w***z
发帖数: 1158 | 1 箭头所指峰在处理前后C 与T的差别是否有意义？ 还是测续信号问题？ 感谢。
红峰为T，蓝峰为C. |
s******s
发帖数: 13035 | 2 你这个啥呀，methylation?
【在 w***z 的大作中提到】
: 箭头所指峰在处理前后C 与T的差别是否有意义？ 还是测续信号问题？ 感谢。
: 红峰为T，蓝峰为C.
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w***z
发帖数: 1158 | 3 提取处理前后样品的DNA，PCR扩增相应片断后作的测序分析。没做过methylation方面
的研究。
【在 s******s 的大作中提到】
: 你这个啥呀，methylation?
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s******s
发帖数: 13035 | 4 就是有区别啊。你想问啥来着
【在 w***z 的大作中提到】
: 提取处理前后样品的DNA，PCR扩增相应片断后作的测序分析。没做过methylation方面
: 的研究。
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w***z
发帖数: 1158 | 5 处理后methylation发生了改变？
【在 s******s 的大作中提到】
: 就是有区别啊。你想问啥来着
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l******g
发帖数: 1623 | 6 是mix.如果怕死测试问题，你可以TA克隆你的PCR产物，从单个菌落里面提plasmid,分
别测序，测几百个的话，还能大致知道突变的比例
【在 w***z 的大作中提到】
: 箭头所指峰在处理前后C 与T的差别是否有意义？ 还是测续信号问题？ 感谢。
: 红峰为T，蓝峰为C.
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w***z
发帖数: 1158 | |
u*********1
发帖数: 2518 | 8 从我个人的经验来说，
我觉得肯定是很明显的差别
当然不爽的是有点noise，不是那么clean。当然我不知道你是在做啥
【在 w***z 的大作中提到】
: 箭头所指峰在处理前后C 与T的差别是否有意义？ 还是测续信号问题？ 感谢。
: 红峰为T，蓝峰为C.
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w***z
发帖数: 1158 | 9 小鼠体内某组织诱发癌变。 不同个体，不同批次PCR，甚至克隆化后，DNA测序得类似
结果,都有同样的noise。
其实我想观察的是另一个位点，结果没变化。这个有变化的在它上游一点。
【在 u*********1 的大作中提到】
: 从我个人的经验来说，
: 我觉得肯定是很明显的差别
: 当然不爽的是有点noise，不是那么clean。当然我不知道你是在做啥
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u*********1
发帖数: 2518 | 10 我个人是觉得你这里的变化是significant的
当然了，一般我都是forward和reverse两个方向都测；多测几次如果都是这种变化，就
应该可信吧
【在 w***z 的大作中提到】
: 小鼠体内某组织诱发癌变。 不同个体，不同批次PCR，甚至克隆化后，DNA测序得类似
: 结果,都有同样的noise。
: 其实我想观察的是另一个位点，结果没变化。这个有变化的在它上游一点。
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b****r
发帖数: 17995 | 11 真要发表，恐怕sanger是不行的，这个定量太不靠谱
Pyro可能是比较经典的办法 |
l**********1
发帖数: 5204 | 12 Sure LZ try Pyro then submit MS to N biotech
Btw, if has clinical data (i mean human data not rat/mice) as same SNP proof
after one treatment,might can try Lancet Oncology or similar clinical
medicine journal.
【在 b****r 的大作中提到】
: 真要发表，恐怕sanger是不行的，这个定量太不靠谱
: Pyro可能是比较经典的办法
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w***z
发帖数: 1158 | 13 谢谢楼上两位的回复。目前这只是个偶然发现，还不知道有啥意义，离发表似乎还很远
。呵呵。 |
