K**R
发帖数: 193 | 1 最近我们研究一个基因是不是在不同组织中有特异splicing， 我首先用Ensembl 查看
后有个7个prediction。 这种情况怎么做呢？ 不知道有哪位大侠有经验？
两外我们已经用western测试过了，确实有不同条带在不同组织。
谢谢！ |
m******5
发帖数: 1383 | 2 5'RACE
3'RACE
Junction PCR
Western
insitu
不过就算表达pattern确实有变化如果无法做function也白搭 |
s*****3
发帖数: 20 | 3 My 2 cents:
Try RT-PCR, easy to do and easy to get answers. You can use the 7 predicted
variants in Ensembl as guidance to design your two primers. The handbook
in the link below is a good reference.
http://www.qiagen.com/Products/Catalog/Assay-Technologies/End-P |
K**R
发帖数: 193 | 4 谢谢， 那southern 能用不？
【在 m******5 的大作中提到】
: 5'RACE
: 3'RACE
: Junction PCR
: Western
: insitu
: 不过就算表达pattern确实有变化如果无法做function也白搭
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K**R
发帖数: 193 | 5 谢谢！，
我已经有cDNA了，但是设计引物是需要prediction很全，目前分析好像里面的
prediction不全似乎
predicted
【在 s*****3 的大作中提到】
: My 2 cents:
: Try RT-PCR, easy to do and easy to get answers. You can use the 7 predicted
: variants in Ensembl as guidance to design your two primers. The handbook
: in the link below is a good reference.
: http://www.qiagen.com/Products/Catalog/Assay-Technologies/End-P
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m******5
发帖数: 1383 | 6 RNA是northern
建议先做PCR based的方法吧。 简单得多
【在 K**R 的大作中提到】
: 谢谢， 那southern 能用不？
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w***z
发帖数: 1158 | 7 Cancer Immunol Immunother. 2013 Mar;62(3):423-35. doi: 10.1007/s00262-012-
1325-2. Epub 2012 Sep 2.
【在 K**R 的大作中提到】
: 最近我们研究一个基因是不是在不同组织中有特异splicing， 我首先用Ensembl 查看
: 后有个7个prediction。 这种情况怎么做呢？ 不知道有哪位大侠有经验？
: 两外我们已经用western测试过了，确实有不同条带在不同组织。
: 谢谢！
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K**R
发帖数: 193 | 8 谢谢楼上朋友
【在 w***z 的大作中提到】
: Cancer Immunol Immunother. 2013 Mar;62(3):423-35. doi: 10.1007/s00262-012-
: 1325-2. Epub 2012 Sep 2.
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