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Biology版 - 分析PALM和STORM的数据,需要什么样的计算机配置?
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y***n
发帖数: 109
1
版上有用PALM和STORM的吗?听说需要很高配置的计算机分析数据。不知道得什么样的
配置?最近老板考虑买更新实验室的计算机,不知道最新的MAC PRO够不够?
a*q
发帖数: 2109
2
看你用什么软件了。快的软件应该是够了,稍微需要多等等才能拿到结果而已。
l**********1
发帖数: 5204
3
PALM pls refer, ImageJ new method:
>http://www.biomedcentral.com/1471-2105/14/349
For STORM
Try this paper:
>http://link.springer.com/article/10.1007/s00418-014-1211-4

【在 y***n 的大作中提到】
: 版上有用PALM和STORM的吗?听说需要很高配置的计算机分析数据。不知道得什么样的
: 配置?最近老板考虑买更新实验室的计算机,不知道最新的MAC PRO够不够?

s*****j
发帖数: 6435
4
你不要用 Gaussian 去 fit, 直接上重心, 结果差别肯定在在误差以内.
PSF 本身是 Bessel 函数, 大家都用 Gaussian 也是图省事.
你直接用重心的话, 你机子装的是 XP 也够了.

【在 y***n 的大作中提到】
: 版上有用PALM和STORM的吗?听说需要很高配置的计算机分析数据。不知道得什么样的
: 配置?最近老板考虑买更新实验室的计算机,不知道最新的MAC PRO够不够?

a*q
发帖数: 2109
5
重心是快,但是结果比Gaussian还是明显差一大截的。

【在 s*****j 的大作中提到】
: 你不要用 Gaussian 去 fit, 直接上重心, 结果差别肯定在在误差以内.
: PSF 本身是 Bessel 函数, 大家都用 Gaussian 也是图省事.
: 你直接用重心的话, 你机子装的是 XP 也够了.

a*q
发帖数: 2109
6
重心是快,但是结果比Gaussian还是明显差一大截的。

【在 s*****j 的大作中提到】
: 你不要用 Gaussian 去 fit, 直接上重心, 结果差别肯定在在误差以内.
: PSF 本身是 Bessel 函数, 大家都用 Gaussian 也是图省事.
: 你直接用重心的话, 你机子装的是 XP 也够了.

s*****j
发帖数: 6435
7
怎么个比法?
是重心和Gaussian差很多? 还是 重心和Bessel 的差别 比 Gaussian和Bessel 的差别
差很多?

【在 a*q 的大作中提到】
: 重心是快,但是结果比Gaussian还是明显差一大截的。
l**********1
发帖数: 5204
8
可参考邻坛的一帖 非等分grid
>http://www.mitbbs.com/article_t1/Faculty/31590241_0_1.html

【在 a*q 的大作中提到】
: 重心是快,但是结果比Gaussian还是明显差一大截的。
a*q
发帖数: 2109
9
重心 << Gaussian ~~ Bessel

【在 s*****j 的大作中提到】
: 怎么个比法?
: 是重心和Gaussian差很多? 还是 重心和Bessel 的差别 比 Gaussian和Bessel 的差别
: 差很多?

s*****j
发帖数: 6435
10
do you have a reference paper on this topic?

【在 a*q 的大作中提到】
: 重心 << Gaussian ~~ Bessel
a*q
发帖数: 2109
11
doi:10.1038/nmeth.1447
不同意他们的推论(关于WLS的),但是结果还是很明显的(MLEwG和MLEwT几乎重合)
。直接算重心应该比GME更差。

【在 s*****j 的大作中提到】
: do you have a reference paper on this topic?
1 (共1页)
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