
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s*****g
发帖数: 7857 | 14 clinical trail的病人也是要筛选的...只有符合条件的才可以加入.. |
s*****0
发帖数: 357 | 15 其它endpoint(比如Survival)的结果好么？ 传统定义的PR和CR未必能很好地反应
immunotherapy的疗效
【在 m*****n 的大作中提到】
: 问大家一个问题：
: 公司想开发一个癌症免疫疗法，已经知道，该疗法的临床效果不好，只有15~20%的反应
: 率（含完全治愈和部分治愈）；和目前已经上市的小分子靶向药物相比，后者能暂时延
: 缓癌症的发展，但不能治愈，如长期使用的话，就会产生抗药性导致药物失效。
: 我们打算在开发该疗法的同时，开发一种配套的检测试剂盒，对入组的患者进行初步筛
: 选，以期筛查对该疗法敏感的患者，这样的临床试验效果会更好。具体是打算从癌症患
: 者的肿瘤组织和血液免疫细胞同时着手，通过体外试验进行biomarker的筛选。
: 大家看看，这个方案的成功率有多大？
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b****r
发帖数: 17995 | 16 抗体如何做profile，如果不改变抗体水平呢，只改变一些小分子抗原水平
【在 n******e 的大作中提到】
: 那么直接用抗体的profile来作为生物标记呢？用单个的抗原作为生物标记特异性确实
: 比较低。如果直接用整个血液中的抗体的profile来区分不同的患者是不是有很大的可
: 能找到特意的profile？
: 而且这个不需要很复杂的操作流程，直接用收集不同的血清样本然后在芯片上做
: profile分析，最后用另一组临床样品来检测就可以了。
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c******r
发帖数: 3778 | 17 这个吧，不知道你的具体疗法很难给出比较有针对性的建议啊
一般来说都是测target。你的药target是什么总知道吧。至少这个target在病人中要有
表达。当然也可以定义表达高低。
如果实在不知道，那就要看你的药物是什么性质的。比如吧是个kinase inhibitor，那
大概可以profiling一些重要的肿瘤基因的phosphorylation。然后对比敏感和不敏感的
病人的profile。建立一个signature的profile。有这些signature就敏感，或者没有哪
些signature就敏感。这个要看具体结果。当然这里面还有些技术细节要考虑。
如果连什么性质都不知道，那就太盲目了。profiling也不是不可能有帮助，但是是否
能够建立一个有效的筛选手段就比较难以确定。这时候要看你的具体project怎么考虑
。如果有钱，那可以继续尝试，比如RNA，protein等等的array都可以尝试。但是如果
公司不想负担这个费用，那就没有选择了。
所以最靠谱，有效的办法，是找到target
【在 m*****n 的大作中提到】
: 问大家一个问题：
: 公司想开发一个癌症免疫疗法，已经知道，该疗法的临床效果不好，只有15~20%的反应
: 率（含完全治愈和部分治愈）；和目前已经上市的小分子靶向药物相比，后者能暂时延
: 缓癌症的发展，但不能治愈，如长期使用的话，就会产生抗药性导致药物失效。
: 我们打算在开发该疗法的同时，开发一种配套的检测试剂盒，对入组的患者进行初步筛
: 选，以期筛查对该疗法敏感的患者，这样的临床试验效果会更好。具体是打算从癌症患
: 者的肿瘤组织和血液免疫细胞同时着手，通过体外试验进行biomarker的筛选。
: 大家看看，这个方案的成功率有多大？
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