由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 用什么样的图标来呈现我的数据
相关主题
Microarray的数据呈现这里有多少人听说过用过nanoString的?
请教Nanostring结果分析求科普nanoString
弱问肿瘤基因表达数据库指定测某些基因的表达水平
征人回国创业(基因测序方向)问一个学术问题: 怎样高通量地测量基因表达水平?
各位觉得nanostring好用吗西雅图生物公司职位内推 (转载)
如何绝对定量mRNA拷贝数?如何一次性测多个蛋白的表达量变化?
请教drug screen中的技术问题我国第一片DNA芯片批准试生产
用RNAseq比较转录组找基因,还有必要做qPCR吗?有趣的计算生物学问题(1):基因芯片的设计
相关话题的讨论汇总
话题: heatmap话题: 数据话题: 图标话题: 呈现话题: ko
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
f******g
发帖数: 1003
1
我用Nanostring这个技术的到一些数据,在KO细胞里面发现有30个基因表达量有变化。
如图(我只拿5个基因来举例)。
我的问题是,有没有更好的图标来呈现这些数据。想基因芯片的数据那样的heatmap的
图。
谢谢
f******g
发帖数: 1003
2


【在 f******g 的大作中提到】
: 我用Nanostring这个技术的到一些数据,在KO细胞里面发现有30个基因表达量有变化。
: 如图(我只拿5个基因来举例)。
: 我的问题是,有没有更好的图标来呈现这些数据。想基因芯片的数据那样的heatmap的
: 图。
: 谢谢

a******a
发帖数: 283
3
双柱图,一个是普通正常细胞的该基因表达量;紧挨着的柱子表达在KO细胞里的基因表
达量。如何?
f******g
发帖数: 1003
4
这些数值是归一化后结果,即WT的相应值是1
f******g
发帖数: 1003
5
我其实想做一个这样的图,哪位知道什么软件能做吗?
只要输入数值,然后能够生成这样的图
t******k
发帖数: 599
6

同问,之前研究了半天r语言,然后发现完全不会。。。

【在 f******g 的大作中提到】
: 我其实想做一个这样的图,哪位知道什么软件能做吗?
: 只要输入数值,然后能够生成这样的图

j****x
发帖数: 1704
7
heatmap tool实在太多了...
在线的:
CIMminer: http://discover.nci.nih.gov/cimminer/home.do
本地的:
Heatmap Builder: http://ashleylab.stanford.edu/tools/tools_synthetic/tools_scripts.html
如果会用一点R,那就更不在话下了

【在 f******g 的大作中提到】
: 我其实想做一个这样的图,哪位知道什么软件能做吗?
: 只要输入数值,然后能够生成这样的图

f******g
发帖数: 1003
8
thanks a lot, I will try both of them

【在 j****x 的大作中提到】
: heatmap tool实在太多了...
: 在线的:
: CIMminer: http://discover.nci.nih.gov/cimminer/home.do
: 本地的:
: Heatmap Builder: http://ashleylab.stanford.edu/tools/tools_synthetic/tools_scripts.html
: 如果会用一点R,那就更不在话下了

1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
有趣的计算生物学问题(1):基因芯片的设计各位觉得nanostring好用吗
[合集] 做个调查,版上有多少人以后想回国发展的?如何绝对定量mRNA拷贝数?
MAQC为基因芯片临床应用打下坚实基础zz请教drug screen中的技术问题
列表下一代生命科学新技术和新仪器,请补充!用RNAseq比较转录组找基因,还有必要做qPCR吗?
Microarray的数据呈现这里有多少人听说过用过nanoString的?
请教Nanostring结果分析求科普nanoString
弱问肿瘤基因表达数据库指定测某些基因的表达水平
征人回国创业(基因测序方向)问一个学术问题: 怎样高通量地测量基因表达水平?
相关话题的讨论汇总
话题: heatmap话题: 数据话题: 图标话题: 呈现话题: ko