除了3'RACE还有什么办法验证目的基因的终止位点 - Biology版

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Biology版 - 除了3'RACE还有什么办法验证目的基因的终止位点

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W*****o
发帖数: 1780

发现以前annotate的一组基因有错，有提前终止的stop condon.
但基因是intronless的，表达量很低，用RNAseq只检测到少数几个，都证实了有提前终
止的stop condon。为了拿出更多的证据，觉得需要做3‘RACE，但基因表达量太低而且
可能根本不表达，除此之外还有什么好办法证明有提前的终止位点。一般的RT-PCR是没
有办法排除DNA污染导致的PCR产物（intronless)。

w******x
发帖数: 252

这种受调控的基因，只能在一定的stress下或mutant里面做了。

【在 W*****o 的大作中提到】

: 发现以前annotate的一组基因有错，有提前终止的stop condon.
: 但基因是intronless的，表达量很低，用RNAseq只检测到少数几个，都证实了有提前终
: 止的stop condon。为了拿出更多的证据，觉得需要做3‘RACE，但基因表达量太低而且
: 可能根本不表达，除此之外还有什么好办法证明有提前的终止位点。一般的RT-PCR是没
: 有办法排除DNA污染导致的PCR产物（intronless)。

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