由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 问个基础的问题, 一般酶保存和反应buffer里面的EDTA的作用是什么?
相关主题
Help me !!!DNase I hypersensitive assay免疫大虾,请教一个细胞表面分子marker的问题
please transfer to Biology. RE:Ng-Ago 重复 (转载)Aspirin怎么溶?
请教buffer里的各种成分作用俺来介绍一把Re: what is DNA shaffling?
EMSA疑问有没有磨细胞的微型管?
怎么研究能进细胞核的蛋白质siRNA做后用Trizol提取RNA
将胞质和核可溶蛋白去掉后,剩下的是些什么蛋白?请推荐好的DNase
pH对蛋白表面电荷的影响请教大家是怎么去除protein里混含的genomic DNA的?
请教buffer里的各种成分作用How can I capture a piece of DNA from genomic DNA?
相关话题的讨论汇总
话题: edta话题: 水解话题: 离子话题: dna话题: 二价
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
x*****o
发帖数: 441
1
很多buffer里面都有EDTA, 它的作用是什么?如果不加会怎么样?
s******y
发帖数: 28562
2
反应溶液里的EDTA一般都是用来chelate 无关的二价以上的金属离子。
如果不加的话有可能会出现非特异反应。
对于保存溶液而言,因为大部分二价以上的金属离子是一种催化剂,本身(或者和蛋白
酶结合之后)会导致蛋白水解。所以要用EDTA来chelate

【在 x*****o 的大作中提到】
: 很多buffer里面都有EDTA, 它的作用是什么?如果不加会怎么样?
j****n
发帖数: 3370
3
Will also kill DNase activity

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.6

【在 s******y 的大作中提到】
: 反应溶液里的EDTA一般都是用来chelate 无关的二价以上的金属离子。
: 如果不加的话有可能会出现非特异反应。
: 对于保存溶液而言,因为大部分二价以上的金属离子是一种催化剂,本身(或者和蛋白
: 酶结合之后)会导致蛋白水解。所以要用EDTA来chelate

i***l
发帖数: 1656
4
虽然上面有回答了。
但是,这些问题都是自己能Google出来的
p****t
发帖数: 18
5
虽然能google出来,但是同样的答案出现在哪里可信度其实是不一样的。在这里出现的
答案以后会成为后来的人google结果的一部分,又何乐而不为呢

【在 i***l 的大作中提到】
: 虽然上面有回答了。
: 但是,这些问题都是自己能Google出来的

g*****n
发帖数: 250
6
上一半说对了。EDTA是用来chelate二价金属离子的.
下一半不对. EDTA不会导致蛋白水解. 加EDTA是一种防范措施。DNA酶需要镁离子。一
旦DNA溶液被DNA酶污染,EDTA可以抑制酶活性。

【在 s******y 的大作中提到】
: 反应溶液里的EDTA一般都是用来chelate 无关的二价以上的金属离子。
: 如果不加的话有可能会出现非特异反应。
: 对于保存溶液而言,因为大部分二价以上的金属离子是一种催化剂,本身(或者和蛋白
: 酶结合之后)会导致蛋白水解。所以要用EDTA来chelate

s******y
发帖数: 28562
7
是不是我说的太confusing了所以你没有看懂?我的意思是二价以上的金属离子会导致
蛋白spontaneous水解。而EDTA 是用来防止这个情况发生的。并不是说EDTA 导致水解
(正好相反)。

【在 g*****n 的大作中提到】
: 上一半说对了。EDTA是用来chelate二价金属离子的.
: 下一半不对. EDTA不会导致蛋白水解. 加EDTA是一种防范措施。DNA酶需要镁离子。一
: 旦DNA溶液被DNA酶污染,EDTA可以抑制酶活性。

s******y
发帖数: 28562
8
另外,对于DNA而言,即使不存在DNA酶,在有足够的二价金属离子的情况下,也是可以
导致水解的。
一般认为DNA酶的作用是把镁离子放在一个最有利的位置从而加快这个水解过程。如果
用一个比方的话,如果说DNA酶是枪,那么镁离子就是子弹。
其实从一个化学的角度来说,大部分酶的作用无非就是把氨基酸侧链上的基团(COOH,
SH, OH,NH3, etc.)或者蛋白结合上的小分子(离子或者有机小分子)放到合适的地方让
他们进行水解或者合成(水解倒过来)反应而已。
比方说什么serine-protease, 无非就是用serine的侧链上的-OH来搞搞氢键什么的来促
进水解而已。
s******y
发帖数: 28562
9
对。

【在 j****n 的大作中提到】
: Will also kill DNase activity
:
: ★ 发自iPhone App: ChineseWeb 8.6

g*****n
发帖数: 250
10
"我的意思是二价以上的金属离子会导致蛋白spontaneous水解。" 这个倒是很新鲜。

【在 s******y 的大作中提到】
: 是不是我说的太confusing了所以你没有看懂?我的意思是二价以上的金属离子会导致
: 蛋白spontaneous水解。而EDTA 是用来防止这个情况发生的。并不是说EDTA 导致水解
: (正好相反)。

x*****o
发帖数: 441
11
呵呵,受教了,多谢上面各位的回答.
还有一个问题就是这个EDTA如果用1mM的浓度,之后再加MgCl2的时候是不是浓度就少了
1mM? 比如加到10mM的MgCl2, 但是实际浓度只有9mM?
一般大家用EDTA都用什么浓度的?
s******y
发帖数: 28562
12

可以粗略的认为大概就是这样子。当然如果要准确的话需要算一个比较麻烦的二元方程。

【在 x*****o 的大作中提到】
: 呵呵,受教了,多谢上面各位的回答.
: 还有一个问题就是这个EDTA如果用1mM的浓度,之后再加MgCl2的时候是不是浓度就少了
: 1mM? 比如加到10mM的MgCl2, 但是实际浓度只有9mM?
: 一般大家用EDTA都用什么浓度的?

x*****o
发帖数: 441
13
I see. 多谢!

程。

【在 s******y 的大作中提到】
:
: 可以粗略的认为大概就是这样子。当然如果要准确的话需要算一个比较麻烦的二元方程。

1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
How can I capture a piece of DNA from genomic DNA?怎么研究能进细胞核的蛋白质
RNA seq 的样品制备问题将胞质和核可溶蛋白去掉后,剩下的是些什么蛋白?
双酶切奇怪条带pH对蛋白表面电荷的影响
Is there any way to separate DNA and proteins but keep the protein activity请教buffer里的各种成分作用
Help me !!!DNase I hypersensitive assay免疫大虾,请教一个细胞表面分子marker的问题
please transfer to Biology. RE:Ng-Ago 重复 (转载)Aspirin怎么溶?
请教buffer里的各种成分作用俺来介绍一把Re: what is DNA shaffling?
EMSA疑问有没有磨细胞的微型管?
相关话题的讨论汇总
话题: edta话题: 水解话题: 离子话题: dna话题: 二价