l*****i 发帖数: 1163 | 1 1,2,3使用10m细胞,Covaris超声30min,三个样品的Bioanalyzer Ultra Sensitive
DNA分析图谱。
4,5,6是对应于1,2,3,使用Millipore的Magana Chip kit,抗体CHIP后得到的结果。
请问为什么会得到这么烂的CHIP DNA?
超声片段的图谱有问题么(大小在300-400之间)?
多谢 |
l*****i 发帖数: 1163 | 2 附件
Sensitive DNA分析图谱。
果。 |
k*****n 发帖数: 323 | 3 1-3,我没用过covaris,而且检测sonication效果的话一般都是琼脂糖胶。不过根据
你的bioanalyzer的结果,如果是library preparation之前的话,size偏大且范围偏窄
。这不是个好兆头。如果是pcr后的文库的话,大小还算合适
至于4-6,chip下来的dna量太少,没有任何检测size的意义。 |
l*****i 发帖数: 1163 | 4 1-3是刚刚Sonication之后的DNA(冻在-80有一个星期)。条带太大,可以延长
Sonication时间么?范围窄要怎么解决?多谢!
CHIP下来的DNA太少是不是基本没救了?我用的是Millipore的CHIP Magana kit,是不
是被坑了?
【在 k*****n 的大作中提到】 : 1-3,我没用过covaris,而且检测sonication效果的话一般都是琼脂糖胶。不过根据 : 你的bioanalyzer的结果,如果是library preparation之前的话,size偏大且范围偏窄 : 。这不是个好兆头。如果是pcr后的文库的话,大小还算合适 : 至于4-6,chip下来的dna量太少,没有任何检测size的意义。
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k*****n 发帖数: 323 | 5 1-3,重新跑个电泳胶吧
4-6,chip本来拉下来的dna就少,没有检测size的意义 |