s******y 发帖数: 17729 | 1 俗称,干的和湿的
前者能写code能分析数据
后者不能写code,分析数据也仅限于现场的软件,而且还是图形界面的,要是用命令行
导入导出数据,就的抓虾,除非人家手把手的教过几条语句,下次还用这几个语句做同
样的事情,经常也需要去水槽电泳槽里捞数据
通常说(从工钱上来说)
干的比较高大上
湿的就比较低端
干的瞧不起湿的,觉得你们不过是搬砖的奴隶搭了个顺风车灌水
,不配叫做做生物信息学的
湿的也瞧不起干的,觉得他们生物啥都不懂,不过是分析数据的工匠,俺们在水槽里动
不动就是捞好几个月,你坐在那里分析几天,文章挂名还想往前窜,没扣就不爽
干湿两头都通的人很少,一般都是生物出身,上岸早的奴隶。
还是那句话,劳心者治人,劳力者治于人 |
s******y 发帖数: 17729 | 2 前几天那个生物信息不靠谱的lz,估计是连湿的都没入门的主儿
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 俗称,干的和湿的 : 前者能写code能分析数据 : 后者不能写code,分析数据也仅限于现场的软件,而且还是图形界面的,要是用命令行 : 导入导出数据,就的抓虾,除非人家手把手的教过几条语句,下次还用这几个语句做同 : 样的事情,经常也需要去水槽电泳槽里捞数据 : 通常说(从工钱上来说) : 干的比较高大上 : 湿的就比较低端 : 干的瞧不起湿的,觉得你们不过是搬砖的奴隶搭了个顺风车灌水 : ,不配叫做做生物信息学的
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N******n 发帖数: 3003 | |
N******n 发帖数: 3003 | 4 顺便帮我看看这个问题:
标 题: 问个简单的matrix变换的问题,包子答谢
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 10 15:27:16 2014, 美东)
有一个symmetric matrix, 我是平方得来的,应当是positive definite: 看了
eigvalue 都是正的,但是在matlab上用cholcov: Cholesky-like covariance
decomposition
出不来:
[T,err] = cholcov(sigma)
T是空的。不知道为什么,谢谢
A=
sigma =
0.4382 -0.3990 -1.2396 -1.0880 0.9084 1.5463 -0.6721 0.
4587
-0.3990 0.5448 1.3429 1.1029 -1.0068 -1.7077 0.6971 -0.
4047
-1.2396 1.3429 15.4717 10.6047 -10.6348 -18.3169 6.8657 -6.
0160
-1.0880 1.1029 10.6047 7.5741 -7.2716 -12.7805 4.8757 -4.
0894
0.9084 -1.0068 -10.6348 -7.2716 7.4749 12.4427 -4.6320 4.
0857
1.5463 -1.7077 -18.3169 -12.7805 12.4427 22.0718 -8.3375 7.
0495
-0.6721 0.6971 6.8657 4.8757 -4.6320 -8.3375 3.2289 -2.
6939
0.4587 -0.4047 -6.0160 -4.0894 4.0857 7.0495 -2.6939 2.
5615
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 俗称,干的和湿的 : 前者能写code能分析数据 : 后者不能写code,分析数据也仅限于现场的软件,而且还是图形界面的,要是用命令行 : 导入导出数据,就的抓虾,除非人家手把手的教过几条语句,下次还用这几个语句做同 : 样的事情,经常也需要去水槽电泳槽里捞数据 : 通常说(从工钱上来说) : 干的比较高大上 : 湿的就比较低端 : 干的瞧不起湿的,觉得你们不过是搬砖的奴隶搭了个顺风车灌水 : ,不配叫做做生物信息学的
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s******r 发帖数: 1245 | 5 牛逼的干的都去码工矿工了
剩下的也是跳不出去的人
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 俗称,干的和湿的 : 前者能写code能分析数据 : 后者不能写code,分析数据也仅限于现场的软件,而且还是图形界面的,要是用命令行 : 导入导出数据,就的抓虾,除非人家手把手的教过几条语句,下次还用这几个语句做同 : 样的事情,经常也需要去水槽电泳槽里捞数据 : 通常说(从工钱上来说) : 干的比较高大上 : 湿的就比较低端 : 干的瞧不起湿的,觉得你们不过是搬砖的奴隶搭了个顺风车灌水 : ,不配叫做做生物信息学的
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s******y 发帖数: 17729 | 6 re
生物信息学鱼龙混杂,你说的基本上是事实
就算是捞干的人,也是半路出家的多。也有少数灌水灌成了faculty不愿意离开恋栈的,
但多数还是靠帮别人灌水维持生计的工匠
(生物大公司写code可以不算生物信息这个领域了,他们就是码工
甚至说在工业界干数据分析的那些也基本上可以不算生物信息的了,因为他们基本上和
码工同工同酬了)
捞湿的人,通常来说上岸很晚,不是腿上的泥都还没洗掉,就是半截身子还陷在泥里
捞干的工匠和在水槽里捞东西的纯窑工,主要区别是工作强度,找下家的难易程度,其
次才是报酬。工匠比窑工撑死也就多一两万,不能更多了。
【在 s******r 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 牛逼的干的都去码工矿工了 : 剩下的也是跳不出去的人
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e*******o 发帖数: 4654 | 7 不是搞这个的,不知道答案。
不过,你应该找个最简单的case看看。
【在 N******n 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 顺便帮我看看这个问题: : 标 题: 问个简单的matrix变换的问题,包子答谢 : 发信站: BBS 未名空间站 (Thu Apr 10 15:27:16 2014, 美东) : 有一个symmetric matrix, 我是平方得来的,应当是positive definite: 看了 : eigvalue 都是正的,但是在matlab上用cholcov: Cholesky-like covariance : decomposition : 出不来: : [T,err] = cholcov(sigma) : T是空的。不知道为什么,谢谢 : A=
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l********8 发帖数: 197 | 8 大家都是underpay的,就不要互掐了。不管是湿的还是干的,牛的人都可以混得很好很
好(特别是有title的),湿的里面也有年薪20~30万的~ |
e*******o 发帖数: 4654 | 9 生物专业就业问题的终极答案就是转行。
一句话早转早好。 |
e*******o 发帖数: 4654 | 10 生物信息学鱼龙混杂,你说的基本上是事实
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哪个行业不是鱼龙混杂,只可惜,生物的龙混的不如它领域的鱼。 |
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s******y 发帖数: 17729 | 11 我也觉得相互掐的都是最苦逼的奴隶
不过相对而言,生物的奴隶主还不如其他行当的芸芸众生,这还得靠水槽里面捞活儿的
人给供着。你说这个湿的里面年薪二三十万的基本上可以忽略不计,太少,属于掐头去
尾的那种无效数据
【在 l********8 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 大家都是underpay的,就不要互掐了。不管是湿的还是干的,牛的人都可以混得很好很 : 好(特别是有title的),湿的里面也有年薪20~30万的~
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N******n 发帖数: 3003 | 12 tol = 1000000*eps(max(abs(diag(Sigma))));
if (n == m) && all(all(abs(Sigma - Sigma') < tol))
高了半天,程序里面的检查symmetic matrix的条件太严格了,我把tol乘以1000,现在
运行了。
【在 e*******o 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 不是搞这个的,不知道答案。 : 不过,你应该找个最简单的case看看。
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l********8 发帖数: 197 | 13 说句实话,我觉得生物真是蛮惨的,生物信息其实前景也有限,王道不都是计算机云云
啊。。。。(这个需要专家认证了,我也是听来的)。行行出状元,但是行行状元少,
所以大家比得就是个平均或者median。我觉得能够坚守传统生物并且做成功的,那绝对
是人杰,因为那是相当不容易的,也是有很幸运的,而且可以把传统生物做得很有逻辑
,很有道理的,不是简简单单发个文章,而是能够真的有所发现的,其实也是需要很大
的智慧的。这样的人是有的,有些人混得很好,有些其实是混得没有应该的那么好,所
以说生物耽误人,也有这个原因。如果比较average,那生物信息的就业前景是比传统
生物好的。但是牛人永远都是例外。
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 我也觉得相互掐的都是最苦逼的奴隶 : 不过相对而言,生物的奴隶主还不如其他行当的芸芸众生,这还得靠水槽里面捞活儿的 : 人给供着。你说这个湿的里面年薪二三十万的基本上可以忽略不计,太少,属于掐头去 : 尾的那种无效数据
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M*P 发帖数: 6456 | 14 最牛的是Fisher,其实就是搞生物的,但是开创了统计学。
★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.8
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 俗称,干的和湿的 : 前者能写code能分析数据 : 后者不能写code,分析数据也仅限于现场的软件,而且还是图形界面的,要是用命令行 : 导入导出数据,就的抓虾,除非人家手把手的教过几条语句,下次还用这几个语句做同 : 样的事情,经常也需要去水槽电泳槽里捞数据 : 通常说(从工钱上来说) : 干的比较高大上 : 湿的就比较低端 : 干的瞧不起湿的,觉得你们不过是搬砖的奴隶搭了个顺风车灌水 : ,不配叫做做生物信息学的
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n******7 发帖数: 12463 | 15 真是不想抬杠,不过你这里的湿的哪算生物信息的啊
不就是运行GUI软件吗,这个传统生物要求也很多,比如收集衍射数据
不过确实可以分两类:生物出身的和非生物出身的
生物出身有domain knowledge,但是算法方面一般比较弱,编程技能够用。主要做data
processing,results analysis (挖掘生物意义)
CS什么出身的对算法,ML什么的很熟,生物知识看悟性,编程技能差异比较大,但是肯
定够用。主要做methods。
还有一类database的工作,生物的和计算的人做的都不少。生物的人主要做那种人肉
mining文献的database,计算的人一般是data 整合处理 搞出来的meta database。
非生物出身做bioinfo的老板一般都比较nice,因为你搞猛了,别人就不干这苦逼又没
钱的差事了。 |
j****x 发帖数: 1704 | 16 你说的没错了。
传统意义上的“干湿”实验分类,其实原本是指,做计算(算法/建模)和数据分析的
为干,做实验产生数据验证猜想的为湿,并不是LZ这里的分法。当然,生物信息可以泛
泛的分为“理论”生物信息学,着重于新算法新模型的建立;以及“应用”生物信息学
,直接面向生物数据解决具体问题,但实际中二者之间并没有泾渭分明的界线分野,很
多时候都是交叠的,比如构建生物信息各种Database/WebServer(参考每年NAR
special issues),这些工具其实是连接干湿实验和CS/BIO人士的重要方式/手段,也
是当今生物信息学发展的核心组成部分之一。
至于LZ这里所说的“湿”,也就是运行软件分析数据产生结果,实际上是属于生物信息
学服务的范畴(而非生物信息学研究本身),可以由Core facility或者生物信息服务
公司完成,而更多时候,是由具备一定软件操所常识和自学能力的(原本)湿实验者来
完成。各生物信息商业软件公司的目标之一,自然就是将这一门槛降到尽量低从而产生
尽可能大的客户群,那么一个好的GUI和一个方便有效的Q&A/help系统,就是必不可少
的了。这块随着生物信息学理念和教学的逐步普及,生物学背景的学生掌握起来难度也
越来越小,之前一个实验室里可能就那么一两个会摆弄软件分析数据的还可能是二把刀
,今后大多数PhD/Postdoc都应具备基本的分析能力了,至于能走多深,看个人的学习
能力
。
data
【在 n******7 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 真是不想抬杠,不过你这里的湿的哪算生物信息的啊 : 不就是运行GUI软件吗,这个传统生物要求也很多,比如收集衍射数据 : 不过确实可以分两类:生物出身的和非生物出身的 : 生物出身有domain knowledge,但是算法方面一般比较弱,编程技能够用。主要做data : processing,results analysis (挖掘生物意义) : CS什么出身的对算法,ML什么的很熟,生物知识看悟性,编程技能差异比较大,但是肯 : 定够用。主要做methods。 : 还有一类database的工作,生物的和计算的人做的都不少。生物的人主要做那种人肉 : mining文献的database,计算的人一般是data 整合处理 搞出来的meta database。 : 非生物出身做bioinfo的老板一般都比较nice,因为你搞猛了,别人就不干这苦逼又没
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n******d 发帖数: 1055 | |
j********6 发帖数: 375 | |
s******y 发帖数: 17729 | 19
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看吧我原帖里总结的没错吧,做干的从来瞧不起做湿的
“干的瞧不起湿的,觉得你们不过是搬砖的奴隶搭了个顺风车灌水
,不配叫做做生物信息学的”
这也就是隔壁那个连生物信息学都没沾边的窑工大怒,跳出来盖高楼,说生物信息不靠谱
那个帖子的原因。
data
【在 n******7 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 真是不想抬杠,不过你这里的湿的哪算生物信息的啊 : 不就是运行GUI软件吗,这个传统生物要求也很多,比如收集衍射数据 : 不过确实可以分两类:生物出身的和非生物出身的 : 生物出身有domain knowledge,但是算法方面一般比较弱,编程技能够用。主要做data : processing,results analysis (挖掘生物意义) : CS什么出身的对算法,ML什么的很熟,生物知识看悟性,编程技能差异比较大,但是肯 : 定够用。主要做methods。 : 还有一类database的工作,生物的和计算的人做的都不少。生物的人主要做那种人肉 : mining文献的database,计算的人一般是data 整合处理 搞出来的meta database。 : 非生物出身做bioinfo的老板一般都比较nice,因为你搞猛了,别人就不干这苦逼又没
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p******a 发帖数: 6 | 20 阿。难道幸福就是以挣钱多少和管人还是被管来衡量?
没人考虑做的东西好玩不好玩吗?
我就是觉得生物医药的很多命题好好玩呀。每天一睁眼想想又可以去捣鼓那些数据,期
待着新发现, 说不定还可以救病治人,就觉得很有意思。反正我觉得比做矿工好玩。
反正挣再多再少都出不了中产的圈子。我觉得和谈得来的人做喜欢的事更重要。 |
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n******7 发帖数: 12463 | 21 你太敏感了,这跟瞧不瞧得起没关系
不是就是不是,有啥好争的
任何一个组要找bioinformatian或者computational biologist 不是你所谓的湿的这种
会使用软件采集分析生物数据,早10年前都是基本要求了,也没什么难度,跟学个
office软件比,就是多了一些domian knowledge
靠谱
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : : -------------------------------------------- : 看吧我原帖里总结的没错吧,做干的从来瞧不起做湿的 : “干的瞧不起湿的,觉得你们不过是搬砖的奴隶搭了个顺风车灌水 : ,不配叫做做生物信息学的” : 这也就是隔壁那个连生物信息学都没沾边的窑工大怒,跳出来盖高楼,说生物信息不靠谱 : 那个帖子的原因。 : data
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h*****7 发帖数: 6781 | 22 我觉得LZ说的对。生物信息基本就是应用,倒弄文件,学会用别人的软件
建模计算写code(而非script)这些不属于生物信息学,应该属于计算机工程下面的计
算生物方向,是生物信息的上游之一(另一个是测序等技术) |
l********k 发帖数: 14844 | 23 生物那点玩应,智商够写code的,随便拉一个训练一两年就是砖家。问题是会写code的
,还去搞揭不开锅的生物,得极其脑残才干得出来。随便干点什么都比生物来钱高个三
五倍,还能很有意思。
【在 s******y 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 俗称,干的和湿的 : 前者能写code能分析数据 : 后者不能写code,分析数据也仅限于现场的软件,而且还是图形界面的,要是用命令行 : 导入导出数据,就的抓虾,除非人家手把手的教过几条语句,下次还用这几个语句做同 : 样的事情,经常也需要去水槽电泳槽里捞数据 : 通常说(从工钱上来说) : 干的比较高大上 : 湿的就比较低端 : 干的瞧不起湿的,觉得你们不过是搬砖的奴隶搭了个顺风车灌水 : ,不配叫做做生物信息学的
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h*****7 发帖数: 6781 | 24 随便干点什么...
你让那些CS 发考题喝西北风啊
【在 l********k 的大作中提到】![](/moin_static193/solenoid/img/up.png) : 生物那点玩应,智商够写code的,随便拉一个训练一两年就是砖家。问题是会写code的 : ,还去搞揭不开锅的生物,得极其脑残才干得出来。随便干点什么都比生物来钱高个三 : 五倍,还能很有意思。
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d***y 发帖数: 8107 | 25 同意echowuhao,作为学生来讲,能早转就早转,还有希望混到faculty的,那就抓紧去
当奴隶主 |