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1
(共1页)
f******g
发帖数: 1003
1
我用Nanostring这个技术的到一些数据,在KO细胞里面发现有30个基因表达量有变化。
如图(我只拿5个基因来举例)。
我的问题是,有没有更好的图标来呈现这些数据。想基因芯片的数据那样的heatmap的
图。
谢谢
f******g
发帖数: 1003
2
【在 f******g 的大作中提到】
: 我用Nanostring这个技术的到一些数据,在KO细胞里面发现有30个基因表达量有变化。
: 如图(我只拿5个基因来举例)。
: 我的问题是,有没有更好的图标来呈现这些数据。想基因芯片的数据那样的heatmap的
: 图。
: 谢谢
a******a
发帖数: 283
3
双柱图,一个是普通正常细胞的该基因表达量;紧挨着的柱子表达在KO细胞里的基因表
达量。如何?
f******g
发帖数: 1003
4
这些数值是归一化后结果,即WT的相应值是1
f******g
发帖数: 1003
5
我其实想做一个这样的图,哪位知道什么软件能做吗?
只要输入数值,然后能够生成这样的图
t******k
发帖数: 599
6
同问,之前研究了半天r语言,然后发现完全不会。。。
【在 f******g 的大作中提到】
: 我其实想做一个这样的图,哪位知道什么软件能做吗?
: 只要输入数值,然后能够生成这样的图
j****x
发帖数: 1704
7
heatmap tool实在太多了...
在线的:
CIMminer:
http://discover.nci.nih.gov/cimminer/home.do
本地的:
Heatmap Builder:
http://ashleylab.stanford.edu/tools/tools_synthetic/tools_scripts.html
如果会用一点R,那就更不在话下了
【在 f******g 的大作中提到】
: 我其实想做一个这样的图,哪位知道什么软件能做吗?
: 只要输入数值,然后能够生成这样的图
f******g
发帖数: 1003
8
thanks a lot, I will try both of them
【在 j****x 的大作中提到】
: heatmap tool实在太多了...
: 在线的:
: CIMminer:
http://discover.nci.nih.gov/cimminer/home.do
: 本地的:
: Heatmap Builder:
http://ashleylab.stanford.edu/tools/tools_synthetic/tools_scripts.html
: 如果会用一点R,那就更不在话下了
1
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