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Biology版 - 分子克隆高手进来看看
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话题: 克隆话题: 载体话题: 片段话题: ligation话题: 连接
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1 (共1页)
c*****8
发帖数: 49
1
正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
,都不成功。
都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
,但酶切鉴定也不对。
现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。
M******g
发帖数: 152
2
Try Gibson Assembly plus NEB 10 beta competent cells from NEB. I now use
Gibson Assembly to do all of my cloning work. Very easy, and none of them
failed.
Good luck.
p*****e
发帖数: 93
3
再找一个酶切位点,分步克隆上去。载体和基因大小太接近。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

n****3
发帖数: 543
4
你要对载体去磷酸化,我克隆了3kb到27kb的载体内通过notI, 挑了5个有3个是, 测
序鉴定没有问题
s*****i
发帖数: 315
5
你的载体片段多大?如果载体片段5~7k,几乎不可能得到养性克隆,最好载体和
insert的大小差距比较大,这样容易连接成功。
如果出现载体跟insert差不多大小的情况,最好分段克隆上去,或是用Gibson
Assembly

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

k*****n
发帖数: 323
6
我不是高手,但是这方法简单靠谱

【在 n****3 的大作中提到】
: 你要对载体去磷酸化,我克隆了3kb到27kb的载体内通过notI, 挑了5个有3个是, 测
: 序鉴定没有问题

d****i
发帖数: 2346
7
在你的insert中间切一刀,变成两个小段,然后和6k的vector连接,triple-ligation
a*****1
发帖数: 3134
8
这招太损了。

ligation

【在 d****i 的大作中提到】
: 在你的insert中间切一刀,变成两个小段,然后和6k的vector连接,triple-ligation
: 。

x**2
发帖数: 255
9
我最近在做triple ligation,试过不同的insert1:insert2:vector ratio(1:1:1,
3:3:1和6:6:1)但是都不成功。请问有什么诀窍么?
我的insert已经克隆到其他vector了,所以我知道双酶切没有问题。同样我也知道双酶
切的vector没有问题。在连接体系中我的dna浓度是150ng/20ul,之后16度用NEB的T4连
接酶过夜后转化到学校自己生产的DH5alpha competant cell中,有过几个菌落,但都
不是想要的。
请问有什么诀窍么?
谢谢!
我现在只好先连接上一个片段,再连另一个了。

ligation

【在 d****i 的大作中提到】
: 在你的insert中间切一刀,变成两个小段,然后和6k的vector连接,triple-ligation
: 。

b******n
发帖数: 4225
10
什么学校还有自产的DH5alpha competant cell啊?

【在 x**2 的大作中提到】
: 我最近在做triple ligation,试过不同的insert1:insert2:vector ratio(1:1:1,
: 3:3:1和6:6:1)但是都不成功。请问有什么诀窍么?
: 我的insert已经克隆到其他vector了,所以我知道双酶切没有问题。同样我也知道双酶
: 切的vector没有问题。在连接体系中我的dna浓度是150ng/20ul,之后16度用NEB的T4连
: 接酶过夜后转化到学校自己生产的DH5alpha competant cell中,有过几个菌落,但都
: 不是想要的。
: 请问有什么诀窍么?
: 谢谢!
: 我现在只好先连接上一个片段,再连另一个了。
:

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分子生物学问题求救大片段连接求教
TA 克隆克隆小贴示。
原核表达蛋白的毒性问题克隆失败了
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y******s
发帖数: 92
11
太扯了
triple-ligation的难度提高10倍吧

ligation

【在 d****i 的大作中提到】
: 在你的insert中间切一刀,变成两个小段,然后和6k的vector连接,triple-ligation
: 。

y******s
发帖数: 92
12
这个就是片段太大转化效率低的问题
去买个10^9的超级感受态细胞,你的问题立马解决

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

H*******i
发帖数: 196
13
和酶有关,常用酶(可以片段自连),差不多是这样
如果末端是4个碱基且非反向互补,三片段效率还是很高的。

【在 y******s 的大作中提到】
: 太扯了
: triple-ligation的难度提高10倍吧
:
: ligation

y******s
发帖数: 92
14
原帖的意思是,把一个完整的片段中间切一刀,再用酶把它连成完整片段做克隆,因此
可以提高成功率
我感觉要么就是开玩笑(unlikely),要么就是完全不知道克隆的原理

【在 H*******i 的大作中提到】
: 和酶有关,常用酶(可以片段自连),差不多是这样
: 如果末端是4个碱基且非反向互补,三片段效率还是很高的。

y*****5
发帖数: 567
15
你自己的载体上这两个酶切位点挨得近不近?如果是相邻的两个,那么有一个酶没有切
开。要换酶。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

y*****5
发帖数: 567
16
哦,楼上有人说的对10K以上的话,要用电转化法,或买高效的转化态细胞。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

l******a
发帖数: 3339
17
顶礼膜拜一下,幸好你不是我师兄,不然得走多少弯路。

ligation

【在 d****i 的大作中提到】
: 在你的insert中间切一刀,变成两个小段,然后和6k的vector连接,triple-ligation
: 。

d****i
发帖数: 2346
18
既然这么多人抨击我说的triple ligation,有说我损的,有说我不懂克隆的,那我就
收回我说的吧。对不起大家了。
我之所以这么说,是因为我以前也碰到过类似的问题就是这样解决的。
同样大小两个片段连接肯定能连上,但是好不好做成功率多少至少在我手里不好。
再次对大家表示对不起!
m*****z
发帖数: 1451
19
信息量太少了。载体CIP了吗?什么酶切位点?什么载体?酶切鉴定怎么不对?可能性
太多啦。
我做过9kb+9kb的平末端连接,PUC vector和lentiviral vector都做过,转的是自己做
的感受态,都没有问题。载体要CIP干净,连接要过夜,比例1:1左右。其他没有了。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

m*****z
发帖数: 1451
20
又是一个。。。克隆不是自己想要的,到底怎么不是?即使是失败的实验也可以告诉你
很多东西的。

【在 x**2 的大作中提到】
: 我最近在做triple ligation,试过不同的insert1:insert2:vector ratio(1:1:1,
: 3:3:1和6:6:1)但是都不成功。请问有什么诀窍么?
: 我的insert已经克隆到其他vector了,所以我知道双酶切没有问题。同样我也知道双酶
: 切的vector没有问题。在连接体系中我的dna浓度是150ng/20ul,之后16度用NEB的T4连
: 接酶过夜后转化到学校自己生产的DH5alpha competant cell中,有过几个菌落,但都
: 不是想要的。
: 请问有什么诀窍么?
: 谢谢!
: 我现在只好先连接上一个片段,再连另一个了。
:

相关主题
问个分子克隆的问题,求助大拿...大家都用什么免费软件来替代 Vector NTi 啊?
再问gateway cloning大家克隆promoter都用什么方法?谢谢!
KpnI 和HindIII 没什么特殊的吧Re: who makes the Competent cell called NM522?
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z**********1
发帖数: 3
21
问题解决了么?

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

s*****i
发帖数: 315
22
我挺你,我经常做三段连,成功率非常高;有两次做过四段连,虽然得到我想要的,但
是效率低,就放弃了。楼主做不出来的根本原因是载体和插入片段大小一样,你是明眼
人,看出问题所在了。不要理会别人的议论。

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

【在 d****i 的大作中提到】
: 既然这么多人抨击我说的triple ligation,有说我损的,有说我不懂克隆的,那我就
: 收回我说的吧。对不起大家了。
: 我之所以这么说,是因为我以前也碰到过类似的问题就是这样解决的。
: 同样大小两个片段连接肯定能连上,但是好不好做成功率多少至少在我手里不好。
: 再次对大家表示对不起!

s*****i
发帖数: 315
23
为什么说做三段连就不懂分子克隆原理?

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

【在 y******s 的大作中提到】
: 原帖的意思是,把一个完整的片段中间切一刀,再用酶把它连成完整片段做克隆,因此
: 可以提高成功率
: 我感觉要么就是开玩笑(unlikely),要么就是完全不知道克隆的原理

b***2
发帖数: 348
24
做过一次5k+4.3k的,做了很长时间都没有做出来,不过最后还是做出来了。
当时的做法是1.增加inert的量,比例做到9:1。
2.16度过夜连接
3.transformation结束后,加lb摇3个小时再铺
c*****8
发帖数: 49
25
正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
,都不成功。
都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
,但酶切鉴定也不对。
现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。
M******g
发帖数: 152
26
Try Gibson Assembly plus NEB 10 beta competent cells from NEB. I now use
Gibson Assembly to do all of my cloning work. Very easy, and none of them
failed.
Good luck.
p*****e
发帖数: 93
27
再找一个酶切位点,分步克隆上去。载体和基因大小太接近。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

n****3
发帖数: 543
28
你要对载体去磷酸化,我克隆了3kb到27kb的载体内通过notI, 挑了5个有3个是, 测
序鉴定没有问题
s*****i
发帖数: 315
29
你的载体片段多大?如果载体片段5~7k,几乎不可能得到养性克隆,最好载体和
insert的大小差距比较大,这样容易连接成功。
如果出现载体跟insert差不多大小的情况,最好分段克隆上去,或是用Gibson
Assembly

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

k*****n
发帖数: 323
30
我不是高手,但是这方法简单靠谱

【在 n****3 的大作中提到】
: 你要对载体去磷酸化,我克隆了3kb到27kb的载体内通过notI, 挑了5个有3个是, 测
: 序鉴定没有问题

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d****i
发帖数: 2346
31
在你的insert中间切一刀,变成两个小段,然后和6k的vector连接,triple-ligation
a*****1
发帖数: 3134
32
这招太损了。

ligation

【在 d****i 的大作中提到】
: 在你的insert中间切一刀,变成两个小段,然后和6k的vector连接,triple-ligation
: 。

x**2
发帖数: 255
33
我最近在做triple ligation,试过不同的insert1:insert2:vector ratio(1:1:1,
3:3:1和6:6:1)但是都不成功。请问有什么诀窍么?
我的insert已经克隆到其他vector了,所以我知道双酶切没有问题。同样我也知道双酶
切的vector没有问题。在连接体系中我的dna浓度是150ng/20ul,之后16度用NEB的T4连
接酶过夜后转化到学校自己生产的DH5alpha competant cell中,有过几个菌落,但都
不是想要的。
请问有什么诀窍么?
谢谢!
我现在只好先连接上一个片段,再连另一个了。

ligation

【在 d****i 的大作中提到】
: 在你的insert中间切一刀,变成两个小段,然后和6k的vector连接,triple-ligation
: 。

b******n
发帖数: 4225
34
什么学校还有自产的DH5alpha competant cell啊?

【在 x**2 的大作中提到】
: 我最近在做triple ligation,试过不同的insert1:insert2:vector ratio(1:1:1,
: 3:3:1和6:6:1)但是都不成功。请问有什么诀窍么?
: 我的insert已经克隆到其他vector了,所以我知道双酶切没有问题。同样我也知道双酶
: 切的vector没有问题。在连接体系中我的dna浓度是150ng/20ul,之后16度用NEB的T4连
: 接酶过夜后转化到学校自己生产的DH5alpha competant cell中,有过几个菌落,但都
: 不是想要的。
: 请问有什么诀窍么?
: 谢谢!
: 我现在只好先连接上一个片段,再连另一个了。
:

y******s
发帖数: 92
35
太扯了
triple-ligation的难度提高10倍吧

ligation

【在 d****i 的大作中提到】
: 在你的insert中间切一刀,变成两个小段,然后和6k的vector连接,triple-ligation
: 。

y******s
发帖数: 92
36
这个就是片段太大转化效率低的问题
去买个10^9的超级感受态细胞,你的问题立马解决

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

H*******i
发帖数: 196
37
和酶有关,常用酶(可以片段自连),差不多是这样
如果末端是4个碱基且非反向互补,三片段效率还是很高的。

【在 y******s 的大作中提到】
: 太扯了
: triple-ligation的难度提高10倍吧
:
: ligation

y******s
发帖数: 92
38
原帖的意思是,把一个完整的片段中间切一刀,再用酶把它连成完整片段做克隆,因此
可以提高成功率
我感觉要么就是开玩笑(unlikely),要么就是完全不知道克隆的原理

【在 H*******i 的大作中提到】
: 和酶有关,常用酶(可以片段自连),差不多是这样
: 如果末端是4个碱基且非反向互补,三片段效率还是很高的。

y*****5
发帖数: 567
39
你自己的载体上这两个酶切位点挨得近不近?如果是相邻的两个,那么有一个酶没有切
开。要换酶。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

y*****5
发帖数: 567
40
哦,楼上有人说的对10K以上的话,要用电转化法,或买高效的转化态细胞。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

相关主题
问个克隆问题TA 克隆
Gibson Cloning求助原核表达蛋白的毒性问题
分子生物学问题求救大片段连接求教
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l******a
发帖数: 3339
41
顶礼膜拜一下,幸好你不是我师兄,不然得走多少弯路。

ligation

【在 d****i 的大作中提到】
: 在你的insert中间切一刀,变成两个小段,然后和6k的vector连接,triple-ligation
: 。

d****i
发帖数: 2346
42
既然这么多人抨击我说的triple ligation,有说我损的,有说我不懂克隆的,那我就
收回我说的吧。对不起大家了。
我之所以这么说,是因为我以前也碰到过类似的问题就是这样解决的。
同样大小两个片段连接肯定能连上,但是好不好做成功率多少至少在我手里不好。
再次对大家表示对不起!
m*****z
发帖数: 1451
43
信息量太少了。载体CIP了吗?什么酶切位点?什么载体?酶切鉴定怎么不对?可能性
太多啦。
我做过9kb+9kb的平末端连接,PUC vector和lentiviral vector都做过,转的是自己做
的感受态,都没有问题。载体要CIP干净,连接要过夜,比例1:1左右。其他没有了。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

m*****z
发帖数: 1451
44
又是一个。。。克隆不是自己想要的,到底怎么不是?即使是失败的实验也可以告诉你
很多东西的。

【在 x**2 的大作中提到】
: 我最近在做triple ligation,试过不同的insert1:insert2:vector ratio(1:1:1,
: 3:3:1和6:6:1)但是都不成功。请问有什么诀窍么?
: 我的insert已经克隆到其他vector了,所以我知道双酶切没有问题。同样我也知道双酶
: 切的vector没有问题。在连接体系中我的dna浓度是150ng/20ul,之后16度用NEB的T4连
: 接酶过夜后转化到学校自己生产的DH5alpha competant cell中,有过几个菌落,但都
: 不是想要的。
: 请问有什么诀窍么?
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z**********1
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问题解决了么?

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

s*****i
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我挺你,我经常做三段连,成功率非常高;有两次做过四段连,虽然得到我想要的,但
是效率低,就放弃了。楼主做不出来的根本原因是载体和插入片段大小一样,你是明眼
人,看出问题所在了。不要理会别人的议论。

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

【在 d****i 的大作中提到】
: 既然这么多人抨击我说的triple ligation,有说我损的,有说我不懂克隆的,那我就
: 收回我说的吧。对不起大家了。
: 我之所以这么说,是因为我以前也碰到过类似的问题就是这样解决的。
: 同样大小两个片段连接肯定能连上,但是好不好做成功率多少至少在我手里不好。
: 再次对大家表示对不起!

s*****i
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47
为什么说做三段连就不懂分子克隆原理?

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

【在 y******s 的大作中提到】
: 原帖的意思是,把一个完整的片段中间切一刀,再用酶把它连成完整片段做克隆,因此
: 可以提高成功率
: 我感觉要么就是开玩笑(unlikely),要么就是完全不知道克隆的原理

b***2
发帖数: 348
48
做过一次5k+4.3k的,做了很长时间都没有做出来,不过最后还是做出来了。
当时的做法是1.增加inert的量,比例做到9:1。
2.16度过夜连接
3.transformation结束后,加lb摇3个小时再铺
s********s
发帖数: 67
49
长波uv
l**********1
发帖数: 5204
50
Mark.

【在 b***2 的大作中提到】
: 做过一次5k+4.3k的,做了很长时间都没有做出来,不过最后还是做出来了。
: 当时的做法是1.增加inert的量,比例做到9:1。
: 2.16度过夜连接
: 3.transformation结束后,加lb摇3个小时再铺

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克隆失败了KpnI 和HindIII 没什么特殊的吧
问个分子克隆的问题,求助大拿...大家都用什么免费软件来替代 Vector NTi 啊?
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i***l
发帖数: 1656
51
i agree these, am using these tricks myself and efficiency is higher.
1.增加inert的量,比例做到9:1。
2.16度过夜连接(16c >=4hr , at least)
3.transformation结束后,加lb摇3个小时再铺 (i usually recover for 2hr)

【在 b***2 的大作中提到】
: 做过一次5k+4.3k的,做了很长时间都没有做出来,不过最后还是做出来了。
: 当时的做法是1.增加inert的量,比例做到9:1。
: 2.16度过夜连接
: 3.transformation结束后,加lb摇3个小时再铺

g*********3
发帖数: 177
52
如果insert和backbone大小一样,我试过1:1的ratio,成功率比较高。。。。
C****n
发帖数: 79
53
不知道你解决了没有。
昨天做了一个类似的,只不过我是5k + 5k
I assume 你gel extraction是干净彻底的
我用的molar ratio 是1:1,我不知道你为什么要用3:1或者其他的。为什么一定要认定
一个是insert,而另一个是plasmid呢,为什么不能换一下?
我用的是NEB的普通T4 DNA ligase, 连接1小时(普通的我一般是连接20min,也值按
照Protocol上说的),因为片段比较大。
I assume 你的感受态是没有问题的。
最后我提醒一下你,有时候酶切验证会失败,原因是不你克隆失败,而是其他原因,比
如甲基化。
Touble-shooting一下,不要漫天考虑太多的因素。
Hope it helps.

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

m*********r
发帖数: 49
54
进来学习一下,
H*********a
发帖数: 133
55
我也常用三片段链接,效果都不错。

【在 s*****i 的大作中提到】
: 我挺你,我经常做三段连,成功率非常高;有两次做过四段连,虽然得到我想要的,但
: 是效率低,就放弃了。楼主做不出来的根本原因是载体和插入片段大小一样,你是明眼
: 人,看出问题所在了。不要理会别人的议论。
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8

m*******t
发帖数: 482
56
克隆做出来了吗?如果还没有,查查是什么载体,如果是RETROVIRUS VE
CTOR就比较讨厌。谁有什么好办法,给俺也说说。俺想插一段四KB的片段进PM
XS-GFP载体,后来没做成就算了。
a*******a
发帖数: 4233
57
我这么做出来过…

【在 y******s 的大作中提到】
: 太扯了
: triple-ligation的难度提高10倍吧
:
: ligation

n****k
发帖数: 516
58
最近经常做差不多大小的片段连接,可以参考下我的条件
1.载体去磷酸化
2.高效率感受态细胞
3.insert:vector大概6:1-9:1
4.足够的DNA,我10ul体系里面大概加100ng
5.我用NEB的连接酶,一般连接RT放一个小时
6.酶切时间不要太长,1-3小时+0.5-1小时载体去磷酸化
7.不要太相信酶切鉴定,我有一个载体,重做了2次,每次酶切位点都突变,可以连进
去,但是切不出来了,建议lz做PCR鉴定之后送测序。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

f**u
发帖数: 346
59
不明白为什么好几个人都说vector和insert大小差不多就不好连,这个有什么讲究吗?
我好像从没注意到有什么区别
x*****e
发帖数: 309
60
看来做cloning 的人还真不少,其实我建议不要纠结于连接了。设计PCR得到5+5=10kb
的片段,注意设计引物的时候5端磷酸化修饰,然后直接T4 ligase连接 10 kb的片段,
相当于自连,容易很多,PCR酶可以用NEB的fusion,说明书上说可以扩增22kb的片段。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

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C**S
发帖数: 522
61
刚做了一个retroviral plasmid,5k的载体,6k的基因,大概1:1比例,室温连接6个
小时,转化top10,筛了几个克隆,全都对。不知道你的问题出在哪里。

【在 c*****8 的大作中提到】
: 正在做一个克隆,从别人的载体上切下了一个6k的基因,用同样的两个酶切了自己的载
: 体,酶切后的载体也是6k,现在想把这6k的片段克隆到6k的载体里。可是尝试了好多次
: ,都不成功。
: 都是转的top10,比例从3:1,到6:1都试过了,要不就是没有克隆,有时有几个克隆
: ,但酶切鉴定也不对。
: 现在急死了,高手们给点建议啊,感激不尽。

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