confocal tile scan的问题 - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - confocal tile scan的问题

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话题: tile话题: confocal话题: scan话题: 问题话题: 断裂

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t******k 发帖数: 599	1 用tile scan扫40x的图像，为啥出来的每个tile之间总是有很明显的断裂，于是拼接出来的图片都很丑，有人知道这是什么原因吗？
c********r 发帖数: 189	2 tilescan 是这样的，可以设置overlap，一般用5%，但是我觉得0%最好，你可以试试
Z****9 发帖数: 738	3 你的pixel size 矫正了没？如果矫正了，用10% overlap，不会出现明显的断裂，但是边缘会比中间稍微暗一点【在 t******k 的大作中提到】 : 用tile scan扫40x的图像，为啥出来的每个tile之间总是有很明显的断裂，于是拼接出 : 来的图片都很丑，有人知道这是什么原因吗？
w********y 发帖数: 288	4 我们显微镜也这样，据我经验不是软件问题，最有可能是你的镜头太大，碰到边上 stage了。比如你扫的中心区已经在slide或chamber边缘了，当整个stage继续朝四周移动的时候，镜头会碰到stage。解决方法就是确保你扫的区域一定在最中心。

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