高通量测序建库时怎样避免adapter自连 - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 高通量测序建库时怎样避免adapter自连

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e***o 发帖数: 344	1 上次问的那个问题，http://www.mitbbs.com/article_t0/Biology/31880339.html 如果有办法在高通量测序建库时避免adapter自连。也就能解决很大问题。一般建库是DNA片段肖平加A，adapter带T就不会有自连了。但是我的DNA产物是两个NN的末端，所以只能通过adapter不磷酸化来避免自连。但带来的问题是DNA有nick不好扩增。不知各位大侠有什么好的办法没有。谢谢！
N****n 发帖数: 294	2 你的adaptor 5‘端可以采用2’-OH。也就是2‘和3’-OH，相对于通常的3‘和5’-OH 。好像是这样的。你可以问Operon或Sigma的tech support。【在 e***o 的大作中提到】 : 上次问的那个问题，http://www.mitbbs.com/article_t0/Biology/31880339.html : 如果有办法在高通量测序建库时避免adapter自连。 : 也就能解决很大问题。一般建库是DNA片段肖平加A，adapter带T就不会有自连了。但是 : 我的DNA产物是两个NN的末端，所以只能通过adapter不磷酸化来避免自连。但带来的问 : 题是DNA有nick不好扩增。 : 不知各位大侠有什么好的办法没有。谢谢！
c********b 发帖数: 363	3 好像很难完全避免，但是可以用一个resin移除大部分。 http://www.fishersci.com/ecomm/servlet/itemdetail?itemdetail=&# 【在 e***o 的大作中提到】 : 上次问的那个问题，http://www.mitbbs.com/article_t0/Biology/31880339.html : 如果有办法在高通量测序建库时避免adapter自连。 : 也就能解决很大问题。一般建库是DNA片段肖平加A，adapter带T就不会有自连了。但是 : 我的DNA产物是两个NN的末端，所以只能通过adapter不磷酸化来避免自连。但带来的问 : 题是DNA有nick不好扩增。 : 不知各位大侠有什么好的办法没有。谢谢！
e***o 发帖数: 344	4 感谢各位的帮助，那个2’-OH看起来好像很贵的样子哦

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