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Biology版 - 想问一下,能不能用下代测序测STR来做三体分析?
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相关话题的讨论汇总
话题: str话题: 三体话题: meiosis话题: 测序话题: 下代
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m****e
发帖数: 489
1
有熟悉的说说吧。 非常感谢。
b****r
发帖数: 17995
2
你是说21三体之类的?
下代测序对比较长的trinucleotide repeat之类的测序准确性比较差,加上mapping的
时候因为NGS本身的缺陷也容易出错,所以不是最好的方法。做STR需要准确的话还是用
专门的酶和引物效果比较好
如果测准了,做三体当然是没问题的,事实上我在临床上都碰过几次做STR发现是三体
的情况
m****e
发帖数: 489
3
谢谢大牛指点。 你是做PCR扩增STR么? 另外我不太理解三体的几种情况, 为什么电
泳时有时候是1:1:1, 有时候是2:1,有的时候就1条带? 能给详细解释一下么?

【在 b****r 的大作中提到】
: 你是说21三体之类的?
: 下代测序对比较长的trinucleotide repeat之类的测序准确性比较差,加上mapping的
: 时候因为NGS本身的缺陷也容易出错,所以不是最好的方法。做STR需要准确的话还是用
: 专门的酶和引物效果比较好
: 如果测准了,做三体当然是没问题的,事实上我在临床上都碰过几次做STR发现是三体
: 的情况

b****r
发帖数: 17995
4
我就是说做PCR 扩STR
三种情况分别是
1:1:1 ,多半是因为母亲meiosis I 不分离
2:1 ,多半是母亲meiosis II 不分离
1,不一定是三体,可能就是纯和子,如果仍然是三体,不太容易解释
要讲更清楚,你就要给我付辛苦费了,要打很多字

【在 m****e 的大作中提到】
: 谢谢大牛指点。 你是做PCR扩增STR么? 另外我不太理解三体的几种情况, 为什么电
: 泳时有时候是1:1:1, 有时候是2:1,有的时候就1条带? 能给详细解释一下么?

m****e
发帖数: 489
5
给你发了50个包子。望大牛不吝赐教,或提供一些相关材料。

【在 b****r 的大作中提到】
: 我就是说做PCR 扩STR
: 三种情况分别是
: 1:1:1 ,多半是因为母亲meiosis I 不分离
: 2:1 ,多半是母亲meiosis II 不分离
: 1,不一定是三体,可能就是纯和子,如果仍然是三体,不太容易解释
: 要讲更清楚,你就要给我付辛苦费了,要打很多字

b****r
发帖数: 17995
6
本想让你知难而退,没想到你这么大手笔,内牛满面。。。
找了半天,看到这个文章说得比较清楚,而且有实验data支持,和我的提法很相似的一
句原文“Maintenance of heterozygosity for parental markers in the individual
with trisomy 21 was interpreted as resulting from a meiosis I error, while
reduction to homozygosity was attributed to a meiosis II error. ”
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1684265/pdf/ajhg000

【在 m****e 的大作中提到】
: 给你发了50个包子。望大牛不吝赐教,或提供一些相关材料。
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