s********3
发帖数: 231 | | s******y
发帖数: 28562 | 2 我觉得很有前途。但是目前领域里很多东西都还莫名其妙，大家都在瞎做，表面性的文
章很多，可重复的，根本性或者说原则性的成就还不多。不过也正是因为这样，这个是
一个很有前途的，有可能产生突破的一个领域。
【在 s********3 的大作中提到】
: 大家对这个交叉领域有什么看法呢？
| s********3
发帖数: 231 | 3 谢谢sunnyday点评哈，刚接触不久，觉得挺有意思的交叉领域。工科、化学物理的背景
的人完全通过这个视角进入生物领域。
【在 s******y 的大作中提到】
: 我觉得很有前途。但是目前领域里很多东西都还莫名其妙，大家都在瞎做，表面性的文
: 章很多，可重复的，根本性或者说原则性的成就还不多。不过也正是因为这样，这个是
: 一个很有前途的，有可能产生突破的一个领域。
| d*****n
发帖数: 166 | 4 和cell motility比哪个好点
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8
【在 s******y 的大作中提到】
: 我觉得很有前途。但是目前领域里很多东西都还莫名其妙，大家都在瞎做，表面性的文
: 章很多，可重复的，根本性或者说原则性的成就还不多。不过也正是因为这样，这个是
: 一个很有前途的，有可能产生突破的一个领域。
| s***e
发帖数: 911 | | s******y
发帖数: 28562 | 6 也不完全是，cell motiliy里面偏生化的那一块已经快完蛋了，主要是容易做的都快做
完了，而太难做的目前的技术又不到位做不下去，已经没有什么令人兴奋的突破口了，
很多文章一看题目就知道整个故事了，很多人在靠系统生物学来编故事来勉强度日。
cell motiliy里面偏生物物理的那一块和mechanotransduction有很大重合，几乎就是
同一个题材。对于这个领域其实你才是行家，多点评几句吧。
我的感觉是mechanotransduction和蛋白结构以及各种信号通道都相关，相关的受体的
可逆性和flexibility很强，而且很多结论都要依赖动态模拟才能make sense, 但是瞎
做的人和瞎下结论的人很多。
【在 s***e 的大作中提到】
: 这是同一个领域。
| s***e
发帖数: 911 | 7 其实试验上最近突破挺大的。最近有两篇文章几乎同时出来(PNAS; Naure
Communication), 关于in vitro formin如何感应力并调控actin生长速度。不知道你看
到没有。in vivo 也有很大进展。Sheetz组现在能够直接in vivo 测量 focal
adhesion protein的end-to-end distance. 其中talin的工作去年已经发表在PLoS
Biology上。 今年会有一系列别的蛋白的结果出来。会非常有趣。
in vitro adhesion protein如何感受机械力，如何unfold, 如何因此和别的signaling
protein相互作用把机械力信息转化成生化反应信号传递，今年会有一系列工作出来，
包括talin-vinculin, alpha-actenin - vinculin, 等。
上面这些全部都是直接单分子测量，和模拟无关。 我觉得你说得挺对的。这个方向似
乎很快就会有很大突破。 | d*****r
发帖数: 2583 | 8 如果将来想做纯学术的话，这是一个活跃的领域, 不过也是一个很老的领域。
signaling
【在 s***e 的大作中提到】
: 其实试验上最近突破挺大的。最近有两篇文章几乎同时出来(PNAS; Naure
: Communication), 关于in vitro formin如何感应力并调控actin生长速度。不知道你看
: 到没有。in vivo 也有很大进展。Sheetz组现在能够直接in vivo 测量 focal
: adhesion protein的end-to-end distance. 其中talin的工作去年已经发表在PLoS
: Biology上。 今年会有一系列别的蛋白的结果出来。会非常有趣。
: in vitro adhesion protein如何感受机械力，如何unfold, 如何因此和别的signaling
: protein相互作用把机械力信息转化成生化反应信号传递，今年会有一系列工作出来，
: 包括talin-vinculin, alpha-actenin - vinculin, 等。
: 上面这些全部都是直接单分子测量，和模拟无关。 我觉得你说得挺对的。这个方向似
: 乎很快就会有很大突破。
| s******y
发帖数: 28562 | 9 哦，我还没有注意到那两篇formin的文章，谢谢你告诉我啊！
Sheetz组挺厉害的，很多他在做的事情都是我以前想做但是没有能力做的。
signaling
【在 s***e 的大作中提到】
: 其实试验上最近突破挺大的。最近有两篇文章几乎同时出来(PNAS; Naure
: Communication), 关于in vitro formin如何感应力并调控actin生长速度。不知道你看
: 到没有。in vivo 也有很大进展。Sheetz组现在能够直接in vivo 测量 focal
: adhesion protein的end-to-end distance. 其中talin的工作去年已经发表在PLoS
: Biology上。 今年会有一系列别的蛋白的结果出来。会非常有趣。
: in vitro adhesion protein如何感受机械力，如何unfold, 如何因此和别的signaling
: protein相互作用把机械力信息转化成生化反应信号传递，今年会有一系列工作出来，
: 包括talin-vinculin, alpha-actenin - vinculin, 等。
: 上面这些全部都是直接单分子测量，和模拟无关。 我觉得你说得挺对的。这个方向似
: 乎很快就会有很大突破。
| s********n
发帖数: 2939 | 10 Academic应该有吧，industrial够呛
【在 s********3 的大作中提到】
: 大家对这个交叉领域有什么看法呢？
| P****d
发帖数: 564 | 11 这一层突破之后要做什么？
signaling
【在 s***e 的大作中提到】
: 其实试验上最近突破挺大的。最近有两篇文章几乎同时出来(PNAS; Naure
: Communication), 关于in vitro formin如何感应力并调控actin生长速度。不知道你看
: 到没有。in vivo 也有很大进展。Sheetz组现在能够直接in vivo 测量 focal
: adhesion protein的end-to-end distance. 其中talin的工作去年已经发表在PLoS
: Biology上。 今年会有一系列别的蛋白的结果出来。会非常有趣。
: in vitro adhesion protein如何感受机械力，如何unfold, 如何因此和别的signaling
: protein相互作用把机械力信息转化成生化反应信号传递，今年会有一系列工作出来，
: 包括talin-vinculin, alpha-actenin - vinculin, 等。
: 上面这些全部都是直接单分子测量，和模拟无关。 我觉得你说得挺对的。这个方向似
: 乎很快就会有很大突破。
| s***e
发帖数: 911 | 12 我背景不是生物的，所以观点可能不太全面。基本上这些研究强调的是机械力在细胞生
物学里的重要性。力的重要性在之前细胞生物学里似乎强调不足。比如这篇文章:
A. Engler, S. Sen, H.L. Sweeney, D.E. Discher. Matrix elasticity directs
stem cell lineage specification. Cell 126:677-689 (2006)
指出extraceluular matrix的物理硬度单一原因就能够决定干细胞分化方向。那么细胞
必须具有测量外部环境力学性质的能力。物理上这只有一种办法可以作到: 对外部环境
施加力，测量外部环境的力学形变。所以有一些细胞膜附近的蛋白必须具有类似弹簧的
功能，比较自己和外部环境受力下的相对形变，探测外部环境的力学性质。此外，这些
局部的力学探测必须导致细胞内的信号传递，否则这些力学信息就无法影响细胞整体行
为。最简单的方案是force sensing蛋白受力形变，影响自己和其它signaling蛋白的相
互作用, 实现force sensing.
P. Kanchanawong, G. Shtengel, A. Pasapera-Limon, E. Ramko, M.W. Davidson, H.
F. Hess, C. M. Waterman. “Nanoscale Architecutre of Integrin-based
Adhesions”, Nature, 468(7323): 580-4, 2010.
上面这篇文章用三位超分辨显微镜技术， 指出在focal adhesion sites, actin末端到
跨膜蛋白integrin之间还有大概40 nm的空间。这个空间必须由各种focal adhesion
proteins填充，才能把actin联接到膜上。这些蛋白都受actomyosin force, 都有可能
是force sensing protein.
talin已经被Sheetz组证明，当12 pN的力施加到talin两端时，vinculin binding就被
激发了。
del Rio, A., R. Perez-Jimenez, R. Liu, P. Roca-Cusachs, J.M. Fernandez, and
M.P. Sheetz. 2009. Stretching single talin rod molecules activates vinculin
binding. Science. 323:638-41
类似的研究包括alpha-catenin - vinculin作用，以及其它一些adhesion proteins 与
各种sigaling proteins的相互作用。今年会有不少相关文章出来。
所以从上面的层面来讲，force-sensing是个理解比较少的，基础重要的生物问题。非
常适合交叉学科背景的人。应用层面上来说，我觉得任何针对focal adhesion protein
的药物设计， 恐怕从drug screening这一步就必须在蛋白受力的条件下进行。以talin
为例。talin rod和vinculin head相互作用强度大概是 micro molar range (kD). 但
是talin受一点力(一两个myosin motor提供的力的范围)，kd就降到 1 nM量级了。 | d***y
发帖数: 8107 | |
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